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RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 4MGN_B



RNA: 4MGN_B
Rfam family: tRNA

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CMfinder(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((..((((.......)))).((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))...
Carnac(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..................(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))..
CentroidAlifold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.............................................(.......).....)))))..
CentroidAlifold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))..
CentroidFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..................(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))..
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))..
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))..
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))..
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))..
DAFS(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))..
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] .....(((((((.......)))).[[[[[[)))..]]]]]](((..[[[[[.......)))....]]]]].
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((((...)))))))......((((.......)))).))))))..
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).((((((.....)))))).....(((((.......)))))))))))..
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).((((((.....)))))).....(((((.......)))))))))))..
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MCFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.(...).)))).((((((.....))))))(((.(.(((..))).).)))..))))))..
MXScarna(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......))))..((((.......))))......(((((.......)))))))))))..
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Mastr(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .......................................................................
Mastr(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).((((((.....)))))).....(((((.......)))))))))))..
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))..
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))..
Multilign(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))..
Murlet(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))..
NanoFolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..(((([[.[[[.)))).{{{{{{{]]]}}}}}}}.{{{{<<<<<]].}}..>>>>>))))))}}
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((.(...).))))).....(((((.......)))))))))))..
PETfold_2.0(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))..
PETfold_pre2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((.(...).))))).....(((((.......)))))))))))..
PETfold_pre2.0(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))..
PPfold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .......................................................................
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Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).((((((.....)))))).....(((((.......)))))))))))..
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).((((((.....)))))).....(((((.......)))))))))))..
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((((...))))))).....((((((....).)))))))))))..
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] .............(((((.....))))).........(((((((...((((.......)))).))))))).
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))..
RNASampler(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..................(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))..
RNAalifold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))..
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).((((((.....)))))).....(((((.......)))))))))))..
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))..
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).((((((.....))))))(((.(.((....)).).)))..))))))..
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......))))...((((((((..))))))))..((((((...)..)))))))))))..
RNAwolf [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......))))...((((((((..))))))))..(((((.......)))))))))))..
RSpredict(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((........................................(.....................))))..
RSpredict(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).......................(((((.......)))))))))))..
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).((((((.....))))))......................))))))..
TurboFold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))..
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))..
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).((((((.....)))))).....(((((.......)))))))))))..
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((..[[[[[)))).{{{{{{]]]]]}}}}}}.....(((((.......)))))))))))..