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RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 3U4M_B



RNA: 3U4M_B
Rfam family: -

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Reference structure (std) [ sec struct ] ((((.(......(..[[[[[..(((......((((((((....))))))))...)))..........).]]]]]).))))
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Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.((((...((((((....))))))...((((((((....))))))))....)))).((((......))))..))))
CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.((((...((((((....))))))...((((((((....))))))))....)))).((((......))))..))))
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (.........(((..((((((.((((.....((((((((....))))))))..)))).)..........)))))..))))
CentroidFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (.........(((((((((((.((((.....((((((((....))))))))..)))).)..........)))))))))))
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Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (.........(((..((((((.((((.....((((((((....))))))))..)))).)..........)))))..))))
Cylofold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.((((...((((((....))))))...((((((((....))))))))....)))).((((......))))..))))
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........(((..(((((..(((.(((..((((((((....)))))))).....))).)))......)))))..))).
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.((((...((((((....))))))...((((((((....))))))))....)))).((((......))))..))))
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((...........(((((..(((([[...((((((((....))))))))..))))]]..........)))))..))))
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MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........(((..(((((..(((.(((..((((((((....)))))))).....))).)))......)))))..))).
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((...........(((((..((((.....(((((((((..)))))))))..))))............)))))..))))
NanoFolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.({((...((.[[[[[..[[[[))...(((((((((<<)))))))))aa]]]])}.>>....)).]]]]]AA))))
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] .....(((....((((((....))))))...((((((((....))))))))[[[[[))).(((.....)))...]]]]].
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.((((...((((((....))))))...((((((((....))))))))....)))).((((......))))..))))
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........(((..(((((..(((.(((..((((((((....)))))))).....))).)))......)))))..))).
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.((((...((((((....))))))...((((((((....))))))))....)))).((((......))))..))))
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RNAwolf [ FASTA input ] [ sec struct ] (((.((.(((........((..((((.....(((((((((..)))))))))..)))).)).......)))))))).....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.((((...((((((....))))))...((((((((....))))))))....)))).((((......))))..))))
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.((((...((((((....))))))...((((((((....))))))))....)))).((((......))))..))))
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.((((...((((((....))))))...((((((((....))))))))....)))).((((......))))..))))
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((.((((...((((((....))))))...((((((((....))))))))....)))).((((......))))..))))