RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 3ZEX_G

RNA: 3ZEX_G
Rfam family: -

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Reference structure (std)		[ sec struct ]	...(((((.(...).)))))....((((((....(((..(..((((......(....).....))))..)((.((...((((....((((((((((....)))))..)))))...))))..)).)).((((....(.(.............).)....))))..))).......))))))..
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	...((((((....).)))))....(((((((..(((((.(.(((((.((.((((..)))))).)))))).((((((...((((...((((((((((....)))))..))))).).))))..))))).((((((.(((((()((.))..)..)))))).)))).))))).....)))))))..                                           (                        )                                                                                                                                                                                                 (                                       )                                                                                                                                                                                                             (    )                                                                                                                                                                         (                     )                                                                                                                                                                               ( )                                                                                                        (                                                   )                                                                   (   )                                                                                                                                                                                                                (                             )                                                                                                                                                                                                                                                            (         )                                                                                                                                                                             (     )
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.......)))))))).((((((....((((.((((((((..((.(....)..)))))))))).......(((((((((((.....((((..((((....)))))))).((((......))))......................))))))))))))))).......))))))..
CentroidFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.......)))))))).((((((....((((.((((((((...............)))))))).......(((((((((((............(((.......((((.((((((....))))))..))))......)))......))))))))))))))).......))))))..
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.......)))))))).((((((....(((..(((((((...(...........).)))))))(((((....(((....((((((((((....)))))..)))))...)))...))))).(((((...((((...........))))...)))))..))).......))))))..
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((...........)))))).((((((..((((...((((((((...(.......)...))))))))....))))((((((((((...........((((.......((((.((((((....))))))..))))......)))).....))))))))))............))))))..
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.......)))))))).(((((((..(((...((((((((..((.(....)..))))))))))....)))(((((((((((.....((((..((((....))))))))((((((....))))))....(((.....)))......)))))))))))((....)).).))))))..
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.......)))))))).((((((((..((((.((((((((...............))))))))(((((...((((.((.((((((((((....)))))..))))))).))))..))))).(((((((.((((...........)))))).))))).))))...))..))))))..
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.......)))))))).((((((((..((((......(((.(((.(....)..))))))..(((((((...((((.((.((((((((((....)))))..))))))).))))..)))))))((((((.((((...........)))))).))))..))))...))..))))))..
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.......)))))))).((((((....((((.((((((((..((.........))))))))))(((((..[[((({{{{((((((((((....)))))..)))))...)))...)))))..(((....((((...........))))}}}})))]])))).......))))))..
MCFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..............................................................................((((((((((..(...........................................................).))))))))))(((....)))..........
MCFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..............................................................................(((((((((((.(...........................................................))))))))))))(((....)))..........
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.......)))))))).((((((((..((((.((((((((...............))))))))(((((...((((.((.((((((((((....)))))..))))))).))))..))))).(((((((.((((...........))))))).)))).))))...))..))))))..
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.......)))))))).((((((....((((.....(((((....((((((.........((((((((..[[[[[[[[[[[....(((((..(((((..)))))))))).....)))))))).)))))).......)))))....]]]]]]]]]]])))).......))))))..
NanoFolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((fff(.ee))))))))((((.(((...((((ddd.dddddd{((.bbbbbbb([[))})..gggggga((cccccccccccccc)B]]A)).<<<<<<<)DDDDDD)BCCC.)F)GGGGGG..BBBBB)DDD..FF))))>>.))CCCCCCCCCCC.(((....EE)))>>>>>.
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.......))))))))(((((.((...[[[..(((((((((............)).))))))))))))))(((((((((((((((((((....)))))..)))))((.((((((....))))))))..((((...........))))))))))))).(((......)))..]]].
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.......)))))))).((((((((..((((....(((.........(((((.........(((((((...((((.((.((((((((((....)))))..))))))).))))..))))))).((((......)))).)))))..........))).))))...))..))))))..
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.......)))))))).((((((....((((.(((((((((............).))))))))(((((...((((.((.((((((((((....)))))..))))))).))))..))))).(((((((.((((...........))))))).)))).)))).......))))))..
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......................................................................................................................................................................................
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.......)))))))).((((((((..((((......(((.(((.(....)..))))))..(((((((...((((.((.((((((((((....)))))..))))))).))))..)))))))((((((.((((...........)))))).))))..))))...))..))))))..
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.......)))))))).((((((..((((...(((((((((............)).)))))))....)))).(((((..((((((((((....)))))..)))))...((....))..(((((((((.((((...........)))))).)))))...)).))))).)))).)).
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.......)))))))).((((((..((((.(.(((((((..(((.(....)..))))))))))..).))))((((((((((((((((((....)))))..)))))((.((((((....))))))..))((((...........))))))))))))(((....)))..))))))..
RNAwolf	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........((...((((.(((((.......)))))....(((((((((....(....)..)).))))))).......(((((((((((....(((......)))..........(((.........)))((((......)))).........)))))))))))))))...))((((..))))
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........((((.((((.(((((.......)))))....(((((((((...(((..))).)).))))))).......(((((((((((((.(((((...).))))........(((((.......))))((((......))))..)...)).))))))))))))))).))))((((..))))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.(...).)))))))).((((((....((((.(((((((...(..(....)...).)))))))(((((...((((.((.((((((((((....)))))..))))))).))))..)))))..((((((.((((...........))))))).)))..)))).......))))))..
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.......)))))))).((((((((..((((.((((((((...............))))))))(((((...(((..((.((((((((((....)))))..)))))))..)))..))))).(((((((.((((...........)))))).))))).))))...))..))))))..
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.............((((.(((((.......)))))....((((......)))).........))))..(((((((((((.......))))..((((....)))).(((......)))....)))))))((((((.((((...........))))))).)))..(((.......)))......

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