ASE_00017
|
[ FASTA input ]
|
GCGGAAGGAAGCUCACUGUAGAGGCUACUUGCUGGGUGCUGUUGUUACUCUAUCAACCAGCCUUGGGGAAGGUCUGAGAUAAGAGCCACUUGUUGCCUUCACAAGGCAUUGCUUGGUGUAAGCAAGUGAGUUCCCAUCAAAGAUGGCUCAGUUGCAAGCUUAAUGCAAGAGACAUAGCAAAGAAGCCCAAUAUACUUCUGAUAUGGAUGCAAUGCCCAACAGACUGGAAAUGACUCACGGCUGGCAUGUUCAAGCUCAAUGACUGAGGGGAAGCAAGUGAUGGCUUCCUAACCCAAUUCAGACCACUCUCCGGAAUUCCG |
[ reference structure ]
|
((((((((...((((.((..((((.........(((((.......)))))..........))))))...[[[.[[[[[.....((((......(((((.....)))))(((((((...)))))))(((((((...........(((...........................................................................))).......))))))))))).....................))))(((((((........)))))))........]]]]]]]]....))))))))...
|
[ predicted structure ] |
.((((((((((((((((((((((..iiiiiii(aaaaaaaa(<<<<.))))))...jjjjjj.((((((.[[[[[[[[....[[[[[(cccccc.cccccccc.ccccccc(ffffffff)>>>>AAA..))))))eee.e(()FFFFF..((((({{{{{..)))))eee..)AAAAA.))...III..FCCCCC))E((((((((.)CCCCCCC.IIIIFFhhhhh..EEEEEE..JJJJJJ)))))).}}}}}...CC..CCCCCC..C]]]]]))dd)))))))).......]]]]]]]]..))HHHHH.DD))))
|
ASE_00083
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACGGAUCAACGGUGCCGGAUAACGUCCGGCGGGGGCAACCCCAGGGAAAGUGCCACAGAAAAGUAAACCGCCACGGGCGCGUUGCGUUUAGCCUGCGGCAAGGGUGAAACGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGUUUCCGGCAACGGAAGCGGCAGGGCAAACCCCACCGGGAGCAAAACCGAAUAGGAACGGCGCGCGUUUCCGCGCAAGCGGGAAAGCAGAUCGAUCCGGAUCAGCCGUUCGGGUAGGUCGCUUCAGGCACACAGCAAUCUGUGCCGCAGAGGAAUGGCCGUCACGUGCUGCGUUAUCGCGCAGCGCCAUACAGAACCCGGCUUAC |
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((..[[[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((.............(((((((((((............)))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......(((((((..((((((((((....)))))))))).((((]]]]]])))).))))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((((((((....))))))))).))......))))))))..
|
[ predicted structure ] |
..((...((((((i.((([[(ddd...ddd((((((((...))))))))((((...))))..)))..cccc(........bbb..))ii(.((.((((((((((((fff(eeeeeeee.eee(....(((((((jjjj...))))))).gggggggg.))))<<<<<<<<...)E..)EEE..GGGGGGGG....DDD..EE....)))))))).(((((((aa..)))))))..{{{{{)).)))))))..(((((((hhhh..>>>>>>>>.)BBBC...AA.}}}}}EEEEEFFF..))))))II]]...(((((((((.DDD)))))))))..CCC...HHHHI))JJJJ
|
ASE_00122
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCAGUACAGAGCAACCCACCGGUGAACAGCCGGCCACCAAUUGGUGAGAGAAAGUGCCACAGAAAAUAACUGUCUUGCCUAAGGCGAGAUGAGGGUGAAAAUGUGAGGUAAGAGCUCACGGUUGUUAUCGGUAACGGUAGCAACGGGUAAACCUUGGGUGCUGCAAUGCCACAUAUAGAGCCGUUUUGAGAGCUGCUCGUUCAAGGCUCAGGGUAGGCAGCAACAGGUAAACAGUAAUGUUUAUCGCAGAUAAAUGAUAGUGUAGAAACAGAACCCGGCUUA |
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........((((((((((...))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))))).)))..)))))))))))))...((((......((((((.....((((((.]]]])))))))))))).....))))......((((((((....))))))))............................)))))))).
|
[ predicted structure ] |
..((..(((.aaaaaaaaa(...cc..))(((((((....eeeeee.eeee.)))))))........bbbbbb......b()))((((((((BB.))))))))...EEEE....(((((()C.....)))))B((((((((((BB..)))))))))).BB)).(((((((((dddd(..<<(.fff(.{{..CA.{{{{{{...AAAAAAAA.{{{..)))))))))..)}}}F.((.[[[[[[[[))..]]]]]]]])FF..((..>>D)))DDD.....}}}}}}EEEEEE}}
|
ASE_00185
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCACCAUAGGACAGGGUGGUGGGUAACGCCCACCGGCCGUAAGGUUAGGGAAAGUGCCACAGAAAAUACACCGCCUAAGGGGAGCUGUUAGCGUUUGGCCUUUAGCUCUUAGCCAGACAAUCGUCUGGCUAAUGGCUGACCGCUAAUAGCUAACAGCUUGCCCGGUAAGGGUGAAAAGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGCAGGCGAGGUGACUCGCCUGGCUCGGUAAACCCCGCCCGGUGCAAGACCAAGCGGAGAGCAUGAGCCGGUCCGGCUCGCUACGACUCUCGGGUAGGUCGCUAGAGGCCGCGGGCAACCGUGGUCGUAGAGGAAUGAUCGCCAAAUCGCUUCGGCGGAUACAGAAUCCGGCUUA |
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((...((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..)))))))))))))...((((.....(((((..((((((.]]]]))))))......))))).....))))......((((((((....))))))))..................((((((....))))))......)))))))).
|
[ predicted structure ] |
......(((((((((..mm(..(((....((((((((...))))))))ccccc(.aaaa...((..((ddd(kk......)).ffffff(.jjjjjjjjjjjjjj)))eeeeeeeeeee))((((((((((..gg)))))))))))KKDDD.lllll..)JJJJJJJJJJJJ)))))))C..hhhhh...((((((iii....))))))..(((((((()LL.)))))))))))CCCC...JJF.((((((.bb..bbb(.LLLEE.{{{(.[[[[[[[[[[[.[[[[(<<<<<<<<.)))))).)BBBEEEEEEEEEMM)>>>>AAAABB>>>>]]]].]]]((GGHHHHH...(()]]].FFFFF.III.))))]]]]]}}}
|
ASE_00190
|
[ FASTA input ]
|
AGCAUUGGCUAACAGCUGCUUGAAAGAGUAGAGGAAAGUCCACGCUAGCACAACCUGCGAUGGUUGUAGUGAUCAUGCUAGGCCCAAUAAGCCUAGGCUUAGACGACUAGUGCCACAGAGACGAGAAUUGUGAAACGCGGUAAACUCCAUGAGUUAGAAACCCAAAUAUUGGUAGGGGAACUUUUCAACGGAAAUUGAACCAAAGAAAAGAGUUGAUUAAUCAACUAGAUAAAUUGUUAGCACCUGAGAGGGUACAAAACGUGGCUUAUAAAUGCUAAAACACUUGCGCGAGCAGGCGUUUU |
[ reference structure ]
|
((((((((((((((.((((((....))))))....[[[.[[[[[(((((((((((......)))))).....(((((((((((.......))))))((...).)((...(((((........................)))..))))))))))))))...(((...........)))...(((((((................)))))))((((((....))))))........)))))))((((....))))......]]]]]]]].)).)))))(((((((((((....)))))))))))
