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RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 4CXG_Y



RNA: 4CXG_Y
Rfam family: tRNA

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Reference structure (std) [ sec struct ] (((((((..((.(.....[..).)).(((((.......))))).....{{{{{..]....}}}}})))))))....
Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((([{{.{)<a.ab..}]}}.((((((.....))))))....>ccccccAB.CA.CCCCC)))))))....
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CMfinder(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((....((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))..)).......
Carnac(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((........)))).(((((.......)))))......((((.......))))))))))))....
CentroidAlifold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..............................................(.......).....))))))....
CentroidAlifold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((......(...(((((((((.(((((((......))))).)).))))))..))).).))))))))....
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ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((......((..(((((((((.(((((((......))))).)).))))))..))))).))))))))....
DAFS(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((........((((.((((((...(((((......)))))....))))))..))))..))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((........((((.((((((.(((((((......))))).)).))))))..))))..))))))))....
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Mastr(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ............................................................................
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MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((......(.((((.((((((.(((((((......))))).)).))))))..))))).))))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........))))...(((((((......)))))))(((((.......))))))))))))....
Multilign(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
Murlet(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))...)))).
NanoFolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((.[[[[[[[)))).(((((....{{.))))).<<]]]]<<<}}.]]].>>>.)))))))).>>.
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Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((((........))))...(((((((......))))).))((((.......))))))))))))....
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.(......((((.((((((.(((((((......))))).)).))))))..))))).))))))))....
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RSpredict(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (..(..........................................(...........(..)........))..).
RSpredict(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))...).
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((........((((.((((((.(((((((......))))).)).))))))..))))..))))))))....
TurboFold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((..(((....))).((((((.(((((((......))))).)).))))))........))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((..[[[[..))))...{{{..]]]].}}}.......(((((.......))))))))))))....