CompaRNA - on-line benchmarks of RNA structure prediction methods
Home

Methods
Datasets
Rankings
RNA 2D Atlas

Help
FAQ

Contact us
RSS feeds
Twitter

RNA Secondary Structure Atlas - PDB - 5HLF_E



RNA: 5HLF_E
Rfam family: -

UACCCCCCCUUCGGUGCUUUGCACCGAAGGGGGGG
Reference structure (std) [ sec struct ] ..(((((((((((((((...)))))))))))))))
Reference structure (ext) [ sec struct ] ..(((((((((((((((...)))))))))))))))
Afold [ FASTA input ] [ sec struct ] (.((((((.((((((((...)))))))))))))))
CentroidFold (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((((((((((((...)))))))))))))))
CentroidFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((((((((((((...)))))))))))))))
ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((((((((((((...)))))))))))))))
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((((((((((((...)))))))))))))))
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((((((((((((...)))))))))))))))
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((((((((((((...)))))))))))))))
HotKnots [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((((((((((((...)))))))))))))))
IPknot [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((((((((((((...)))))))))))))))
MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((((((((((((...)))))))))))))))
McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((((((((((((...)))))))))))))))
Pknots [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((((((((((.....))))))))))))))
PknotsRG [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((((((((((((...)))))))))))))))
ProbKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((((((((((((...)))))))))))))))
RDfolder [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((((((((((((...)))))))))))))))
RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((((((((((((...)))))))))))))))
RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((((((((((((...)))))))))))))))
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((((((((((((...)))))))))))))))
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((((((((((((...)))))))))))))))
RNAwolf [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((((((((((((...)))))))))))))))
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((((((((((((...)))))))))))))))
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((((((((((((...)))))))))))))))
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] ..(((((((((((((((...)))))))))))))))
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((((((((((.....))))))))))))))
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] ..((((((((((((((.....))))))))))))))