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CRW_00013
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[ FASTA input ]
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AACUAUGACUCAACGUUCUGAGGGAUGUAUAUUUCACAGCGGGGUUUGGCAACUAAACUUCGAGAGGGUCAAGUAACGUAAAAGGCGUUGCUAGUGGGCAGUGCUGACCUCUGGACCGGCGAUCCGCGACGAGAGACGCCCCCGCGACAUCAUCAAAUUGCGGGGACUCCCUAAAGCUGUGUGCUACUAAGCAGGUGCCGAAACGACCUGUGGCCGGGGUAAUGACCUGGGGUAUAGUAAAAACGCACCAGAUGCCACAAUGGGUGAUCCGCAGCCAAGUCCUAAGGCAACAGGCCUCUUCCCGCCCGUGGGGGAGAGUGUCCCGCGCUAUGGAUGCAGUUCAACGACUAAACGGUGAUGGGCUAGCGUAAUGAAUGCGUUCUGCACACUCUUACGCCGGCUUAAGAUAUAGUCUACUCCCACUCCGAAAGGAGGGGUACUAAAAGCUCUUAAGGU |
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[ reference structure ]
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| [ predicted structure ] |
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CRW_00016
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[ FASTA input ]
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AACUAUGACUCAAAUGGCACGAAUGUUCUGAAAGACAAAUUCGAGAGGGUCAAGUAACGUAAAAGGCGUUGCUAGUGGAGGUUUUGGAACCGAAACCUCUGCUACAUCAUCAAAUUGCGGGGACAUCCUAAAGCUGGUGCUACUAAGCAGGUGCCGAAACGACUUGUGGCCGGGGUAAUGACCUGGGGUAUAGUAAAAACGCGCCAGAUGACACAAUGGACAAUCCGCAGCCAAGUCCUAAGGUGCAGGAGACUUCUCUCCUGCACUAUGGAUGCAGUUCAACGACUAGACGGUGAUGGGCUAGCGUAAUGAAUGCGUUCUGCACACUCUUACGCCGGCUUAAGAUAUAGUCUACUCCCACUCUGAAAGGAGGGGUACUAAAAGCUCUUAAGGU |
|
[ reference structure ]
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| [ predicted structure ] |
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|
CRW_00610
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[ FASTA input ]
|
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|
[ reference structure ]
|
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| [ predicted structure ] |
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|
CRW_00613
|
[ FASTA input ]
|
ACGCAGCGGACUUAGAAAACUGGGCCUCGAUCGCGAAAGGGAUCGAGUGGCAGCUCUCAAACUCAGGGAAACCUAAAACUUUAAACAUUAAAGUCAUGGCAAUCCUGAGCCAAGCUAAAGCUAAACAACUAACAGCUUUAGAAGGUGCAGAGACUAGACGGGAGCUACCCUAACGGAUUCAGCCGAGGGUAAAGGGAUAGUCCAAUUCUCAACAUCGCGAUUGUUGAUGGCAGCGAAAGUUGCAGAGAGAAUGAAAAUCCGCUGA |
|
[ reference structure ]
|
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| [ predicted structure ] |
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|
CRW_00614
|
[ FASTA input ]
|
GAUUGGAUUGAGCCUUGGUAUGGAAACCUACUAAGUGAGAACUUCCAAACUCAGAGAAACCCCGGAAUAAAAAAUGGGCAAUCCUGAGCCAAAUCCUGUGUUCAGAAAACAAGGUUCAGAAAGCGGGAAUCAAAAAAAGGAUAGGUGCAGAGACUCAAUGGAAGCUGUUCUAACAAAUAGAGUUGACUGCAUCGGUAAGGGAAUUCUUUCCUUUUAUCCAAACGACAGAAAGGAUGACCUUGUAUACGUACGUAUACAUACUGAAACAUCAAACGAUUAAUCACGACUCGAAUCGGUUUUUUUUUCUGAAAAAUUUCAGAAUAGAAGGAUUGUGAAUUGAUUCCAAGUUGAAGGAAGAAUCGAAUAUUCAGAGAUCAAAUCAUCCAUUCCCGAGUCUAAUAGAUCUUUUGAAGAACCGAUGAAUCGGACGAGAAUAAAGAUAGAGUCCCGUUCUACAUGUCAAUACAGACAACAAUGAAAUUGAUAGUAAGAGG |
|
[ reference structure ]
|
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|
| [ predicted structure ] |
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|
|
CRW_00618
|
[ FASTA input ]
|
AAUUGGAUUGAGCCUUGGUAUGGAAACCUACUAAGUGAUAAUUUUCAAAUUCAGAGAAACCUUGGAAUUAAUAAAAAGGGCAAUCCUGAGCCAAAUCCUAUUUUUUUGAAAAAAUAAAAAAAAAAAUAAAGAUAGGUGCAGAGGUGCAGAGACUCAAUGGAACGCUGUUCUCAAAUGGAGUUGGUGAAGAGGGGUAUAUACAGAGUGUAUCAAACGAUUCACCCACAGCGUGUAGAUUUUUUCACGAACGAAUUAUUAUUCAUCAUCGGAUUAGAAUAAAGAGAGAGUCCCGUUCUGCAUGUCAAUGCCGACAACAAUGAAAUUUAUAGGAAGAGG |
|
[ reference structure ]
|
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|
| [ predicted structure ] |
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|
|
CRW_00633
|
[ FASTA input ]
|
AAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGAGAACAAAUGAUUCUUUCGCUAAGACAUUUGCUGAAGCCUUGAAGAGCAGUAGUCAUCCUUACUGCUAGUUCAACUUAUUGUUGAGCAACAUUGCCAAAUUGCGGGAAAGUCUUAAUGACUUCGCUACCAAGUUCAAUAGCGUACUCUGAAUGGCCGGCUUAAUACACCGGGUAGGGUUAUAAUGCGAAGUAUGUUACAAUAGGCAACCUGCAGCCAACUUCUACAUUGUAGGAUGCUGUUCACAGAUCAAAUGGCAGUGGGUGCAUCAUGUAAGCUAAUGAUGCGCUUAAGAUAUGAUCGGUCCUUAUUGCGAGAGCUUAAGGUAGAAAACGU |
|
[ reference structure ]
|
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|
| [ predicted structure ] |
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|
|
CRW_00634
|
[ FASTA input ]
|
ACCAGGAGUUAACAAACAGGCUCUGCUCCAAACAGUAGCUCGAAUAGAGUACGGUGGUCGCUGUCGUUUAAAUACUAGUCUGUUUAUAACAGGCAAGAUCUUCAAAUUGCGGGGAAGUACUGGGGCUCUAAUCUACCAAGUCAUUGUCUGAAAAGGCAUGAUGGCCUGAGGUAAUAACUCAGGAUAUGGUUACAACGAUUAGAGAUGUUACAAUGUAUGAUUCGCAGCCCAAUCCCUCAAUAUGGGAUCAGGUUCAGAGACUAAACGGAGAUCGAUCUAGGCAUUGAACUAGGUUUAAGAUAUAGUCCAUUAUUCUGCUUAACAGCAAUUGAAUGUAUUAAUUGGGAGCCUGCGGCUUAA |
|
[ reference structure ]
|
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|
| [ predicted structure ] |
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|
|
CRW_00670
|
[ FASTA input ]
|
AACUAUGACUCACCUUUUGAGGGUCAUGAAAGCGGCGCGAAAGUGUUAGCUAGUGAUCCGAAAAAUAAAUUCGGGUUGCGACACUGUCAAAUUGCGGGGAGUCCCUAAAGAUUCAACUACUAAGCAGCUUGUGGAAACACAGUUGUGGCCGAGUUAAUAGCCCUGGGUAUAGUAACAAUGUUGAAUAUGACUCUUAAUUGAGGAAAUGGGUGAUCCGCAGCCAAAUCCUAAGGACAUUUUAUUGUCUAUGGAUGCAGUUCAGCGACUAGACGGCAGUGGGUAUUGUAGAGAUAUGGGGUUAUUUAUGGCCUUAUCUACAAUGCUUAAGGUAUAGUCUAAUCUCUUUCGAAAGAAAGAGUAGUGUGCUCUUAAGGU |
|
[ reference structure ]
|
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|
| [ predicted structure ] |
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|
|
CRW_00671
|
[ FASTA input ]
|
AACUAUGACUCAACCUUUUGAGGGUCAUUAAAGCGGCGUGAAAACGUUCGCUAGUGAUCUGAAGCCUUUUCAGGUUGCGACACUGUCAAAUUGCGGGGAAGCCCUAAAGAUUCAACUACUAAGCAGCUUGUGGAAACACAGCUGUGGCCGAGUUAAUAGCCCUGGGUAUAGUAACAAUGUUGAAUAUGAAUCUUGAUUGAAGAUGAAAUGGGUGAUCCGCAGCCAAGUCCUAAGGACGUAUAAUGUCUAUGGAUGCAGUUCAACGACUAGAUGGCAGUGGGUGUUGUUAAGACUUAGGUUUUUACAAUGCUUAAGGUAUAGUCUAUUCUCUAUCGAAAGAUAGCGUAUGGUGCUC |
|
[ reference structure ]
|
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|
| [ predicted structure ] |
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|
|
CRW_00672
|
[ FASTA input ]
|
AACUAUGACUCAACCUUUUGAGGGUCAUGAAAGCAGCGUGAAAACGUUUGCUAGUGGUCAAGUUGGGUAUUCUGAUUUGACUGCGACACUGUCAAAUUGCGGGGAAGCCCUAAAGCCUUAUUCACCAAGCAAUUGUGGAAACACUCUUGUGGCCAGGUUAAUAGCCUCGGGUAUGGUAACAGUAGUAAGGAUAAAUGUGAAAAAUGGGUUAUCCGCAGCCAAAUCCUAAGGGGAAAAAGAAUUACAAAUCCGUAUUUUCAUCCUAUGGAUGCAGUUCAACGACUAGACGGCAGUGGGUACUGCUCUUUUUUACUCUGAGUAGUGCUUAAGGUAUAGUCUGUCCUUUUCUGAAAAGAGAGGGAGGGGAGGUGCUCUUAAGGU |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((..........)))))))...((((((((....))).))))).(((((((((((((.....)))))))))))))..(((((((....((((((....(((.....(((((((((((..(((((((((....)))))))))..(((((((...))))).))....)))....).)))))))...............)))...))))))(((..((((...((((.((((................))))..))))..))))..)))...[.[[[[[...)))))))((((((((((...........)))))))))).......]]]]]]((.(((((((....)))))))........))...........