|
[ predicted structure ] |
((((((.(((((((([[[[[[[...(((a...((....ggg.((((((.((((((<<<<<.)))))).bbb.bbbbb(((((((..ccccccccc)))))))....))))))))((....fff....fff(eeeeeeeeee..))A)BBBBB.((((...(((...{{{{{{{.)))...ddddddd..GGG..))))}}}}}.......(((((((CC)))))))...}}..))))))))EEEDDDDDDD)E)EEE..EEECCCCCCC.))))))....BBB>>>>>]]]]]]]FFFFFF)
|
ASE_00191
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCAGCCAUCACCCUAAACCCCGGUGCCGCAAGGCAUCGGCCGAGAGGCCGGACCCUGGCGCAGAAACGACACGUCUCCCGAUGGAUGAUAAUGAGGCCCCAAUUAAAGGGGUUGAUUGACAUCGGGAGGAUCGGUGAAACGGCCAAUCCGGGGGAUGCAAGGGUGAAAAUCUGCCAAUGAUAUGAGGCAGAGAUUGCCCGCUUAGAUGAAUGCUGCCUAAACAGAAGGUGGCUUA |
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((........((((((((((....)))))(((((....)))))((...((((............((((((((((((............(((((.......))))).......))))))))))..))........)))).)))))))))))...((((.....((((((..(......)))))))....))))...........................)))))))).
|
[ predicted structure ] |
..(((...)))(((((ffffff(.....((((((((<<<<))))))))((((..{{{{(..[[[[[(.aaa....((.cc))aaaaaaaaaa..)).((((..((((((.gggg..)))))).)))).AAAAAAAAAA.))))fff..)}}}}.ee)AAA]]..]]].)FFFFFF...((((((..GGGG.dd.))))))..>>>>..)))....CC.EE(((((((...DD..)))))))FFF
|
ASE_00196
|
[ FASTA input ]
|
AGGGGGCUGGUGACUUUCCCCUCUUUAAGAGGGGAGGAAGUUCCGCCCACCCCAUUUAUGGGCAGCGUCCCCUGAGAAGGGGCGGGAGAUGCAGCAGAAACGACACGGCUCCGGAAGAGAUGACGAUGAUAGUGAAAGUUGAGGACUUCCGGAGAACCGGUGAAACGGGCAUCUCCCCUGCCCGGGGUGCAAGCCGGUUUCGGCGCUUAGCCGAAUGUCACCGAAAUUACAGAAGGCGGGCUAUAGCCCCCA |
[ reference structure ]
|
((((((((((((((...(((((((...)))))))....[[[.[[[[[(((((......(((((((.(.(((((....))))))((((((((((............((((((((((((..............((....))......)))))))))..)))........))))))))))))))))))))))...((((....))))............))))))............]]]]]]]]..))))))))
|
[ predicted structure ] |
.(((((((((((((((((((((((bbb))))))))))..((cccccccccccccc((.<<<<<<<<<((((((.{{.))))).ddddddddd.)).....cc...((.((((((((()>>>>)>>.BBB..[[[[[[[[[[....)))))))))ccccccc....)).DDDDDDDDD>>>)CCCCCCCC]].CCCCCCC(((((]]]].)))))..)))))CC...]]]]....CCCCCC}}.)))))))).
|
ASE_00221
|
[ FASTA input ]
|
CGGGACGGGCAGACAGUCGCCGCGUAUCGCGUAAGGCAUACGGGGAGGAAAGUCCGGGCUCCGCAGGGUAGAAUGCCGGUUAACGGCCGGGCGCGGUAACGCGACGGAAAGUGGAACAGAAAGCAAAACCGCCGAUGGCUGCUUUGGCAGCACAGGCAAGGGUGAAAAGGUGCGGUAAGGGCGCACCGCGCAUUUGGUAACAAUAUGCGGCAGGCCAAACCCCAUUCGGAGCAAGACCAAACAGAACGCAAUGACGCUGCCCGCCGAGCGUUCGGGUAGGUUGCUUGAGCAUACCGGCAACGGUAUGCCUAGAGGAAUGACUGUCCGAGACAGAACCCGGCUUACCGCCUGUCCGGUGUG |
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((.(((((((((((....)))))))))))....[[[.[[[[[((((...{{{{.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((.............(((((..(((((((....))))).)))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((.....((((((...(((((.}}}}))))))))))).....))))......((((((((....))))))))..........)))))))..........]]]]]]]].).))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
((dddddddd.ddddddd((((((((((((((.eeeeeeeeeeee.......eee(.{{{{{a((.cccc...cccccc(....<<<<<<<.<<<<<.))A)).)>>>...jj(........[[...>>CCC.[[(.((((((ff)))))).iiiiiii.iii......(((((((....hhhh))))))).iiiiii....)))))))))..IIIIIICCCC)II)CCC)}...III......bbbbb..)}.))((((((()II.BBBBB))))))).III]]]].JJ(()}}}EEE.ggEEEEEEEE......))DDDDDDDGG.....FF.>>>>>>>EEEEDDDDDDDD.HHHH.
|
ASE_00227
|
[ FASTA input ]
|
CUCAAGCAAAGCGAUUGCAGAGCAACUAGAAGAUGCUCUGAGGAAAGUCCGGGCUCCCUAACUAUUCCAGCUGCUGGAUAAUUUCCAGUGUGAUAUAAUCACGAGGAAAGUGCCACAGAAAGAAACCAAUCAAAUCUCCAUCGAAUGGCUCACAAGCUCUAGGAGAUCUUGGAUUGGGUGCAAAUGUAUUCUUGACGUGAGUUAAGCGUCUGGUAUACCCCAGUCGGGAGCAAGAUGAGGUUAGUUUAUAGAGAAUAGACCAUAGACUAAUCUAUUCCAUUGCUCGAGAGGGUUCAUACAGAACUCUCCAAUCAGAUAAUCUCCACACCUCUCAGGACCAAGCUAGAAACCAGUUUGAGCCUCUCGAGAUUUGUACCGAACCCGGCUUAUUUCUUGAG |
[ reference structure ]
|
.(((((.(((((((((.((((((((((...)))))))))).....[[.[[[[[(((((...{{{{{{.((((((((((.....)))))((((((...))))).)((...(((((...........((((((((((((((.......((((....))))...)))))).)).))))))........(.(((((((((....)))))))))).)))..))))))))))))))...((((((((((((((((...}}}}}}...))))))))))))....))))......((((((((.....)))))))).........)))))).(((..(((((((..((((((.......))))))..)))...))))..))).......]]]]]]]..))))))))
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((.((((((((((((.((iii)).))))))).jjjjjjjjjjj(.{{.))...(([[[(mmmm((((((hh.hh))))))mmmmm.))MMMMMHH)MMMf(fff....f(.<<....)))))..eeeee(.F)...eeeeeeee.M]]]F).)EEEEE)}}JJJJJ.lllllllll.(((((((...EEEEEEEEggggggggg(.HH....aaaaaaa.FFFaaaa.aaaaaaaaaaaa.)))))))....AAAAAAAAAAAA.JJJJ.(((kkkkkkkk(((((ccc..))))III...)GGGGGG.AAAA......>>kkkkkkk.)))GGG.JJ.....))))))))KKKKKKKKLLLLLLLLL...AAAAAAACCC.KKKKKKK
|
ASE_00228
|
[ FASTA input ]
|
CACAGAGCAGGGCGGUGGGUAACACCCACCCGGGGCAACCCGCGGGACAGUGCCACAGAGAACAGACCGCCUCCCGAAUCCAGCGCCACCGGACGACGGAGGUAAGGGUGAAACGGUGGAGCAAGAGACCACCAGCAUGCCGGGCGACCGGCGUGGCUAGGCAAACCCCGCCCGGAGCAAGAUCAGACAGCACACGCAGGUUCCGACCGGAAGGGCUGCUCGCCCGAGUGUGCGGGUAGAUCGCUGGAGGCCGUCGGCAACGGCGGUCGUAGAUGGAUGGUCGCCCCUCCUCCCGCAAGGGCGGAGG |
[ reference structure ]
|
(...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((...................((.....)).)))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..))))))))))......((((.....((((((...(((....)))..((((((.]]]])))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((((((....)))))))))
|
[ predicted structure ] |
(((...((.i((.(((((((.bb)))))))hhhhh..hhhhhh(..jj.BBjjjj(........[[[[[[[.)))...fffffff<(((((..cccccc.cc(..dddddd..)))))).((......{()DD.{(.ggg(aaaaaaaaa))>JJJJ..)AAA..((eeeeeeeeee.....eee..((((....)A.))(((((..)))))..)))I.DDDDCC..))))HHHHHH....AAAAAGG))CCCCCC}}...]]]]]]]JJ...EEE.G)FFFFFFFEEEEHHHHH...EEEEEE...
