|
CRW_01343
|
[ FASTA input ]
|
CACCAGGUUGAUUCUGCCUGUUAUAUGUACUAGUGUCGAAGAUUUAGCCAUGCAUGCUUUACGAAUUCACAAGAAGAAGUGGCGGACAGCUCAGUAAUACAGUUAUAAUAUACUCUCUACUAAAGGAUAACCGCGGUAAGCUGCGGGUAAAACUUCAAGCUAUGUGUUUCAUGAAAGAAUUUAUAGUUCAGAGUGUUAGUUUCUGGCCUAUUAGUUAGUAGGUAAUGUAAGGGAUUACCUAGACUAUUAUGGGUAACGGGAGAUGAAUGUCUGAUACCGGAGAGGAAGCCUUAGAAACCGCUUUCACGUCCAAGGAUGGCAGCAGGCGCGAAACUUACCCAAUCGUUUUUUAAGACGGAGGUAGUUAUGACACAUGUGAAUUAUUCACGAGGAAGAUCAAUAAAUCAGAUUUUUUUUACUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAGUAGUGCAUAUACAUGCUGUAGUUAGAAAGUUUGUAGCCGUAUAAGCUUGAAUCAGAGGAAAGGAGGACUCUUAAGGUAAACUUUAACUCUGGUCAAUGCUUAUAUUCGAAGCGGAUGGAGGCACUUGUAUUCAAUAGCGAGAGGUAAAAUUUGAUGACCUAUUGAGGACAAUCAGUAGCGAAAGCGAGUGUCUAGUACGCGUUUGAGGGUCAAGAACGUUAGCCGGAGGAUCGAAGAUGAUUAGAUACCGUUGUAGUUCCGGCCGUAAACCAUGCCUACUUGCCUUGUACAUAGUAUGAAGCAUAGAGAAAUUAAGAGUUUUUGGGCUCUAGGGAUAGUAAUCCGGCAACGGACAAACUUAAAGAAAUUGGCGGAAGGACACCACAAGGAGUGGAUUGUGCGGCUCAACUUGACUCAACACGGGAAAUCUUACCAGGGUCUGUAUAUGUGAGACUGUCCCAUUUAUGGUGGUACACGAUAAUAUACUGAGUGGUGCAUGGCCGUUUUCAACACGUGGGGUGACCUGUCAGGUUUAUUCCGGUAACGUGUGAGGUCACAGUAUUAAUAAGUAUUUUAAUAGACAGCUAAUGGUAAAUUAGAGGAAGUGUGACGAUAACAGGUCAGUGAUGCCCUUAGAUACCCUGGGCUGCACGCGCAAUACAUUGAGUAAGUCAUUUACAAUAGUAAUUUUGAAACUUACUCGCUACUGGGAUCAUCCUUUGUAAUUGGGAUGUGAACGUGGAAUUCCUAGUAAUCGUAGCUCACUAAGUUACGAUGAAUGUGUCCCUGUUCUUUGCACACACCGCCCGUCGCUAUCUAAGAUGGAUGUUGAUAUGAAAUUGCUGCUUGAAUGUGAGGUACUUGAGUAUUAACAACUAGAUAAGAUAUAAGUCGUAACAAGGCUGCUAUAGAAGAAUCUGUGGCAAGAUCAUAC |
|
[ reference structure ]
|
...(((((...[[[.))))).((((((((((.(((((((((.....(((.(((..((..(((...(((....)))...)))))......(((......((((((((..((...(((((...((((....(((((((....))))))).....))))...((((((((((.......))))))))))...)))))..))))))))))(((..(.(((..((((((((.......))))))))))).....))))...((((((((....))))...))))))).((((((..........)))))).((((....))))...)))))).).......(((...((((((....)))))).)))..)).))))))..(((((...))))).(((((((((.........)))))))))..(((((((((....{{{{.....{{.)))}}.......}}}})))))).)))))))))).......(((((.....((((...(((.(((((((....((((((....(((...(((.....)))...)))....))))))....)))))))...(((((((((..(((((((((..((((((((...(((......)))......))))))))..))....(..((....)))))))))).)))))).)))...)))...))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........<<<<<<.((((((((((...))))))))))..<<..))>>....>>>....>>>.))).(((......((((....))))....)))...]]]..(((((.(((((((..((..(((((((((((((((((....((((........))))........(((((((...(((((......((((((((((...))))))))))....)))))...((.((((..(((((((((...(((((((((....))).((((......))))...))))))....((((..((((((.((...))))))))..((((((((.....))))))))....))))...)))).)))...).))))))).....)))))))...)).))))))))))...((((((((((.((((....))))...)))..)))))))......(...((((((((......))))))))...).....))))).....((((((((.......))))))))......))...)))))))))).))....((.((.(.((((((((..((((((((((((((((((((((((........))))))))))))))))))))))))..))))))))..).))..))....((((((((((....))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
...(((((.......))))).((((((((((.((((((((......(((.(((.......((..(((......)))..)).((......(((.......(((((((..((...(((((((.((((.....((((((....))))))......))))..(((((..())))))...............)))))))..)))))))))((((.((.(((..((((((((.......)))))))))))...)).))))..(((((.((....))....)))))))).(((((.............))))).((((...)))))).)))))).......(((((...(((((..))))).)))))).)))))))......((((((.)))))).((((((((((.......))))))))))..((...(.......((((((...((((...))))..))))))))).)))))))))).........((((......(((((.(.((((((((((((..((((((((....((((((((.....))))))))...))))))))...))))))))...((((((.....((((((((((.(((((((.((.(((......)))....)).))))))).))).......((....)).)))))))....))).)))..)))).).)))))...(((((((...(...((((.........))))...))))))))..........(((((...((..(((...(((......))))))..)).(....)....))))).)))).(((((((.(((((....)))))..))))...((...(((((.(((((((..((.(((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((...((((........(((.((((.....)))).)))......))))......((.((((((((((((...((((((.((....))...((((......))))..)))))).....((..((.((((..(.)...))))))..((.(((((.....))))).)).....))....)))).))))....)))).)).....)))))))...)).)))))))).)...(((((((.(((..((...))....)))....)))))))...........(((..((........)))))..........)))))).))..(((((((.......)))))))............)))))))))).))..)).)))....((((((..(((((((..((((((..(((((((............)))))))..)))))))))))))..)))..)))............((((((((((((....))))))))).....))).
|
|
PDB_00005
|
[ FASTA input ]
|
GGGAGCUCAACUCUCCCCCCCUUUUCCGAGGGUCAUCGGAACCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((.......)))))(((...[[[[[[)))...]]]]]]...
|
| [ predicted structure ] |
.....((.)).............((((..........))))...
|
|
PDB_00012
|
[ FASTA input ]
|
GGCAGAUCUGAGCCUGGGAGCUCUCUGCC |
|
[ reference structure ]
|
..(((....((((......)))).)))..
|
| [ predicted structure ] |
..........(((......))).......
|
|
PDB_00213
|
[ FASTA input ]
|
GGCGGUACUAGUUGAGAAACUAGCUCUGUAUCUGGCGGACCCGUGGUGGAACUGUGAAGUUCGGAACACCCGGCCGCAACCCUGGGAGAGGUCCCAGGGUU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((..))))))))))))))....((((..(((.((((((((((..))))))....)))))))))))((((((((((....))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
.......((((((....))))))...........((((.((.(.(((((((((....)))))....)))))))))))......((((....))))......
|
|
PDB_00553
|
[ FASTA input ]
|
GGCCAGAUCUGAGCCUGGGAGCUCUCUGGCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((...((((......)))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
(..........(((......)))......).
|
|
PDB_00716
|
[ FASTA input ]
|
AUGGCCGGCAUGGUCCCAGCCUCCUCGCUGGCGCCGGCUGGGCAACACCAUUGCACUCCGGUGGUGAAUGGGAC |
|
[ reference structure ]
|
..(((((((...{{{{{{(((.[[.....))))))))))]]...(((((..........)))))....}}}}}}
|
| [ predicted structure ] |
...(((............(((........)))........(....)................))).........
|
|
PDB_00810
|
[ FASTA input ]
|
GGAGUUCACCGAGGCCACGCGGAGUACGAUCGAGGGUACAGUGAAUU |
|
[ reference structure ]
|
..((((((((...(((((((((...)))..)).))))..))))))))
|
| [ predicted structure ] |
.(((...((....(((.((((.....))..))..)))...)).))).
|
|
PDB_01050
|
[ FASTA input ]
|
GGUUGUACGUCGCUUUGGAUAAAAGCGUCUGCGACC |
|
[ reference structure ]
|
((((((..(((((((.......))))))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
...........(((((.....)))))..........
|
|
PDB_01051
|
[ FASTA input ]
|
GAGACUAUCGACAUUUGAUACACUAUUUAUCAAUGGAUGUCUC |
|
[ reference structure ]
|
(((((......(((..(((((.....))))).)))...)))))
|
| [ predicted structure ] |
...........................................
|
|
PDB_01092
|
[ FASTA input ]
|
AAGCGCCGGACUUAAAGCCAUGGCUUUAAGUUGACGAGGGCAGGGUUUAUCGAGACAUCGGCGGGUGCCCUGCGGUCUUCCUGCGACCGUUAGAGGACUGGAAAACCACAGGCGACUGUGGCAUAGAGCAGUCCGGGCAGGAA |
|
[ reference structure ]
|
...((((((((((((((((..)))))))))))..(((...[[[[[[...)))......)))))...]]]]]](((((.{{{{{{)))))....(((.(((..((((((((((..))))))))))....))).))).}}}}}}.
