 | ||||||||||||||
| ||||||||||||||
 | ||||||||||||||
RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 4X4P_B
RNA: 4X4P_B
Rfam family:
-
| GGCCGCGGCAGGUUCGAGUCCUGCCGCGAUCGCCAC | |||
| Reference structure (std) | [ sec struct ] | ((((((((((((.......)))))))))...))).. | |
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | ((((((((((((.......)))))))))...))).. | |
| Afold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((.......)))))))))...).).) |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((.......)))))))))...))).. |
| CentroidFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((.......)))))))))...))).. |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((.......)))))))))...))).. |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((.......)))))))))...))).. |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((.......)))))))))...))).. |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((.......)))))))))...))).. |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((.......)))))))))...))).. |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((.......)))))))))...))).. |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((.......)))))))))...))).. |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((.......)))))))))...))).. |
| NanoFolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((...[[{{))))))))).]])))}} |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((.......)))))))))...))).. |
| PknotsRG | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((.......)))))))))...))).. |
| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((....).)))))))))...))).. |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((.......)))))))))...))).. |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...(((((((((.......)))))))))........ |
| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((.......)))))))))...))).. |
| RNAshapes | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((.......)))))))))...))).. |
| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((.......)))))))))...))).. |
| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((((((((((((...)..)))))))).)..))).. |
| RNAwolf | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | (((.((((((((.......))))))))....))).. |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((.......)))))))))...))).. |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((((((((((((.......)))))))))...))).. |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...(((((((((.......)))))))))........ |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...(((((((((.......)))))))))........ |