RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 3R4F_A

RNA: 3R4F_A
Rfam family: -

			GGCGUGUAUGUGGGGAAACCCUGAUUGAGUUCAGCCCACAUACUUUGUUGAUGGUUGUCAAUCGCC
Reference structure (std)		[ sec struct ]	((((.((((((((.......((((......)))).))))))))...((((((....))))))))))
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	((((((((((((((......(((((....)))))))))))))))..((((((....))))))))))
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((((......((((......)))))))))))))...((((((....))))))))))
Alterna	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((((......((((......)))))))))))))...((((((....))))))))))
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((((..(((.........)))...)))))))))...((((((....))))))))))
CentroidFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((((..(((.........)))...)))))))))...((((((....))))))))))
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((((..(((.(.....).)))...)))))))))...((((((....))))))))))
Cylofold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((((......((((......)))))))))))))...((((((....))))))))))
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((((......((((......)))))))))))))...((((((....))))))))))
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((((......((((......)))))))))))))...((((((....))))))))))
MCFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((..)))((((((..))))))..))))))))..(((((((..)))))))))))
MCFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((((....))((((.(..).))))..)))))))...(((((((..)))))))))))
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((((......((((......)))))))))))))...((((((....))))))))))
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((((......((((......)))))))))))))...(((((((..)))))))))))
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((((....).((((......)))).))))))))...((((((....))))))))))
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((((......((((......)))))))))))))...((((((....))))))))))
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((((......((((......)))))))))))))...((((((....))))))))))
RDfolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((((..(((.........)))...)))))))))....((((......)))).))))
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((((......((((......)))))))))))))...((((((....))))))))))
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((((......((((......)))))))))))))...((((((....))))))))))
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((((......((((......)))))))))))))...((((((....))))))))))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((((......((((......)))))))))))))...((((((....))))))))))
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((((......((((......)))))))))))))...((((((....))))))))))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((((......((((......)))))))))))))....(((((....))))).))))
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.(((((((((......((((......)))))))))))))....(((((....))))).))))

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