|
| [ predicted structure ] |
...((((.(((((((..........)))))))..(((............))).......)))).........(((((.......)))))................((((((....))))))......................
|
|
PDB_01152
|
[ FASTA input ]
|
GGAUGGGGAAAGAAGCCCCGCAAUUUCCCCAUCC |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((..((...)).))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
...(((((((.(..((...))..))))))))...
|
|
RFA_00390
|
[ FASTA input ]
|
GAUAAGUCUGUGCUAAGCACACUGAUGAGUCUCUGAAAUGAGACGAAACUUAUC |
|
[ reference structure ]
|
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
|
| [ predicted structure ] |
......................................................
|
|
RFA_00416
|
[ FASTA input ]
|
CAAAAGUUUGGGCUAAAGCCCACUGAUGAGCCGCUGAAAUGCGGCGAAACUUUUG |
|
[ reference structure ]
|
.((((((.(((((....))))).......((((........))))...)))))).
|
| [ predicted structure ] |
.......................................................
|
|
RFA_00433
|
[ FASTA input ]
|
GAAGAGUCUGCGCUAAGCGCACUGAUGAGUCUUUGAAAUAAGACGAAACUCUUC |
|
[ reference structure ]
|
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
|
| [ predicted structure ] |
......................................................
|
|
RFA_00587
|
[ FASTA input ]
|
GGCUGGUCCGAUUGCAGUGGUACUUAUAAUUAAUUGAUCACAGUCAGUUACAGGUUUCUUUGUUCUUUCUCCACUCCCACUGCUUCACUUGACUAGUCU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((.....(((((((........................................................))))))).......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
...................................................................................................
|
|
RFA_00603
|
[ FASTA input ]
|
UUAUACCCGCUUAAUUCAUUCAGAUCUGUAAUAGAACUGUCAUUCAACCCCAAAAAUCUAGUGCUGAUAUAACCUUCACCAAUUAGGUUCAAAUAAGUGGUAAUGCGGGACAAAAGACUAUCGACAUUUGAUACACUAUUUAUCAAUGGAUGUCUUAUUUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((..........(((.(((.....))).)))......................................((((((((........))))))))...)))))....(((((.(((..(((.(((((.......)))))))))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
.....................................................................................................................................................................
|
|
RFA_00604
|
[ FASTA input ]
|
AGAUACCUCCUGUGGAUCCAUUCAGGAUUAAUGAAAUCCUGUCAUUCAACCCCAAAAAUCUUGUCAAAUUAUUGCCUCGUCUUUUGGGCACAAACAAAAGUCACGCAGGAGGUUCAGACAUUCGACAUAAGAUACACUAUUUAUCUUAUGGAAGGUCUAGUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((............(((.(((.....))).))).....................................((((((((........)))))))).....)))))..(((((.(((..(((.(((((.......))))).)))))).)))))......
|
| [ predicted structure ] |
.....................................................................................................................................................................
|
|
RFA_00605
|
[ FASTA input ]
|
GACAAUUGCUGUAUUCAUUCUCCUUUCUCGAUAGAGAUUGGAGUCAUACAACCCCAGAAACCAUUCCUUAUACCUUGAGUAUUGCUGAAUUCAGUUUAGCGUGCAUGCUCUUGGCUAUUCUCAUAGUGAUUGUCAAAUUUGGAGUUACUUAUUCGUCAAUUCAAUAUUUAUGACG |
|
[ reference structure ]
|
....(((((..........(((...(((......)))...))).....................................((((((((.......))))))))..........))))).....(((((.(((...(((.(((((.........))))))))))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
...............................................................................................................................................................................
|
|
RFA_00606
|
[ FASTA input ]
|
GGAUAUAGGGUAGUUCUCCAUUGACUAAUCCGUCAAAUCUGUCAAACAAAACCCCAAAACCGAUCAAUAGGUGCGUUUAGCUUGAUUACACCUCUUAAAUGAAAUCUUGCAAUUCUGGAGAGCUUGAGAGGUGAAACCCCCACAGUUAGGUCAAACAUAGUUUGAGAUUUGUAUCUCAUAUGCUCUAGCUGUCCUCUCAUCUUUUUG |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((........((((((........)))...))).........................................((((((((.........)))))))).....))))).........(((((..........((((((.(((((..........((((......))))...))))).)))))))))))..........
|
| [ predicted structure ] |
...............................................................................................................................................................................................................
|
|
RFA_00607
|
[ FASTA input ]
|
AGUUUCUCGAUAAUUGAUCUGUAGAAUCUGUCAAGCAAAACCCCAAAACCUUACACUGAGAGCAUUUAGCCUGAUUACUCUUUAAAUCAAAUCAGGCAAUAGAGAGAAACUCGAGAGGUGAAAACCCCACAGCAUUCUGAAAUGUAUUUGGGAGUAAUCUCAUAUUAGUUUGCUGUCCUCUCAUCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((........(((......)))......................................((((((((.............))))))))....))))).......(((((..........((((((.(((((.........((((....))))...))))).)))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
.............................................................................................................................................................................................
|
|
RFA_00609
|
[ FASTA input ]
|
AGCUGGUGGAAGUGCGUCAGUCAUAGCACUGUCAACAAAACCCCAAAACCGUAAACUCAGAGCAAUUCGCCUGGUUCCUCUUUAAAGCAAAACCAGGAGGUUCCGCCAGCUACCAGAGGACGAAGUGGGCUAAGUGAAAUGAAAAUUUGAGAGUUUCUCUCCAUCACUUAGCCCCGCCUCUCAUUCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((.......((((......)))).....................................((((((((..............))))))))...)))))........(((((......((((((.(((((...........((((.....))))..))))).))).)))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
..............................................................................................................................................................................................
|
|
RFA_00610
|
[ FASTA input ]
|
AGUCGGCGGAAAUCAGUCAGUCAUAGCGCUGUCAACAAAACCCCAAAACCGUAAAAUUAGAGCAAUUCGCCUGGUUCCUCUUUAAAGCAAAACCAGGAGGCUCCGCCGACUCAGAGGGCACUGUGGGCUGAGCAAAAUGAAAAUUUGAGAGUUUCUCUCCAUUGCUUAGCCCUACCUCUAUCUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((.......((((......)))).....................................((((((((..............))))))))...))))).......(((((.(((....(((.(((((...........((((.....))))..))))).)))))))))))........
|
| [ predicted structure ] |
..........................................................................................................................................................................................
|
|
RFA_00611
|
[ FASTA input ]
|
UUAUACCCGCAUAUCAUUCAGACCCUUUAUGGAACUGUCAUUCAACCCCAAAAAUCUAGUGCAAAUAUUGUCUUAAUUACUUAGGCUAAAAGAAAUAAGUAUUAAAGCGGGACAAGGCAUCGACAUUUGAUACAAAUAUUGAUCAAUGGAUGUCUUAUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((........(((.(((.....))).)))......................................((((((((............))))))))...)))))..((((((((..(((.(((((........))))))))))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
..................................................................................................................................................................
|
|
RFA_00613
|
[ FASTA input ]
|
UUAUACCCGCAUUUUCAUUCAGAUCUUUAAUGGAGCUGUCAUUCAACCCCAAAAAUCUAGUGCAACUACUGCCUUAACUACUUAGGCAAAAUAAGUCGUAAAGCGGGACAAGGCAUCGACAUUUGAUACAAAUAUUGAUCAAUGGAUAUCUUAUUUUUUAU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((.........(((.(((.....))).)))......................................((((((((.......))))))))...)))))..((((((((..(((.(((((........)))))))))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
.................................................................................................................................................................
|
|
RFA_00615
|
[ FASTA input ]
|
UUAUACCCGCACAUUCACUCAAAUCUGUAAUAGACUUGUCAUUCAACCCCAAAAAUCUAGUGCAAAUAUUACCUUCGCCAAUUAGGUACAAUUAAUGGUUCUCGCGGGACAAAAGACUAUCGACAUUUGAUACAUUAUUUAUCAAUGGAUGUCUUAUUUUUCUU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((.........(((.(((.....))).)))......................................((((((((.......))))))))....)))))....(((((.(((..(((.(((((.......)))))))))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
....................................................................................................................................................................
|
|
RFA_00620
|
[ FASTA input ]
|
UGACAAUUGCUGUAUUCAUUCUCCUUUCUCGAUAGGAAUUGGAGUCAUACAACCCCAGAAACCAUCCUUAUACCUUGAGUAUGCUGAAUUCCGUUAGCGUAGCUCUUGGCUAUUCUCAUAGUGAUUGCAUAUUUGGAGUUACUUAUUCGUCAAUUCAAUUAAAAUUCAUGACGAACCUAAAAGUACUCUGAAUGGUUAUUUUUUAUAAUU |
|
[ reference structure ]
|
.....(((((..........(((...(((.....)))....)))...................................((((((((......)))))))).......))))).....((((((((....(((.(((((.........((((................))))............))))).))))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
..................................................................................................................................................................................................................
