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RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 4FRN_A
RNA: 4FRN_A
Rfam family:
AdoCbl-variant
| GGGCUAAAAGCAUGGUGGGAAAGUGACGUGUAAUUCGUCCACAUUACUUGAUACGGUUAUACUCCGAAUGCCACCUAGCCCAAAGUAGAGCAAGGAGACUCA | |||
| Reference structure (std) | [ sec struct ] | .(((((.......(((((....(.((((.......)))))(.(([.[[[.)).{{{......)}}}....)))))))))).......(((.]]]...]))). | |
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] |
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|
| Carnac(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...................................................................................................... |
| CentroidAlifold(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.......(((((.....(((((.......))))).............(((.......)))....)))))))))))......(((........))). |
| CentroidFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.......(((((.........((((((.......................))))))........)))))))))))..................... |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.......(((((....(.((((.......)))).......)......(((.......)))....)))))))))))......(((........))). |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((....((([[[[[((((((((.{{{{{{{b((aaa...)B))))..<<<))}}}}}})))}.)))]]]]]))))))...>>>(((...AAA..))). |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((.(((((..(((........)))..)))))...........(((.......))).))))....))))))......(((........))). |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.......(((((..((((((((.......)))).)).....))..(.(((.......))).)..)))))))))))......(((........))). |
| Cylofold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...(((((............))))).(((((...........................)))))......))))))..................... |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.......(((((......((.(((((((.(((...((.....))..))))))))))))......)))))))))))......(((........))). |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.......(((((..((((((.(((.........))).))))))....(((.......)))....)))))))))))......(((........))). |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.......(((((......(((([[.....))))]]............(((.......)))....)))))))))))......(((........))). |
| MCFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((.((..(((.(..(((((..(((.((..)).)))..)))))..).)))(((.(((.......))).)).)..(((.((.(.(..).).)).))))).)).. |
| MCFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((..((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))((((((((...)..)))))).)..((((((((((..))))))))))))))).. |
| MXScarna(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.......(((((.((.((((((.......))))))...))...((..(((.......))).)).))))))))))).......((........)).. |
| Mastr(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...................................................................................................... |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.......(((((......(..(((((...(((..............)))..))))).)......)))))))))))......(((........))). |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.......(((((......((((.......))))..............(((.......)))....)))))))))))......(((........))). |
| Multilign(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .......(((....(((((..(((........)))..)))))....)))....(((.......))).....................(((........))). |
| Murlet(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((........((((.......(((.......)))....(((....)))..................)))).))))))..................... |
| PETfold_pre2.0(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.......((((((....(((((.......))))).)((......)).(((.......)))....)))))))))))......(((........))). |
| PPfold(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...................................................................................................... |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...[[..(((((....(.((((.......))))).((((.....................)))))))))))))))........]].((....)).. |
| PknotsRG | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.......(((((..((((((.(((.........))).))))))....(((.......)))....)))))))))))......(((........))). |
| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.......(((((.......(.((((((..(((..............))).))))))).......)))))))))))......(((........))). |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((...((((..((((...(((((((((...................))))).))))..)))).))))....))))))..................... |
| RNAalifold(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((........((((.....(((((.......))))).............(((.......)))....)))).))))))......(((........))). |
| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.......(((((..((((((.(((.........))).))))))....(((.......)))....)))))))))))......(((........))). |
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| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.......(((((.(((((((.(((.........))).))))))....(((.......)))..).)))))))))))......(((........))). |
| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((.(...(((((((.((((....(........)...).))))))).))).(((......)))((((..((((..((((((..)))))))))))))).))).. |
| RNAwolf | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((.....(((.(((.(((....................))))))..))).............(((...(((...(((........))).))).)))..)).. |
| RSpredict(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .................(........((....................................)).....).............................. |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.......(((((.(.................................(((.......)))..).)))))))))))......(((........))). |
| TurboFold(seed) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.......(((((....((((((.......)))).))...........(((.......)))....)))))))))))......(((........))). |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((.......(((((..((((((.(((.........))).))))))....(((.......)))....)))))))))))...........((....)).. |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ..((((......))))(((.....((((.[[[[[.))))...]]]]].(((.....)))..((((............................)))).))). |