RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 3O58_3

RNA: 3O58_3
Rfam family: 5_8S_rRNA

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Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((...........(((((....))))).(((.((((...((..((((......))))....((((((((.....((((((((.(((...))).)))).))))....))))))))(((((((((....)))))))))....))..)))))))...)))
Carnac(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..............................................................................................................................................................
Carnac(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...................................................................................................................(((((((((....))))))))).....................
CentroidAlifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	............................................((((......)))).........................................................(((((((((....))))))))).....................
CentroidAlifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.............................................(((......)))..........................................................(((((((((....))))))))).....................
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.............................((...............(........)))....((((((((.....................................))))))))(((((((((....))))))))).....................
CentroidFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.............................((...............(........)))....((((((((.....................................))))))))(((((((((....))))))))).....................
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	............................(((((.((.((.......)).))...)))))...((((((((..........(((...........)))..........))))))))(((((((((....))))))))).....................
Cylofold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..............(((((....))))).....(((((((....((((......))))....{{{{{{{(....{{{{...........)))))))...........)}}}}}}}(((((((((....)))))))))((((}}}}....)))).....
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((.(((((..((((...((((.(((........))).)))).((((......))))...(((((((((..((.((((((((.(((...))).)))).))))))..)))))))))((((((((....)))))))).....))))))))).)).....
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	............(((((...........((((.[[[[[[(...{{{{.))))..((((((..<<<<<<<<.))))))....)))))...)]]]]]]...........>>>>>>>>(((((((((....)))))))))............}}}}.....
MCFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(((((....(((((....)))))..((((((((((.....))))))..))))((((((..(((.(((((....)))))))).......)))))).)))))((((((((((((((((((((..))))))))))..))))...))))))......
MCFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(((((....(((((....)))))..((((((.((.......)).))..))))(((.((..(((.(((((....)))))))).......)).))).)))))(((.((..(((((((((((....)))))))))..)).....)).)))......
MXScarna(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(.((((((((((.....................(((((((....((((......))))...............................)))))))...................(((((((((....))))))))).....)))).))))))...).
MXScarna(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(.(((((((((.......................((((((....((((......))))...............................))))))............((...)).(((((((((....)))))))))......).))))))))...).
Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..............................................................................................................................................................
Mastr(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..............................................................................................................................................................
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((.(((((...((((((....)))).................((((......))))....((((((((..((.((((((((.(((...))).)))).))))))..))))))))(((((((((....))))))))).....)).))))).)).....
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	............(((((...........((((.[[[[[[[........))))..((((((...........))))))....)))))...]]]]]]]........((((.......(((((((((....)))))))))............)))).....
Murlet(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..........................................................................................................((.....))(((((............))))).....................
Murlet(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......................(((...................((.((((....................)))).................(((....)))...)).......((((((((......))))))))..)))................
PETfold_pre2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........(((........((.(...)......(...).))((((((......)))).......(((......................)))......))))...((.....))(((((((((....))))))))).)..((.....))........
PETfold_pre2.0(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((......(..((((...(...).))......)).....(((((((......)))).....(..(((...................).))...)...)))....((.....))(((((((((....)))))))))..)...........)).....
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	............(((((((((((((((((....[[[[[[[))))).))).))..((((((((.....))..))))))))..)))))...]]]]]]].....(((..((.....))(((((((((....))))))))).(((........))))))...
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..............(((((....))))).(((.((((...((..((((......))))....((((((((.....((((((((.(((...))).)))).))))....))))))))(((((((((....)))))))))....))..)))))))......
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(((((..((((((([[[[))))......(((...]]]].{{{{.)))..}}}}....((((((((..((.((((((((.(((...))).)))).))))))..))))))))(((((((((....))))))))).....))))))))........
RNASampler(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........((((.....................(((((((....((((......))))...............................)))))))...................(((((((((....))))))))).....))))............
RNASampler(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...(((.......(((.....))).........(((((((....((((......))))........((((...))))............)))))))...................(((((((((....)))))))))..........)))........
RNAalifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...................................................................................................................(((((((((....))))))))).....................
RNAalifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...........................................((((.((((....................))))..............................((.....))(((((((........)))))))............)))).....
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..............(((((....))))).(((.((((...((..((((......))))....((((((((.....((((((((.(((...))).)))).))))....))))))))(((((((((....)))))))))....))..)))))))......
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((...........(((((....))))).(((.((((...((..((((......))))....((((((((.....((((((((.(((...))).)))).))))....))))))))(((((((((....)))))))))....))..)))))))...)))
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..............(((((....))))).(((.((((...((..((((......))))....((((((((.....((((((((.(((...))).)))).))))....))))))))(((((((((....)))))))))....))..)))))))......
RSpredict(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..........................................................................................................(((...))).......((............................))....
RSpredict(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((.((.....(...(((....(((.((...((.((.((.(...((((......)))).)...))...))...))..))...)))...))).).))...)).((..(((....(((((((((((....)))))))))..)).))).......))....
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......((......(((((....)))))................((((......))))....((((((((...........(.............)...........))))))))(((((((((....)))))))))..........)).........
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..............(((((....))))).(((.((((...((..((((......))))....((((((((.....((((((((..((...))..)))).))))....))))))))(((((((((....)))))))))....))..)))))))......
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......((((...........)))).(((((......)).))).((((......))))....((((((((..((((........))))....((((....))))...)))))))).(((((.........)))))..((((........)))).....
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......(((.....(((((....))))).....(((((((....((((......)))).(((.....)))..((((........)))).))))))).....))).(((.....)))((((((((....)))))))).((((........)))).....

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