|
|
RFA_00626
|
[ FASTA input ]
|
GUUUCCGUGUCCAUCCUUGUUAAAACAAGAAAUUUUACGGAAUAACCCAUUUUGCCCGACCGAUCAUCCACGCAGCAAUGGCGUAAGACGUAUUGAUCUUUCAGGCAGUUAGCGGGCUGCGGGUUGCAGUCCUUACCGGUAGAUGGAAAUAUUUCUGGAGAGUAAUACCCAGUCUGUUUCUCUGAUAAUUGCGCUGUUUUUCCGCAUGAAAAACGGGCAACCGACACUCUGCGCCUCUUUGAGCUGACGAUAACCGUGAGGUUGGCGACGCGACUAGACACGAGGCCAUCGGUUCACACCCGGAAAGGCGUUACUUUGCCCGCAGCUUAGUCGUCAA |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((.....(((((........))))).....)))))))........((((((((..((((....(((..((....))......)))...))))..)))))))).....(((((((((((........(((((((.....(((((....(((((..........)))))...)))))........(((.(((((((((.....))))))))))))(((((........(((((..........((((((((....))))))))..............)))))..)))))......)))))))...........))))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
.....................................................(((((((..((((...((((.((....))....).)))..))))..))))))).......(((((((((((..........((((...................................................(((.((((.((((.....)))).)))))))(((((........(((((..........((.(((((....))))).))..(........)..)))))..))))).......)))).............))))))))))).........
|
|
RFA_00627
|
[ FASTA input ]
|
AAUUCUACGUUGAUUCUCGUUAGACCAAGAGACUUGUGGAAUAAUAAACUUUGCCUGAUCACACAAAAACGCGGCAAUGGCGUAAGACGUAAUGUGAAAUCAAGCAAUUAGCGGGCUGCGGGUUGCAGCUUGGCCGGCAAGUGGGUAAAGCUCUGUUGUCUUAAAUUCAGAAGCUACCCUUUAUAUAAAAGCGCUGUUUUUCAGAACGAAACACAGGCUUACCGAAAUAAUGCGCCCCUAUGCAGGCGACAACCGUGAGGUUGACGGCUUAGCUAGAAGACUCGGGGCCAUCGGUUUACCCGGUCAUGAGGUUAUUUUGCCCGCAGUUCUAACGCCAA |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((.....(((((........)))))....)))))))........((((((((...((((...(((..((....))......)))..))))...)))))))).....(((((((((((.......(((((((.....(((((....(((((..........)))))...)))))..........(((.(((((((((.....)))))))))))).(((((........(((((........((((((((....)))))))).................)))))..)))))....)))))))............))))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
..................................................((((.((((..((((...((((.((....))....).)))..))))..)))).)))).....(((((((((((.......((((((....................................................((((.((((.((((.....)))).))))))))(((((........(((((........((.(((((....))))).))....((........)).)))))..))))).....))))))............))))))))))).........
|
|
RFA_00628
|
[ FASTA input ]
|
CUUUCCGCGUUGAUUCUCGUUAAACAGGGAAAACGGUGGAAUUAUAAAAUUUGUCUGAUCGCGCAAAAACGCAGCAAUGGCGUAAGACGUAAUGCGAAAUCAAACAAUUAGCGGGCUGCGGGUUGCAGCUUGGCCGGCAAAUGGAAUCAGAUCUGUCGACGUAAAUCAGAGGCUAUUCCCCUAGUAAAAGUGCUGUCUUUCACAAAGAAAAGCAGGCUUACCGAGAUAAUGCGCCCCUAUGCAGGCGACAACCGUGAGGUUGACGACUUUGCGAGAAGACACGGGGCUUUCGGUUUAACUCCGGCCAUGAGGUUAUUUUGCCCGCAGCUUUGUCGAUAA |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((.....(((((........)))))....)))))))........((((((((...((((...(((..((....))......)))..))))...)))))))).....(((((((((((.......(((((((.....(((((....((((...........))))....))))).........(((.(((((((((.....)))))))))))).(((((........(((((........((((((((....)))))))).................)))))..)))))......)))))))............))))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
....................................................((.((((..((((...((((.((....))....).)))..))))..)))).)).......(((((((((((.......((((((...................................................((((.((((.((((.....)))).))))))))(((((........(((((...(((((((.(((((....))))).))..)))))..........)))))..))))).......))))))............))))))))))).........
|
|
RFA_00630
|
[ FASTA input ]
|
GUUUCCGCACCGAAACUUGUUAAAACAAAAAGUUUAGCGGAAUAACCCAUUUUGUCUGACCGAUCAUCAACGCAGCAAUGGCGUAAGACGUAUUGAUUUUUCAGACAGUUAGCGGGCUGCGGGUUGCAGUCCUUACCGGUAGAUAGGAUCUUCUCUGGAGAGUAAUGCCCAGGCUGCUUCCCUGAUAAUUGCGCUGUGUUUCCGUAUGAAAUACAGGCAACCGACACUCUGCGCCUCUUUGAGCUGACGAUAACCGUGAGGUUGGCGACGCGAAAUAGUCACGAGGCCAUCGGUUCAUGCCCGGUAAGGCGUCACCAUGCCCGCAGCUUAGUCGUCAA |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((.......(((((....))))).......)))))))........((((((((..((((....(((..((....))......)))...))))..)))))))).....(((((((((((........(((((((.....(((((....(((((..........)))))...)))))........(((.(((((((((.....))))))))))))(((((........(((((..........((((((((....))))))))...............)))))..)))))......)))))))...........))))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
.....................................................(((((((..((((...((((.((....))....).)))..))))..))))))).......(((((((((((.........(((((...................................................(((.((((.((((.....)))).)))))))(((((........(((((..........((.(((((....))))).))....(.......)..)))))..))))).......)))))............))))))))))).........
|
|
RFA_00632
|
[ FASTA input ]
|
GUGGCCGGCAUGGCCCCAGCCUCCUCGCUGGCGCCGGCUGGGCAACGAUCCGAGGGGACUGUCCCUCUCGAGAAUCGGCAAAUGGGGCCCC |
|
[ reference structure ]
|
...((((((...[[[[[[(((........))))))))).......(((((((((((((...).)))))).)).)))).....]]]]]]...
|
| [ predicted structure ] |
...(((............(((........)))........(....)..............................)))............
|
|
RFA_00636
|
[ FASTA input ]
|
GUGGCCGGCAUGGUCCCAGCCUCCUCGCUGGCGCCGGCUGGGCAACAUUCCGAGGGGACCGUCCUCCUCGGUAAUGGCGAAUGGGACCCA |
|
[ reference structure ]
|
...((((((...[[[[[[(((........))))))))).......(((((((((((((...).)))))))).)))).....]]]]]]...
|
| [ predicted structure ] |
...(((............(((........)))........(....).............................)))............
|
|
RFA_00639
|
[ FASTA input ]
|
GGAUGUGAGGGCGAUCUGGCUGCGACAUCUGUCACCCCAUUGAUCGCCAGGGUUGAUUCGGCUGAUCUGGCUGGCUAGGCGGGUGUCCCCUUCCUCCCUCACCGCUCCAUGUGCGUCCCUCCCGAAGCUGCGCGCUCGGUCGAAGAGGACGACCAUCCCCGAUAGAGGAGGACCGGUCUUCGGUCAAGGGUAUACGAGUAGCUGCGCUCCCCUGCUAGAACCUCCAAACAAGCUCUCAAGGUCCAUUUGUAGGAGAACGUAGGGUAGUCAAGCUUCCAAGACUCCAGACACAUCCAAAUGAGGCGCUGCAUGUGGCAGUCUGCCUUUCUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((.(((((((.((...((....((((((((((.(((((..(((((((...........))).)))))))..))...)))))))))).)).))..)))))))...))).......((((((((((.((.....))))))(((....(((......))).)))..)))).)).............................(((...((.((((((......((((..(((((.............))))).))))...)))))).))...)))......................(((.((((((((((.....)))))..)))))..)))
|
| [ predicted structure ] |
..............((((((.....................(((((((...........)).))))).(((((((.......)).....................................((((.(.....)..))))...........................................................)))))..........))))))................................................................................................................
|
|
RFA_00642
|
[ FASTA input ]
|
UUCAAAUUUGAAAUAUUUUGCACACUUAUACUUUCAAGUGCCUUUCUACACAUUUUUCCAUGAGCACAGGAUGGUUA |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((((..................)))...((((.(((.((..........)))))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
....((((((...................(((....)))((......................))..))))))....
|
|
RFA_00643
|
[ FASTA input ]
|
AAAAAAAGUGAAAAAAUAACAGCUUUAAAGUGCCUUUCUGCAGUUAUCUGAGAGCGCCAGAUAGAGU |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((((..........)))...((((.(((.((........)))))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.....................(((((....(((......)))........)))))............
|
|
RFA_00644
|
[ FASTA input ]
|
GUUGUGUUUUAAAAUUUGAAGAAAACCAGCUUUCAAGUGCCUUUUGCAGUUAAUUGGAGAGCGCAAGAUAGGGA |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((((.................)))...((((.(((((........)).)))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
....((((((..................(((....)))((.....)).................))))))....
|
|
RFA_00645
|
[ FASTA input ]
|
AAAGAAAAGAAAAGAAAAACAGCUUUAAAGUGCCUUCUUUGCAUUGCCACAUUAGAGCGGUCUGUUAUUA |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((((..........)))...((((.((.(.((........))..)))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.....................(((((....(((.......)))..........)))))............
|
|
RFA_00649
|
[ FASTA input ]
|
UUCGUAUCUUAAGGAAACAGCUUUCAAGUGCCUUUACUGCAGUUUUUCAGGAGCGCAAGAUAGAUU |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((((........)))...((((.(((..((........)))))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
...................(((((....(((.......)))........)))))............
|
|
RFA_00651
|
[ FASTA input ]
|
UCCAUAUCUUAAAGAAACAGCUUUCAAGUGCCUUUCUGCAGUUUUUCAGGAGCGCAAGGAAUUAA |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((((........)))...((((.(((.((........)))))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
....((((((.........(((....)))((......))................))))))....