|
| [ predicted structure ] |
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|
|
CRW_00674
|
[ FASTA input ]
|
UAACAAGGUUUUGUUCUCGAGUAACGAGGAUGGAUAUUGAUCCUUCCGCGGUGACACUCACAGAAGCCUUUGCAGCCUCGCAAGAGUUUGGCGCGACAGUAAAGAAUGCCUGGAUGCAAGUCAGCGACGCUGGCAACACUUUCGAAUUGCGGGGACGUCCUUAGAGCUCAGUUCUACCAACCAGUGAGGGAAACCUCCGCUGGGGCCUAUGCUAAAAACAUGGGAGAUGGUAAGAAGGAACUGAGAUUGGAUAAUCCGCAGCCAAGCCCUAAGGUGUGGAAGCACUAUGGGACAGGUUCACAGACUAAGUGGAAGUGGGUGGCAUGCGUUAAGGCGUGUGCUGCUUAAGAUAUAGUCGGUCUUGCUGAGAAAUCAUCAAGAAGUCACUGCACAGAUUGAACGUUCCGUA |
|
[ reference structure ]
|
....((((((((......((((..(((((((((((....))))))))))).....))))...))))))))(((((((((....)))))(((..................)))..)))).((((((...))))))..(((((((....((((((....(((......((((((((((((..(((((((((....))).))))))..((((((.......))))))....)))....).))))))))...)))...))))))(((..((((...(((((....)))))..))))..)))...[.[[[[[...)))))))((((((((((((....)))))))))))).......]]]]]]((((((((((....))))))))...................))........
|
| [ predicted structure ] |
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|
|
CRW_00676
|
[ FASTA input ]
|
CUUGGUCAUUUAGAGGAAGUAAAAGUCGUAACAAGGUUUUGUUCUCGAGUAACGAGGAUGGAUUGGACUCCCUUCCGCGGUGACACUCACAGAAGCCUUUGCAGCCUCGCAAGAGGUCUGGCGCGACAGUAAAGAAUGCCUGAUGCAAGUCAGUUCGCUGGCAACACUUUCGAAUUGCGGGGACGUCCUGAGAGCUCGGUUCUACCAACCAGCAGAGAAAUCUAGCCGGGGCUGAUGUUAACAGCAUCGGAGGGUAAGAAUGAAUCGAGAUUGGAUGAUCCGCAGCCAACCCCUAAGGCUUGCUGCUAUGGGAGAGGUUCACAGACUAAGUGGAAGUGGGUGGUAUGCUCUAGCGUACUGCUUAAGAUAUAGUCGGUCUCUGCUGGAAACAGCGGAGAAGUCACUGCACAUGAAACGUUCCGUAGGUGAACCU |
|
[ reference structure ]
|
................................((((((((......((((..((.(((((((......).)))))).)).....))))...))))))))(((((((((....)))))..((((.............))))...)))).(((((....)))))..(((((((....((((((....(((......((((((((((((..((.(((((....))).)).))..((((((.......))))))..)))....).))))))))...)))...))))))(((...(((...(((.....)))..)))...)))...[.[[[[[...)))))))((((((((((....)))))))))).......]]]]]]((((((((((....)))))))).................)).................
|
| [ predicted structure ] |
.....................((((((.......))))))...((((.....))))....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................(((((....))))).......................................
|
|
CRW_00692
|
[ FASTA input ]
|
GCGUAUAGGGGCGAAAGACUAAUCGAAUCAUUAAGGAAUAGACCAAGCUCUAGGUGAUUGAGAAACCCCUUUGGUAUUAGUCCUGGAGACAGGGCGACAUUGUCAAAUUGUUCGGGGACCACCUGUUAAAUUAUAUGCUACUGCAGCAGUGCUGAAAGGCCUGUGAGCACUGAGGGUAACGCCCUCAGGGAUGGUAAUAACGCAUAUAUAGGGUAUAUCCGCAGCGAAGUUCUAAGGCUUCGAGCUAUGAAUCGCGUUCACAGACUAGACGGCAAUGGGCUCCUCGCGGGGCUUAAGAUAUAGUCGAACCCCUCAGAGAUGAGGAUGGAAUCAAUGCUAGUAGCUGGUUCCUGCCGAAGUUUCCCUCAGGA |
|
[ reference structure ]
|
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|
| [ predicted structure ] |
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|
|
PDB_00005
|
[ FASTA input ]
|
GGGAGCUCAACUCUCCCCCCCUUUUCCGAGGGUCAUCGGAACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((.......)))))(((...[[[[[[)))...]]]]]]...
|
| [ predicted structure ] |
.((.(.........))).......(((((......)))))....
|
|
PDB_00012
|
[ FASTA input ]
|
GGCAGAUCUGAGCCUGGGAGCUCUCUGCC |
|
[ reference structure ]
|
..(((....((((......)))).)))..
|
| [ predicted structure ] |
.(((((...((((......))))))))).
|
|
PDB_00213
|
[ FASTA input ]
|
GGCGGUACUAGUUGAGAAACUAGCUCUGUAUCUGGCGGACCCGUGGUGGAACUGUGAAGUUCGGAACACCCGGCCGCAACCCUGGGAGAGGUCCCAGGGUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((..))))))))))))))....((((..(((.((((((((((..))))))....)))))))))))((((((((((....))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
.......((((((....))))))...........((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))..
|
|
PDB_00553
|
[ FASTA input ]
|
GGCCAGAUCUGAGCCUGGGAGCUCUCUGGCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...((((......)))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
...............................
|
|
PDB_00716
|
[ FASTA input ]
|
AUGGCCGGCAUGGUCCCAGCCUCCUCGCUGGCGCCGGCUGGGCAACACCAUUGCACUCCGGUGGUGAAUGGGAC |
|
[ reference structure ]
|
..(((((((...{{{{{{(((.[[.....))))))))))]]...(((((..........)))))....}}}}}}
|
| [ predicted structure ] |
....(((((.(((..(((((......)))))..)))))))).................................
|
|
PDB_00810
|
[ FASTA input ]
|
GGAGUUCACCGAGGCCACGCGGAGUACGAUCGAGGGUACAGUGAAUU |
|
[ reference structure ]
|
..((((((((...(((((((((...)))..)).))))..))))))))
|
| [ predicted structure ] |
....(((((....(((...((.....))......)))...)))))..
