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RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 3ZEX_H



RNA: 3ZEX_H
Rfam family: -

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    (                                                                                                                              )   
         (        )                                                                                                                    
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] (..((((((((.((..((....)).(((((........)))))...))...(((((((....)))))))..))))))))......(((((..((((.((((((.........))...))))))))..)))))..)
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((((((((((.....)).....(((((........)))))........(((((((....)))))))..))))))))......(((((..(((..((((................)))).)))..)))))...
CentroidFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((((((((.......).....(((((........)))))........(((((((....)))))))..))))))))......(((((..((((.((((................))))))))..)))))...
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((((((((.....))))......(((((((((.........))).)(((((((....)))))))....(((((.......)))))((((.......))))..............)))))...)))))...
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((((((((((.....))((((.(((((........))))).))(...)(((((((....)))))))))))))))))......((((((.((((.((((.(.........)....))))))))).)))))...
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((((((((...........((.(((((........))))).)).....(((((((....)))))))..))))))))......(((((..((((.((((((.........))...))))))))..)))))...
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((((((((...........((.(((((........))))).)).....(((((((....)))))))..))))))))......(((((..((((.((((((.........))...))))))))..)))))...
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((((((((..............((((([[......)))))........(((((((....)))))))..))))))))......(((((...((...(((................)))]]))...)))))...
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ....((((((((((..(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..)))))))..))))))))))))))))))))((((((...)))))).))))))))))))))))))))))))))...
MCFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ....((((((...(..(.((((.(.((.(((((((.((..(.(.((..(.(((((((((..)))))))..)).)..)).).)..)).)))((((.......)))).)))).)).).)))).))...))))))...
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((((((((...........(..(((((........)))))..).....(((((((....)))))))..))))))))......(((((..((((.((((((.........))...))))))))..)))))...
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ....((((((.(((((.((((....(((((........)))))((((....((((((((..))))))))....(((((.......)))))....))))....))))....)))))...........))))))...
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] ....(((((((((.....))))....((((........))))((((((((.(((((((....)))))))....(((((.......)))))((((.......))))..))))(((....))).)))).)))))...
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((((((((.((..((....)).(((((........)))))...))...(((((((....)))))))..))))))))......(((((..((((.((((((.........))...))))))))..)))))...
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((((((((..............(((((....[[[.)))))...]]]..(((((((....)))))))..))))))))......(((((..((((.((((................))))))))..)))))...
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((((((((..............(((((........)))))........(((((((....)))))))..))))))))......(((((..((((.((((................))))))))..)))))...
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((((((((.((..((....)).(((((........)))))...))...(((((((....)))))))..))))))))......(((((..((((.((((((.........))...))))))))..)))))...
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] ....((((((......((....))....(((((((..((((((((((((..(((((((....)))))))....(((((.......))))).....))))...))).)))))......)))))))..))))))...
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((((((((.((..((....)).(((((........)))))...))...(((((((....)))))))..))))))))......(((((..((((.((((((.........))...))))))))..)))))...
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((((((((..(..(((..)))((((((.......).)))))((((..(........)))))......)))))))))......((((((((((....).)))..((..(((((..)))))))..))))))...
RNAwolf [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((((((((.....((....))((((((.......).)))))((((............)))).......))))))))......(((((.(((.......)))...(...((((..)))).)....)))))...
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((((((((...........(..(((((........)))))..).....(((((((....)))))))..))))))))......(((((..((((.((((((.........))...))))))))..)))))...
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((((((((.((..((....)).(((((........)))))...))...(((((((....)))))))..))))))))......(((((..((((.((((((.........))...))))))))..)))))...