|
ASE_00229
|
[ FASTA input ]
|
CACAGGGCAAGGUGGUGGGUAACACCCACCCGGGGCAACCCGCGGGACAGUGCCACAGAGAACAGACCGCCCCUGCGUGCAGGGGUAAGGGUGAAACGGCGGUGUAAGAGACCACCAGCGACCGGGGCGACCCGGCCGGCUCGGCAAACCCCACCUGGAGCAAGGUCAAGAAGUCCGGUGCUCUCACCGGACGCGCGCACGACUGAGGGCGGCCCGCCCGAGUGCGCGGGUAGACCGCUGGAGGGCGUCGGCAACGGCGCUCGUAGAUGGAUGGUCGCCACGCUUCGGCGUU |
[ reference structure ]
|
(...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((....)))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..))))))))))......((((.....((((((((....))))))))..((((((.....(((((.]]]]))))).)))))).....))))......((((((((....)))))))).................((((....)))).
|
[ predicted structure ] |
......((..((((((((((...))))))).ccc(..<<<<<<(....[[[[[[[[.........)))bbbbbbbb))BBBBBBBB...(((....aaaaaaa]]....aaaa))).(((.((((ggggggg.gggg(fffff(....)CCC..ffffff(..AAAA....ff(eeeeeeeeeee.)))).)))(((.{{{)EE.....)EEEE)))))FFFF.)>>>>>>..AAAAAAAEEEEEFFGGGG....]]]]]]}}}.((((...GGGGGGG..FFFFFFF))))
|
ASE_00231
|
[ FASTA input ]
|
CACAGGGCAGCGUGGUGGGUAACGCCCACCCGGGGCAACCCGCGGGACAGUGCCACAGAGAACAGACCGCCAGCGGCCUGGAUGAACCCCGUGGUUCAUCCAGGUGCGGGUGAGGGUGAAACGGUGGUGUAAGAGACCACCAGCUCCCCAGGUGACUGGGGAGGCUCGGUAAACCCCACGUGGAGCAAGGCCAAGAAGGACGGCGGGCAACCGUCGUCCGCGCGAGCGUUCGAGGGCUGCCCGCCCGAGCUCGCGGGUAGGCUGCUGGAGGCGGCUGGUAACAGCCGCCGUAGAUGGAUGGUCGCCGACA |
[ reference structure ]
|
(...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((..(((((((((((((((....))))))))))))).)))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..))))))))))......((((.....(((((((((....)))))))))..((((((....((((((.]]]])))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).....................
|
[ predicted structure ] |
(((..bbbbbbb((((((((.<<))))))).ggg(..fffffffffff.)))(([(.........dd((((eeee((((((((((((({{{{)))))))))))))eeeeeeee.))))..)F((((((>>.....))))))..((((((((FF..))))))))((ccccc...)FFF..]))).))..(((((......((((((((((.ii.EEEEEEEE((...EEEEhh...))))))))))HH..FFFFFGGGB..BBBBBBII.aaaaaaaa))..AAAAAAAADD..}}}}.)))))CCCCC..
|
ASE_00234
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAGGAAAGUCCGGGCUCCCGAAAGACCAAACUUGCUGGAUAACGUCCAGUGCGAGCGAUCGUGAGGAUAGUGCCACAGAAAGAUACCGCCAAAACAAGUAAAAAGUAAAAAGCAAAAAAGCAAAAGAAACAAAAAUUUCUUUUUACUUUUGCCCUUUAACUUUUGCCUUUUUUUGGUAAGGGUGCAAAGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGCAGCGUCGAGAGGCGUUGGCUCGGUAAACCCCGGUUGGGAGCAAGGCCAGAGGAACUACGGUUGGUCUUUUACCAGUUCCGCGUAUGAGAGCCGCUAGAGGCUUUUGGUAACAACCGUCCCAGAUAGAUAACUGCCAUCAUGUAAAAUUUUUACAUAGAUAACAGAACCCGGCUUAC |
[ reference structure ]
|
........(((.((((((((((.[[[[[[[.(((.(((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((......)))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..))))))))))))))...(((.....(((((..(((.]]]]]]].))))))))...........)))......((((((((....)))))))).................((((((((((...))))))).))).......))))))))..
|
[ predicted structure ] |
((((.ffffff({{{{{{{{{{{([[[[[[[((((m(((((((...)))))))((((<<<.))))..((.aa.aa(....gg(.hhh..>>>......)))M..(((((.....)AA.......((((((((......))))))))lllllllll(eeeee)))))(((((((()HH)EEEEELLLL....((((((ccccc..)))))).jjjjjjj.)))))))).ddddddddddd.))))..)}}}}}}}...((((((((.)}}kk(()DDDDDDDDDDD]..}}FFJJJkkk..]]]]]].LLLLL.)))))))).....))KK))...KKK..AA.JJJJ.HGG(((((((bbb))))))).BBB........FFFFCCCCC
|
ASE_00238
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAGGAAAGUCCGGGCUCCCAAAAGGCCAAGCUUGCUGGGUAACGCCCAGUGCGAGCGAUCGCGAGGAUAGUGCCACAGAAAUAUACCGCCCUCUAGAUAGAAGAUUUCUCCUGUUUAGUGGGGUAAGGGUGCAAAGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGCAGUGUCGUGAGGCACUGGCUAGGUAAACCCCGGCUGGGAGCAAGGUCGGAGGAAUCAUGGUUGGUCUUUUUCCAGUUCCGUCGCACUAUAGGUAAAUCUAUGGUGUUAGGUGUACCGCAAGAGGUGUCUGGUAACAGGCAUCCCAGAUAGAUAACUGCCCUCUUAACUGGUUUCAGCUAAGGGAACAGAACCCGGCUUA |
[ reference structure ]
|
........(((.((((((((((.[[[[[[[.(((.(((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........((((((((((((((((((....))))))))))).)))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..))))))))))))))...(((.....(((((..(((.]]]]]]].))))))))....((((((((((....)))))))))).......)))......((((((((....)))))))).................((((((((((....)))))))))).......)))))))).
|
[ predicted structure ] |
.((((((...(({{{{{{{{{{(gggggggggggggggggggg.))GGGGGGG((.ccc..((((((...ffffff(...bbbbbbbbb(((((((((((((...[[[[[[[[[)))))))iiiiii.))))))......bbbbbbb.GGGG.bbb(.hhhhh.)))))))FFFFFF<<(..aa..IIIIII)))GGGGGG..)AA.]]]]]]]]]((((GGG}}}}}}dddddddd)))).(((((((((((..)))))))))))(()BBBBBBBBBB...((((((((BBB.))))))))ee...BB..))HHHHH))))))DDDDDDBBBB.>>C(((EE....DDCC}}}}))).
|
ASE_00248
|
[ FASTA input ]
|
AGAGUCGAUUGGACAGUCGCUGCCCUCUAUGAAAAUUAGGGGGGGGAGGAAAGUCCGGGCUCCAUAGGGCGAAGUGCCAGGUAAUGCCUGGGGGGCGUGAGCCUACGGAAAGUGCCACAGAAAAUAACCGCCUAAGCACUUCGGUGCCGGUAAGGGUGAAAAGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCACGACUGGCAACAGUUCGUGGCUAGGUAAACCCCACUUGGAGCAAGACCAAAUAGGGUUCCAAGGCGUGGCCCGCGCUGGAACCGGGUAGGUUGCUAAAGAUGUCCAGUGAUGGCCAUCGUAGACGAAUGACUGUUCAAGACAGAACCCGGCUUAUAGAUCGACUCUCCAC |
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((.(((((((((((....)).)))))))))....{{{.{{{{{((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((...((((....)))).)))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((..(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....))))))))..........)))))))..........}}}}}}}}.).))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((((((((((.(((((((((((...aaa.a(iiiii(......cccccccccc({{{{{.{{{{{{{{))iii(.bbbb)))))))))(([[[[(eee.....)BBB.)).....((..(((((..}}}}}}}}.fffffff..))))).....(((((((....<<<<))))))).FFFFFFF..hh(dddddddddBIII..)}}}.hhhhhhhh....)}...)))}HHHHHHHH>>>>CCCCCC(((((((.gggggg)EEE])DD...CCC.))))))).DDDDDDD]]].......)))))))))..CII.HHGGGGGGIIIAA.))))))))))AA..
