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GAUUUGGGGAGUAGCCGAUUUCCGAAAGGAAAUGUACGUGUCAACAUUUUCGUUGAAAAACGUGGCACGUACGGACUGAAGAAAUUCAGUCAGGCGAGACCAUAUCC |
| Reference structure (std) |
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[ sec struct ] |
(((.(((......(((.((((((....))))))((((((((((.......((((....)))))))))))))).(((((((....))))))).)))....))).))).
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| Reference structure (ext) |
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[ sec struct ] |
(((.((((((.[[[[[.(((((((..)))))))[[[[[[[[.(.......(((((..)))))))]]]]]]]](((((((((..)))))))))]]]]]))))).))). ( ) ( )
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Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((......(((.((((((....)))))).(((((((((.......((((....)))))))))))))..(((((((....))))))).)))....))).)).) |
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CentroidFold
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((......(((.((((((....))))))((((((((((((.(((((...))))).)))))))))))).(((((((....))))))).)))....))).))). |
|
CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((......(((.((((((....))))))((((((((((.......((((....)))))))))))))).(((((((....))))))).)))....))).))). |
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ContextFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((.(((......(((..(((((....))))).(((((((((....(((((...)))))....))))))))).(((((((....))))))).)))....))).)).. |
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Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((......(((.((((((....))))))((((((((((.......((((....)))))))))))))).(((((((....))))))).)))....))).))). |
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DotKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((......(((.((((((....))))))((((((((((.......((((....)))))))))))))).(((((((....))))))).)))....))).))). |
|
Fold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((......(((..(((((....))))).((((((((((...(((((...)))))...)))))))))).(((((((....))))))).)))....))).))). |
|
HotKnots
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((......(((.((((((....))))))((((((((((.......((((....)))))))))))))).(((((((....))))))).)))....))).))). |
|
IPknot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((......(((.((((((....))))))((((((((((...((((([[.)))))]].)))))))))).(((((((....))))))).)))....))).))). |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((......(((..(((((....))))).((((((((((...(((((...)))))...)))))))))).(((((((....))))))).)))....))).))). |
|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......(((...(((.((((((....))))))((((((((((.......((((....)))))))))))))).(((((((....))))))).))).........))) |
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NanoFolder
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((((([[...{{.)))))))).<<<..<<<<<<<<<<<]]aaaaaaaaa......}}>>>>>>>>>>>(((((((....))))))).AAAAAAA..AA.>>> |
|
Pknots
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.............(((.((((((....))))))((((((((((.......((((....)))))))))))))).(((((((....))))))).)))............ |
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PknotsRG
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((......(((.((((((....))))))((((((((((.......((((....)))))))))))))).(((((((....))))))).)))....))).))). |
|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((......(((.((((((....))))))((((((((((...(((((...)))))...)))))))))).(((((((....))))))).)))....))).))). |
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RNASLOpt
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((((((........))))))))......(((((((((((.......((((....)))))))))))))))(((((((....)))))))................ |
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RNAfold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((......(((.((((((....))))))((((((((((.......((((....)))))))))))))).(((((((....))))))).)))....))).))). |
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RNAshapes
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((...((.....(((.((((((....))))))((((((((((.......((((....)))))))))))))).(((((((....))))))).)))....))..))). |
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RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((......(((.((((((....))))))((((((((((.......((((....)))))))))))))).(((((((....))))))).)))....))).))). |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((....((((((((((((..)))))))((((((((((...(((......)))....)))))))))).((((((((..))))))))))))).).))))))). |
|
RNAwolf
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((......(((.((((((....))))))((((((((((...(((......)))....)))))))))).(((((((....))))))).)))....))).))). |
|
Sfold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((......(((..(((((....))))).((((((((((.......((((....)))))))))))))).(((((((....))))))).)))....))).))). |
|
UNAFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((.(((......(((.((((((....))))))((((((((((.......((((....)))))))))))))).(((((((....))))))).)))....))).))). |
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Vsfold4
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((((((........)))))))).......((((((((((.......((((....)))))))))))))).(((((((....)))))))................ |
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Vsfold5
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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