|
|
RFA_00653
|
[ FASTA input ]
|
GUAAAAUAGAAAAACAGCUUUAAAGUGCCUUUUUUUGCAUUGCCACAUUAGAGCGGUCUGUUGAUA |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((((.....)))...((((.(((...((........))..)))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
................(((((....(((........)))..........)))))............
|
|
RFA_00654
|
[ FASTA input ]
|
UUCAUGUCUUAAAGGAAGAAACAGCUUUCAAGUGCCUUUCUCCAGUUUUUCCAUGAGCGCAAGAUUAUUA |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((((............)))...((((.(((.((.........)))))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
....((((((.............(((....)))((.....................))..))))))....
|
|
RFA_00658
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAGCUGACGAGUCCCAAACAGGACGAAACGCGCGUCAAACUGCAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((())))....))))))
|
| [ predicted structure ] |
................................................
|
|
RFA_00659
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAACUGACGAGUGCCCAAUAGGAGGAAACGCGCGUCAAACUGCAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((())))....))))))
|
| [ predicted structure ] |
................................................
|
|
RFA_00664
|
[ FASTA input ]
|
CCCUGGCUGACGAGUCCCAAACAGGACGAAACGCGCGUCCUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
.............................................
|
|
RFA_00667
|
[ FASTA input ]
|
AUCUUUCUGACGAGUUUCAAAUAGGACGAAACGCGUGUCAUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
.............................................
|
|
RFA_00668
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAGCUGACGAGUGCCAAAUAGGACGAAAUGUGCAUCCUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
.............................................
|
|
RFA_00672
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAGCUCACGAGUCCCAAAUAGGACGAAACGCGUCCUCCAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...((())).))))))
|
| [ predicted structure ] |
...........................................
|
|
RFA_00673
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAGCCGACGAGUCCCAAAUAAAACGAAACGCGCGUCAAAGUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((())))....))))))
|
| [ predicted structure ] |
................................................
|
|
RFA_00674
|
[ FASTA input ]
|
AUUCAGCUGACGAGUCCCAAAUAGGACGAAGUGACGCGCGUCCUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))......(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
................................................
|
|
RFA_00675
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAACUGACCAGUCGGAAAUAGGACGAAACGCGCGUCCAGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
.............................................
|
|
RFA_00677
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAGCUGACGAGUCCUAAAUAGGGUGAAACGCGCGUCCUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
.............................................
|
|
RFA_00678
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAGCUGACGAGUCCCAAAUAGGACGAACGCACUUCCUAGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))..(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
............................................
|
|
RFA_00680
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAGUUGACGAGUCCCAAAUUGGACGAAACGCGCGUCAAACUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((())))....))))))
|
| [ predicted structure ] |
................................................
|
|
RFA_00684
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAGCCGAUGAGUUCCAAACAGGACUAAACGCGCUUCUUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
.............................................
|
|
RFA_00685
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAACCGAUGAGUCCCAAAUAGAACGAAACCUGCGUCCUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
.............................................
|
|
RFA_00695
|
[ FASTA input ]
|
CUUUCCCUGAAGAGACGAAGUGAUCAAGAGAUCGAAGACGAGUGAACUAAUUUUUUUUUAAUAAAAAGUUCACCACGACUCCUCCUUCUCUCACAAGUCGAAACUCAGAGUCGGAACAG |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((..............................................................................))))...((((.)))).)))).))
|
| [ predicted structure ] |
.......................................................................................................................
|
|
RFA_00703
|
[ FASTA input ]
|
CUUUCCCUGAAGAGACGAAGUGAUCAAGAGAUUGAAGACGAGUGAACUAACGACUCCUCCUUCUCUCACAAGUCGAAACUCAGAGUCGGAAAG |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((.....................................................))))...((((.)))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
.............................................................................................
|
|
RFA_00704
|
[ FASTA input ]
|
AUUUAGCUGACGAGUCCCAAACGGUACGAAACUGGCGUCCUUGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
.............................................
|
|
RFA_00705
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAGUUGAUGAGUCCCAGAGAAGGACGAAACGUGCAUCCUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((.......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
..............................................
|
|
RFA_00706
|
[ FASTA input ]
|
CAAUUGCUGAGGAGUCCCAUAAUAGGACGAAACGGCCGUCCAGUGC |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((.......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
..............................................
|
|
RFA_00707
|
[ FASTA input ]
|
GCACUGCUGAGGAGUCCCACAAUAGGACGAAACGACCGUCCAGUAC |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((.......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
..............................................
|
|
RFA_00708
|
[ FASTA input ]
|
GCACUUCUGAAGAGUCCCAUGCUAGGACGAAACAGCCUUCCAGUAC |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((.......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
..............................................
|
|
RFA_00709
|
[ FASTA input ]
|
AUCUAGCUGACGAGUCCCGAAUAGGAGGAAGUGCUCGUUCAAUAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
.............................................
|
|
RFA_00710
|
[ FASTA input ]
|
AUCUAAAUGACGAGUCCUAAAUGGAACUAAACACAUGUGUUUGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
.............................................
|
|
RFA_00711
|
[ FASTA input ]
|
CGACUGCUGAGGAGUCCCACAAUAGGGCGAUACGGACGUCCAGUGC |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((.......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
..............................................
|
|
RFA_00715
|
[ FASTA input ]
|
GGCUAGCAGUGGAAUCCAAAUAGGACGAAACGCGCGUCCUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((.....))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
............................................
|
|
RFA_00716
|
[ FASTA input ]
|
ACUCCGUGACAAGUCUCGAAUAGGACGAAAUGUGCGUCCUAGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((......((((......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
............................................
|
|
RFA_00717
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAGCUGACGAGUCCCAAAUAAGACGAACGCGCGUCUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))..(((())))))))))
|
| [ predicted structure ] |
...........................................
|
|
RFA_00730
|
[ FASTA input ]
|
CUUUCCCGAGGCCACGGCGAGUAGCAUCGAGGGUACAGGAAAG |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
|
RFA_00731
|
[ FASTA input ]
|
GGAAGCCGCGGCCACGCCGAGUAGGAUCGAGGGUACAGCUUCC |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
|
RFA_00733
|
[ FASTA input ]
|
GAGAGCCGAGGCCACGCCGAGUAGGAUCGAGGGUACAGCUCUC |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
|
RFA_00734
|
[ FASTA input ]
|
CAGUGCCGGGGCCACGCGGCGUACGAUCGUGGGUACAGCACUA |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
|
RFA_00736
|
[ FASTA input ]
|
GGAGACCGCGGCCACGCCGAGUAGGAUCGAGGGUACAGUCUCC |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
|
RFA_00737
|
[ FASTA input ]
|
ACUCGCCGAGGCCACGCCGAGUAGGACCGAGGGUACAGCGAGU |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
|
RFA_00745
|
[ FASTA input ]
|
ACUACCCGAGGCCACGCCGAGUUAGGAUCGAGGGUACAGGUAGU |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((......))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
.(((((....(((.((((......))..))..)))...))))).
|
|
RFA_00749
|
[ FASTA input ]
|
GGGAGCCGCGGCCACGCCGAGUAGGAUCGAGGGUACAGCUCCC |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
|
RFA_00758
|
[ FASTA input ]
|
CAGUGCCAGGGCCACGCGGAGUACGAUCGAGGGUACAGCACCA |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
|
RFA_00762
|
[ FASTA input ]
|
CAGUGCCGAGGCCACUCGGAGUACGAUCGAGGGUACAGCACUA |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
|
RFA_00763
|
[ FASTA input ]
|
UGAUGCCGAGGCCACGCCGGGUAGGAUCGAGGGUACAGCAUCG |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
|
RFA_00764
|
[ FASTA input ]
|
CAAUCCCGAGGCCACGCCGAGUAGGAUCGAGGGUACAGGAUUG |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
|
RFA_00765
|
[ FASTA input ]
|
GAAAGCCGAGGCCACGCCGAGUAGGAACGAGGGUACAGCUUUC |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
|
RFA_00767
|
[ FASTA input ]
|
GCACUCUCUAUCAGAUUGGAUGUCUUGCUGCUAUAAUAGAUAGAGAAGGUUAUAGCAGACUA |
|
[ reference structure ]
|
....((((((((...............[[[[[[[[[[.))))))))..]]]]]]]]]]....
|
| [ predicted structure ] |
.........(((......)))..........((((((...........))))))........
|
|
RFA_00768
|
[ FASTA input ]
|
ACACUCUCUAUCAGAAUGGAUGUCUUGCUGUCAUAACAGAUAGAGAAGGUUGUGGCAGACCC |
|
[ reference structure ]
|
....((((((((...............[[[[[[[[[[.))))))))..]]]]]]]]]]....
|
| [ predicted structure ] |
.........(((......)))...........(((((...........))))).........
|
|
RFA_00769
|
[ FASTA input ]
|
UUGGUCUUGCACACAACGGUAAGCCAGUGGUAAUGUCAGUGCAAGAAGGAUAUUACCAUAGCA |
|
[ reference structure ]
|
....((((((((..............[[[.[[[[[[[.))))))))..]]]]]]].]]]....
|
| [ predicted structure ] |
.........(((......)))......((..((((((...........))))))..)).....
|
|
RFA_00770
|
[ FASTA input ]
|
CUACUCUUGUACAGAAUGGUAAGCCAAGUGUCAAUAGGAGGUACAAGCAACCUAUUGCAUAUUA |
|
[ reference structure ]
|
....((((((((...............[[[.[[[[[[[..))))))))..]]]]]]]]]]....
