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RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 4JRC_A
RNA: 4JRC_A
Rfam family:
-
| GAACCCUCUCUUCCGAAGCGAGCCGGGGGCGGUGGGAGCCCGGUGAAGACGGUUCC | |||
| Reference structure (std) | [ sec struct ] | (((((...(((((.....(..[[[[[[..........)]]]]]]))))).))))). | |
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] |
((((((...((((...[{(.]((((((.........})))))))))))).))))). ( ) ( ) ( ) ( ) |
|
| Afold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((.(((...(((..((..((((....))))....)).)))...))).)))).) |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((.(((..((((..((..((((....))))....)).)))..)))).))))). |
| CentroidFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((..(((((........((((((...........))))))))))))))))). |
| CentroidHomfold‑LAST | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((.....(((........((((((...........)))))))))...)))).. |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .((((...((((.........((((((...........)))))).)))).)))).. |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((.(((..((((..((..((((....))))....)).)))..)))).))))). |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((.(((...(((..((..((((....))))....)).)))...))).))))). |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((.(((...(((..((..((((....))))....)).)))...))).))))). |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((.((.......................................)).))))). |
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| MCFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((.(((((((((..((..))))))))((.((((..)))).)).))).))))). |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((.(((...(((..((..((((....))))....)).)))...))).))))). |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((...(((((........((((((...........))))))))))).))))). |
| NanoFolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((.(((((((((..((..[[[[[[.))..))))))]]]]]]..))).))))). |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((...((((((.....).((((((...........))))))))))).))))). |
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| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((.((((..(((......((((....)))).......))).).))).))))). |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((...(((((.........(((((...........))))).))))).))))). |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((...(((((........((((((...........))))))))))).))))). |
| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((.(((...(((..((..((((....))))....)).)))...))).))))). |
| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((.(((...(((..((..((((....))))....)).)))...))).))))). |
| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((.(((...(((..((..((((....))))....)).)))...))).))))). |
| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((......)).))((((((.((......))))))))....).))))). |
| RNAwolf | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((.(((........).))((((((...........))))))......))))). |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((.(((...(((..((..((((....))))....)).)))...))).))))). |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((.(((...(((..((..((((....))))....)).)))...))).))))). |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((.......(((........)))((((.......)))).........))))). |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((.((((..(((........)))[[[[...))))]]]].........))))). |