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RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 4MGN_D



RNA: 4MGN_D
Rfam family: tRNA

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Reference structure (std) [ sec struct ] ((((((..((((....[..)))).(((((.......))))).....{{{{{..]....}}}}}))))))...
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CMfinder(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((..((((.......)))).((((((.....)))))).....(((((.......))))))))))....
Carnac(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..................(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))...
CentroidAlifold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((.............................................(.......).....)))))...
CentroidAlifold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))...
CentroidFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..................(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))...
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))...
CentroidHomfold‑LAST [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))...
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))...
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))...
DAFS(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))...
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] .....(((((((.......)))).[[[[[[)))..]]]]]](((..[[[[[.......)))....]]]]]..
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((((...)))))))......((((.......)))).))))))...
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).((((((.....)))))).....(((((.......)))))))))))...
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).((((((.....)))))).....(((((.......)))))))))))...
MCFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.(...).)))).((((((.....))))))(((.(.(((..))).).)))..))))))...
MCFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((((((((...)))))))(((((((...)))))))(((((((((..))))))))).)))))))...
MXScarna(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......))))..((((.......))))......(((((.......)))))))))))...
MXScarna(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......))))..((((((...))))))......(((((.......)))))))))))...
Mastr(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ........................................................................
Mastr(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).((((((.....)))))).....(((((.......)))))))))))...
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))...
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))...
Multilign(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))...
Murlet(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))).)..
NanoFolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((([[[[...{{))]]]].((((((({{{))))))).}}}.<<<<<.}}aaa.>>>>>))))))AAA
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((.(...).))))).....(((((.......)))))))))))...
PETfold_2.0(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))...
PETfold_pre2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((.(...).))))).....(((((.......)))))))))))...
PETfold_pre2.0(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))...
PPfold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ........................................................................
PPfold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))...
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).((((((.....)))))).....(((((.......)))))))))))...
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).((((((.....)))))).....(((((.......)))))))))))...
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((((...))))))).....((((((....).)))))))))))...
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] .............(((((.....)))))......((((((((..(((......)))..))))))))......
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))...
RNASampler(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))...
RNAalifold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))...
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).((((((.....)))))).....(((((.......)))))))))))...
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))...
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).((((((.....))))))(((.(.((....)).).)))..))))))...
RNAwolf [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......))))...((((((((..))))))))..(((((.......)))))))))))...
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......))))...((((((((..))))))))..((((((...)..)))))))))))...
RSpredict(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(........................................(......................))....
RSpredict(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))...
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((((...)))))))......................))))))...
TurboFold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))...
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).(((((((...))))))).....(((((.......)))))))))))...
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((.......)))).((((((.....)))))).....(((((.......)))))))))))...
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..((((..[[[[[)))).{{{{{{]]]]]}}}}}}.....(((((.......)))))))))))...