|
|
PDB_00827
|
[ FASTA input ]
|
GAGCCUUUAUACAGUAAUGUAUAUCGAAAAAUCCUCUAAUUCAGGGAACACCUAAGGCAAUCCUGAGCUAAGCUCUUAGUAAUAAGAGAAAGUGCAACGACUAUUCCGAUAGGAAGUAGGGUCAAGUGACUCGAAAUGGGGAUUACCCUUCUAGGGUAGUGAUAUAGUCUGAACAUAUAUGGAAACAUAUAGAAGGAUAGGAGUAACGAACCUAUCCGUAACAUAAUUGGCUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((..))))))))))....((((((....((((((((..(((.))).))))))))(((..((((((((..)))))))).))).....{{{{{(((((..)))))...(((((.[[[))))).....))))))((.((.....)).))......}}}}}..((..(((((((..)))))))...((((((((...]]].)))))))).........)).))))
|
| [ predicted structure ] |
.......................................((.(((.....)))))...........................................((((...............................................................))))........((((....))))............................................
|
|
PDB_01050
|
[ FASTA input ]
|
GGUUGUACGUCGCUUUGGAUAAAAGCGUCUGCGACC |
|
[ reference structure ]
|
((((((..(((((((.......))))))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
........(.((((((.....)))))).).......
|
|
PDB_01051
|
[ FASTA input ]
|
GAGACUAUCGACAUUUGAUACACUAUUUAUCAAUGGAUGUCUC |
|
[ reference structure ]
|
(((((......(((..(((((.....))))).)))...)))))
|
| [ predicted structure ] |
..(((.(((...(((.((((.......))))))).))))))..
|
|
PDB_01092
|
[ FASTA input ]
|
AAGCGCCGGACUUAAAGCCAUGGCUUUAAGUUGACGAGGGCAGGGUUUAUCGAGACAUCGGCGGGUGCCCUGCGGUCUUCCUGCGACCGUUAGAGGACUGGAAAACCACAGGCGACUGUGGCAUAGAGCAGUCCGGGCAGGAA |
|
[ reference structure ]
|
...((((((((((((((((..)))))))))))..(((...[[[[[[...)))......)))))...]]]]]](((((.{{{{{{)))))....(((.(((..((((((((((..))))))))))....))).))).}}}}}}.
|
| [ predicted structure ] |
.......................................(((((.(...((((....)))).....).))))).(............).................((((((....))))))......................
|
|
PDB_01152
|
[ FASTA input ]
|
GGAUGGGGAAAGAAGCCCCGCAAUUUCCCCAUCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((..((...)).))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
.((((((((((...((...))..)))))))))).
|
|
RFA_00603
|
[ FASTA input ]
|
UUAUACCCGCUUAAUUCAUUCAGAUCUGUAAUAGAACUGUCAUUCAACCCCAAAAAUCUAGUGCUGAUAUAACCUUCACCAAUUAGGUUCAAAUAAGUGGUAAUGCGGGACAAAAGACUAUCGACAUUUGAUACACUAUUUAUCAAUGGAUGUCUUAUUUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((..........(((.(((.....))).)))......................................((((((((........))))))))...)))))....(((((.(((..(((.(((((.......)))))))))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
....................(((.((((...)))).))).........(((.........(............)....((.((((........)).))))......)))......(((.(((......(((((.......)))))...))))))...........
|
|
RFA_00604
|
[ FASTA input ]
|
AGAUACCUCCUGUGGAUCCAUUCAGGAUUAAUGAAAUCCUGUCAUUCAACCCCAAAAAUCUUGUCAAAUUAUUGCCUCGUCUUUUGGGCACAAACAAAAGUCACGCAGGAGGUUCAGACAUUCGACAUAAGAUACACUAUUUAUCUUAUGGAAGGUCUAGUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((............(((.(((.....))).))).....................................((((((((........)))))))).....)))))..(((((.(((..(((.(((((.......))))).)))))).)))))......
|
| [ predicted structure ] |
......................(((((((.....))))))).........((..........(.(........).)....((.((...........)))).......)).......(((.(((......(((((.......)))).)...))).)))........
|
|
RFA_00605
|
[ FASTA input ]
|
GACAAUUGCUGUAUUCAUUCUCCUUUCUCGAUAGAGAUUGGAGUCAUACAACCCCAGAAACCAUUCCUUAUACCUUGAGUAUUGCUGAAUUCAGUUUAGCGUGCAUGCUCUUGGCUAUUCUCAUAGUGAUUGUCAAAUUUGGAGUUACUUAUUCGUCAAUUCAAUAUUUAUGACG |
|
[ reference structure ]
|
....(((((..........(((...(((......)))...))).....................................((((((((.......))))))))..........))))).....(((((.(((...(((.(((((.........))))))))))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
......................(((((((....)))...))))....................................................................................................................................
|
|
RFA_00606
|
[ FASTA input ]
|
GGAUAUAGGGUAGUUCUCCAUUGACUAAUCCGUCAAAUCUGUCAAACAAAACCCCAAAACCGAUCAAUAGGUGCGUUUAGCUUGAUUACACCUCUUAAAUGAAAUCUUGCAAUUCUGGAGAGCUUGAGAGGUGAAACCCCCACAGUUAGGUCAAACAUAGUUUGAGAUUUGUAUCUCAUAUGCUCUAGCUGUCCUCUCAUCUUUUUG |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((........((((((........)))...))).........................................((((((((.........)))))))).....))))).........(((((..........((((((.(((((..........((((......))))...))))).)))))))))))..........
|
| [ predicted structure ] |
........................(..((......).)..).....................................................................................................(((..((.(.....)..((..(((((....)))))....)).))..)))................
|
|
RFA_00607
|
[ FASTA input ]
|
AGUUUCUCGAUAAUUGAUCUGUAGAAUCUGUCAAGCAAAACCCCAAAACCUUACACUGAGAGCAUUUAGCCUGAUUACUCUUUAAAUCAAAUCAGGCAAUAGAGAGAAACUCGAGAGGUGAAAACCCCACAGCAUUCUGAAAUGUAUUUGGGAGUAAUCUCAUAUUAGUUUGCUGUCCUCUCAUCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((........(((......)))......................................((((((((.............))))))))....))))).......(((((..........((((((.(((((.........((((....))))...))))).)))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
........................................................................((......(.........))).........(((...(((.....(((....))).....(((((....))))).......)))..))).............................
|
|
RFA_00609
|
[ FASTA input ]
|
AGCUGGUGGAAGUGCGUCAGUCAUAGCACUGUCAACAAAACCCCAAAACCGUAAACUCAGAGCAAUUCGCCUGGUUCCUCUUUAAAGCAAAACCAGGAGGUUCCGCCAGCUACCAGAGGACGAAGUGGGCUAAGUGAAAUGAAAAUUUGAGAGUUUCUCUCCAUCACUUAGCCCCGCCUCUCAUUCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((.......((((......)))).....................................((((((((..............))))))))...)))))........(((((......((((((.(((((...........((((.....))))..))))).))).)))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
........................................................................((..(((((..............)))))..))......................(((...(((...((....))..(((((...)))))....)))...)))................
|
|
RFA_00610
|
[ FASTA input ]
|
AGUCGGCGGAAAUCAGUCAGUCAUAGCGCUGUCAACAAAACCCCAAAACCGUAAAAUUAGAGCAAUUCGCCUGGUUCCUCUUUAAAGCAAAACCAGGAGGCUCCGCCGACUCAGAGGGCACUGUGGGCUGAGCAAAAUGAAAAUUUGAGAGUUUCUCUCCAUUGCUUAGCCCUACCUCUAUCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((.......((((......)))).....................................((((((((..............))))))))...))))).......(((((.(((....(((.(((((...........((((.....))))..))))).)))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
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RFA_00611
|
[ FASTA input ]
|
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|
[ reference structure ]
|
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| [ predicted structure ] |
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|
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RFA_00613
|
[ FASTA input ]
|
UUAUACCCGCAUUUUCAUUCAGAUCUUUAAUGGAGCUGUCAUUCAACCCCAAAAAUCUAGUGCAACUACUGCCUUAACUACUUAGGCAAAAUAAGUCGUAAAGCGGGACAAGGCAUCGACAUUUGAUACAAAUAUUGAUCAAUGGAUAUCUUAUUUUUUAU |
|
[ reference structure ]
|
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| [ predicted structure ] |
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|
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RFA_00615
|
[ FASTA input ]
|
UUAUACCCGCACAUUCACUCAAAUCUGUAAUAGACUUGUCAUUCAACCCCAAAAAUCUAGUGCAAAUAUUACCUUCGCCAAUUAGGUACAAUUAAUGGUUCUCGCGGGACAAAAGACUAUCGACAUUUGAUACAUUAUUUAUCAAUGGAUGUCUUAUUUUUCUU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((.........(((.(((.....))).)))......................................((((((((.......))))))))....)))))....(((((.(((..(((.(((((.......)))))))))))))))).........