|
| [ predicted structure ] |
.........(((......))).......((..((((((............)))))).)).....
|
|
RFA_00773
|
[ FASTA input ]
|
CUAGUCUUAUACACAAUGGUAAGCCAGUGGUAGUAAAGGUAUAAGAAAUUUGCUACUAUGUUA |
|
[ reference structure ]
|
....((((((((..............[[[.[[[[[[[.))))))))..]]]]]]].]]]....
|
| [ predicted structure ] |
.........(((......))).........((.(((.............))).))........
|
|
RFA_00779
|
[ FASTA input ]
|
CUACUCUUGUACAGAAUGGUAAGCACGUGUGAUGGGAGGUACAAGCAACCCCAUUACAUAUUA |
|
[ reference structure ]
|
....((((((((..............[[[[[[[[[[..))))))))...]]]]]]]]]]....
|
| [ predicted structure ] |
.........(((......))).........((((((.............))))))........
|
|
RFA_00781
|
[ FASTA input ]
|
GUCUGUACUAGUUGGCCGACUAGCUCUGUACCUGGCGGACCCGUGGUGGAACUGACGAGUUCGGAACACCCGGCCGCAACCCUGGGAGACGUCCCGGGGAC |
|
[ reference structure ]
|
..(.(..((((((....))))))..).)......((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.......((((((....))))))...........((((.((.(.(((((((((....)))))....)))))))))))......((((....))))......
|
|
RFA_00786
|
[ FASTA input ]
|
GUUUGUACUAGUUGGCCGACUAGCUCUGUACCUGGCGGACCCGUGGUGGAACUGACGGGUUCGAGACACCCGGCCGCAACCCUGGGAGACGUCCCAAGGAC |
|
[ reference structure ]
|
..(.(..((((((....))))))..).)......((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.......((((((....))))))...........((((.((.(.(((((((((....)))))....)))))))))))......((((....))))......
|
|
RFA_00791
|
[ FASTA input ]
|
GUCUGUACUAGUUGGCUAACUAGAUCUGUAUCUGGCGGUCCCGCGGAAGAACUGACGAGUUCGUAUUCCCGGCCGCAGCCCCUAGGAGACGUCCCAGCGGCC |
|
[ reference structure ]
|
..(.(..((((((....))))))..).)......((((..(((.(((((((((....)))))...)))))))))))..((.((((((....)))))).))..
|
| [ predicted structure ] |
.......((((((....))))))...........((((.((.(.(((((((((....)))))...))))))))))).......((((....)))).......
|
|
RFA_00792
|
[ FASTA input ]
|
GCCUGUACUAGUUGGCUGACUAGACCUGUAUCUGGCGGUUCCGUGGAAGAACUGACGAGUUCGGAGUUCCCGGCCGCAACCCUGGGAGACGUCCCGGGGAC |
|
[ reference structure ]
|
..(.(..((((((....))))))..).)......((((..(((.(((((((((....)))))....)))))))))))..((((((((....))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.......((((((....))))))...........((((.((.(.(((((((((....)))))....)))))))))))......((((....))))......
|
|
RFA_00801
|
[ FASTA input ]
|
GUCUGUACUAGUUAGCUAACUAGAUCUAUAUCUGGCGGGUCCGCGGAAGAACUGACGAGUUCGUAUUCCCGACCGCAGCCCUAGGGAGACGUCCUAGGGUC |
|
[ reference structure ]
|
..(.(..((((((....))))))..).)......((((..(((.(((((((((....)))))...)))))))))))..(((((.(((....))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.......((((((....))))))...........((((.((.(.(((((((((....)))))...))))))))))).......((((....))))......
|
|
RFA_00808
|
[ FASTA input ]
|
CUUCCGAUGUAGGCCCGUAUUCUUCGCCUGUACCACGGGUCGGUUUUAGUACAGGCGUUUUCUU |
|
[ reference structure ]
|
...........(((((((......[[[[[[[[[.))))))).......]]]]]]]]].......
|
| [ predicted structure ] |
........................(((((((((...............))))))))).......
|
|
RFA_00809
|
[ FASTA input ]
|
CUUCCGAUGUAGACCCGUCCUCCUUCGCCUGCGUCACGGGUCCUGGUUAGACGCAGGCGUUUUCUG |
|
[ reference structure ]
|
...........(((((((.......[[[[[[[[[.))))))).......]]].]]]]]].......
|
| [ predicted structure ] |
.........................(((((((((................))))))))).......
|
|
RFA_00814
|
[ FASTA input ]
|
ACGUAGCUUAAAACGUUUGGUUCACAUACAUCUGCCUGCUGCCUUGGCACAAUAUCAAAAAGGCAUAAACAUCGCACAUAAUGGUUAUUUACGGCUAUGAGGAUGGUUUUAGUACGUAGGCGUUGCGGAACUUCGGUUCGGAUAGAGCAAUGAAUCGUGCAUGCUAGGAACUGACCAAAUAACGCAGCCCUAGUAUCUUUCGAAGAUUUCCAUACCUUUGCGAUC |
|
[ reference structure ]
|
.......................................((((((..............)))))).....(((((......................(((((.(((.....(((((....(((((((((((....)))))......))))))...))))).((((((......................))))))..............)))..)))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
................................(((....((((((..............)))))).................................(((..........(((((....((((((....................))))))...))))).(((((((....................)))))))....................))).)))...
|
|
RFA_00815
|
[ FASTA input ]
|
ACGUAGCUGAGCGCGUUUGAUAUAGUGAUAAAUGCCUGCUGCCUGGGCUCAACAUCAAAUGCAGGCAUAAACAUCGCAACUAGCAACAAGGAGGAUGGUUUUUAGUACGUAGGCAUUGCGGAACCCUCAACGUGAAGAAGUUCAGAUAGAGCAAUGAAUCGUGCAUGCUAGAGUCAUUGGUUCGACCUAGUAUCUUUCGAAGAUUUCCAUUCCUUCGCGAUC |
|
[ reference structure ]
|
.......................................((((((................)))))).....(((((............(((((.(((......(((((....(((((((((((...............)))))......))))))...))))).((((((...............))))))..............)))..)))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.......................................((((((................)))))).....(((((...........................(((((....((((((...............................))))))...))))).(((((((.............)))))))........................))))).
|
|
RFA_00816
|
[ FASTA input ]
|
GCUUGAUCUCUGUAUUUGUUUCUAUUUUGAACAUUUGCCUGCUACCUUGGCAUAACAUCAAUAAGGUACAAACAUCGCAAAAAGUCAUCAUAAGGUGGGUUUUAGUACGUAGGCGCUGUAGAACUUAAUUGUUCUGAUAGAGCAGCGAGUCGUGCAUGCUAGUCUAACAUUUCUUGCUACCUAGUAUCUUUAGAAGAUUUCCCUCCCUUAGCGGUC |
|
[ reference structure ]
|
..........................................((((((..............)))))).....(((((............(((((.(((.....(((((....(((((((((((......)))))......))))))...))))).((((((..................))))))..............)))..)))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
...................................(((....((((((..............)))))).......................(((..........(((((....((((((......................))))))...))))).(((((((................)))))))....................))).)))...
|
|
RFA_00817
|
[ FASTA input ]
|
AUGUACUAACCUCUAGCUUUUCUUAUACCUUUUGCCUGCUACCUUGGCAUUACAUCUAAAAAGGUACAAACAUCGCAUUGUCAUAAAGAGGUGGUUUUAGUACGUAGGCGCUGUGGGACUUCAUUGUCCCGGUGAUGCAGUGAAUCGUGACUACGAGAUUGUCCAGUAGUUGGUGCUCGUAUCUUUAGAAGAUUUCCUUCCUCGGCGAUC |
|
[ reference structure ]
|
.......................................((((((...............)))))).....(((((..........((((((((.....(((((....(((((((((((......)))))......))))))...))))).((((((..................))))))..............))).)))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.......................................((((((...............)))))).....(((((.......................(((((....((((((......................))))))...))))).(((((((................))))))).......................))))).
|
|
RFA_00818
|
[ FASTA input ]
|
ACCUAGCCGAAACACUAUGUUGGAAAGAAGACGCUUGCUACCUAGGCAUAAUGUAAAAUUAGGUAUAAACAUCGCAGUUGUAAACUUGAGGUGGUUUAGUACGUAGGCGUGAUGAUGACUUGUUGAAGUGAAACCACGAAUCGUGCUCGCUAUUACGUUGGCCCUUAAUAGUAUCUAUGAAGAUUUCCCAUCCUCAGCGGUC |
|
[ reference structure ]
|
......................................((((((...............)))))).....(((((...........((((((((....(((((....(((((((((((....))))).....))))))...))))).((((((..............))))))..............))).)))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
......................................((((((...............)))))).....(((((.......................(((((....((((((...................))))))...))))).(((((((............))))))).......................))))).
|
|
RFA_00819
|
[ FASTA input ]
|
ACUUAGCUAAAUCGUUUGGUUCAAAACAUUUGCUUGCUGUCUUGGCAUAACAUCAAUAAAGGCAUAAACAUCGCAAAAUAAUGGUUAUAAUUAAAUGGCUAUGAGGAUGGUUUUAGUACGUAGGCGUUGCGGAACUUCGGUUCAUAUAGAGCAAUGAAUCGUGCAUGCUAGGAAAACUGACCACACACAGUGUUGGCAGACCUAGUAUCUUUCGAAGAUUUCCAUACCUCCGCGAUC |
|
[ reference structure ]
|
.....................................((((((...............)))))).....(((((...........................(((((.(((.....(((((....(((((((((((....)))))......))))))...))))).((((((..............................))))))..............)))..)))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.....................................((((((...............)))))).....(((((.........................................(((((....((((((....................))))))...))))).((((((..............................))))))........................))))).