|
ASE_00250
|
[ FASTA input ]
|
CAGCAGAUCGGUCUGUCGCUCACUCUUUCGAGAGUGGGAGGAACGUCCGGGCAACGCAGAGCACCAUCCUUCCUAACAGGAAGUUACUCGUGAGGGUAAAGGAGCGUAGAAGAGAAUGACCGCCAUUUUCCAUGAGUUGUCUGUGCUUCGGUACGGACUACGUGGAGGGUAAGGGUGAGAAGGUGGGGUAAGAGCCUACCGGAUGCAGCGGUGACGCUGCAUGCCGUACGUCUGAUGGGUUGUAAGAUCAUGUAUACCGGCGCAUGUAGGGUGGCUCGCCCGAUGCCGGGGGGUAGAUCGCUGGAGCCAUGCGGUGACGCACGGCCAAGAUAAAUGACAGACGCUCUGGCUACGUGUGGCCGUGAGUACAGAACCCGGCUUACAGAUCUGCUGCUUUU |
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((((.((((((((....))))))))....[[[.[[[[[((((...{{{{.((((((((((.....)))))((((((....))))))((..(((((...........(((((...(((((((..(((((((..........)))))))))))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).))))))))))))))))...((((.......((((((......((((.}}}}))))..))))))......))))......((((((((....))))))))..........)))))))((((((((((....)))))).))))......]]]]]]]].).))))))))).....
|
[ predicted structure ] |
(((((((((.(((((((((((((((((gg)))))))))((((.fffffffff.fff(.GGhh(aaaaaaa))))(((.....(((ddddd(...jjjj...j()AAAjjjjj.....)))[[[[[[[[[[[[[[.)))((((((((()J)))))))))((]]]]]]]]]]..(((((((..((((((ii.....))))))..((((((((.{{.))))))))<<<<((.AAAAH)JJJJJccccc.IIccccccJJJJ]]]]..)HFFFFFFFF)))))))(((eeeeee..eee.)))bbbbbbb(}}))>>>>FFFFbbbbbbbb...))..)))))))))BBBBBBBCCCCCCBBBBBBBB..EEE....EEEEEECCCCC)))))))))DDDDD
|
ASE_00254
|
[ FASTA input ]
|
CACAGAGCAGGGUGGUGGGUAACGCCCACCCGGGGUGACCCGCGGGCCAGUGCCACAGAGAACAGACCGCCCCGAUGCGCCGGUUCGCCGACGUGCCGGGGUAAGGGUGAAACGGCGGUGUAAGAGACCACCGGCACCGUGAGCGAUCACGGUGGCCAGGUAAACCCCACCCGGAGCAAGACCAGACAGCAGGCGGGUUGCUCGCCCUUGCCUGCGGGUAGGUCGCUGGAGGCCGUCAGCAAUGACGGUCCGAGAUGGAUGACCGUCCCACG |
[ reference structure ]
|
(...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((((((((((....)))))))))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..))))))))))......((((.....((((((((((.]]]]))))..)))))).....))))......((((((((....))))))))......................
|
[ predicted structure ] |
......((.(((((((((((...)))))))((((((({{{{{{{{{{...{{{(...aaa.......))))))).((((((([[(ffff...fffff(()AAA.ffff(...bb.)))))))...)]]..))FFFFF.<<<<<<<<<(.cccccccc.ccc..)))))BBFF...((...CCC.....)).FFFF)CCCCCCCC>.}}}}}}}}}}}}}.>>>>>>>>..eeeeeeee))..EEEEEEEE......(((((..)))))..FF
|
ASE_00255
|
[ FASTA input ]
|
GAAAGCAGGAGAGGUGAUCGCAAUCGAGAUUUAUCGCGUUUCCGCAAUAAACUCUCGGUUGAGGAAAGUCCGGGCUCCCAGAUGGUCCAACUUGCUGGGUAACUCCCAGUGCGGGUGACCGUGAGGAUAGUGCCACAGAAACACACCGCCGAUGUCUCAUAGAGCACAGGCAAGGGUGCAAAGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGCAGUAUCGAGAGGUACUGGCUUGGUAAACCCCGGUUGGGUGCAAGGCAAAGGUUUUAGGAUGACCAUUUUGCCUAUUUCCUAUUUAAAGCCGCUCGAGGCUGUUGGAGACAACAGUCCCAGAUAGAUGAUCACCCACUAACCAAUUUUGGAUAGUGAACAGAACCCGGCUUACUUCCUGCUUUC |
[ reference structure ]
|
(((((((((.(((((((((.((((((((((((((((((....))))))))).)))))))))....{{{.{{{{{(((((...[[[[[.(((.(((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........((((((((((.((...))))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..))))))))))))))...(((...(((((..((..]]]]]......))...)))))......)))......((((((((....))))))))..........)))))))(((((((((....))))))))).......}}}}}}}}.).))))))))))
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((.(((((((((((((((((jjjjjjjjjjjjjg((..rrr..)G))))))).)RRR)((nnnn(ii(((..eeeee{...((.bbbbbbb..bb(kkkkkkk))}.)BB)EE..cp((<((((l(..(((f(...((h((..qqqq(..ddd.dddd.)))..((DDDD...mmJJJJJJJJJ.)H)J.oooooooo.(((.)EEKKKKKKK)M)M))F...O)))Laaaaaaa..aaaaaaaaO)))>.O).OOOO).AAAAAAAAc([[[[[[[[[[[[[.AAAAAAA.)O)))))))QQQQ...PCII.)E)]NN.))))))))..DDD.NN..]]]]]]]]]].]]C....BBBBBBBJJJ.)))))))))))
|
ASE_00257
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACAGGGCACGGUGGUGGGUAACGCCCACCGUCCGCGAGGACAGGGAAAGUGCAACAGAAAGUAAACCGCCGGGCCAGUUCGCUGGCCAGGUAAGGGUGAAACGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGCAGACCGGGUGACCGGUCUGGCUAGGUAAACCCCACCGGGUGCAAGACCAAGCAGGGAGCAGUUCUGGUUCGCCAGAACACGGAUCGGCCCGAUCCGUUACGACUUCCGGGUCGGUCGCGCGAGGCUGCAGGCAACUGCGGUCCCAGAUAAAUGGCCACUCUCGACAGAACCCGGCUUA |
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((((((....))))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..)))))))))))))...((((.....(((((..(((((((....)))))))(((((((.]]]]))))))).....))))).....))))......((((((((....))))))))...........................)))))))).
|
[ predicted structure ] |
.....(((((((({{{{(...((g(((((((((((((...))))))))))bb(..aa...aaa...))))...((...eee..)G[[[((((((((ff))))))).<<(.dddddd....((((((.jjjj..)))))).dd...)))){{{{{{{{{{{{{)).(((....AAA.cccccccc...)DD..DD..)DDDD.((((((((hh))))))))iiiiiiii)))IIIIIIIIEEE.))))}}}}}}}}}}}}})BB.((((((((CC..))))))))AA.FF....)]]]>>}}}}.....HHCCCCCCJJJJ
|
ASE_00267
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACAGGGCAGGGUGCCAGAUAACGUCUGGGAGGCGCGAGCCUACGACAAGUGCAGCAGAGAGUAAACCGCCGAUGGCCUGUUUACAGGAUCAGGUAAGGGUGAAAGGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCACAGCUGGUAACAGUUUGUGGCAAGGUAAACUCCACCCGGAGCAAGACCAAAUAGGGGUUCUUAUGGUGCGGCCCGCAUUGAACCCGGGUAGGUUGCUGGAGCCAGCGCGCAAGUUCUGGCCUAGAUGAAUGGUUGUCCACGACAGAACACGGCUUA |
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((..(((((((....)))).))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((....(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....))))))))...........................)))))))).
