RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 3ZEX_E

RNA: 3ZEX_E
Rfam family: -

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Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((...........((((.....)))).((((.............((((((((...((((((.............(((((((...)))))))((((((((((.((.((((...........))))))))))))))))..))))))....))))))))....((.(((..(((......)))..))).))...............)))).))
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...................((((((...................((((((((...((((((.............(((((((...)))))))(((((((((((.(.((((...........))))))))))))))))..))))))....))))))))............((((..((((.......))))..)))).....))))))....
CentroidFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...................((((((...................((((((((...((((((.............(((((((...)))))))(((((((((((.(.(((.............)))))))))))))))..))))))....))))))))............((((((((((.......)))))))))).....))))))....
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	............................................((((((((...((((((.............(((((((...)))))))((((((((((....((...............))..))))))))))..))))))....))))))))......................................................
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.................(((............)))...(.((((((.......)))))).)..)))).(((((.(((((.....)))((((((((.((((....................))))))))))))..........((((.............)))).(((((.((((.......)))).)))))......)).))))).
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.............((((..(((((((.......)..........((((((((...((((((.............(((((((...)))))))(((((((((((.(.((((....(.....)))))))))))))))))..))))))....))))))))............(((((.((((.......)))).))))).....))))))))))
Cylofold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((........[[((((...................{{{{{{{{...............))))...(((((((...)))))))[[[[[[[[[[[...(((()))))))....)))).]]]]]]]]]]]............}}}}}}}}..................((((.......))))...........]]))))....
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((.........(((((...))))).........))).((((.((((((((...((((((.............(((((((...)))))))((((((((((.((.((((...........))))))))))))))))..))))))....)))))))).......(((..(((......)))..))).((......)).......))))...
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.............((((..((((((...................((((((((...((((((.............(((((((...)))))))((((((((((.((.((((...........))))))))))))))))..))))))....))))))))....(..(((..(((......)))..)))..)............))))))))))
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.............(((....((((...............[[...((((((((...((((((.............(((((((...)))))))((((((((((.((.((((...........))))))))))))))))..))))))....))))))))............(((...((((.......))))...)))......))))]])))
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......((((.....))))...................((((.((((((((...((((((.............(((((((...)))))))((((((((.((((.((((...........))))))))))))))))..))))))....))))))))............(((((.((((.......)))).)))))........))))...
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.............((((..(((((((((................((((((((...((((((.............(((((((...)))))))((((((((.........(((((..........)))))))))))))..))))))....)))))))).........))).((((((..................)))))).))))))))))
NanoFolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((ffffffff{....((eeeeeeeee...)}))..(((....aaaaaaaaa((..)Eaaaa((ddd.)E.))(((((((...)))))))bbbbbbbbbb(gg(.[[.EEEEEEE[[[[[))).)BBBBBBBBBBDDD))A.(((((AAAAAAAA....((...)FF.cccccc.]]]]])]])))))))GGCCCCCC.FFFFFFAAAA
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.............((((..((((((...................((((((((...((((((.............(((((((...)))))))((((((((.((((.((((...........))))))))))))))))..))))))....))))))))....((.(((..(((......)))..))).))............))))))))))
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((...((((..[[[))))...]]].........)))(((((.((((((((...((((((.............(((((((...)))))))(((((((((.(((.((((...........))))))))))))))))..))))))....))))))))............(((((.((((.......)))).)))))........)))))..
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.............((((..((((((...................((((((((...((((((.............(((((((...)))))))(((((((((((...((((...........)))).)))))))))))..))))))....))))))))............(((((.((((.......)))).))))).....))))))))))
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.............((((..((((((...................((((((((...((((((.............(((((((...)))))))((((((((((.((.((((...........))))))))))))))))..))))))....))))))))....(..(((..(((......)))..)))..)............))))))))))
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((..(((((.....))).))((........)).))).((((.((((((((...((((((.............(((((((...)))))))((((((((((.((.((((...........))))))))))))))))..))))))....))))))))....((.(((..(((......)))..))).))...............))))...
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.............((((..((((((...................((((((((...((((((.............(((((((...)))))))((((((((.((((.((((...........))))))))))))))))..))))))....))))))))....(..(((..(((......)))..)))..)............))))))))))
RNAwolf	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((...(.((((..(..)...(((......)))...(((((..)).))).....))))...)....))))((((((.((..(((((((((((..))))))....((.(((((..........))))))).((((..))))..(((((.((((((.(...............)..))))))...)..))))..)))))...)).))))))
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((...(((((((.(..)...((((....))))...(((((..)).)))....))))).).)....))))((((((.((.((((((((((((..))))))...(((.(((((((......))))))))))((((..))))..((((((((((((((...............)).)))))))..)..))))..))))).).)).))))))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((...((((.....))))...........))))....((((.((((((((...((((((.............(((((((...)))))))((((((((((.((.((((...........))))))))))))))))..))))))....))))))))....(..(((..(((......)))..)))..)...............))))...
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.............((((..((((((...................((((((((...((((((.............(((((((...)))))))((((((((((.((.((((...........))))))))))))))))..))))))....))))))))....(..(((..(((......)))..)))..)............))))))))))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((...((((.....))))..((((.......)))).......((((((.......))))))....)))........(((((.((....))..))))).....(((...(((..........))).(((((((...........)).))))).....(((.((........))))).))).(((.................))).....
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((...((((.....))))..(((.....))){{{{{{.....((((((.......))))))....))))..(((..(((((.((....))..)))))..((((.<<<<<<<.....)))).>>>>>>>....))).(((.....(((([[[[.........)))).....((((]]]]..))))...)))............}}}}}}

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