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Reference structure (std) |
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[ sec struct ] |
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Reference structure (ext) |
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Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidFold
(ext)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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ContextFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((.(...((((...(((((....).))))..))))..((((((.(((.......(((((((....(((......((((((((.....))))))))))))))))...))(((..((..((((((((((....))))))))))..))..))).....)))))))))).)).)))))))) |
DotKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Fold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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HotKnots
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[ FASTA input ] |
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IPknot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((.(((...((((...((((.......))))..))))....((((.(((...((......(((....[[.)))..(((((((((.....)))))))))]].......)).(((..(((.((((((((((....))))))))))...)))))).....))))))))))....)))))))) |
MaxExpect
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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McQFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((((((...))))).((((.......))))........((((((.(((......(((((((((.....))))).(((((((((.....))))))))).........))))....(((.((((((((((....))))))))))...)))........))))))))).....)))))))) |
NanoFolder
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Pknots
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[ FASTA input ] |
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PknotsRG
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[ FASTA input ] |
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ProbKnot
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[ FASTA input ] |
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RNASLOpt
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[ FASTA input ] |
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RNAfold
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[ FASTA input ] |
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RNAshapes
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[ FASTA input ] |
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RNAsubopt
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[ FASTA input ] |
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RNAwolf
(ext)
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[ FASTA input ] |
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RNAwolf
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((..(((((.((((......(..(((........))))......))))...(((..((((........(((((....((((((..)).))))....))))).......))))...)))..((((((((((....))))))))))(((............))).))))).....))))))) |
Sfold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((.....((((...((((.......))))..))))..((((((.(((..((((((..(((((.....))))).(((((((((.....))))))))).....))).)))(((..((..((((((((((....))))))))))..))..))).....)))))))))..)).)))))))) |
UNAFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((.....((((...((((.......))))..))))..((((((.(((..((((((..(((((.....))))).(((((((((.....))))))))).....))).)))(((..((..((((((((((....))))))))))..))..))).....)))))))))..))).))))))) |
Vsfold4
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((.((((.....)))).((((.......))))..(((................((((...(((((.....))))).(((((((((.....)))))))))....((((....)))).)))).(((((((((....)))))))))(((((.........)).))).)))......))))))) |
Vsfold5
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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