|
[ predicted structure ] |
.......((((.ccccccc..(((((((.ddddd(.{{{{{{{{{{{..{{{{{.{{{<...((.hhhhh.h(.....iiiiii(ffff.ff.)))>)))gg.)))).)FFF....(((.....eeeeeee.....)))EEEEEEE..)FFFII((.)Ibbbbb(II.)IH.(((((([[[[[(.)H..[[[[[....)))))).HHHH.GG((((((.)}}}}....)]]]]].))))))CCCCCCC..}}}}}..aaaaaa.}}}}}}}}..]]]]])))BBBBBAAAAAA.}}DDDDD
|
ASE_00270
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCAUAGGGCAGGGCGCUCGUCGAGACUGGCGGCGGAAGUUCGCCAGUCAAGGCGAGGGAGUUGCUCCGGCGAGAUGCUGGGGCAACUUCGGAAAGUGCCACAGAAACCAUACCGCCGUCGGGCUAAGCGGCACUGUGGCUUCCGCUGCCAGCCGCUGCAGUGUUCGCGUUUCCCGGCGGUAAGGGUGAAAUGGUGGGGUAAGAGCCCACCAGCACGACCGCGAGGUCGUGGCUGGGCAAACCCCGCCCGGAGCAAGACCAAAUAGGGGGCGCUAUCAGGUUGCCCGCCGAUGCCCCCGGGUCGGUCGCUUAGAGAAAUGGUCGCCAGCGUCAGGGCUAAAACCUGACGCCACAGAACCCGGCUUA |
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.(((((((((((..(((((((((.......)))))))))..)))).))((((((((((((((...))))))))))))).)((...(((((............(((((((((((((((((((((((((((((...(((...))))))))))))).)))))))))))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..)))))))))))))...((((.....((((((....((.(((.]]]]))))).)))))).....))))...................(((((((((.......)))))))))......)))))))).
|
[ predicted structure ] |
..((....(((fffff(.<<([[[[[[[[[[[(..bbb...bbbbbbbbbbbbbb(jjjj..j(..ggggg.(((((((((((((((ii.)))))))))))))))))).)GGGGG((.)J..hhhh.hhhhhhhhhh(aaaaaaaaa((((()JJJJBBBBBBBBBBkkkII)))))))ff((cccc)AAAAAAAA...BBBB....llllllll..)BBB]].))((((((((())FF))))))ddddddd...LLLLLLLLKKK.((..{{{{CCCC.{{{{{{{.)]]..AH]]]]]]))]>>}}}}}}}.}}}}.HHHHHHHHH....HHHHFFFFF.eeeeeeee)))....EEEEEEEE.......DDDDDDD..
|
ASE_00274
|
[ FASTA input ]
|
UUGAGGAAAGUCCGGGCUCCUAUUUGGCCAGGCUUGCUGGGUAAUUCCCAGUGCGGGUGACCGUGAGGAUAGUGCCACAGAAACACACCGCCUAAUGCUUAAUGGGGAAAUCCCAACAAGCGCGGCAAGGGUGCAAAGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGCAGCAUCGAGAGGUGCUGGCUAGGUAAACCCCGGCUAGGAGCAAGGUGAGGGACGCUGGAGGCCAUAGACCGUGUCCCUAAGUAGAGCCGCUUGAGGCUAUCGGCAACGCUAGUCCCAGAUAGAUGAUUACCCAUUCACUUUCUAAAGAAAGAAGAAAGAACAGAACCCGGCUUAC |
[ reference structure ]
|
.......(((.((((((((((...[[[[[.(((.(((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((..(((((((((((((...))))))))))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..))))))))))))))...(((..((((((..(((]]]]]...))).))))))........)))......((((((((....)))))))).................(((((((((.(.....)))))).)))).......))))))))..
|
[ predicted structure ] |
(((.{{{{{{{{{{{(hhhhhh(((((((((((((<<<<<<<..((((((.ii(fffff(..eeee.eeeeeee(..........[[.[[[[[..[[[[[..)))))).ggg.))).)GGGbb(((...(((((...(((((()E.....)))))).)II)))))....cccc>>>>>>>))))...)))))aaa.]]]]]]]]]]aaaaaaaa.))))hh(...ddd.)AAAAAAA...AAA.ABB))(((..EEEEEE)HH..CCCC.DDD...HHH...]].)FFFFF.(((HHH}}}}..............)))))).}}}}}}}EEEE
|
ASE_00277
|
[ FASTA input ]
|
UUGAGGAAAGUCCGGGCUCCCACAUGGUCAGGCUUGCUGGGUAAUUCCCAGUGCGGGCAACCGUGAGGAUAGUGCCACAGAAACAUACCGCCUAAUACUUUAUGUAUGGCAAGGGUGCAAGGGUGUGGUAAGAGCGCACCAGCAACAUUGAGAAGUGUUGGCUAGGUAAACCCCGGCUGGGAGCAAGGCUUAGUAGAUUUAUGACCAUUAAAUAAUCUACUUUUAAGCGCCGCUUGAGACUUUGAAGUAAUUCCAGUCCUAGAUAGAUGAUUGCCCAUCUUAUUAAUUAAGGAGAACAGAACCCGGCUUAC |
[ reference structure ]
|
.......(((.((((((((((...[[[[[.(((.(((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((..((((.....)))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..))))))))))))))...(((..((((((.(((.]]]]]...)))..)))))).......)))......(((((.(((....)))))))).................(((((((.....))))))).......))))))))..
|
[ predicted structure ] |
((((((((.[[[[[(hhhhhh(.ccccccccccc({{{{{{{..))))(((((.iiiiii(((((ggggg..gggggg(....bbbbbbb(eeeeeeeeee.ee)))))EE..(((((..d(.)GGGGGG.dddd))))).)B..))))).EEEEEEEEEE<<.BBBB..)D)]]].)HHHHHH.)}}}}.((((((((((}}}CCCC))...))))))))(((((((DD.)))))))((((BB))))..ffff.GGGGG((((.aaaa.IIIIII))))AAAA..))))FFFF...>>.CCCCCCCDD]]
|
ASE_00279
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACGAAACAACGGUGCCGGAUAAUGCCCGGCGGGGGUGACCCCAGGGAAAGUGCCACACAGAGAGCAGACCGCCCCGGCGCAAGCCAAGGGUAAGGGUGAAAGGGUGCGGCAAGAGCGCACCGCGCGGCUGGUAACAGGCGCGGCACGGCAAACCCCACCGGGAGCAAGACCGAAUAGGGGCGGCGUGAGGUUUCGGCCUCAGGGCACGUUUCGGCCCGUCGCCCGGGUUGGUUGCUUGAGCCGUUCCGCAAGGAUCGGCCUAGAGGAAUGGUCGCCUAUCCCCGCUUGGGGUGGACAGAAUCCGGCUUA |
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((..............((((((((((....)))).))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......(((((((.((((((....))))))(((((.]]]]])))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((((....)))))))......)))))))).
|
[ predicted structure ] |
..(((...<<<<<<<))).((((((..((((ccccccc..cccc(bbbbbbbbb(ffffff......(((((.........ee...eeeeeee)))))..(((..aaaa..aaa(gg.....((((hh.....))))((((((ddddddd.....))))))...)))..)AAA.)))).[[[[[[..[[[[...EEEEEEE..(((((((GG))))))))BBBB.))))))AAAA(((>>>>>>>]]]]]]]]]]..((((((((EE....DDDDDDD{{{.)))))))).HH.)BBBBBCCCCFFFFFF.)))...CCCCCCC}}}
|
ASE_00285
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACGAAACAAGGGUGGCGGGUAACGCCCGCCGGCGUUCCUUCGGGGGCGCAAGGGAAAGUGCCACAGAGAGUAUACCGCCGAUGAUCCCGGACUUGAUCCGGGAACAGGCAAGGGUGAAAGGGUGCGGUAAGGGCGCACCGGGGGGCUGGCAACAGCCACCGCAUGGCAAACCCCACCCGGAGCAAGGCCGAAUAGGGGCCGCGUGCCCAUCAGCAAUGGUGGGUAGGGGAGUUUCGCCCCGAGCGGCCCGGGUUGGCUGCUAAAGCGCCGGAGCAAUCCGGCGACCAGAUGAAUGGCUGCCACCGCAGGCCCGUCCCGCAAGGGAUACCGCCUGAGGAGACAGAACCCGGCUUA |
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((..[[[[[[.((((((((((.....)))))(((((((((....)))))))).)((...(((((............(((((..((((((((((.....)))))))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......(((((((.(((((((((....)))))))))((((.]]]]]]))))..))))))).....))))......((((((((....)))))))).................((((((((((((((((....)))))).)).))))))))......)))))))).
