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RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 4PDB_I



RNA: 4PDB_I
Rfam family: -

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Reference structure (std) [ sec struct ] (((((((((...(((((....)))..)).)))))))))
Reference structure (ext) [ sec struct ] ((((((((((.([)((((..))))...]))))))))))
             (            )           
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Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((....((((....))))....)))))))))
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.(..((((....))))..).)))))))))
CentroidFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((((((((((....)))))))))))))))))
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.....((((....)))).....))))))))
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.(..((((....))))..).)))))))))
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((....((((....))))....)))))))))
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((....((((....))))....)))))))))
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((....((((....))))....)))))))))
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((....((((....))))....)))))))))
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((....((((....))))....)))))))))
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((....(((((..)))))....)))))))))
NanoFolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..(((((((..)))))..)))))))))))
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..((((((....)))..))))))))))))
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((....((((....))))....)))))))))
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((....((((....))))....)))))))))
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..((((..........)))))))))))))
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((....((((....))))....)))))))))
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((....((((....))))....)))))))))
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((....((((....))))....)))))))))
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((....((((....))))....)))))))))
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.(((..(((..)))..))).)))))))))
RNAwolf [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((.((...((....))...)).)))))))))
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((....((((....))))....)))))))))
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((....((((....))))....)))))))))
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((....((((....))))....)))))))))
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((....((((....))))....)))))))))