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| [ predicted structure ] |
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|
|
RFA_00620
|
[ FASTA input ]
|
UGACAAUUGCUGUAUUCAUUCUCCUUUCUCGAUAGGAAUUGGAGUCAUACAACCCCAGAAACCAUCCUUAUACCUUGAGUAUGCUGAAUUCCGUUAGCGUAGCUCUUGGCUAUUCUCAUAGUGAUUGCAUAUUUGGAGUUACUUAUUCGUCAAUUCAAUUAAAAUUCAUGACGAACCUAAAAGUACUCUGAAUGGUUAUUUUUUAUAAUU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((..........(((...(((.....)))....)))...................................((((((((......)))))))).......))))).....((((((((....(((.(((((.........((((................))))............))))).))))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
.......................((((.((.....))...))))......................................................................................................................................................................
|
|
RFA_00626
|
[ FASTA input ]
|
GUUUCCGUGUCCAUCCUUGUUAAAACAAGAAAUUUUACGGAAUAACCCAUUUUGCCCGACCGAUCAUCCACGCAGCAAUGGCGUAAGACGUAUUGAUCUUUCAGGCAGUUAGCGGGCUGCGGGUUGCAGUCCUUACCGGUAGAUGGAAAUAUUUCUGGAGAGUAAUACCCAGUCUGUUUCUCUGAUAAUUGCGCUGUUUUUCCGCAUGAAAAACGGGCAACCGACACUCUGCGCCUCUUUGAGCUGACGAUAACCGUGAGGUUGGCGACGCGACUAGACACGAGGCCAUCGGUUCACACCCGGAAAGGCGUUACUUUGCCCGCAGCUUAGUCGUCAA |
|
[ reference structure ]
|
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| [ predicted structure ] |
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|
|
RFA_00627
|
[ FASTA input ]
|
AAUUCUACGUUGAUUCUCGUUAGACCAAGAGACUUGUGGAAUAAUAAACUUUGCCUGAUCACACAAAAACGCGGCAAUGGCGUAAGACGUAAUGUGAAAUCAAGCAAUUAGCGGGCUGCGGGUUGCAGCUUGGCCGGCAAGUGGGUAAAGCUCUGUUGUCUUAAAUUCAGAAGCUACCCUUUAUAUAAAAGCGCUGUUUUUCAGAACGAAACACAGGCUUACCGAAAUAAUGCGCCCCUAUGCAGGCGACAACCGUGAGGUUGACGGCUUAGCUAGAAGACUCGGGGCCAUCGGUUUACCCGGUCAUGAGGUUAUUUUGCCCGCAGUUCUAACGCCAA |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((.....(((((........)))))....)))))))........((((((((...((((...(((..((....))......)))..))))...)))))))).....(((((((((((.......(((((((.....(((((....(((((..........)))))...)))))..........(((.(((((((((.....)))))))))))).(((((........(((((........((((((((....)))))))).................)))))..)))))....)))))))............))))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
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|
|
RFA_00628
|
[ FASTA input ]
|
CUUUCCGCGUUGAUUCUCGUUAAACAGGGAAAACGGUGGAAUUAUAAAAUUUGUCUGAUCGCGCAAAAACGCAGCAAUGGCGUAAGACGUAAUGCGAAAUCAAACAAUUAGCGGGCUGCGGGUUGCAGCUUGGCCGGCAAAUGGAAUCAGAUCUGUCGACGUAAAUCAGAGGCUAUUCCCCUAGUAAAAGUGCUGUCUUUCACAAAGAAAAGCAGGCUUACCGAGAUAAUGCGCCCCUAUGCAGGCGACAACCGUGAGGUUGACGACUUUGCGAGAAGACACGGGGCUUUCGGUUUAACUCCGGCCAUGAGGUUAUUUUGCCCGCAGCUUUGUCGAUAA |
|
[ reference structure ]
|
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|
| [ predicted structure ] |
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|
|
RFA_00630
|
[ FASTA input ]
|
GUUUCCGCACCGAAACUUGUUAAAACAAAAAGUUUAGCGGAAUAACCCAUUUUGUCUGACCGAUCAUCAACGCAGCAAUGGCGUAAGACGUAUUGAUUUUUCAGACAGUUAGCGGGCUGCGGGUUGCAGUCCUUACCGGUAGAUAGGAUCUUCUCUGGAGAGUAAUGCCCAGGCUGCUUCCCUGAUAAUUGCGCUGUGUUUCCGUAUGAAAUACAGGCAACCGACACUCUGCGCCUCUUUGAGCUGACGAUAACCGUGAGGUUGGCGACGCGAAAUAGUCACGAGGCCAUCGGUUCAUGCCCGGUAAGGCGUCACCAUGCCCGCAGCUUAGUCGUCAA |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((.......(((((....))))).......)))))))........((((((((..((((....(((..((....))......)))...))))..)))))))).....(((((((((((........(((((((.....(((((....(((((..........)))))...)))))........(((.(((((((((.....))))))))))))(((((........(((((..........((((((((....))))))))...............)))))..)))))......)))))))...........))))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
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|
|
RFA_00632
|
[ FASTA input ]
|
GUGGCCGGCAUGGCCCCAGCCUCCUCGCUGGCGCCGGCUGGGCAACGAUCCGAGGGGACUGUCCCUCUCGAGAAUCGGCAAAUGGGGCCCC |
|
[ reference structure ]
|
...((((((...[[[[[[(((........))))))))).......(((((((((((((...).)))))).)).)))).....]]]]]]...
|
| [ predicted structure ] |
....(((((.(((..(((((......)))))..)))))))).....(((((((((((.....))).)))).).)))...............
|
|
RFA_00636
|
[ FASTA input ]
|
GUGGCCGGCAUGGUCCCAGCCUCCUCGCUGGCGCCGGCUGGGCAACAUUCCGAGGGGACCGUCCUCCUCGGUAAUGGCGAAUGGGACCCA |
|
[ reference structure ]
|
...((((((...[[[[[[(((........))))))))).......(((((((((((((...).)))))))).)))).....]]]]]]...
|
| [ predicted structure ] |
...........(((((((((((.................))))..((((((((((((......)))))))).)))).....)))))))..
|
|
RFA_00639
|
[ FASTA input ]
|
GGAUGUGAGGGCGAUCUGGCUGCGACAUCUGUCACCCCAUUGAUCGCCAGGGUUGAUUCGGCUGAUCUGGCUGGCUAGGCGGGUGUCCCCUUCCUCCCUCACCGCUCCAUGUGCGUCCCUCCCGAAGCUGCGCGCUCGGUCGAAGAGGACGACCAUCCCCGAUAGAGGAGGACCGGUCUUCGGUCAAGGGUAUACGAGUAGCUGCGCUCCCCUGCUAGAACCUCCAAACAAGCUCUCAAGGUCCAUUUGUAGGAGAACGUAGGGUAGUCAAGCUUCCAAGACUCCAGACACAUCCAAAUGAGGCGCUGCAUGUGGCAGUCUGCCUUUCUUU |
|
[ reference structure ]
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|
| [ predicted structure ] |
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|
|
RFA_00642
|
[ FASTA input ]
|
UUCAAAUUUGAAAUAUUUUGCACACUUAUACUUUCAAGUGCCUUUCUACACAUUUUUCCAUGAGCACAGGAUGGUUA |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((((..................)))...((((.(((.((..........)))))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.....................................((((..((.(............).))))))..........
|
|
RFA_00643
|
[ FASTA input ]
|
AAAAAAAGUGAAAAAAUAACAGCUUUAAAGUGCCUUUCUGCAGUUAUCUGAGAGCGCCAGAUAGAGU |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((((..........)))...((((.(((.((........)))))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.....................(((((....(((......)))........)))))............
