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RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 4TZY_X



RNA: 4TZY_X
Rfam family: Purine

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Reference structure (std) [ sec struct ] ((((((((((..((((((......[[.))))))[.....)]{{{{{{]].....}}}}}}..)))))))))
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Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
Carnac(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .......................................................................
CentroidAlifold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((((.....((((.........))))..........((((((.......))))))..)))))))..
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
CentroidFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..(((((((.........))))).........((((((.......)))))))))))))))))
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..(((((((.........))))))........((((((.......)))))).))))))))))
DAFS(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ...((((((...(((((((.......)))))))........((((((.......))))))..))))))...
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...............(((((.[[[[[[[.......)))))..]]]]]]]....)))))))))
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
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MXScarna(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((((...(((((((.......)))))))........((((((.......))))))..)))).....
Mastr(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .......................................................................
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
Multilign(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
Murlet(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .....((((.....((((.........))))..(((........(((.......)))..))))))).....
NanoFolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..((([[...))).(((({{{{{{{{{{..)))){{]].}}.}}}}}}}}}}.)))))))))
PETfold_2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((((((.(((((((.......)))))))(...))).((((((.......))))))..)))))))..
PETfold_pre2.0(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((((.(((((((.......)))))))(...))).((((((.......))))))..)))))))).
PPfold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] .......................................................................
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...((((((.........))))))((....))((((((.......))))))..)))))))))
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...(((((((......).))))))........((((((.......))))))..)))))))))
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
RNAwolf [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..((((((((.......)))))))).......((((((.......))))))..)))))))))
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((..((((((((.(...).)))))))).......((((((.(...).))))))..)))))))))
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
TurboFold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((((...((((((.........))))))........((((((.......))))))..)))))))))