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RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 3ZEX_C

RNA: 3ZEX_C
Rfam family: 5_8S_rRNA

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Carnac(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........................................................................................................................................................................
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CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...............................................................................................................((((((((((.((.((((....))))..)))))))))..)))................
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(.((.....)).)....(((....((((..........))))..((((......))))....(((((((...............((((............))))..........(((((((....(((......)))....))))))))))))))..........))).
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........((((((.....(...((.........(((......)))..))...)........................(......)))))))...................((((((((((.((.((((....))))..)))))))))..)))((((......))))..
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(.(((((.(((((((((.(((........((((....)))).))).))))((((((((((((.((.......))))))))).)))))......((((....)))).((((((((((.((.((((....))))..)))))))))..))).))))).)).))).).
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........((((((((.....[[[[[[.......((((....))))...[[[[[((((((..{{{{{{{..)))))).......)))))))).....]]]]]........((((((..((((...........]]]]]])))).....}}}}}}}........))))))
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MXScarna(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((......................(((((((....((((......))))..............................)))))))...................(((((((.............(.....)))))))).....)...))).))))))).
MXScarna(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..................................((((((...(((((......)))).....((((....))))..........)..))))))....................(((((((((.....)...........)))))))).....................
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MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......(((....((((..........................((((......))))...................(((....)))........................((((((((((.((.((((....))))..)))))))))..))).)))).....)))...
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....(((((((..(((..........))).....((((....))))........))))))).(((((((.....................(((..................)))(((((((....((((....))))....))))))))))))))..............
Multilign(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	............................................((((......))))..............................((((.............))))..((((((((((.((.((((....))))..)))))))))..)))................
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ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......................................((((.(((([[[[..))))...((((((.....]]]]...))))))...........))))...........((((((((((.((.((((....))))..)))))))))..))).(((......)))...
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........(((((((((...((((........(((((...........(((((.((((((((((((............))))))).))))).....)))))......))))).(((((((....((((....))))....)))))))..)))))))))......))))
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RNASampler(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((...............((((.............(((....((((......))))....(((((....)))))............)))........))))..(((......(((((((....................))))))).)))...........))))..
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RNAalifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.............................(((...(((((....((((......))))....(((((....)))))............)))))............((.....))(((((((((................)))))))))...............)))...
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(.(((((..((((...((((..((...(((......))).((..(((((.((((((((((((.((.......))))))))).))))).....)))))...))....)).(((((((.((.((((....))))..)))))))))..))))))))..)).))).).
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((.....((((.(((..........)))....))))(((.(((.((..(((((.((((((((((((.((.......))))))))).))))).....)))))...))....((((((((((.((.((((....))))..)))))))))..)))....))))))..))..
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(.(((((..((((...((((..((...(((......))).((..(((((.((((((((((((.((.......))))))))).))))).....)))))...))....)).(((((((.((.((((....))))..)))))))))..))))))))..)).))).).
RNAwolf	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....(((.(((((((((((...(((((......((......)).(((......)))....))))...........)....))))).)))))).(((...)))...)))..((((((.(((((((.((((....))).((..........))...).)))))))))))))
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RSpredict(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......(.(....((......(.((............((.(...((((......)))).)...)).........))...)...........))......).).((((.....(((((((((.(.................))))))))..))...........))))..
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(.(((((..((((...((((.......(((((.(((((.....................................................)))))..))).)).....(((((((.((.((((....))))..)))))))))..))))))))..)).))).).
TurboFold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.............(((..........)))....((......)).((((......))))....(((((....)))))...................................((((((((((....((((....))))....)))))))..)))................
TurboFold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.............(((..........)))....((......)).((((......))))....(((((....)))))...................................((((((((((....((((....))))....)))))))..)))................
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(.(((((..((((...((((..((...(((......))).((..(((((.((((((((((((.((.......))))))))).))))).....)))))...))....)).(((((((.((.((((....))))..)))))))))..))))))))..)).))).).

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