RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 4KR2_C

RNA: 4KR2_C
Rfam family: tRNA

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Reference structure (std)		[ sec struct ]	((((((..(((.....[...)))((((((.......))))))....{{{{..]....}}}}.))))))
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((((.[[[[){.<a..]]]](((((((.....)))))))..}bbbbbb>A.B..BBBBB))))))                    (                       )                                     (     )
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.((((......))))..((((((.......))))))...(((((.......)))))))))))
CentroidAlifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((............................................(.......).....)))))
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.................(((((((.......))))))).((((((.......)))))))))))
CentroidFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.......)........(((((((.......))))))).((((((.......)))))))))))
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((...(((.........)))((((((.......))))))..((((((.......)))))))))).
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.((((((....))))))(((((((.......))))))).((((((.......)))))))))))
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((......)))))(((((((.......)))))))..(((((.......)))))))))))
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((......))))).((((((.......))))))...(((((.......)))))))))))
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((................(((((((.......)))))))..(((((.......)))))))))))
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MXScarna(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((..((((.......)))).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))).
Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....................................................................
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McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.................(((((((.......))))))).((((((.......)))))))))))
PETfold_2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((..((((.......)))).(((((.(...).)))))....(((((.......)))))))))))
PETfold_pre2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((..((((.......)))).(((((.(...).)))))....(((((.......)))))))))))
PPfold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....................................................................
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((......)))))(((((((.......)))))))..(((((.......)))))))))))
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((((.[[)))))))..]].((((((.......))))))..((((((.......)))))).....
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.(((((......)))))((((((((....).))))))).((((((.......)))))))))))
RDfolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...(((((...............((((((.......))))))..((((((.......)))))))))))
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((((...)))))))....(((((((.......))))))).((((((.......)))))).....
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((................(((((((.......)))))))..(((((.......)))))))))))
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RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((......)))))(((((((.......)))))))..(((((.......)))))))))))
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((....(((((..))).))..(((((.......)))))...(((((((...)..)))))))))))
RNAwolf	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((....((((....)).))..(((((.......)))))...((((((.......)))))))))))
RSpredict(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((..............................................................)))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.................((((((.......))))))...(((((.......)))))))))))
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.((((......)))).(((((((.......)))))))..(((((.......)))))))))))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((.((((......)))).(((((((.......)))))))..(((((.......)))))))))).
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((.....))))))....(((((((.......))))))).((((((.......)))))).....

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