|
|
RFA_00644
|
[ FASTA input ]
|
GUUGUGUUUUAAAAUUUGAAGAAAACCAGCUUUCAAGUGCCUUUUGCAGUUAAUUGGAGAGCGCAAGAUAGGGA |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((((.................)))...((((.(((((........)).)))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
............................(((((....(((.....))).........)))))............
|
|
RFA_00645
|
[ FASTA input ]
|
AAAGAAAAGAAAAGAAAAACAGCUUUAAAGUGCCUUCUUUGCAUUGCCACAUUAGAGCGGUCUGUUAUUA |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((((..........)))...((((.((.(.((........))..)))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
..............................(((..((.(..............))))))...........
|
|
RFA_00649
|
[ FASTA input ]
|
UUCGUAUCUUAAGGAAACAGCUUUCAAGUGCCUUUACUGCAGUUUUUCAGGAGCGCAAGAUAGAUU |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((((........)))...((((.(((..((........)))))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
...........................((((..((.(............)))))))..........
|
|
RFA_00651
|
[ FASTA input ]
|
UCCAUAUCUUAAAGAAACAGCUUUCAAGUGCCUUUCUGCAGUUUUUCAGGAGCGCAAGGAAUUAA |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((((........)))...((((.(((.((........)))))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
...........................((((..(((............)))))))..........
|
|
RFA_00653
|
[ FASTA input ]
|
GUAAAAUAGAAAAACAGCUUUAAAGUGCCUUUUUUUGCAUUGCCACAUUAGAGCGGUCUGUUGAUA |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((((.....)))...((((.(((...((........))..)))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
................(((((....(((........)))..........)))))............
|
|
RFA_00654
|
[ FASTA input ]
|
UUCAUGUCUUAAAGGAAGAAACAGCUUUCAAGUGCCUUUCUCCAGUUUUUCCAUGAGCGCAAGAUUAUUA |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((((............)))...((((.(((.((.........)))))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
...............................((((..((...............))))))..........
|
|
RFA_00658
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAGCUGACGAGUCCCAAACAGGACGAAACGCGCGUCAAACUGCAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((())))....))))))
|
| [ predicted structure ] |
........((((.((((......))))........)))).........
|
|
RFA_00659
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAACUGACGAGUGCCCAAUAGGAGGAAACGCGCGUCAAACUGCAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((())))....))))))
|
| [ predicted structure ] |
........((((..(.(......).).........)))).........
|
|
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|
[ FASTA input ]
|
CCCUGGCUGACGAGUCCCAAACAGGACGAAACGCGCGUCCUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
........((((.((((......))))........))))......
|
|
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|
[ FASTA input ]
|
AUCUUUCUGACGAGUUUCAAAUAGGACGAAACGCGUGUCAUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
........((((.((((......))))........))))......
|
|
RFA_00668
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[ FASTA input ]
|
AUCCAGCUGACGAGUGCCAAAUAGGACGAAAUGUGCAUCCUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
........((.(.((.(......).))........).))......
|
|
RFA_00672
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAGCUCACGAGUCCCAAAUAGGACGAAACGCGUCCUCCAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...((())).))))))
|
| [ predicted structure ] |
.........(((.((((......))))......))).......
|
|
RFA_00673
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAGCCGACGAGUCCCAAAUAAAACGAAACGCGCGUCAAAGUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((())))....))))))
|
| [ predicted structure ] |
........((((.((..........))........)))).........
|
|
RFA_00674
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[ FASTA input ]
|
AUUCAGCUGACGAGUCCCAAAUAGGACGAAGUGACGCGCGUCCUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))......(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
........((((.((((......))))...........))))......
|
|
RFA_00675
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAACUGACCAGUCGGAAAUAGGACGAAACGCGCGUCCAGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
........(((..(((........))).........)))......
|
|
RFA_00677
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAGCUGACGAGUCCUAAAUAGGGUGAAACGCGCGUCCUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
........((((.((((......))))........))))......
|
|
RFA_00678
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAGCUGACGAGUCCCAAAUAGGACGAACGCACUUCCUAGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))..(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
........((.(.((((......)))).......).))......
|
|
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|
[ FASTA input ]
|
AUCCAGUUGACGAGUCCCAAAUUGGACGAAACGCGCGUCAAACUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((())))....))))))
|
| [ predicted structure ] |
........((((.((((......))))........)))).........
|
|
RFA_00684
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAGCCGAUGAGUUCCAAACAGGACUAAACGCGCUUCUUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
........((.(.((((......))))........).))......
|
|
RFA_00685
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAACCGAUGAGUCCCAAAUAGAACGAAACCUGCGUCCUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
........((((.((.(......).))........))))......
|
|
RFA_00704
|
[ FASTA input ]
|
AUUUAGCUGACGAGUCCCAAACGGUACGAAACUGGCGUCCUUGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
........((((.((.(......).))........))))......
|
|
RFA_00705
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAGUUGAUGAGUCCCAGAGAAGGACGAAACGUGCAUCCUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((.......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
........((((.((((.......))))........))))......
|
|
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[ FASTA input ]
|
CAAUUGCUGAGGAGUCCCAUAAUAGGACGAAACGGCCGUCCAGUGC |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((.......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
........((.(.((((.......))))........).))......
|
|
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[ FASTA input ]
|
GCACUGCUGAGGAGUCCCACAAUAGGACGAAACGACCGUCCAGUAC |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((.......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
........((.(.((((.......))))........).))......
|
|
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[ FASTA input ]
|
GCACUUCUGAAGAGUCCCAUGCUAGGACGAAACAGCCUUCCAGUAC |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((.......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
........((((.((((.......))))........))))......
|
|
RFA_00709
|
[ FASTA input ]
|
AUCUAGCUGACGAGUCCCGAAUAGGAGGAAGUGCUCGUUCAAUAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
........((((..(((......))).........))))......
|
|
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[ FASTA input ]
|
AUCUAAAUGACGAGUCCUAAAUGGAACUAAACACAUGUGUUUGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
.........(((.((.(......).))........))).......
|
|
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|
[ FASTA input ]
|
CGACUGCUGAGGAGUCCCACAAUAGGGCGAUACGGACGUCCAGUGC |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((.......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
........((.(.((((.......))))........).))......
|
|
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[ FASTA input ]
|
GGCUAGCAGUGGAAUCCAAAUAGGACGAAACGCGCGUCCUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((.....))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
........(..(..((.......)).........)..)......
|
|
RFA_00716
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[ FASTA input ]
|
ACUCCGUGACAAGUCUCGAAUAGGACGAAAUGUGCGUCCUAGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((......((((......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
.......(((..((((......)))).........)))......
|
|
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|
[ FASTA input ]
|
AUCCAGCUGACGAGUCCCAAAUAAGACGAACGCGCGUCUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))..(((())))))))))
|
| [ predicted structure ] |
........((((.(((........))).......)))).....
|
|
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|
[ FASTA input ]
|
CUUUCCCGAGGCCACGGCGAGUAGCAUCGAGGGUACAGGAAAG |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
.(((((....(((...((.....))......)))...))))).
|
|
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|
[ FASTA input ]
|
GGAAGCCGCGGCCACGCCGAGUAGGAUCGAGGGUACAGCUUCC |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
.(((((....(((...((.....))......)))...))))).
|
|
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|
[ FASTA input ]
|
GAGAGCCGAGGCCACGCCGAGUAGGAUCGAGGGUACAGCUCUC |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
.(((((....(((...((.....))......)))...))))).
|
|
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|
[ FASTA input ]
|
CAGUGCCGGGGCCACGCGGCGUACGAUCGUGGGUACAGCACUA |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
.(((((....(((...((.....))......)))...))))).
|
|
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|
[ FASTA input ]
|
GGAGACCGCGGCCACGCCGAGUAGGAUCGAGGGUACAGUCUCC |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
.(((((....(((...((.....))......)))...))))).
|
|
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[ FASTA input ]
|
ACUCGCCGAGGCCACGCCGAGUAGGACCGAGGGUACAGCGAGU |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
.(((((....(((...((.....))......)))...))))).
|
|
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|
[ FASTA input ]
|
ACUACCCGAGGCCACGCCGAGUUAGGAUCGAGGGUACAGGUAGU |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((......))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
.(((((....(((...((......))......)))...))))).
|
|
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|
[ FASTA input ]
|
GGGAGCCGCGGCCACGCCGAGUAGGAUCGAGGGUACAGCUCCC |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
.(((((....(((...((.....))......)))...))))).
|
|
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|
[ FASTA input ]
|
CAGUGCCAGGGCCACGCGGAGUACGAUCGAGGGUACAGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
..((((....(((...((.....))......)))...))))..
