RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 4PKD_V

RNA: 4PKD_V
Rfam family: -

			GAUCCAUUGCACUCCGGAUCCAGGAGAUACCAUGAUCACGAAGGUGGUUUUCCU
Reference structure (std)		[ sec struct ]	(((((..........))))).((((((..((((..........)))).))))))
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((..........))))).(((((((.((((.(()....).)))))))))))
CentroidFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((..........))))).((((((.(((((..........)))))))))))
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((..........))))).((((((.(((((..........)))))))))))
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.......((((.......)))).......)))).................
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((..........))))).((((((.(((((..........)))))))))))
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((......[[[[)))))..]]]].......((((((....)))))).....
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((..........))))).((((((.(((((..........)))))))))))
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((..........))))).((((((.......(((((....)))))))))))
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((..........))))).((((((.(((((..........)))))))))))
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((..........))))).((((((.(((((..........)))))))))))
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((..........))))).((((((.(((((..........)))))))))))
NanoFolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((.[[[...[[.))))).{{{{{{.{{{{{]]...]]]..}}}}}}}}}}}
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((..........))))).((((((.(((((..........)))))))))))
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((......[[[[)))))..]]]].......((((((....)))))).....
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((..........))))).((((((.(((((..........)))))))))))
RDfolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((..........))))).((((((.((((............))))))))))
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((..........))))).(((((.......((((((....)))))))))))
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((..........))))).((((((.......(((((....)))))))))))
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((..........))))).((((((.......(((((....)))))))))))
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((..........))))).(((((.......((((((....)))))))))))
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((..........))))).(((((...(((...((..))...)))..)))))
RNAwolf	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((..........))))).(((((...(((...((..))...)))..)))))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((..........))))).((((((.......(((((....)))))))))))
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((..........))))).(((((.......((((((....)))))))))))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...........((((.......)))).......((((((....)))))).....
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((......[[[[)))))..]]]].......((((((....)))))).....

---