RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 4PLX_A

RNA: 4PLX_A
Rfam family: -

			GAAGGUUUUUCUUUUCCUGAGGCGAAAGUCUCAGGUUUUGCUUUUUGGCCUUUCUUAAAAAAAAAAAAAGCAAA
Reference structure (std)		[ sec struct ]	(((((..........((((((((....)))))))).[[[[[[[[[[..)))))...........]]]]]]]]]]
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	((((([{<abcdef.(((((((((..)))))))))....f........)))))...........]}>ABCFDEF                                          (                          )                                                (                        )                                             (                                )                                        (                                  )                                               (                  )              (                                                          )                                               (                                    )                                             (                    )                                                 (                            )                                                (                      )
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...............((((((((....)))))))).((((((((((..................))))))))))
CentroidFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...............((((((((....)))))))).((((((((((..................))))))))))
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...............((((((((....))))))))..(((((((((..................))))))))).
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((......))...((((((((....)))))))).((((((((((....(((....)))....))))))))))
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((........((((((((....)))))))).[[[[[[[[[[)))))))...........]]]]]]]]]]
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((....))))).((((((((....))))))))..(((((((((..................))))))))).
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((....))))).((((((((....)))))))).((((((((((..................))))))))))
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((.....)))).((((((((....)))))))).((((((((((..................))))))))))
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((....))))).((((((((....))))))))..(((((((((..................))))))))).
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...............((((((((....)))))))).((((((((((..................))))))))))
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((....))))).((((((((....)))))))).((((((((((..................))))))))))
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((........((((((((....)))))))).[[[[[[[[[[)))))))...........]]]]]]]]]]
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((....))))).((((((((....)))))))).((((((((((....(((....)))....))))))))))
RDfolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...............((((((((....)))))))).((((((((((....(((.......))).))))))))))
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((....))))).((((((((....)))))))).((((((((((..................))))))))))
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((....))))).((((((((....))))))))..(((((((((..................))))))))).
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((....))))).((((((((....))))))))..(((((((((..................))))))))).
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((....))))).((((((((....)))))))).((((((((((..................))))))))))
RNAwolf	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((...))))))((((((((....)))))))).((((((((((....(((.....)))...))))))))))
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((...))))))(((((((((..))))))))).((((((((((.((.((((...)))))).))))))))))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((....))))..((((((((....))))))))..(((((((((..................))))))))).
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((....))))).((((((((....)))))))).((((((((((..................))))))))))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((......)))..((((((((....))))))))...((((((((..................))))))))..
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((....))))).((((((((....))))))))..(((((((((..................))))))))).

---