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RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 5D3G_E



RNA: 5D3G_E
Rfam family: -

ACCCCCCCUUCGGUGCUUUGCACCGAAGGGGGGG
Reference structure (std) [ sec struct ] .(((((((((((((((...)))))))))))))))
Reference structure (ext) [ sec struct ] .(((((((((((((((...)))))))))))))))
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((...)))))))))))))))
CentroidFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((...)))))))))))))))
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((...)))))))))))))))
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((...)))))))))))))))
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((...)))))))))))))))
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((...)))))))))))))))
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((...)))))))))))))))
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((...)))))))))))))))
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((...)))))))))))))))
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((...)))))))))))))))
NanoFolder [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((...)))))))))))))))
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((((((((.....))))))))))))))
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((...)))))))))))))))
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((...)))))))))))))))
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((...)))))))))))))))
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((...)))))))))))))))
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((...)))))))))))))))
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((...)))))))))))))))
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((...)))))))))))))))
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((...)))))))))))))))
RNAwolf [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((...)))))))))))))))
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((...)))))))))))))))
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((((...)))))))))))))))
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((((((((.....))))))))))))))
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((((((((.....))))))))))))))