|
|
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|
[ FASTA input ]
|
CAGUGCCGAGGCCACUCGGAGUACGAUCGAGGGUACAGCACUA |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
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|
|
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|
[ FASTA input ]
|
UGAUGCCGAGGCCACGCCGGGUAGGAUCGAGGGUACAGCAUCG |
|
[ reference structure ]
|
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|
| [ predicted structure ] |
.(((((....(((...((.....))......)))...))))).
|
|
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[ FASTA input ]
|
CAAUCCCGAGGCCACGCCGAGUAGGAUCGAGGGUACAGGAUUG |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
.(((((....(((...((.....))......)))...))))).
|
|
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[ FASTA input ]
|
GAAAGCCGAGGCCACGCCGAGUAGGAACGAGGGUACAGCUUUC |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
.(((((....(((...((.....))......)))...))))).
|
|
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|
[ FASTA input ]
|
UUGGUCUUGCACACAACGGUAAGCCAGUGGUAAUGUCAGUGCAAGAAGGAUAUUACCAUAGCA |
|
[ reference structure ]
|
....((((((((..............[[[.[[[[[[[.))))))))..]]]]]]].]]]....
|
| [ predicted structure ] |
...........................((.(((((((...........))))))).)).....
|
|
RFA_00770
|
[ FASTA input ]
|
CUACUCUUGUACAGAAUGGUAAGCCAAGUGUCAAUAGGAGGUACAAGCAACCUAUUGCAUAUUA |
|
[ reference structure ]
|
....((((((((...............[[[.[[[[[[[..))))))))..]]]]]]]]]]....
|
| [ predicted structure ] |
............................((.(((((((............))))))))).....
|
|
RFA_00773
|
[ FASTA input ]
|
CUAGUCUUAUACACAAUGGUAAGCCAGUGGUAGUAAAGGUAUAAGAAAUUUGCUACUAUGUUA |
|
[ reference structure ]
|
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|
| [ predicted structure ] |
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|
|
RFA_00779
|
[ FASTA input ]
|
CUACUCUUGUACAGAAUGGUAAGCACGUGUGAUGGGAGGUACAAGCAACCCCAUUACAUAUUA |
|
[ reference structure ]
|
....((((((((..............[[[[[[[[[[..))))))))...]]]]]]]]]]....
|
| [ predicted structure ] |
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|
|
RFA_00781
|
[ FASTA input ]
|
GUCUGUACUAGUUGGCCGACUAGCUCUGUACCUGGCGGACCCGUGGUGGAACUGACGAGUUCGGAACACCCGGCCGCAACCCUGGGAGACGUCCCGGGGAC |
|
[ reference structure ]
|
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|
| [ predicted structure ] |
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|
|
RFA_00786
|
[ FASTA input ]
|
GUUUGUACUAGUUGGCCGACUAGCUCUGUACCUGGCGGACCCGUGGUGGAACUGACGGGUUCGAGACACCCGGCCGCAACCCUGGGAGACGUCCCAAGGAC |
|
[ reference structure ]
|
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|
| [ predicted structure ] |
.......((((((....))))))...........((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((.(((((....))))).))..
|
|
RFA_00791
|
[ FASTA input ]
|
GUCUGUACUAGUUGGCUAACUAGAUCUGUAUCUGGCGGUCCCGCGGAAGAACUGACGAGUUCGUAUUCCCGGCCGCAGCCCCUAGGAGACGUCCCAGCGGCC |
|
[ reference structure ]
|
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|
| [ predicted structure ] |
.......((((((....))))))...........((((..(((.(((((((((....)))))...)))))))))))..(((.(.(((....))).)).))..
|
|
RFA_00792
|
[ FASTA input ]
|
GCCUGUACUAGUUGGCUGACUAGACCUGUAUCUGGCGGUUCCGUGGAAGAACUGACGAGUUCGGAGUUCCCGGCCGCAACCCUGGGAGACGUCCCGGGGAC |
|
[ reference structure ]
|
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|
| [ predicted structure ] |
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|
|
RFA_00801
|
[ FASTA input ]
|
GUCUGUACUAGUUAGCUAACUAGAUCUAUAUCUGGCGGGUCCGCGGAAGAACUGACGAGUUCGUAUUCCCGACCGCAGCCCUAGGGAGACGUCCUAGGGUC |
|
[ reference structure ]
|
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|
| [ predicted structure ] |
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|
|
RFA_00808
|
[ FASTA input ]
|
CUUCCGAUGUAGGCCCGUAUUCUUCGCCUGUACCACGGGUCGGUUUUAGUACAGGCGUUUUCUU |
|
[ reference structure ]
|
...........(((((((......[[[[[[[[[.))))))).......]]]]]]]]].......
|
| [ predicted structure ] |
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|
|
RFA_00809
|
[ FASTA input ]
|
CUUCCGAUGUAGACCCGUCCUCCUUCGCCUGCGUCACGGGUCCUGGUUAGACGCAGGCGUUUUCUG |
|
[ reference structure ]
|
...........(((((((.......[[[[[[[[[.))))))).......]]].]]]]]].......
|
| [ predicted structure ] |
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|
|
RFA_00814
|
[ FASTA input ]
|
ACGUAGCUUAAAACGUUUGGUUCACAUACAUCUGCCUGCUGCCUUGGCACAAUAUCAAAAAGGCAUAAACAUCGCACAUAAUGGUUAUUUACGGCUAUGAGGAUGGUUUUAGUACGUAGGCGUUGCGGAACUUCGGUUCGGAUAGAGCAAUGAAUCGUGCAUGCUAGGAACUGACCAAAUAACGCAGCCCUAGUAUCUUUCGAAGAUUUCCAUACCUUUGCGAUC |
|
[ reference structure ]
|
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|
| [ predicted structure ] |
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|
|
RFA_00815
|
[ FASTA input ]
|
ACGUAGCUGAGCGCGUUUGAUAUAGUGAUAAAUGCCUGCUGCCUGGGCUCAACAUCAAAUGCAGGCAUAAACAUCGCAACUAGCAACAAGGAGGAUGGUUUUUAGUACGUAGGCAUUGCGGAACCCUCAACGUGAAGAAGUUCAGAUAGAGCAAUGAAUCGUGCAUGCUAGAGUCAUUGGUUCGACCUAGUAUCUUUCGAAGAUUUCCAUUCCUUCGCGAUC |
|
[ reference structure ]
|
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|
| [ predicted structure ] |
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|
|
RFA_00816
|
[ FASTA input ]
|
GCUUGAUCUCUGUAUUUGUUUCUAUUUUGAACAUUUGCCUGCUACCUUGGCAUAACAUCAAUAAGGUACAAACAUCGCAAAAAGUCAUCAUAAGGUGGGUUUUAGUACGUAGGCGCUGUAGAACUUAAUUGUUCUGAUAGAGCAGCGAGUCGUGCAUGCUAGUCUAACAUUUCUUGCUACCUAGUAUCUUUAGAAGAUUUCCCUCCCUUAGCGGUC |
|
[ reference structure ]
|
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|
| [ predicted structure ] |
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|
|
RFA_00817
|
[ FASTA input ]
|
AUGUACUAACCUCUAGCUUUUCUUAUACCUUUUGCCUGCUACCUUGGCAUUACAUCUAAAAAGGUACAAACAUCGCAUUGUCAUAAAGAGGUGGUUUUAGUACGUAGGCGCUGUGGGACUUCAUUGUCCCGGUGAUGCAGUGAAUCGUGACUACGAGAUUGUCCAGUAGUUGGUGCUCGUAUCUUUAGAAGAUUUCCUUCCUCGGCGAUC |
|
[ reference structure ]
|
