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RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 3UZL_B
RNA: 3UZL_B
Rfam family:
tRNA
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| Reference structure (std) | [ sec struct ] | ((.((.(..(...............).(((((.......))))).((.....))...(..((.......))..)).)).)).... | |
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] |
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| Alterna | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((....(((((((((...))...((((.......))))))))..))).....(((((.......)))))))))))).... |
| CentroidAlifold(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.....................................................................)))))).... |
| CentroidFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((...........))))(((((.......))))).............(((((.......)))))))))))).... |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((...........))))(((((.......))))).............(((((.......)))))))))))).... |
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| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((...........))))(((((.......))))).............(((((.......)))))))))))).... |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((...........))))(((((.......))))).(....)......(((((.......)))))))))))).... |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((..{{{{{....)))))).............}}}}}..((((....[[[[[.))))..]]]]].)))))).... |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((...........))))(((((.......))))).(((...)))...(((((.......)))))))))))).... |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((...........)))))).(((.(((....))).))).........(((((.......))))).)))))).... |
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| Mastr(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..................................................................................... |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((...........))))(((((.......))))).(((...)))...(((((.......)))))))))))).... |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((...(((..)))....((((((((((.......))))).(((...)))((((((..))))))))))).))))))).... |
| NanoFolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((({{{{{{{{{..))))).(((.}}....)))}}}}}..}}((.(((((([[))))))....))))))))).]]. |
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| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((...........))))(((((.......))))).((.....))...(((((.......)))))))))))).... |
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| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((...........))))(((((.......))))).(((...)))((([[[[[...))).]]]]]))))))).... |
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| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((...........)))))).(((.(((....))).))).........(((((.......))))).)))))).... |
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| RNAwolf | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((.((((...........))))(((((.......))))).............(((((.......)))))))))))).... |
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| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((....(((...................................))).....(((((.......)))))))))))).... |
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| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((..(((...........))).(((((.......))))).....((((((.....))).))).......))))))).... |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((.(((......[[[)))...(((((((((.......)))))]]]..((((((.....)).)))).....))))....)))). |