|
[ predicted structure ] |
((((.(((((((((dddd.d(.......{{((((((((...)))))))){{{{{{{{))}}}}}}}}..hh.....hhh(......hhh.hhhh(hh..h(ff)))))))))..(((((j..((<<<..<<<<<<<<..<<<<<<(..eeeee...))J.ccccccc)>.cccccH>>>>>)HH)H..[[[(.)))))Fii..((((((.]H.(((((((.(((((((((aa..)))))))))]]HH..>>>>>>>>H}.))))))).FH))))))HHH....(((((((....))))))).))...H>.HHCCCCC)).}DII..>>).(((((AA..)))))..EEEEE..DDDD.......CCCCCCC.
|
ASE_00287
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACGGAACGCGGUGCCGGGUAACGCCCGGCGGGGGCGACCCCAGGGAAAGUGCCACAGAGAGCAGACCGCCGAUGGCUCCGAAAGGACCACAGGCAAGGGUGAAAGGGUGCGGCAAGAGCGCACCGCGCAGCGGGCAACCGAAGCGGCACGGCAAACCCCACCGGGAGCAAGACCGAAUAGGCACGCGAUGGGCUUAGGCCCGGGGCAGGAACCGGCCCUUUUCGCGUGCGGGUUGGUUGGUUGAGGCCGUCGGCAACGCCGGUGGUAGAGGAAUGAUCGUCACUGUCCUUCGGGGCAGAACAGAACCCGGCUUA |
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((..[[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((..(((((((....)))).))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((((.((((....))))((((((.]]]]]))))))..)))))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((((....)))))))......)))))))).
|
[ predicted structure ] |
..((....((((((((((.hhh..hhhh(((((((((...))))))))((((<<.)))).bb....bbbbb.......bb...))ccccccca(()B....)B.c[.c(.BB..eeee.....((((((ff.....))))))BBB..eeee.cccccccc((BBHHH.FF...HHggggggg..))....HH).....ddddddd(iiiiiiii)))))))).....((((((((()CCC)))))))))IIIIIIICCCCC.)]ACCCCCCC..>>GGGGGGGID..)E..)E.EEEE..((((((({{)))))))....}}EECCDDDDDD
|
ASE_00294
|
[ FASTA input ]
|
UCAGUCGGCCGGACGGCCGCUCCGGCAAGUGCCGAAAGGCCGCCGGGGAGGAAAGUCCGGGCUCCAUCGACAUACGGUGCCGGAUAACGUCCGGCGGGGGCGACCCCAGGGAAAGUGCCACAGAGAACGAACCGCCCGCCUUCGCAGCUUCGCUGCUUCGGCGCGGCAAGCCCUCGGGCUCGCUGCGCCAUAACCCGCAAGGGUGAAGGCGAGUAAGGGUGAAAAGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGUCGCCGGCAACGGGGACGGCAUGGUAAACCCCACCGGGAGCAAAACCGAAUAGGGACGGCAUCGCGGAUAGUUCGCUGCUCGCAGCGAUAACUCCGCAGGGCGAUGUCAGGCUCGCCGUCCGGGUAGGUUGCUCGAGGCGCUGUGCAAACAGUGUCCCAGAGGAAUGGCCGUCGCGCAUCGCCUCCGCAAGGAAGCGGUGCCCUCACAGAACCCGGCUUACAGGCCGGCUGA |
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((.(((((((..(.(((....)))))))))))....[[[.[[[[[((((.{{{{{{{.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((((((((((...)))))((((((((((((((((....))))))))))))))))((((....))))))))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......(((((((...(((((..((((((((....)))))..)))))))).((((.}}}}}}}))))))))))).....))))......((((((((....))))))))..........)))))))(((((((((((((....)))))))))))..))......]]]]]]]].).))))))))))
|
[ predicted structure ] |
((((((((((.(((((((((((((((..mmmmm(...fff.))))))).((..((((((((.jjj.jj(...kkkkkkkkjjjjj(lllll(.bbbbbbbbbb..)).jjj....jjjjj....j(()F..iiFFMiiiiiiii(ee(.ggggggg)))jjjjjjj(.dddd)))))))).JJJJJJJJ.{(<<<<<<..<()GGGGGGGE.<<<<<<<<<<(..((((((oo.....))))))ccccccc(hhhhhhEIhhhhhhh.)))JJ...JJJ.{{{{{.OO....JH...JH(((((nnnnnnnn)BBB..)HHHHH)II.IIIIIII)B..BBBHH..)HHHHCCC..DDDD.CCCC>>>>>>>..>>>>>>JBBBLLLLLJJJ......JJ))))).aaa...))))))))MMMM.KKKKKKKKJJ..JJJ.NNNNNNNNAAA......}}}}}>>>>}.))))))))))
|
ASE_00295
|
[ FASTA input ]
|
CUAAAUGGUCGUGCAGUUGCGUGAUGAUAAUCACGAGGAAAGUCCGGACUCUAUAGAGGUAUGGUGCCGGUUAACAUCCGGCAGAGUAUUAUUACUUUAGGGCUAGUACCACAGAAAAUAUACCGCCGAGUAUUUCGGUAAGGGUGAAAAGGUGUGGUAAGAGCACACCGGUAAGUUGGCAACAAGUUACGCAUGGUUAACCCCACCAAGAGCAAGAUCAAAUAGGCAUUACAGAAUUUAAAUAUUUAUUUAAGUUCCUGGGUUACCUCUAAUCGGAUUGUAAUGCGGGUAGAUCGCUUGAGGUAAACGGUAACGUUUAUCCUAGAUAAAUAACUGCAAUGAAUUAAUAUUCAUACAGAAUCCGGCUUAUAGACCAGAUGAGCAG |
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((.((((((....))))))....{{{.{{{{{((((.[[[[[[[.((((((((((.....)))))(((((((....)))))).)((...(((((............((((((((...))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((((((((((((((....))))))))))(((((.]]]]]]].)))))..)))))))).....))))......((((((((....))))))))..........)))))))((((((....))))))......}}}}}}}}.).))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((..iiiii.iiiiii((((((((.aaa.aaaaa(.....[[(((((hhh(.llllllllll.llllllll(.{{)))))..ffffffffffffffffffff(..(((((((((...)Ljjj(((((((<<<)))))).kkkkkkkk.kkk))))))))HHH...LLLLLLLbbbbbb...LL.))))))))((((eeeeee.))))..)FF..cccc...)))((((((((((((((((((())))))))))))KKKEEEELLLLLLLL.)AA..)))))))))..(((CCCC.FFFFFFFFFF..)KKK...KKKKKJJJ..>>>..EEIIIIII.AAAddFFFFFFFF.)))...DDBBBBBBAAA.IIIII..}}.]]..
|
ASE_00298
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCACCGCAGGGCAGGAUGCCAGCUAACGGCUGGUCGGCGAGUCGAGCACCCGCACGCGCGCCUUGGCGUGUAGGAAGCGGCGAAGCCGAAGGAAAGUGCCACAGAAACCAGACCGCCAUUCCCGGACAGCCCCGGCGCGGGCGGGAGUGGUCAGGGUGAAACGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGGCUCCCCGGAGACGGCGAGCGCUGGUAAACCCCAUCCGGUGCAAGACCCGACAGUGCGGUAUGGAACGGCCCGUUCCUUUGACCGCCAGGAUGGUCGCUAGAGGCGCGCGGCGACGUGCGUCCCAGAGAGAUGACCGUGACCCCACGCGAGUGGGCCACAGAAUCCGGCUUA |
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((...(((.....((((.(((((((....)))))))....))))))).)))).)((...(((((............((((((((((((......((((...))))))))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)))))..)))))))))))))...((((.......(((((..(((((.]]]])))))....)))))......))))......((((((((....)))))))).................(((((((....))))))).....))))))))..