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|
| [ predicted structure ] |
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|
|
RFA_00818
|
[ FASTA input ]
|
ACCUAGCCGAAACACUAUGUUGGAAAGAAGACGCUUGCUACCUAGGCAUAAUGUAAAAUUAGGUAUAAACAUCGCAGUUGUAAACUUGAGGUGGUUUAGUACGUAGGCGUGAUGAUGACUUGUUGAAGUGAAACCACGAAUCGUGCUCGCUAUUACGUUGGCCCUUAAUAGUAUCUAUGAAGAUUUCCCAUCCUCAGCGGUC |
|
[ reference structure ]
|
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|
| [ predicted structure ] |
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|
|
RFA_00819
|
[ FASTA input ]
|
ACUUAGCUAAAUCGUUUGGUUCAAAACAUUUGCUUGCUGUCUUGGCAUAACAUCAAUAAAGGCAUAAACAUCGCAAAAUAAUGGUUAUAAUUAAAUGGCUAUGAGGAUGGUUUUAGUACGUAGGCGUUGCGGAACUUCGGUUCAUAUAGAGCAAUGAAUCGUGCAUGCUAGGAAAACUGACCACACACAGUGUUGGCAGACCUAGUAUCUUUCGAAGAUUUCCAUACCUCCGCGAUC |
|
[ reference structure ]
|
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|
| [ predicted structure ] |
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|
|
SRP_00016
|
[ FASTA input ]
|
GGUGGGCUAGGCCGGGGGGUUCGGCGUCCCCUGUAACCCGAAACCGCCGAUACGCGGGGGCCGAAGCCGAGGGGAGGCCUGUCAAGCGGGCGGCAGCGGUUCCAGGCACCGCAGAGUCCUCGUCCCGGAGGGCCGGCGGUUAUGGCCGGGCUGCCCGGAGGGGCUGUCCGCCAUAUUAGCCGGGGGGAACGGCCCAGGCCCGGAAGGGAGCAGGCUAACCCCGGACGACCGGCGCUUCCGGGGGUGCGGGGAGGAGGUGCCUGGGGCUUCAAGCCGCCCGUAAGGCAGGUCGACCCGAGGCGUGCCCACC |
|
[ reference structure ]
|
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| [ predicted structure ] |
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|
|
SRP_00130
|
[ FASTA input ]
|
GAGUAUUACUGGACUAGACCGGGGAGCUAGGCACUCCCUGUGACCCGUGCCGAAAUGCGGGGGCGACUGUCUGGUGAGGGCAACCAGGCCUUUGGCAGUCUUCAUGAAAUCGUAGAGUCUCUGUCCUUUUGGAUCGGGGGUUUGCAUAUGCAACUUCAAAGGAUGAUGCAUAUACAAUCUGUCGGGAAAACCCCGCCAGGCCCGGAAGGGAACACCGGUAUUCCGAACCAUCGAUGCUGAGAGGGUGCGGGGAGGAGAGGAAGUGGAGGACGCUACCAAAACACCUGGUCUGAACCAGAUGUGUCCAGUAUUAUGG |
|
[ reference structure ]
|
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|
| [ predicted structure ] |
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|
|
SRP_00142
|
[ FASTA input ]
|
GGACUAGGCCGGGCGGUUUGGCUCCGCCCGACACCCGUGAGACAGUCAUCAGCGGGGGCCGAACACCGGGCGCGUCCGACCGCCGCGGUCGGCCCCGGAAGCCAACGUGGAAGCCUCGUCCGUCGGGGACGGCGGUCCGCGGCGUGCGCCCGCAGGGGCGUUCCGUCGUGGUUCGACGGUGGCAACCCGCCAGGCACGGAAGUGAGCAGCGGACCACCGAACGCCCGUCGCUCGACGGGUCGCGGGGUGGAGAAGGCGACCGGGACUACCCGGCCGGGAACGCCGGGCUACCCCGACUGUCCAC |
|
[ reference structure ]
|
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|
| [ predicted structure ] |
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|
|
SRP_00143
|
[ FASTA input ]
|
GAUGGACUAGGUCGGGGGGCUAGGCCCCCCUCCUUGCCCGCACUGUGGUCUUGAGCGGGGACCGAACACCGGGGGCGUCCGGUCUGACGGACGUGGACCCCGUGAGCUAACGUGGAAGCCUCGUCCCACGGGGACGGCGGUCCGCGUGGUCGCACCUGCAGGGGUGCGCCCACGUGGUUAAACGAUGGCACUCCGCCAGGCACGGAAGUGAGCAGCGGACCAUCGAACACCCGUCGCUCGUGGGGUCGCGGGGUGGAGGAGGCAAACGGGAUUACCCGCGUCCGAACGCCGGGCCAUCCUGGCUGUCCGUUCCAUU |
|
[ reference structure ]
|
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|
| [ predicted structure ] |
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|
|
SRP_00144
|
[ FASTA input ]
|
GGACUAGGUCGGGCAGUUAGGCCCUGCUCUUCACCCGCGAAAUAGGUCUUUAGCGGGGACCGAACACGGGCGCGUCCGGUCAGACCGGCGCGGGCCCCGGAAGCCAACGUAGAAACCUCGUCCUUCGGGGACAGCGGUUCCGCGUACCCCUUCCGCAGGGAAGGGUUCGCGCGGUUUAUCGGUGGUACCCCGCCAGGCGCGGAAGCGAGCAGCGGACCAUCGGACGUGCGUCGCUCGAGGGAUCGCGGGGUGGAGGAGGCAACCGGGAUUCCCCACGUCGGAACGCCGGGCAACCUCGCUGUCCAC |
|
[ reference structure ]
|
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| [ predicted structure ] |
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|
|
SRP_00197
|
[ FASTA input ]
|
UGAUGAGCUAGUCCGGGUAGCCCGGCGUUACCUGUAACCCGAAAUCGCCGAUAUGCGGGGGACGAAGCCAAUGGAAGAUGCGUCAAAGGGAUUCCAGCCUGUGAUCUCAACUGAGAAACCCCGUCCUGCUUGGAUGAUGCAGGUAUGUGGACUUGCUGGAAAACAGGUCCUCAUACCCUAACUGCGGAAACCGGUCGAGGCCCGGAAGGGAGCAGACUCACUGUGGGCAACCGUCGCUUGCGGGGUCGCGGGGUGGAGAAGAGAUUCCAGUCUACUGAAAUCUCCCAGAUACAACGACCUGCGGUGUGCUCAUCA |
|
[ reference structure ]
|
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|
| [ predicted structure ] |
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|
|
SRP_00198
|
[ FASTA input ]
|
GCUGAUGAGCUAGUCCGGGUAGCCCGGCGUUACCUGUAACCCGAGAUCGCCGAUACGCGGGGGACGAAGCCAAGGGAAGAUGCGUCGAAGGGACUCCAGCCUGGAAUCUCAACGGAGAAGCCCCGUCCUGCUUGGAUGGUGCAGGUAUGCGGGUUUGCUGGAGAGCAGGUCUUCAUACCAUAACUGCGGAAACCGGUCGAGGCCCGGAAGGGAGCAGACUUACUGUGGGCAACUAUCGCUUGCGGGGCUGCGGGGUGGAGAAGAGGUCCCAGUCUCCUGGUAUCUCCAAGAUUCAACGACCCGAGGCGUGCUCAUCGCUU |
|
[ reference structure ]
|
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|
| [ predicted structure ] |
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|
|
SRP_00199
|
[ FASTA input ]
|
GUGGCGGGCUAGUCUGGGUAGGCCGGCGUUACCUAUAACCCGAAAUCGUCGAUAUGCGGGAGACGAAGCCAAAAGAAGUUGUUUUGAUCAUAUCUAAACCUGUGAUCUCAACUGAGAAGCCCCGUCCUGCUUGGAUGAUGUUGGUAGAAGAACUAAUUGGAGAAUUGGUUUUCCUAUCUUUACAGUGGGAACCAGUCGAGGCCCGGAAGGGAGCAGACCUACCAUUGACAUUUGUCGCUUGUAGGGCUGCGGGGUGGAGGAGAGGUUGCAGAUCAUUUGGAUUUGUGACAAGCGGCAACUCGCGGUAUGCCCGCCACUUU |
|
[ reference structure ]
|
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|
| [ predicted structure ] |
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|
|
SRP_00201
|
[ FASTA input ]
|
AGGCUAGGCCGGGGGGUUAGGGGUCCCCUGUAAGCGCAAAUCCCCUAUAUGGCGCGGCCGAAGCCCAGGAGGCGGCAAGACCGCCAGACAUCGGCCUGAGGGUUAAACAAUGAAGCCUCGUCCCACAGGGCCACCGGUGGCGAGGGUCCAGCUGGAGGGCUGGACCUAAUCGCCUUUGCUGCGGGAACGGGUCAGGCCCGGAAGGGAGCAGCCCUACCGCAGACGGAUGGUGCUUGUGGGUCAACGGGGUGGAGUCUAUAACCCUCAGAUCACCGGUGUCUGGUGGUCUUGUCCACUCCUGGGCGUGCCU |
|
[ reference structure ]
|
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|
|
SRP_00202
|
[ FASTA input ]
|
GGUGUGCAUGGCUAGGCCGGGGGGUUGGGCGUCCCCUGUAACCCGAAAUCGCCCUUAUGCGGGGGCCGAAAACUUGGGGGCGGCAUGUCCUCCAGUCCUUCCUUCCCAGACUCCUCGAUGAGGUCUCGUCCCGUGGGGCUCGGCGGUGGGGGAGCAUCUCCUGUAGGGGAGAUGUAACCCCCUUUACCUGCCGAACCCCGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACGGUAGGCAGGACGUCGGCGCUCACGGGGGUGCGGGACGGAGAAGGAAUCUGGGGGCGAGGGAGGACUGGAGGACAUGCCCACCCCAAGGAAGCCAUGCACACCACUUUU |
