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Reference structure (std) |
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[ sec struct ] |
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Reference structure (ext) |
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CMfinder(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Carnac(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Carnac(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((...((((.......))))................................................................................)))))).......... |
CentroidAlifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((...(((....)))((((((.....................((((.........))))..((((.........))))...............)))))).))))............ |
CentroidAlifold(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((....((....))..(((((.....................((((.........))))..((((.........))))...............)))))..))))............ |
CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((...(((.........((((.....(((.....(.......(((((((...)))))))..(((((.......)))))....)....)))...))))))))))))).......... |
CentroidFold
(ext)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((......((((((.............))))))((((((...(((((((...)))))))..((((((.....)))))).............))))))...)))))).......... |
ContextFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((....((....))..(((((....(......(.((((....((((((.....))))))..(((((.......)))))..)))).)..)....)))))..)))))).......... |
Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((...(((....)...(((((.....(((..(((((.(....(((((((...)))))))..((((((.....))))))..)))))).)))...))))))))))))).......... |
DAFS(seed)
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[ FASTA input ] |
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DAFS(20)
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[ FASTA input ] |
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DotKnot
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[ FASTA input ] |
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Fold
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[ FASTA input ] |
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HotKnots
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[ FASTA input ] |
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IPknot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((....((....))..(((((.....(((....(((......(((((((...)))))))..((((((.....))))))...)))...)))...)))))..)))))).......... |
MXScarna(seed)
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[ FASTA input ] |
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MXScarna(20)
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[ FASTA input ] |
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Mastr(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........................................................................................................................ |
Mastr(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........................................................................................................................ |
MaxExpect
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((....((....))..(((((.....(((..(((((......(((((((...)))))))..((((((.....))))))...))))).)))...)))))..)))))).......... |
McQFold
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[ FASTA input ] |
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Multilign(seed)
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[ FASTA input ] |
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Multilign(20)
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[ FASTA input ] |
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..((((...((((.......))))..((((.........))))...(((((((...)))))))..((((((.....))))))......................))))............ |
Murlet(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...................((((((.............((((..........................................))))(....)...))))))................. |
Murlet(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((....(((..)))..(((((.............((((......(((.......)))....(((((.......)))))..))))(....)...)))))..))))............ |
NanoFolder
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[ FASTA input ] |
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PETfold_2.0(seed)
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PETfold_2.0(20)
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..((((....((....))..((((((...(.......(((((....((((.........))))..((((.........))))..))))..).))...)))))..))))............ |
PETfold_pre2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
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..((((...(((....)))(((((((..(........(((((....((((.........)))).(((((.........))))).))))..).))...)))))).))))............ |
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((....((....))..((((((...(.......(((((....((((.........))))..((((.........))))..))))..).))...)))))..))))............ |
PPfold(seed)
|
[ FASTA input ] |
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........................................................................................................................ |
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
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..((((....((....))..((((((...(.......(((((....((((.........))))..((((.........))))..))))..).))...)))))..))))............ |
Pknots
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((((((....((....))..(((.....)))[[[((((((((((..((((((.....)))))).(((....))).(((((........))))).)))))))))))))))).....]]].. |
PknotsRG
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[ FASTA input ] |
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((((((....((....))..(((((.....(((..(((((......((((((.....))))))..((((((.....))))))...))))).)))...)))))..)))))).......... |
ProbKnot
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[ FASTA input ] |
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((((((..(.((....))).(((((............(((.[[[(.(((((((...)))))))).((((((.....))))))...)))......]]])))))..)))))).......... |
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((..............(((((..........(((((......(((((((...)))))))..((((((.....))))))...))))).......)))))..)))))).......... |
RNASampler(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((..(((.....))).(((((.............((((....(((((.......)))))..(((((.......)))))..)))).........)))))..)))))).......... |
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((...(((....)))((((((.............((((....((((.........))))..((((.........))))..))))(....)...)))))).))))............ |
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
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..((((....((....))..(((((.............((((....((((.........))))..((((.........))))..))))(....)...)))))..))))............ |
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((....((....))..(((((.....(((..(((((......((((((.....))))))..((((((.....))))))...))))).)))...)))))..)))))).......... |
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
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((((((....((....))..(((((.....(((..(((((......((((((.....))))))..((((((.....))))))...))))).)))...)))))..)))))).......... |
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((....((....))..(((((.....(((..(((((((....((((((.....))))))..((((((.....)))))))).))))).)))...)))))..)))))).......... |
RNAwolf
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((....(.((((((((..(((.....))))))))))).).....(((((((...)))))))..(((..........))).........))))..(((((............))).)). |
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((..)(.((((((((..((((...)))))))))))).).....(((((((...)))))))..((((........))))(.......)))))..((((((((......)))))).)). |
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((....((....))..(((((.....(((..(((((......(((((((...)))))))..((((((.....))))))...))))).)))...)))))..)))))).......... |
TurboFold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((....((....))..(((((.....(((.....((((....(((((((...)))))))..((((((.....))))))..))))...)))...)))))..)))))).......... |
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.(((((....((....))..(((((.....(((.....((((....(((((((...)))))))..((((((.....))))))..))))...)))...)))))..)))))........... |
UNAFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((....((....))..(((((.....(((..(((((......((((((.....))))))..((((((.....))))))...))))).)))...)))))..)))))).......... |
Vsfold4
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...(((..........))).(((((.((((.((....))))))...((((((.....))))))..((((((.....))))))...............))))).................. |
Vsfold5
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((...((((.......))))..((((.((....))))))...((((((.....))))))........[[[[[[(((........))).............))))))...]]]]]]. |