RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 4BYQ_N

RNA: 4BYQ_N
Rfam family: -

			GUCGCGCCUGCGUAGGAUAGGUGGGAGCCUGUGAACCCCCGCCUCCGGGUGGGGGGGAGGCGCCGGUGAAAUACCACCCUGGCGCGG
Reference structure (std)		[ sec struct ]	.((.((((..(.....[..{{{.{..{{{......{..{.{.{...)}.}.}..}...}}}..........].}.}}}..)))).))
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	.(((((((..(..(..[[){{{{{{.{{{...{{.{.{{{{.....)].}}}}.}.}}}}}.....(...)]}}}}}}..)))))))                                           (    )                                                                  (                                             )                                 (                                                )
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(.((((((.((((...((((((....))))))...((((((((....))))))))....)))).((((......))))..)))))))
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((((.(.........((((((.((((.....((((((((....))))))))..)))).))..........))))).)))))))
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ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((.(.........(((((..(((......((((((((....))))))))...)))............)))))).)))))).
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((((.(.........((((((.((((.....((((((((....))))))))..)))).))..........))))).)))))))
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((((.((((...((((((....))))))...((((((((....))))))))....)))).((((......))))..)))))))
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((.((.((...)).)).((.((((.....((((((((....))))))))..)))).))((((......))))..)))))).
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((.((((...((((((....))))))...((((((((....))))))))....)))).((((......))))..)))))).
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((..................((((.....((((((((....))))))))..))))...((((......))))..)))))).
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((.((((...((((((....))))))...((((((((....))))))))....)))).((((......))))..)))))).
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((((...........(((((..((((.....(((((((((..)))))))))..))))............)))))..)))))))
NanoFolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((((.((((.[[)).{{{{{..{{{{<<...<<<<<<<<<]]>>>>>>>>>aa}}}})).......>>.}}}}}AA)))))))
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((.(((....)))..((((....)))))))).((((((((....))))))))....(((((((((......))))..)))))..
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((.((((...((((((....))))))...((((((((....))))))))....)))).((((......))))..)))))).
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((((.((((...((((((....))))))...((((((((....))))))))....)))).((((......))))..)))))))
RDfolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((...........(((((..........(((..(((((((.........)))))))..)))......)))))..)))))).
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((((.((((...((((((....))))))...((((((((....))))))))....)))).((((......))))..)))))))
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((.((((...((((((....))))))...((((((((....))))))))....)))).((((......))))..)))))).
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((.((((...((((((....))))))...((((((((....))))))))....)))).((((......))))..)))))).
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((((((.(.....((((((....))))))...((((((((....))))))))).))))(((((((......))))..)))))).
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RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(..(((((((.....)))))))..).((((....(((((((((..))))))))).))))((((((((((..))))))..))))...
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((.((((...((((((....))))))...((((((((....))))))))....)))).((((......))))..)))))).
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((.((((...((((((....))))))...((((((((....))))))))....)))).((((......))))..)))))).
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((.((((...((((((....))))))...((((((((....))))))))....)))).((((......))))..)))))).
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((((.((((...((((((....))))))...((((((((....))))))))....)))).((((......))))..)))))).

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