|
|
RFA_00820
|
[ FASTA input ]
|
GGCCGCACGGAUUCCAGUGCAUAUCUUAGUGAUACUCCAGUUAACUCUAUACUUUCCCUGCAAUACGCUAUUCGCCUUAGAUGUAUCUGGGUGGCUGCUCCACUAAAGCCCGGGAAUAUGCAACCAGUUACAUUUGAGGCCAUUUGGGCUUAAGCGUAUUCCAUGGAAAGUUAUCGUCCCACAUUUCGGAAAUUAUAUUCCGAGCCAGCAAGAAAAUCUUCUCUGUUACAAUUUGACAUAGCUAAAAACUGUACUAAUCAAAAUGAAAAAUGUUUCUCUUGGGCGUAAUCUCAUACAAUGAUUACCCUUAAAGAUCGAACAUUUAAACAAUAAUAUUUGAUAUGAUAUUUUCAAUUUCUAUGCUAUGCCAAAGUGUCUGACAUAAUCAAACAUUUGCGCAUUCUUUGACCAAGAAUAGUCAGCAAAUUGUAUUUUCAAUCAAUGCAGACCAUUUGUUUCAGAUUCGGAGAUUUUUUGCUGCCAAACGGAAUAACUAUCAUAGCUCACAUUCUAUUUACAUCACUAAGAAGAGCAUUGCAAUCUGUUAGGCC |
|
[ reference structure ]
|
((((..(((((((.((((((...((((((((((.................(((((((.((.((((((((....((((((((((((.((((...((((.(((...........))).)).))..)))).))))))))))))............)))))))).)).)))))))........................(((((((...((((((((((.((((.((((..((((((((.((((((((.(((.((.....((((((.....((((((((.(((((((.(((((...........))))))))..))))..))))))))...........))))))..........)).))).)).)))))).))))(.(((((.(((.........((((((((((((.......))))).))..)))))...............)))))))))..))))..))))....)))))))))))))).....)))))))..........................))))))))))...)))))).)))))))..))))
|
| [ predicted structure ] |
(((...((.((...((((((.(.(((((((((..................(((((.((((.((((((.....)).(((((((.((.((((.....((.(((...........))).)).....)))).)).)))))))..................)))).)).)))))))....................................................((..(((...((.((((((.........................((((((((.((((..............................))))..))))))))........(((((......))))).............)))))).)).....((((.(((..............((((((((.....)))))).))..((.....))...........))))))).....)))..))...........................................................))))))))).).))))))...)).))...)))
|
|
RFA_00830
|
[ FASTA input ]
|
GCUGCCGAGUUUUUUAAUGCAUUUUCUACUGACAUAAACUGAAGUGCCAUUAUUUGGAAACUUUAUUUGUAAAGCGUUCUUUGAUCUCAACGCUGUCUGGCUGGACAUUUGCCAAAGCCCAUGAAUGCCCAACCAGACACUGUUGAGACGAAUAUGGGCUUUAAUUGAACGCUUUACAGAAGAAGUUUAUAAAUACACAUAAAAUGCAUUUCUUUCUUAUAACUCAGGCCAACUGGCAUAGCAAGUAAAACUGUACUGAUCUAAAUGAAAAAUGUUUCUCUUCCUGAUAAUCGCACGUCCUUCUAUGGACAUUAUAUGCCAUUAUCAGUCGAAGAUCGAACGUUUAACCAAUAAUGUUCUUCAGAAUAUUUUUAAGCUUUGUUAUGCCACAGUUUGCAUGUUGCAAUUAAACAUUCUUCACGUGAGAAUUGUUUACAAAUUGUCUCUAAACACAUGUGAACCACAGGCCUCACUUAUCUAAACGAAAUCUGUACUUACUUUCAGAAUGUAAGAUAGUUUUAUCAAUUGAAAAUGCAUUCCAAAUAUGUAUCUC |
|
[ reference structure ]
|
((((.(((((((..((((((...((((((((((..........................(((((((.((.((((((((....(((.(((((((((.((((...((((.(((..........))).)).))..)))).))))))))))))..................)))))))).)).)))))))...............((((((((((((((.((((.((((..((((((((.((((((((...(((.((.....((((((.....((((((((.(((((((.(((((.............................))))).)))..))))..))))))))...........))))))..........)).).)).)))))).))))(.((.(((......((((((((((((.......))))).))..)))))..............))).)))))..))))..))))..))))))))))))..))))))........................))))))))))...)))))).)))))))..))))
|
| [ predicted structure ] |
...............(((((.(.(((((((((...........................(((((.((((.(((((..........(((((((.((.((((.....((.(((..........))).)).....)))).)).))))))).(.......).............))))).)).))))))).........................................(((...((.((((((...........................((((((((.((((.................................................))))..))))))))........(((((......)))))...........)))))).))...(((((((...........((((((((.....)))))).))..((.....))..........))))))).....))).....................................................))))))))).).)))))...............
|
|
SRP_00079
|
[ FASTA input ]
|
GCGCCGGCUGGAGUCACGUCCAGUUGUCACCCAUGUGGGGGCCAAGCGGAUGAAGGAACAUAUGGCUCUCCGGUCGUGAACGCUUCCGUCGAUAGCGUGUCCUCUUCGAGUCCACAGUCGGCAAGGUCGCUGCCCUGAUGGGUGGCUGACCUGGUUGAUGAUUAGUCCCGCACCGCGUGAGGCAGGAAACUGAGCAGCGAAAAGGGACAGCUGCGGACGGCGAAAGGAUCGCAUGCUUGAGGAGGUGCCACGACCACCCGGGGGGUCCUCUGUGGGACCAACUACCGUUU |
|
[ reference structure ]
|
..((((((((((......)))))))....((((..))))))).((((((..(..((..((((.(.......(((((((..(((((((......(((((((((..((((.((((.((((((((.((((((.(...((....))..).)))))).))))(....).(((((......(((....(((....)))....)))....))))).)))).))))..)))).))...)))))))...))))))).))))))).............).))))...))..)..))))))
|
| [ predicted structure ] |
.............................(((....))).....................................................(((((((((...((((.((((((...................((...)).......................(((((......(((....(((....)))....)))....)))))....))))))..)))).))....)))))))....................................................
|
|
SRP_00124
|
[ FASTA input ]
|
GUUCGGAUGACUAACGACCAUCUGUUACCUCAAGGUGAGGGAACUUAAGAAUUGGAAUUGGCUACUCGGAAUGUUUGAUCGUCUGAGACUACCCCAACCCAUAUCUUCGUGCAUCACUGUGUGUCUUUCGGAUGGAGGGCAACUGGGGAUGGUAAGGAACAGGGUACUGCGUGAGGCCGGCAACGGAGCAACGAAAACCUGUCCACGGAUGAUAGACCUGGGUUGAAAAGGAUGUCGAGAUCUUGCGGACCUUGUGGGUGGAACUGAUUCUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((..(...)..)))))....(((((...)))))))))..(((((((((..(((.((((..((..(((..(((..(.(((........(..(((((((.((((((((((.(((..((((((((....))))))))..))).)))).(...).(((((....(.(((....(((....)))....))).)..))))).))))))..)))....)))).......)....))).))))..)))..))..)))).)))..))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
...............................................................((((((........................(((..................((((.(((((..(((((())))))..))))).))))......(.((((.......(((....(((....)))....))).....)).)))................))).....................).)))))......................
|
|
SRP_00137
|
[ FASTA input ]
|
ACUCGGGAAAUACGUUAUUAAUAGCUUAAACUUGUCAGGACUGGAAAGUAGCAGCAAUUCAGCUUAAUUACAUAAGGUGUUUUCCGGGUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((....((.(...((((.....((((....(((....)))....))))...))))..).))....)....))))))))))...
|
| [ predicted structure ] |
...............................(((.....(((....))).....)))...................................
|
|
SRP_00141
|
[ FASTA input ]
|
GGAAACCUUCUCGGUCUCUCGCAACGGUGUCUGGUUUACUCGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCAAAGUCGGAAUUACUGUGUGCCGAGAAGAAGCUGGGAAGGUUUCCGCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((.((((((.(((((((((((((...(.(((....(((....)))....))).))))))))..)))))))...)))))....)))))))))))))))...
|
| [ predicted structure ] |
........................................(((.....(((....))).....)))...............................................
|
|
SRP_00146
|
[ FASTA input ]
|
CUCUUAUUUAGACCUAUGCAAUAGGAUUUUAGGGUAACGCUUCAGGGUAGGAAUACAGCAGAGUCCCCUAAUUUCUUGUGUGCCUUAGCCAUCUGAAUAGGAG |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((.(((.((.((((((..((((((....((((....(((....)))....)))).))))))..)))))))...).)))...))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
......................................(((.....(((....))).....))).......................................
