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RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 4KR3_C



RNA: 4KR3_C
Rfam family: tRNA

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Reference structure (std) [ sec struct ] ((((((..(((.....[...)))((((((.......))))))...{{{{{..]....}}}}})))))).
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CentroidAlifold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((............................................(.......).....))))).
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.................(((((((.......))))))).((((((.......))))))))))).
CentroidFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.......)........(((((((.......))))))).((((((.......))))))))))).
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((...(((.........)))((((((.......))))))..((((((.......))))))))))).
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.((((((....))))))(((((((.......))))))).((((((.......))))))))))).
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((......)))))(((((((.......)))))))..(((((.......))))))))))).
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((......))))).((((((.......))))))...(((((.......))))))))))).
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((................(((((((.......)))))))..(((((.......))))))))))).
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.................((((((.......))))))...(((((.......))))))))))).
MXScarna(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......))))..((((.......)))).....(((((.......))))))))))).
Mastr(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .....................................................................
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.(((((......))))).((((((.......))))))..((((((.......))))))))))).
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.................(((((((.......))))))).((((((.......))))))))))).
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PETfold_pre2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((.(...).)))))....(((((.......))))))))))).
PPfold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .....................................................................
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((......)))))(((((((.......)))))))..(((((.......))))))))))).
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((.[[)))))))..]].((((((.......))))))..((((((.......))))))......
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.((((((....))))))((((((((....).))))))).((((((.......))))))))))).
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ...(((((...............((((((.......))))))..((((((.......))))))))))).
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((...)))))))....(((((((.......))))))).((((((.......))))))......
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((................(((((((.......)))))))..(((((.......))))))))))).
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((......)))))(((((((.......)))))))..(((((.......))))))))))).
RNAwolf [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((....((((....)).))..(((((.......)))))...((((((.......))))))))))).
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((....(((((..))).))..(((((.......)))))...(((((((...)..))))))))))).
RSpredict(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((..........................................(..................)))).
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.................((((((.......))))))...(((((.......))))))))))).
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.((((......)))).(((((((.......)))))))..(((((.......))))))))))).
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((.((((......)))).(((((((.......)))))))..(((((.......))))))))))).
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((.....))))))....(((((((.......))))))).((((((.......))))))......