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RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 5AXW_B
RNA: 5AXW_B
Rfam family:
-
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| Reference structure (std) | [ sec struct ] | ....................(((((((((.((((....))))...)))))))))..(((.....)))..... | |
| Reference structure (ext) | [ sec struct ] | ....................((((((((((((((....)))))..))))))))).(((((..).)))).... | |
| Afold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((.........((.....))..(((((((.((((....))))...)))))))....(((.....)))...)) |
| CentroidFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ....................(((((((((.((((....))))...)))))))))..(((.....)))..... |
| CentroidFold (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ....................(((((((((.((((....))))...)))))))))..(((.....)))..... |
| ContextFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...(((..(((..(((....(((((((((.((((....))))...)))))))))..))).....)))..))) |
| Contrafold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ....................(((((((((.((((....))))...)))))))))..(((.....)))..... |
| DotKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ......((((....))))..(((((((((.((((....))))...)))))))))..(((..[[[)))..]]] |
| Fold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .....(((((....))))).(((((((((.((((....))))...)))))))))..((((...))))..... |
| HotKnots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .....(((((....))))).(((((((((.((((....))))...)))))))))..(((.....)))..... |
| IPknot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ........(((.........(((((((((.((((....))))...)))))))))..........)))..... |
| MaxExpect | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...........((((...))))(((((((.((((....))))...)))))))(((.((((...)))).))). |
| McQFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ....................(((((((((.((((....))))...)))))))))..((((...))))..... |
| NanoFolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .....(((((((([[[{{{{{{{{{.))))).((((.......)))).)))<<<<.]]]}}}}}}}}}>>>> |
| Pknots | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...........((.....))(((((((((.((((....))))...)))))))))..(((.....)))..... |
| PknotsRG | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...........((((.....(((((((((.((((....))))...)))))))))..(((.....))))))). |
| ProbKnot | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ......(((..[[[[)))]]]](((((((.((((....))))...)))))))(((.((((...)))).))). |
| RDfolder | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | .............((((...(((((((((.((((....))))...))))))))).))))............. |
| RNASLOpt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...........((((.....(((((((((.((((....))))...)))))))))..((((...)))))))). |
| RNAfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...........((((.....(((((((((.((((....))))...)))))))))..(((.....))))))). |
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| RNAsubopt | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...........((((.....(((((((((.((((....))))...)))))))))..(((.....))))))). |
| RNAwolf | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((..(((..((((.((((....(((((((..(((....)))....))))))).))))))))))).))..... |
| RNAwolf (ext) | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ((.((((..((((.((((.(..(((((((..((((..))))....))))))))))))))))))))))..... |
| Sfold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ....................(((((((((.((((....))))...)))))))))..((((...))))..... |
| UNAFold | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ...........((((.....(((((((((.((((....))))...)))))))))..(((.....))))))). |
| Vsfold4 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ......((((....))))..(((((((((.((((....))))...)))))))))...(((........))). |
| Vsfold5 | [ FASTA input ] | [ sec struct ] | ......((((....))))..(((((((((.((((....))))...)))))))))..(((.....)))..... |