RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 4Y1J_A

RNA: 4Y1J_A
Rfam family: -

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Reference structure (std)		[ sec struct ]	(((((......((.((((....))))((((((((((.......(((((....)))))))))))))))(((((((....)))))))..))....)))))..
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CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...((((((..((.((((....))))((((((((((.......(((((....)))))))))))))))(((((((....)))))))..)).....))))))
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ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((.....((.((((....))))((((((((((.......(((((....))))))))))))))).((((((....))))))...))....)))))..
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...((((((..((.((((....))))((((((((((.......(((((....)))))))))))))))(((((((....)))))))..)).....))))))
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(((......((((....))))[[[[[[[[[[)))....(((((....)))))]]]]]]]]]](((((((....)))))))...............
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...(((((((.((.((((....)))).(((((((((.......(((((....)))))))))))))).(((((((....)))))))..))...).))))))
HotKnots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...((..((..((.((((....))))((((((((((.......(((((....)))))))))))))))(((((((....)))))))..)).....))..))
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...((((((..((.((((....))))((((((((((.......(((((....)))))))))))))))(((((((....)))))))..)).....))))))
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...((((((..((.((((....)))).(((((((((.......(((((....)))))))))))))).(((((((....)))))))..)).....))))))
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...((((((.....((((....))))((((((((((.......(((((....)))))))))))))))(((((((....))))))).........))))))
NanoFolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...(((((((([[.((((....))))(((((((((({{{.{{{(((((....)))))))))))))))<<<<<<<}}}.>>>>>>>))]].}}}.))))))
Pknots	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	......(((((((.((((....))))[[[[[[[[.).))))))(((((....)))))..]]]]]]]](((((((....)))))))...............
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...((..((..((.((((....)))).(((((((((.......(((((....)))))))))))))).(((((((....)))))))..)).....))..))
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...(((((((....((((....))))((((((((((.......(((((....)))))))))))))))(((((((....))))))).......).))))))
RDfolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...((((((.....((((....))))((((((((((.......(((((....))))))))))))))).((((((....))))))..........))))))
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...((((((.....((((....))))((((((((((.......(((((....)))))))))))))))(((((((....))))))).........))))))
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...((..((..((.((((....)))).(((((((((.......(((((....)))))))))))))).(((((((....)))))))..)).....))..))
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((......((.((((....)))).(((((((((.......(((((....)))))))))))))).(((((((....)))))))..))....)))))..
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...((..((..((.((((....))))((((((((((.......(((((....)))))))))))))))(((((((....)))))))..)).....))..))
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((..(((...(((((..)))))((((((((((.......((((((..)))))))))))))))).(((((((..)))))))..)))..).)))))..
RNAwolf	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((...(((...((((....))))((((((((((.......(((((....))))))))))))))).((((((....))))))..)))....)))))..
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...((..((..((.((((....))))((((((((((.......(((((....)))))))))))))))(((((((....)))))))..)).....))..))
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...((..((..((.((((....)))).(((((((((.......(((((....)))))))))))))).(((((((....)))))))..)).....))..))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(((......((((....)))).........((((....(((((....))))).......((((((((((....))))).))))).))))...)))
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(((......((((....)))).........((((....(((((....))))).......((((((((((....))))).))))).))))...)))

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