RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 4WFL_A

RNA: 4WFL_A
Rfam family: Bacteria_large_SRP

			GCCGUGCUAAGCGGGGAGGUAGCGGUGCCCUGUACCUGCAAUCCGCUCUAGCAGGGCCGAAUCCCUUCUCGAGGUUCGGUAACGAAUCGACAGAAGGUGCACGGU
Reference structure (std)		[ sec struct ]	(((((((...((((((....[[[[[..))))...{{{{{...]]]]]...}}}}}))......((((((...((((((....))))))...)))))).)))))))
Reference structure (ext)		[ sec struct ]	(((((((((((((((((...[[[[[.)))))(.){{{{{]...]]]]...}}}}})))))(..((((((((((((((((..))))))))))))))))))))))))                      (                           )                                                                (                                                   )                                                                     (                 )
Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....((((((((...((..(((((((....((.....))....)))))))))....)))))))).((((((....))))))..........)))))))
CMfinder(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(((.((((((..........................))))))..)))......................................(....).........
Carnac(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........................................................................................................
Carnac(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..................................(((((...........)))))..................................................
CentroidAlifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...........................................................................(((....)))....................
CentroidAlifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..................................(((((...........)))))....................(((....)))....................
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((.(((((((((((.(((((.(((....))))))))....)))))).))))).))(((....((((((...((((((....))))))...))))))....))))
CentroidFold (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((.(((((.(((....))))))))....)))))).)))))))))((....(((((((((((((((....)))))))))))))))....))..
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...((((((.(.(...).).)))))).(((((...........)))))........((((((...((((((....))))))...)))))).)))))))
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((.(((((((((((.(((((.(((....))))))))....)))))).))))).))(((....((((((...((((((....))))))...))))))....))))
DAFS(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...((((((..(.(((..((.(((.((.((.)).)))))..)))).)))))).................................)............)......
DAFS(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((.............((((((((.........)))..)))))................((((((...((((((....))))))...)))))).))))).)
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...((((((......[[[..)))))).(((((...........))))).]]]....((((((...((((((....))))))...)))))).)))))))
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((.(((((((((((...(((..(((((...))))))))..)))))).))))).)))((....((((((...((((((....))))))...))))))....))..
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....((((((((...((..(((((((....((.....))....)))))))))....)))))))).((((((....))))))..........)))))))
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((((((((...(((..[[..[[[[[[[)))......))))).))]]]]]]]]]....((((((...((((((....))))))...)))))).)))))))
MXScarna(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((.(((........................................................((((((...((((((....))))))...)))))).))).)).
MXScarna(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((((((((.((((.((((....))))))))....)))))).)).............((((((...((((((....))))))...)))))).)))).))
Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........................................................................................................
Mastr(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........................................................................................................
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((.(((((((((((...(((..(((((...))))))))..)))))).))))).)))((....((((((...((((((....))))))...))))))....))..
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....((((((((.(((((.[[[[[[..........)))))....]]]]]]......)))))))).((((((....))))))..........)))))))
Multilign(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...(((((.(((((....)))).)...)))))..((.(((((...))))).))...((((((...((((((....))))))...)))))).)))))))
Murlet(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((.....)))....((.((((((((.........)))..)))))))......(((..............)))..............................
NanoFolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((..(([[[[[[[[.(((((.[[[[[[[{{{{{{...))))))).]]]]]]]{{{{{{]]]]]]]].}}}}}}}}......((....))}}}})))))))
PETfold_2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........................................................................(.(((....)))..).................
PETfold_2.0(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((..(((((((...........))))...(((((...........)))))))).....((((...))...(((....)))..........)).)))))).
PETfold_pre2.0(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((..(((((((...........))))...(((((...........)))))))).....(...........(((....)))...........).)))))).
PPfold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........................................................................................................
PPfold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((...(((((............)))....((((.......(....)))))))......((..........(((....)))..........)).)))))).
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....((((((((....((((((((((....((.....))....)))))))...))))))))))).((((((....)))))).((.....)))))))))
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....((((((((...((..(((((((....((.....))....)))))))))....)))))))).((((((....))))))..........)))))))
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((.(((((((((((...(((..(((((...))))))))..)))))).))))).)))......((((((...((((((....))))))...))))))........
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...((((((...........)))))).(((((...........)))))........((((((...((((((....))))))...)))))).)))))))
RNASampler(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........((((((......((((....))))........))))))........((((....((((((...((((((....))))))...))))))....))))
RNAalifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...........................................................................(((....)))....................
RNAalifold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	............(((((.....((((........(((((...........)))))))))..))))).........(((....)))....................
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....((((((((...((..(((((((....((.....))....)))))))))....)))))))).((((((....))))))..........)))))))
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((.(((((((((((...(((..(((((...))))))))..)))))).))))).))(((....((((((...((((((....))))))...))))))....))).
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....((((((((...((..(((((((....((.....))....)))))))))....)))))))).((((((....))))))..........)))))))
RNAwolf	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((..........))).((..))(....(((((...........)))))...)....((((((((....(((....)))..)))..)))))..))))))
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((.((....)).))).((..))(....(((((...........)))))...)....((((((((...(((((..))))).)))..)))))..))))))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((.((((((((((............................))))).))))).)).......((((((...((((((....))))))...))))))........
TurboFold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((.(((((((((((.(((((..((....)).)))))....)))))).))))).))(((....((((((...((((((....))))))...))))))....))).
TurboFold(20)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((.(((((((((((.(((((..((....)).)))))....)))))).))))).))(((....((((((...((((((....))))))...))))))....))).
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((....((((((((...((..(((((((....((.....))....)))))))))....)))))))).((((((....))))))..........)))))))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...((((((...........)))))).(((((...........)))))........((((((...((((((....))))))...)))))).)))))))
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((...((((((....[[[[[..)))))).{{{{{...]]]]]...}}}}}........((((((...((((((....))))))...)))))).)))))))

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