|
[ predicted structure ] |
..((..((((((((.llll((.(((i((..(((((((...))))))).<<<<.<<<<<<<<<(fffffffffffff(.eeeeeeee(..hhhhh(bbbbbb........)))).......<<<..)B((((((((((...ggg(kkkkkk(jjj))))))))))..{{{{.....((((((dd.....)))))).)JJJ.)I))))...mmmmm)KKKKKKBB..)Baaaaa()BBHH...}}}}.....)>>>)L.LLL...[[[[[[[[[))HHHEEEFFF.)AAAAAMMMMM.)FFFFFFFFFDD..)F>>>>.GGG.....ccc..>>>>..)).EEEEE]]]]]]]]].....CCC>>>>>).
|
ASE_00318
|
[ FASTA input ]
|
UGAUAUUUCGGGUAAUCGCUAUAGCAAUAUAGAGGAAAGUCCAUGCUCACACAAUCUGAGAUGAUUGUAGUGUUCGUGCUUGAUGAAACAAUAAAUCAAGGCAUUAAUUUGACGGCAAUGAAAUAACCUAAGUCAUUGGAUAUGGUUAGAAUAGUUUGAAAGUGCCACAGUGACGUAGCUUUUAUAGAAAUAUAAAAGGUGGAACGCGGUAAACCCCUCGAGUGAGCAAUCCAAAUUGGGUAGGAGCACUUGUUUAGCGGAAUUCAACGUAUAGACGAGACGAUUUUUACGCGAAAGUAAAAAUAUGUAGACAGAUGGUUACCACCGACGUACCAGUGUAACUAGUACACAUUAUGAGUACAACGGAACAGAACAUGGCUUACAGAAAUAUCAUCACUAGU |
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((((.(((((....)))))....[[[.[[[[[(((((((((((......)))))).....(((((((((((..........))))))(((......)).)((.((((.....(((...(((....)))..)))......)))).....(((((............((((((((....)))))))).........)))..))))))))))))))...(((..........)))...(((((((.................)))))))((((((((((((....))))))))).)))........))))))).((((((((((((((((.....))))))).....))))))))).......]]]]]]]].).)))))))))........
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((((..{{{{{{{(cc..cccccccc...cccc(hhhhhhh...))))))))))(((((nnnnnn(bbbb(dddddd.d(..aa..aaa(eeeee([[[[[(.kk)))))....bbb((jjjjjjjj)CCCC.oo(()}..ooooo)AAA.)KK]]]...fffffff..CCCCCCCC.ff((.gg...ggggg.((CC.))..((((<<<(.HHHHHHHmmm)]]EEE))))..)DDDDDDpppp}}}}}}...)))((((((...)MMM.EE))FFllllll....)D....)))))).PPPP>>>))BBBGGGGG.FFFF))OOLLLLLL((((GGFFFOOOOO.)BBBB.............JJJJJJJJ......AANNNNNN)))).
|
ASE_00321
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCGCACAGGCUGUGAUGCCUGUAGUGUUCGUGCUUAGCGAAACAAUAAGCUAAGGUGCUCUAUUAGAGUAACGGCAGGAAAACAAGCUAAGGUUUUUAACUAUGCUUAAGUAUCCUUGAAAGUGCCACAGUGACGAAGCGGAUAGGGAAACUUAUUCGGUGGAACGCGGUAAACCCCUCGAGCGAGCAACCCAAACAAUGGUAGGGGCGCUUUUUGUUGGGAAUUAAGAACGAGACAAAAAGGCAGGUUAACUGCAGAUAGAUGGUUACCACAUUGCUUUUUCUCCCUGGAAAGUAGUGUACAGAACACGGCUUAU |
[ reference structure ]
|
.....(((.((((((((((((((((......)))))).....(((((((((((..........))))))(((((((...)))))).)((.((((.....(((...(((.....)))..)))......)))).....(((((............((((((((....)))))))).........)))..))))))))))))))...(((...........)))...(((((((...................)))))))((((.....))))...............((((((((((((......))))))))))))......))))))))..
|
[ predicted structure ] |
(((((..ffff(.bbbb(((([[[[[[[(gggggggg.gggggg)).((((((<<<<(..eeee(.hhhhhhhhh(ccc.ccccccc(aaaa........)))))))AAAA{{{{{{()CCCC.{{.))))).....kkk((((.ii()C...)}}}}jjjjj...CCCCCHjj))GGGGGG(((..))).dddd.)}}}})..bbbbb.bbbKKK)))HHHHHHHHEBBBBBBBB..)JJ....DDDD........GGGGGG...EEE>.>>>..)BBBBFFJJ((((((((((((.JJJII))))))))))))FF....)]]]]]]]GG
|
ASE_00335
|
[ FASTA input ]
|
AUGCAAUUUUUGGAUAAUCGCGUGGUAAAUAUUGCAAUUUUAUCAUGAGGAAAGUCCAUGCUAGCACUGGCUGUGAUGCCAGUAGUGUUUGUGCUAGACAAAAAAAUAAGUCUAGGGAUGUGCUUUGCGCAUUACGGCGGAUAAAAUGGCUAAGUCUUUGAUAGGCCGGAGUAAUUCUGAAAGUGCCACAGUGACGUAGCUUUUAUGGAAACAUAAAAGGUGGAACGCGGUAAACCCCUCAAGCUAGCAACCCAAACUUUGGUAGGGGCAUGGAAAAGCUGGAAAAAGAACGGUCUUUUCUGACUGCAUAAGCAGUAGACAGAUGAUUAUCAAAAAAGGUGGUACCUAGUCGCCUUUGGAACAAAACAUGGCUUAUAGAAAAUUGCAUA |
[ reference structure ]
|
.((((((((((((((((((.(((((((((((.....)))))))))))....[[[.[[[[[(((((((((((......)))))).....(((((((((((..........))))))((((((((...))))))).)((.((((.....(((...(((...)))..)))......)))).....(((((............((((((((....)))))))).........)))..))))))))))))))...(((...........)))...(((((((..................)))))))(((((....)))))........)))))))...(((((((((.....))))))))).........]]]]]]]].).))))))))))..
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((...(((((((((kka...a((((((eeeeeee(.ffff(....ddddddddddddd))eeeeeeeeee))))).aaaaaaaa(llll(......bbbbbbb))aaa((DDDDDjjjjEEEEEEEEEE.)EEEEEEEaa((.hhh(mmmmmmmmmmmmmmmm.))aaa(...iiiiii(.ccc.cccccccc(((((....))))gggggggg.)))))))..)LL)FFFF))AA.JJJJAAA..MMMMMMMM((.DDDDDDDD)CCCCCC..((((((.CC.))))))))AHHHALLAAAAAA)A...)AAA((.MMMMMMMM....)CCCIIIAKK.GGGGGGGG....))...IIIBBBBBBB.))))))))))).
|
ASE_00339
|
[ FASTA input ]
|
AUGUGCAAUUUUUGGAUAAUCGCGUGAGGAGAAUUGUUUCUCAUGAGGAAAGUCCAUGCUAGCACAGGCUGUGAUGCCUGUAGUGUUUGUGCUAGGCGAAACCAUAAGCCUAGGGACGAGAAAUCGUUACGGCAGUUGAAAUGGCUAAGUCCUUGGAUAGGCCAGAGUAGGCUUGAAAGUGCCACAGUGACGGAGUCUUUCUGGAAACAGAGAGAGUGGAACGCGGUAAACCCCUCAAGCUAGCAACCCAAAUUUUGGUCGGGGCAUGGAGUACGCGGAAACGAACGUAGUAUUCUGACUGCUAUCAGCUAGAGCUGUUAGUGGUAGACAGAUGAUUAUCGAAGGAAGUGGUCCUAGUCACUUCUGGAACAAAACAUGGCUUAUAGAAAAUUGCAUAUAGG |
[ reference structure ]
|
...((((((((((((((((((.(((((((((.....)))))))))....[[[.[[[[[(((((((((((......)))))).....(((((((((((..........))))))((((((....))))).)((.((((.....(((...(((....)))..)))......)))).....(((((............((((((((....)))))))).........)))..))))))))))))))...(((...........)))...(((((((.................)))))))((((((((((((....))))))))))))........)))))))...(((((((((....))))))))).........]]]]]]]].).))))))))))......
