CompaRNA - on-line benchmarks of RNA structure prediction methods
Home

Methods
Datasets
Rankings
RNA 2D Atlas

Help
FAQ

Contact us
RSS feeds
Twitter

RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 4C7O_E



RNA: 4C7O_E
Rfam family: -

UGUUGGUUCUCCCGCAACGCGGAAGCGUGUGCCGGGAUGUAGCUGGCA
Reference structure (std) [ sec struct ] (((((((.((((((((((((....)))).))).)))).)..)))))))
Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((.(((((((((((((..))))).))).)))).)..)))))))
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((..(((((((((((((((....)))).)).))))).).)))..)))
CentroidFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((.(((((....)))))).))))).).))))))))
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((....)))).)).))))).).))))))))
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((((.((((....)))))...)))))...))))))))
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((....)))).)).))))).).))))))))
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((..(((.(((((..((((....))))....)))))...)))..)))
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((.(((((((((((....)))).)).)))))...))))))).
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] .((..(((((((((((((((....)))).)).))))).).)))..)).
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((((((((((....)))).)).)))))...))))))))
MCFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((....)))).))).)))).).))))))))
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((((..))))).))).)))).).))))))))
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((.(((((((((((....)))).)).)))))...))))))).
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((((..(((((....)))))..)))))...))))))))
NanoFolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((.((([[.[[[[)))]]]]))((((.{{{{{{.))))]]}}}}}}
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((....)))).)).))))).).))))))))
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] .((..(((.(((((((((((....)))).))).))))...)))..)).
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((((((((((....)))).)).)))))...))))))))
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((((..(((((....)))))..)))))...))))))))
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(((((..((((....))))....)))))...))))))))
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] .((..(((((((((((((((....)))).)).))))).).)))..)).
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] .((..(((.(((((((((((....)))).)).)))))...)))..)).
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] .((..(((((((((((((((....)))).))).)))).).)))..)).
RNAwolf [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((((......))).)).))))).).))))))))
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((((((((..)..))).)).))))).).))))))))
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] .((..(((((((((((((((....)))).)).))))).).)))..)).
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .((..(((.(((((((((((....)))).)).)))))...)))..)).
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((.(((((((((((....)))).)).)))))...))))))).
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((.........)))(((....)))..((((((.......))))))