|
[ reference structure ]
|
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|
| [ predicted structure ] |
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|
|
SRP_00203
|
[ FASTA input ]
|
GGGCUAGGCCGGCGGGCUGGCGGUCCGCUGUAACCCGAAAUCCGCCUCAUGCGGGGGCCGAAGCCGAGGGGGCGGCCCGGUCCCCCGGAGUACCGGCCCCCCGGACCCGACCGAUGACCCUCCGGCCCCCCGGGGGCCCGGGGUGGCGGGGCCGCCGCCGGAGGGCGGCGCGCCACCGCCUUUGCCGGGGCACCGGGUCAGGCCCGAGAGGGAGCAGCCCACCCCGGACCCGCGGCCGCUCGGGGGUCGCCGGAGGCAGGUCGGCCGGGGGAGUACCGGGCUCCGGGGGCCGGGUCCACCCCUCGGCGCGCCC |
|
[ reference structure ]
|
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|
| [ predicted structure ] |
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|
|
SRP_00204
|
[ FASTA input ]
|
GUGGCUAGGCUGGGAAGUUAGGCGUUUCCUGUAACUCGAAAUCGCCUUUGCGAGAGCCGAAAACUUGAGGGCGGUUUUAAAUUCUGUCGCCCAUUCUCAAGUUUUGUGUAGACAUUUCGUCCUUUGGGGUAAGAUGGAGGAGGAACCUUUUUUGUAAGAAAAAGACAAACCUCCCUUAUCUUUCGAACCCCGUCAGGCCCGGAAGGGAGCAGCGGUAGAAAGAACUUCAACGCUCAGAGGGUUGCGGAAUCGAGCAGAACUUGAGGUACAAUGGGUUUCAGGAUUUUUCACCCACCUCAAGGAAGCCACUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.(((((((((((.....)))))))....((((............)))))))).....(((((((..(((...(((.((((..(((((((((((((((((((.(....(((((((((((((.(.(..((.((.(((((...(((((((....))))))).....))))).)..((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))).).)).))...))))))...))))))).).))))))))))))....)))))))..))).).)))..)))..)))))))..)))))).....
|
| [ predicted structure ] |
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|
|
SRP_00206
|
[ FASTA input ]
|
UGGGCUAGACCGGAGGGUUAGGGGUCCUCUGUAAGCGCAAAUCCCCUAUACGGCGCGGUCGAAGUUCAGGGGACGGCUGAUCGACUGUUUAUCGGCCCUGCUGAUUGGUGUCGAAGCCUCGUCCCGCAGGAUCAGUGGUGAUGGGGCCCUGACUGGAGGGUCAGGGUAAACCAUCUUAGUCAUGGGAACGGGUCAGGCCUGGAAAGGAGCAGCCCUACCAUGGACAGCUGAUGCUUGCGGAUUAACGGGGUGGAGCCAGUCAGCGGGAUCACCGGUAAAUGGAAGGUCUGUCAACCCCUGAACGUGCCCA |
|
[ reference structure ]
|
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|
| [ predicted structure ] |
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|
|
SRP_00208
|
[ FASTA input ]
|
UGGCUAGGCUGGGAGGUUAGGCGUCUCCUGUAACUUGAAAUCGCCUUUGCGAGAGCCGAAAACUUGGGGGCGGCAUAAGUUCCCAAAUUUCAUUCUUAAUUAGUAUGUCGACGUUUCGUCCUUUGGGGUAAGAUGGUAAGAGACUCUCUUUCUUAAGAAAGAGUCAAACUCUUUUCGUAUUUCGAAACCCGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACGGUAGAAUUUACUUCGACGCUCAAGGGGUAGCGGGGCUGAGUACUAAUUAAGGCAAAAUGAGAUUUGGUGCUUUUGUCCACCCCAAGGAAGCCA |
|
[ reference structure ]
|
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|
| [ predicted structure ] |
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|
|
SRP_00255
|
[ FASTA input ]
|
GCUGGACUUGGCCGGGAAGCCAGGCACUUCCUGUUACCCGAAGCCUAAAUGCGGGGGCGACAGCCGGUUGAGGGCAACCAGGCCUCCAUAGGGUCCCUGUGGAAGCAAUGAAUCUCUGUCCUCCUUGGUCCUGGGUUUAUGCGUGCAUUUCCAAAGGGAGAUGCAUGCAUAAUCUGUCCGGUGAACCCGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACGGUGGCUGGAACCAAGGAUGCUAGGAGGGUGCGGGGACGAGUGGAAGCAGGGGGCAGCCCUAUGGGCGCCUGGUCCGAUUCCGGCGUGUCCAGCAUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.(.(((((((((.......))))))....((((...........))))))).)..(((((.....((....(.((..((((((((((.(((.(.(..((......(((((((((((((..(..((.((.((((((((((((((((....))))))))))))))))....((((((....(((.....(((....))).....)))..)))))).))..)).)...))))))..)))))))...)).....).).)))..))))))))))...)).).))....)))))..))))))).....
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| [ predicted structure ] |
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|
|
SRP_00276
|
[ FASTA input ]
|
GGCGGCGGGCUAGGCCGGGGGGUUCGGCGUCCCCUGUAACCGGAAACCGCCGAUAUGCCGGGGCCGAAGCCCGGGGGGCGGUUCCCAAAGCCGCUCCCAGAAGCCGAGGUCGAACGAUGAGUCCUCGUCCCGCGGGGUGCCCGGUGGGGGAGGCACGGCUGAAGGGCCGUGCUAACCCCCUUUGGGCCCCGAACCCCGCAAGGCCCGGAAGGGAGCAGCGGUAGGGGCCACGGAGCACGCUCGCGGGGGUGCGGGGAUGAGAUAGGCCUCGGUGGAUGGGAGCGGUGGAGGGUUCCCACCCUCGGGCGUGCCCGCCGCC |
|
[ reference structure ]
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SRP_00278
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SRP_00321
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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| [ predicted structure ] |
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SRP_00322
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SRP_00323
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SRP_00330
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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| [ predicted structure ] |
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SRP_00332
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[ FASTA input ]
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GGCGGCGGGCUAGGCCGGGGGGUUCGGCGUCCCCUGUAACCGGAAACCGUCGAUACGCCGGGGCCGAAGCCCGGGGGGCGGUUCCCGAAGCCGUUCCCGGAAGCCGGGGCACAACGGUGAUCCCUCGUCCCACGGGGCCGGCGGUGGGCGGGGUCCGGCUGGAGGGCCGGGCUAACGCCCUUUGCCCGCCGAACCCCGUCAGGCCCGGAAGGGAGCAGCGGUAGGCGGGACGUUCGGCGCUCGUGGGGUAGCGGGGGUGAGCGAGCCCCGGUGGAAGGGGACGGUGGAGGGUCCCCACCCCCGGGCGCGCCCGCCGCC |
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[ reference structure ]
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| [ predicted structure ] |
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SRP_00339
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[ FASTA input ]
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UGUGCCAGACUUGGCCGGGGGGUUAGGCGUCCCCUGUACCCGAAGUCUAGAUGCGGGGGCGACAGCCCGGUGAGACCACCUGGGUUUCUGUCAGGCCCCGUGGAAUCAUUGAUCCUCUGUCCCUCUGGAUCGGAGGCCUGCAUGUACAUCCUCAAAGGAGGGUGUAUGUGCAGCCUACCAGGGGAACGCGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACGACACCCUGGACUCUCGAUGCUGGAGGGGUGCGGGGGUGAGAGGAAGCGGGGGGUACCUGGCAGGACGCCCAGACCGAACCGGGUGUG |
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[ reference structure ]
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| [ predicted structure ] |
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