|
|
SRP_00182
|
[ FASTA input ]
|
GCCGAGCUUUGUAACGUGGGCUUGUAACCCGAGUGGGGGCAACAAUGUGGUGGAAUGUUGGGUCCAUCUUGAUGGAUGGGCUUGAAGGGCUAAUGUUCUGGCCUGCCCUGUCCAAGCACAGAGUUGGGUCAAGUGGUCUAUACGAAAGUAUAGCCACUUGGCCUUUAGAGUGGGAUGGACUGCGUGAGGCUGGUUUCACAGAGCAACGACUAGUCCCCGCUCUGUGCAGUGGAAGGAUCACGGGCUAGUGCUCUUUGAGUCCUAACAAAAACCUGAUAGGUUGCCUAAUUAAACCAUCACUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((........))))))....((((..)))))))...((.(((((((..((((((((....((....((.(((((((((.(((.((.....((((((((.((..((((.(((((((((.(((((((((((.((((((....)))))))))))))))))((..)).(((((......(((....(((......)))....)))....))))).)))))))))..)))).))....)))))))))).))))))))))).......).))....))...)))))).))..))))))).)).
|
| [ predicted structure ] |
...........................(((....))).............................................................(((((((.((.(((((.((((((....................((....))......................(((((......(((....(((......)))....)))....)))))....))))))..)))))))....))))))).........................................................
|
|
SRP_00197
|
[ FASTA input ]
|
UGAUGAGCUAGUCCGGGUAGCCCGGCGUUACCUGUAACCCGAAAUCGCCGAUAUGCGGGGGACGAAGCCAAUGGAAGAUGCGUCAAAGGGAUUCCAGCCUGUGAUCUCAACUGAGAAACCCCGUCCUGCUUGGAUGAUGCAGGUAUGUGGACUUGCUGGAAAACAGGUCCUCAUACCCUAACUGCGGAAACCGGUCGAGGCCCGGAAGGGAGCAGACUCACUGUGGGCAACCGUCGCUUGCGGGGUCGCGGGGUGGAGAAGAGAUUCCAGUCUACUGAAAUCUCCCAGAUACAACGACCUGCGGUGUGCUCAUCA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((..(((((((((((.....)))))))....((((.(..........).))))))))...(((...((..(.((.(((...((((((.(((.(((.((((((..((.....((((((((((((.((.(((.((..((((((.(((((((.(....).))))))).))))))....((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))).))..)))))...)))))...)))))))..))..)))))).)))....))).))))))...))).)).)..))...)))..))))))))
|
| [ predicted structure ] |
.....................................................................................................................((((((..(((((.(((........(((.....(((((((...)).))))).....))).....((((((....(((......(((....))).....)))..)))))).......)).).))))).....)))))).............................................................
|
|
SRP_00198
|
[ FASTA input ]
|
GCUGAUGAGCUAGUCCGGGUAGCCCGGCGUUACCUGUAACCCGAGAUCGCCGAUACGCGGGGGACGAAGCCAAGGGAAGAUGCGUCGAAGGGACUCCAGCCUGGAAUCUCAACGGAGAAGCCCCGUCCUGCUUGGAUGGUGCAGGUAUGCGGGUUUGCUGGAGAGCAGGUCUUCAUACCAUAACUGCGGAAACCGGUCGAGGCCCGGAAGGGAGCAGACUUACUGUGGGCAACUAUCGCUUGCGGGGCUGCGGGGUGGAGAAGAGGUCCCAGUCUCCUGGUAUCUCCAAGAUUCAACGACCCGAGGCGUGCUCAUCGCUU |
|
[ reference structure ]
|
(.((((((((..(((((((((((.....)))))))....((((.(..........).))))))))...(((..(((..(.((.(((...((((..((((.((((.(((((..(......((((((((((((.((.((((((..((((((.(((((((((....))))))))).))))))....((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))).)).))))))...)))))...)))))))...)..))))).))))....))))..))))...))).)).)..)))..)))..)))))))).).
|
| [ predicted structure ] |
.......................................................................................................................((((((..(((((.(((........(((.....(((((((...)).))))).....))).....((((((.....((......(((....))).....))...)))))).......)).).))))).....))))))................................................................
|
|
SRP_00199
|
[ FASTA input ]
|
GUGGCGGGCUAGUCUGGGUAGGCCGGCGUUACCUAUAACCCGAAAUCGUCGAUAUGCGGGAGACGAAGCCAAAAGAAGUUGUUUUGAUCAUAUCUAAACCUGUGAUCUCAACUGAGAAGCCCCGUCCUGCUUGGAUGAUGUUGGUAGAAGAACUAAUUGGAGAAUUGGUUUUCCUAUCUUUACAGUGGGAACCAGUCGAGGCCCGGAAGGGAGCAGACCUACCAUUGACAUUUGUCGCUUGUAGGGCUGCGGGGUGGAGGAGAGGUUGCAGAUCAUUUGGAUUUGUGACAAGCGGCAACUCGCGGUAUGCCCGCCACUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((..((((((((((.......))))))....((((.(..........).))))))))...(((...((..(((((.(((..((.(((((((.((((((((((..((.....((((((((((((.((.((((((..(((((.((((((((((....)))))))))).)))))....((((((......(((....(((....)))....)))...)))))).))).)))))...)))))...)))))))..))..))))))))))....))))))).))...))))))))..))...)))..)))))))))...
|
| [ predicted structure ] |
......................................................................................................................((((((...................(((.....(((((((...)).))))).....))).....((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))......................)))))).................................................................
|
|
SRP_00202
|
[ FASTA input ]
|
GGUGUGCAUGGCUAGGCCGGGGGGUUGGGCGUCCCCUGUAACCCGAAAUCGCCCUUAUGCGGGGGCCGAAAACUUGGGGGCGGCAUGUCCUCCAGUCCUUCCUUCCCAGACUCCUCGAUGAGGUCUCGUCCCGUGGGGCUCGGCGGUGGGGGAGCAUCUCCUGUAGGGGAGAUGUAACCCCCUUUACCUGCCGAACCCCGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACGGUAGGCAGGACGUCGGCGCUCACGGGGGUGCGGGACGGAGAAGGAAUCUGGGGGCGAGGGAGGACUGGAGGACAUGCCCACCCCAAGGAAGCCAUGCACACCACUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((.(((((((((((.....)))))))....((((.(..........).)))))))).....(((((((..(((((((((((((((((((((((((((((.((((...(...(((((((((((((.(.(.((((((.(((((.(((((((((....)))))))))..))))).)..((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).)))))))...))))))...))))))).)...)))).))))))...)))))))))))))))))))))))..)))))))..)))))))))))))......
|
| [ predicted structure ] |
..........................................................................................................................((((((..(((((.(((.........(((........(((....))).........))).....((((((......((.....(((....))).....))...))))))......)).).))))).....))))))........................................................................
|
|
SRP_00241
|
[ FASTA input ]
|
GCUCAGGAGGAUUUAUUCUCUGUAACAUCGUGGGUUCGGUUCUGCGUGUGCUUGUAGGACUAAGAGUGAACCUGUUAUGACGCUGUGCUUUGGCUUGUCCAUUUCAAAUUAGGUGUCAACAAUGUGGGCUUAGAGUAGUCUUCGCUUUCAUGGUUGUCAAAGAAGUCGGGAAUGCCUCAGGCUGGCAACAGAGCAGGGAAAACGACUCGCACUUAAUAGUGAAAGGAUAGCAAGCCUUUAUAGCGUCGAAGGUUAUCGCUUGGCUCCUAACUGGUAUUCGCAUGGCUGUGGCAUCAAUACCUUU |
|
[ reference structure ]
|
..((.(((((((..))))))).....(((...)))..)).......(((((((..((.(((..(..((..........(...(.(((((..(((((((((.(((...(((((((((((((.(((.((((..(((....)))..)))).))).))))(...)..(((((....(.(((....(((....)))....))).)..))))).)))))))))...))).))...))))))).....))))).)....)..............))..)))).)).........).)))).))........
|
| [ predicted structure ] |
.........................(((...)))........................................................(((((((.((.(((((.((((((..................((......))......................(((((......(((....(((....)))....)))....)))))....))))))..)))))))....)))))))...................................................................
|
|
SRP_00255
|
[ FASTA input ]
|
GCUGGACUUGGCCGGGAAGCCAGGCACUUCCUGUUACCCGAAGCCUAAAUGCGGGGGCGACAGCCGGUUGAGGGCAACCAGGCCUCCAUAGGGUCCCUGUGGAAGCAAUGAAUCUCUGUCCUCCUUGGUCCUGGGUUUAUGCGUGCAUUUCCAAAGGGAGAUGCAUGCAUAAUCUGUCCGGUGAACCCGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACGGUGGCUGGAACCAAGGAUGCUAGGAGGGUGCGGGGACGAGUGGAAGCAGGGGGCAGCCCUAUGGGCGCCUGGUCCGAUUCCGGCGUGUCCAGCAUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((.(.(((((((((.......))))))....((((...........))))))).)..(((((.....((....(.((..((((((((((.(((.(.(..((......(((((((((((((..(..((.((.((((((((((((((((....))))))))))))))))....((((((....(((.....(((....))).....)))..)))))).))..)).)...))))))..)))))))...)).....).).)))..))))))))))...)).).))....)))))..))))))).....
|
| [ predicted structure ] |
..((((..............................(((.............))).........................................................((((((..(((((.(((........(((.....((((.((....)).)))).....))).....((((((....(((.....(((....))).....)))..)))))).......)).).)))))....))))))...................................................)))).......
