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RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 4CXG_1



RNA: 4CXG_1
Rfam family: -

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Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] (...((.(..((((.((..((((((((((.(((..((((.((...((((((((((((((((((.....)))))))))))).).)))))...)).))))..))).)))))))))).)).))))...).)).....)
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ....((.(..((((.((..((((((((((.(((..((((.((...((((((((((((((((((.....)))))))))))).).)))))...)).))))..))).)))))))))).)).))))...).))......
CentroidFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........(((((((..((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.....)))))))))))))..))))))))))))))))))))))))))))))).))))))).............
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(..((.(..((((.((....((((((((.(((..((((.((...((((((((((((((((((.....)))))))))))).).)))))...)).))))..))).))))))))...)).))))...).))...)..
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ....((.(..((((.((..((((((((((.(((..((((.((...((((((((((((((((((.....)))))))))))).).)))))...)).))))..))).)))))))))).)).))))...).))......
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........((((.....((((((((((.(((..((((......(((((.((((((((((((.....))))))))))))...)))))......))))..))).))))))))))....)))).............
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] .((.....)).(((.((..((((((((((.(((..((((.((...(((((.((((((((((((.....))))))))))))...)))))...)).))))..))).)))))))))).)).)))..............
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ....((.(..((((.((..((((((((((.(((..((((.((...((((((((((((((((((.....)))))))))))).).)))))...)).))))..))).)))))))))).)).))))...).))......
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ....((....((((.((...(((((((((.(((..((((.((...(((((.((((((((((((.....))))))))))))...)))))...)).))))..))).)))))))))..)).)))).....))......
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........((((.((..((((((((((.(((..((((.((...(((((.((((((((((((.....))))))))))))...)))))...)).))))..))).)))))))))).)).)))).............
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((((.......((((......(((((....))))).)))).(((((.((((((((((((.....))))))))))))...)))))...))))).......(((((................)))))......
NanoFolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ((([[.(((((([[.[[[[{{{{{{{{{{)))))){{{..]]]].<<<<<<<<<<<<<<<<<<}}}aa>>>>>>>>>>>>.))).AA]]..aaa>>>>>>aaaa}}}}}}}}}}.]]AAAA....AAA.......
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((..(((((((((((....)).))))..))))))))(((((((((((((((((((((((((.....)))))))))))).).)))))...[[[(((((....))))).))).))))........]]].......
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ....((....((((.((..((((((((((.(((..((((.((...(((((.((((((((((((.....))))))))))))...)))))...)).))))..))).)))))))))).)).)))).....))......
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........((((.....((((((((((.(((..((((......(((((.((((((((((((.....))))))))))))...)))))......))))..))).))))))))))....)))).............
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ......((((((..((((......)))).))))))...((((...(((((.((((((((((((.....))))))))))))...)))))......(((((....))))).....))))..................
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ....((.(..((((.((..((((((((((.(((..((((.((...((((((((((((((((((.....)))))))))))).).)))))...)).))))..))).)))))))))).)).))))...).))......
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] .((.....)).(((.((..((((((((((.(((..((((.((...(((((.((((((((((((.....))))))))))))...)))))...)).))))..))).)))))))))).)).)))..............
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ....((.(..((((.((..((((((((((.(((..((((.((...((((((((((((((((((.....)))))))))))).).)))))...)).))))..))).)))))))))).)).))))...).))......
RNAwolf [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((.((((((..((.........))..)))))))).((((....((((((((((((((((.......))))))))))).).))))....)).)).((.((((..((.(((...)))))...))))))......
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((.(((((((((((......).)))))))))))).((((((..((((((((((((((((.......))))))))))).).))))..)))).)).((.(((((.((.(((...))))).).))))))..)...
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ....((.(..((((.((..((((((((((.(((..((((.((...((((((((((((((((((.....)))))))))))).).)))))...)).))))..))).)))))))))).)).))))...).))......
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((..(((((.((..(((((((((..(((..((((.((...(((((.((((((((((((.....))))))))))))...)))))...)).))))..)))..))))))))).)).))))......)..))..
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((((...((((((....)).)))).(((((.((((........))))((((((((((((.....))))))))))))..)))))....)))))........((((................)))).......
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ......((((((..(((........))).)))))).(((.[[[....))).((((((((((((.....))))))))))))...((((......))))]]]....((((................)))).......