RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 4KZE_R

RNA: 4KZE_R
Rfam family: -

			GACGCGACCGAAAUGGUGAAGGACGGGUCCAGUGCGAAACACGCACUGUUGAGUAGAGUGUGAGCUCCGUAACUGGUCGCGUC
Reference structure (std)		[ sec struct ]	((((((((((..((((.(.....(...(((((((((.....)))))))..)).........)..).))))..).)))))))))
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((((((((((((((((.([.{)].(((((((((.(..))))))))..))(..{.).}.}.)))))))))).)))))))))                         (                                  )                                             (                              )                                                   (                                  )                                                     (                               )
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...........(((....))).(((((.....))))).((((....((((....))))..)))).)))))))))
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((..(((..............(((((((.....))))))).......((((....)))))))...))))))))))
CentroidFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((..((((.............(((((((.....)))))))........((......))))))...))))))))))
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((.....(((...(........(((((((.....))))))).......((((....)))))...))))))))))))
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((..(((.......((.....(((((((.....)))))))....)).((((....)))))))...))))))))))
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((.....(((..(((....)))..)))....(((((.(((..[[[))).)))))..]]]......))))))))))
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((..((((......((...(((((((((.....)))))))..)).....)).......))))...))))))))))
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((..((((.(..(.((...(((((((((.....)))))))..)).....)).)...).))))...))))))))))
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((....................(((((((.....))))))).......((((....)))).......)))))))))
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((...................(((((((.....))))))).......((((....))))......))))))))))
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((............(((((..(((((((.....))))))).................)))))...))))))))))
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((............(((((..(((((((.....)))))))((.....))((....)))))))...))))))))))
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...........(((....))).(((((.....))))).((((....((((....))))..)))).)))))))))
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((..(((..............(((((((.....))))))).......((((....)))))))...))))))))))
RDfolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((....................(((((((.....)))))))........(((............))))))))))))
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((...................(((((((.....))))))).......((((....))))......))))))))))
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((..((((.(..(.((.(.(((((((((.....)))))))..)).)...)).)...).))))...))))))))))
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((..((((....(((....)))...((....(((((.(((.....))).))))).)).))))...))))))))))
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((..((((.(..(.((.(.(((((((((.....)))))))..)).)...)).)...).))))...))))))))))
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((.............)......(((((((((((.(((((((.......)))))))))))).)).))))))))))))
RNAwolf	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((......................((((((((....((((((.........))))))...)).)).)))).)))))))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((..((((.............(((((((.....)))))))..................))))...))))))))))
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((...........(((....))).(((((.....))))).((((....((((....))))..)))).)))))))))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((...................(((((((.....))))))).......((((....))))......))))))))))
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((...................(((((((.....))))))).......((((....))))......))))))))))

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