|
|
SRP_00260
|
[ FASTA input ]
|
GUCCGGCUAUGUCCGUGCAAGUGCGGAUUUAGCUGUAACUUUCGAGGGGCAGCACUCUUGUGCAGAUAAAUGGGAUACUAUUAAGUUUAUGAGAAUUUCAAUAUUAUAUAUGUUCCCGUCUAUCACAAGACAUCAGUUACUGAGCAUAUUUUGCUGGAAAGGGAAUAUGCUGAAGUAAUGAUGAAUCAUGAACCGCCUCAGGCUGGAAACAGAGCAGGGUAAGUGGUCGCUGAUGUACGGUGUGAAGAUUACGGUUGAACAUUAAGAUAUUUCAGAAUUCUCGUAAACGUAAUAUGUACACCAUUUCUCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((.(((((((....))))))).)))))....(.((.(.....(.((((....)))).).).)).)))))(((((((.(((..((((((.(((.(.((..(...((.((((((((.(((((..((((((((((((.((((((((((.((....))))))))))))..))))(...)..(((((.....((((....(((....)))....))))..))))).))))))))....)))))))...))))..))....)).)..)).)..))))))))).)).).))))).)).............
|
| [ predicted structure ] |
...........................................................................((((((.....................((.....))((((...(((........(((.((((.....(((((..(.((((....)))))..))))).))))........(((((......(((....(((....)))....)))....)))))..)))........))).)))).............................).))))).........................
|
|
SRP_00278
|
[ FASTA input ]
|
CGGGUAGGGCCGGGGGCUCGCCCUCCCCCGAGCCCCGAAAUGGGCGUAAUGCGGGGGCCAGUAACCCGCACGUCGGCCGUAGUGGUCCAGGGCAGACCCGGCCGACCCAUGACCCCCGUCCCGCGGGGCCGGCGGCGCGGAGCCCCCUCCGGAGGGAGGGAGGCUACCGCCCUUACCGGGGGAACCAGGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACCUAACCCCGGACGCCCGGCGUUCGCGGGGCCACGGGGUGAGGCAACGGCCGGGCCCCCUGCCCUGGGCCCCUACGGCUGGCGUGCGGGGGCCGC |
|
[ reference structure ]
|
(((.(..(((((((((.......))))).....((((.(..........).)))))))).....((((((((((((((((((.((((((((((((.((((((((..((.(...((((((((((((.(.(((((((.((((((((((((((....)))))).)))).))))..)..((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).)).)))))...))))))...)))))).).))...))))))))....)))))))))))).))))))))))))))))))).))).
|
| [ predicted structure ] |
.................................(((................))).........................................................((((((..(((((.(((........((........(((....)))..........))......((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).......)).).))))).....))))))........................................................
|
|
SRP_00285
|
[ FASTA input ]
|
GCUAGUAGUGGGCAUUGCUCUUGCUUAGUUGGUCAGGUCUGAAAAGAAGCAGCCAGGGUAAGAUUCUGUGGGUCAUUACUAGUAUCA |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((.(((.(.(((((((...(((((....(((....)))....))))))))))))..).)))..)))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.............................(((.....(((....))).....)))................................
|
|
SRP_00322
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUCAGGGAGGGUGGGGGAUCUCGCCAAUCCCUAUUACCCGCAAGGCGUAAUGCGGGCACCAGUAACUCCUACCCUAUGGUGUCUCCUAUCUGUAGGUCCCAGUGGAGCGAUGAAGCCUGCCCAGCGGGGCUUGGCGGUCAUGGGCUUUCUCUCCGGAGGGAGAGAAAGUACCAUGAUAGCUGGGGGAAUCGGCGAGGCCCGGAAGGGAGCAGCCGUGCCUGGACGCCAGCGUUCGCUGGUCAACAGCCAGAGUGAAACUGGGGUAAACCUAUAGAUAGGUAGGCCAUGGGGUAGGGGGUCUGGCCCCAU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((...((((((((((.......))))))....((((((........)))))))))).....(((((((((((((((.(..(((((((((((((((((((...((......(.(((.((((((.(.((.((((((((((((((((((((((....))))))))))).)))))))..(((.((....((((....(((....)))....))))..))))).)))))))...))))))....))).)...))...))))))))....))))))))))).).))))))))))))))).)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
.....................................................................................................................(((((..(((((.(((.........(((.....(((((((...)).)))))......))).....((((((....(((.....(((....))).....))).))))))......)).).))))).....))))).............................................................
|
|
SRP_00328
|
[ FASTA input ]
|
GCCAGGGUAGCAAUGCCUGUGACCUCGUGUGGCAUAAACAAUGUAGUUAGAAUAGUCAGAGUAUGAGAGUUUGAUGAGACAGUUUGCUAAGAGUGUGCCCGUUCCAAACAGUGAGUUGCUAUGGUGGAAACCUAGUAAUAGGACUUCACCAGGGCAUUAAAGAGCUGAGGAACCGCCUCAGGCUGGCAACAGAACAGGGAAAACUUGCCGCUUAUUGUGGUGGAAGGAUAACAUACUCAUUAACUGUCAAGCUAAUCGGUUCUGCUAUUCUGAUCAGACACU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....)))))....(.(.).)))))..........(.((((.....(..((.(.(.....(((.(.(..(((((((.(....(((((((.((.(((((.(((((((((((((.(((((((..((((....))))..))))))).))))((...))(.((((......(((....(((....)))....)))....)))).))))))))))..)))))))....))))))).).))))))).).).)))....).).))..).))))..).....
|
| [ predicted structure ] |
............................................................((.((((..................(((.....)))((((..(((.......(((.((((.(((((..((((((....))))))..))))).)))).....(.((.((.......(((....(((....)))....))).....))))).)))........))).))))..............................)))).))................
|
|
SRP_00329
|
[ FASTA input ]
|
GCCAGGGUAGCAAUACCUGUGUCUAUAUGUGGCAUAAACAAUGUAGGUUGUGAUAGAUAGGAUAUGAGAGUUUGAUGAGACAGUUUGCUAAGAGUGUGCCCGCUCCAAACAAUGAGUUGCUAUGGUGGUAACCUAGUAAUAGGACUCCACCAGGGCAUUAAAGAGCUAAGGAAACGCCUCAGGCUGGCAACAGAACAGGGAAAACUUGCCGCUUGUUGUGGUGGAAGGAUAACAUACUCAUUAACUGUCAAACUAAUCGGUUCUACUAUCAAAGCCAGACAUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....)))))....(.....)))))......(...(.((((......(((((.(.(.....(((.(.(..(((((((.(....(((((((.((..((((.(((((((((((((.((((((...((((....))))...)))))).))))((...))(.((((......(((....(((....)))....)))....)))).))))))))))..)))).))....))))))).).))))))).).).)))....).).)))))..)))).)...).
|
| [ predicted structure ] |
.............................................................((((((...................(((.....)))((((..(((.......(((.((((.(((((..((((((....))))))..))))).)))).......(((.((......(((....(((....)))....)))....)))))..)))........))).))))..........................).)))))....................
|
|
SRP_00338
|
[ FASTA input ]
|
AGCCCCCGGUCCAGCGCGGCGGGCCAGGCGUGAACCGGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCCUAAGCGCCUCGGUCCGGGCGCCGCUGGGAAGCCGGGGGCGCUU |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))))..)).)))))))...))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
....................................(((.....(((....))).....)))...........................................
|
|
SRP_00339
|
[ FASTA input ]
|
UGUGCCAGACUUGGCCGGGGGGUUAGGCGUCCCCUGUACCCGAAGUCUAGAUGCGGGGGCGACAGCCCGGUGAGACCACCUGGGUUUCUGUCAGGCCCCGUGGAAUCAUUGAUCCUCUGUCCCUCUGGAUCGGAGGCCUGCAUGUACAUCCUCAAAGGAGGGUGUAUGUGCAGCCUACCAGGGGAACGCGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACGACACCCUGGACUCUCGAUGCUGGAGGGGUGCGGGGGUGAGAGGAAGCGGGGGGUACCUGGCAGGACGCCCAGACCGAACCGGGUGUG |
|
[ reference structure ]
|
.........(.(.((((((((((.....)))))))...((((...........))))))).)..(((((((..(..(...(((..((((((((((.(((.(.(..((.(....(((((((((((((.(.(((((((.((((((((((((((((....)))))))))))))))).)..((((((.....((.....(((....))).....))...)))))).))).))))...))))))..))))))).).)).....).).)))..))))))))))...))))..)..)))))))..)
|
| [ predicted structure ] |
................((((...........))))..............................................................................((((((..(((((.(((........(((....(((((((...)).)))))......))).....((((((.....((.....(((....))).....))...)))))).......)).).)))))....))))))...................................................
|
|
SRP_00340
|
[ FASTA input ]
|
GGUGAGCGUAACGUCUCGCUGUCACCUGAGUGGGGGUCGUCCGUUGGUGGCAGGAGAAUCGCGCUUCCCUGCCUGGCACCGGGUACAAGUGACAAUCUGCCCCUUGCAAGGCCGCAGUCUCCGGUGGGAUGGGGACGGAGGUCCCCAUCUCUCGGGUGAUGAUGAGACGCGCAACGCCUCAGGCUGGAAACAGAGCAGGGAAAAGUGUCCGCUGUGGCGCAGAGCAGGGAUCACAGAGUGUCACCCCGGCUGAACAGGGCAGGUGGAGGAGCUCCUCACACCGCGUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((.((((..(..)..))))....((((..)))).)))..(.((..(.((........((((.......(.(.(....(((((.....((((((.((((.((((.((..((((((((((.((.(.(((((((((((....))))))))))).).)).)(...)..(((((......(((....(((....)))....)))....))))).)))))))).)...))))))....)))).)))))))))))....)..).)...)))).......)).)..)).).....
|
| [ predicted structure ] |
.......................................................((.((((..........................((.....)).((((................((((.......(((((((....))......))))).)))).......(((((......(((....(((....)))....)))....)))))..................))))...............................)))).))...................
|
