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RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 4WJ4_B



RNA: 4WJ4_B
Rfam family: tRNA

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Reference structure (std) [ sec struct ] (((((((..((((.....[..)))).(((((.......))))).....{{{{{..]....}}}}})))))))....
Reference structure (ext) [ sec struct ] (((((((([{{.{)<..ab..}]}}(((((((.....)))))))...>ccccccAB.C..CCCCC)))))))....
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CMfinder(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
Carnac(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.........................................((((.......))))))))))))....
CentroidAlifold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((..............................................(.......).....))))))....
CentroidAlifold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
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ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
DAFS(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((((((.(((..((((......)))).)))))))))).(((((.......))))))))))))....
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((((((.(((..((((......)))).)))))))))).(((((.......))))))))))))....
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MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((((((.(((..((((......)))).)))))))))).(((((.......))))))))))))....
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.....((((((..........))))))..............(((((.......))))))))))))....
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NanoFolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((.((([[[[[[.{{{)))...]]]]]]}}}....(((((((..{{{{..)).)))))))))))))}}}}
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Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........))))....((((...........))))(((((.......))))))))))))....
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((((((.(((..((((......)))).)))))))))).(((((.......))))))))))))....
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RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((.....(((((............)))))..............(((((.......))))))))))))....
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((((((......((((......))))....))))))).(((((.......))))))))))))....
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RNAalifold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
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RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((((((.(((..((((......)))).)))))))))).(((((.......))))))))))))....
RNAwolf [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....((((((...)..))))))))))))....
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((((((.(((..((((......)))).)))))))))).(((((.......))))))))))))....
TurboFold(20) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((...((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))).))))))....
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((((((.(((..((((......)))).)))))))))).(((((.......))))))))))))....
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] (((((((..(((([[[[[...))))...]]]]].(((.....)))...(((((.......))))))))))))....