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RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 4UYJ_R



RNA: 4UYJ_R
Rfam family: -

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                                       (           )                                                         
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((....((((..((.((((((((....(((....)))....)))))).)).))..))))...(((((((((..((..(((....)))..))..)))))))))...)))
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((..((((((.....((((((...((.......))....))))))....))..))))...(((((((((..((..(((....)))..))..)))))))))..))).
CentroidFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((..(((((......((((((..................)))))).....)..))))...((((((((((((((((((....))))))))))))))))))..))).
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((..((((.(((((........)))))....((((.(..........).))))))))...(((((((((..((..(((....)))..))..)))))))))..))))
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((..((((((...((((((((...((.(....)))....)))))).)).))..))))...(((((((((..((..(((....)))..))..)))))))))..))))
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((..((((.(((((.[[[[[[.)))))............]]]]]]........))))...(((((((((......(((....)))......)))))))))..))))
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((..((((..((.(((((((((..((.......))..).)))))).)).))..))))...(((((((((..((..(((....)))..))..)))))))))..))))
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((..((((..((.((((((((....(((....)))....)))))).)).))..))))...(((((((((..((..(((....)))..))..)))))))))..))))
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((..((((((((((.[[[[[[))))))....{{{{....]]]]]]....}}}}))))...(((((((((..((..(((....)))..))..)))))))))..))))
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((..((((..((.((((((((...((.......))....)))))).)).))..))))...(((((((((..((..(((....)))..))..)))))))))..))))
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((..((((((((((.[[[[[[))))))....{{{{....]]]]]]....}}}}))))...(((((((((((((...))))..(((..))).)))))))))..))))
NanoFolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((([[[[(((((((.[[[[[[)))))))..{{.{{....]]]]]]<<<<}}(((((((..aaaaaaaaa.)))))))>>>>..))))))..AAAAAAAAA}}]]]]
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((..((((((((((.......))))))....((((..............))))))))...((((((((((.((..(((....)))..))).)))))))))..))))
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((..((((..((.((((((((....(((....)))....)))))).)).))..))))...(((((((((..((..(((....)))..))..)))))))))..))))
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((..((((.....(((((((((..((.(....)))..).)))))).)).....))))...(((((((((......(((....)))......)))))))))..))))
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((.((((.(((((........)))))....((((..............))))))))..)))))...(((((...((((..(((((....)))))))))..)))))
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((..((((..((.((((((((....(((....)))....)))))).)).))..))))...(((((((((..((..(((....)))..))..)))))))))..))))
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((..((((.((....((((((....(((....)))....))))))....))..))))...(((((((((..((..(((....)))..))..)))))))))..))))
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((..((((..((.((((((((....(((....)))....)))))).)).))..))))...(((((((((..((..(((....)))..))..)))))))))..))))
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((..(...((((((((...))..))))))....(((.((((((......).)))))))).((((((((((.(((..((((..))))..)).))))))))))).))))
RNAwolf [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((..(...((((((((...))..))))))....(((.((((((......).)))))))).((((((((((..((..(((....)))..))..)))))))))).))))
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((..((((..((.((((((((..................)))))).)).))..))))...(((((((((..((..(((....)))..))..)))))))))..))))
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((..((((..((...((((((....(((....)))....))))))....))..))))...(((((((((..((..(((....)))..))..)))))))))..))))
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((..((((.(((((........)))))....((((..............))))))))...(((((((((..((...............)).)))))))))..))))
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((...((((((((((.[[[[[.)))))))...{{{{.....]]]]]....}}}}.)))...{{{{{{{{{(((.....)))......)))).}}}}}}}}}......