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((((.(((((((((((.[[[[...[[[[[[[[..[[[[[....(((((.(((((((((((gg(.bbbbbb.bbbb)))))))))))aa(...(((hhhhhhhh(((((..{{..{{{{{{(<<<<<<<....<<<<<<<))))))))dddddddd...HHHHHHHH....dddddd.)>>>>>>..((((((((....))))))))))))))))))))...ee]]]]].BBBB)BB..ff..(((>>>>>>>BBBBGG(((((((..]]]]]]]].)AA.)))))))>}}}}}}cc(((((..)))))}}.DDDDDD....))).CC))))...((((((((]]]]..))))))))FF.........DDDDDDDD.))))))))))))).EE
|
ASE_00340
|
[ FASTA input ]
|
CACGGAAACCACGGUGCCGGAUAACGUCCGGCGGCUUCGGGAAACCGGAGUCAGGGAAAGUGCCACAGAGAGCAGACCGCCAAAGGCUUCGGCCCGGCGAAAGGUGAAAGGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCGGACGGCAACGGACGCGGCACGGCAAACCCCACCGGGAGCAAGGUCGAAUAGGGAUGGCAAGAGGUGACUCAGGGCUGGUUUCCGGCCCCGCCGUCCGGGUUGACUGCUUGAGCGUCCGGGCAACCGGCCGCCUAGAGGAAUGAUCGCCCAUCCCCUGUCAAAAGGGGUGG |
[ reference structure ]
|
(.[[[[[.[[.((((((((((.....)))))(((((((((....)))))))).)((...(((((............(((((..............))))...).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..))))))))))......((((......((((((...(((....))).((((.]].]]]]]))))..)))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((..(........))))))
|
[ predicted structure ] |
..((((((((((((gg((fd.((..hhh(iiiiiii))D.....((((((((.......{{{{([[[[.[[[[[(.bbbbb...)))))))).)HHH)F...((((....((((((ee.....))))))<<<<<<<<<<(..ccccccc)BBB]]]]...<<<))))>>>.EE..aaaa(..))jjjjjjj.......AAAA)..))GG)))))))))((((()CCCCCCC(((((.)]]]]]..>>>>>>>..)))))IIIIIII........((..>>>JJJJJJJ}}}}))...)))))BB
|
ASE_00343
|
[ FASTA input ]
|
CUGUGCAAUUUUUGGAUAAUCGCGUAGUAUUUUAAUACUAUGAGGAAAGUCCAUGCUAGCACUGGCUGUGAUGCCAGUAGUGAUUGUGCUAGGCGAACACAUAAGCCUAGGGAUGUGCAUACACAUUACGGCGAAGGAAAUGGCUAAGUCGUUUGAUAUGCCAAAGUACUUCUGAAAGUGCCACAGUGACGUAGUUUUUAUGGAAACGUAAAAAAUGGAACGCGGUAAACCCCUCAAGCUAGCAACCCAAACUUUGGUAGGGGCAUGGGAUAGUUGGAAACGAACAAGCUAUCCUGACUGUCAACAGACGGUAGACAGAUGAUUAUCGAAGGAAAUAAUUCCUAGUUAUUUCCGGAACAAAACAUGGCUUAUAGAAAAUUGCAUAAUAGGUUAAGCUAGCAUUUGCUAG |
[ reference structure ]
|
...((((((((((((((((((.((((((((....))))))))....[[[.[[[[[(((((((((((......)))))).....(((((((((((..........))))))(((((((....)))))).)((.((((.....(((...(((....)))..)))......)))).....(((((............((((((((....)))))))).........)))..))))))))))))))...(((...........)))...(((((((.................)))))))((((((....))))))........)))))))...(((((((((.....))))))))).........]]]]]]]].).))))))))))..........................
|
[ predicted structure ] |
.((((((((((((...(((((((((((((((ff)))))).eeee(....hhhhhhhh.(((((.(((((((((ggg(((.ccc(.[[[[[[[[[[..[[(dddddddd(<<<<<<.<<.))).)))))))))...iiiiiiiiiiiiiiiiiii(.aaaaaaaaaa(..bbbbbb.)))))....)>>.>>>..((((((((....)))))))).GGG.))))))).{{{()EEEE..{{{{{{{.((..)AAAAAAAA))HHHHHHHH.)>.BBBBBB........>>DDDDDD.((((((....)))))).FF)AAIIIIII)DD].......)).((((IIIIIIIIIII))))........]]]]]]].)))))))))))).II)}}}...]]]]CCC}}}}}}}
|
ASE_00344
|
[ FASTA input ]
|
GAACACAGAGGAUCGAUAAUGACCAGGAACUGUAACAGGUUCUGUUUCCUCGUGAGAGGGGCUUGGGGAACCGAGUCUGGCGUUGCUAUAAGAAAUCUACAGCGUUGUUCGUUACUUGUAACGUGGCAACCCUGAUGGGAAUGGUAACGGAUGAUCCAUUUGACGUACUGCUACCACUUGUGAUAGCGGUAAGGUCUGUUGAGUGCAAUCGUAGAGCAAAUGUUCGCAUUUGAA |
[ reference structure ]
|
.........((((((................................((((....))))(((((((....)))))))...(((((((................(((((((((((....))))))).))))............)))))))..))))))....(((((((((((((((....)))))))))))).)))....................((((((....))))))..
|
[ predicted structure ] |
((.(((((((((cc(ff.((<<<<.<<<<<<)).ff(>>>>>>bbb))))).)CCdd.(((((((([[..)))))))).(((((((((e.((...ggggg.)E{{{{{{{{{{{(()FFBBB))))))))]]aa.aaa..FF}}}}}}}}}}})).dddddddddddddddddAAA)))))).DDDDDDDD.>>>>DDDDDDDDDAA.))GGGGG.(((((((DD)))))))..
|
ASE_00350
|
[ FASTA input ]
|
GAACACAGAGGAUCAAUUAUCAAAGACCAGGAACUGUAAAGGGUUCUGUUUCCUCGUGAGAGGGGCUUGGGGAACCGAGUUUGGCGUUGUUAUAAGAAAUCAACAGGGUUUGGUUUGGCAUUUUUCGAAGUGGUUGGCCGAACUCUGAUGGGAAUGGCAACGGAUGAUCCAUUUGACGUAUCACUAUUAACAAGUGAUAAGGUCUGUUGAGUGCAAUCGUAGAGCAAAUGGUAACACAUUUGAA |
[ reference structure ]
|
.........((((((..................................((((((....))))))(((((....))))).....(((((((.....................(((((((((((....))))))))))).................)))))))..))))))....(((((((((((.......)))))))).)))....................((((((......))))))..
|
[ predicted structure ] |
.(((.((((((((((.dddddd.dddd(.((((((<<....))))))ee(((((((aa(.....bbb)))))))(((([[))))(((((((((....(((((.ggggggggggg(..{{{{{(ffffff.))))))FFFFFF}}}}}]]....)))))))))..)))))).))))ccc(((((((.)BB>>.))))))).)DDDD))))GGGGG...CCC..BAA...DDDDDD.EE.GGGGGG
|
ASE_00367
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACAGGGCAGGGUGCUAGGUAAUGUUUGGGGGGCGUGAGCCUACGGAAAGUGCCACAGAAAACAUACCGCCUACGUCCUUCGAGACCGGUAAGGGUGAAAUGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCCGGUGGUAACACCGGUGGCAGGGUAAACCCCACCCGGAGCAAGACCAAAUAGGGGAACUUCGUGCGGCCCGCAUGGUUCCCGGGUAGGUCGCUUGAGGUGUGUGGUGACACACAUCCCAGAUGAAUGGCUGUCCAUGACAGAAUCCGGCUUAC |
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((((......))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((..(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....))))))))...........................))))))))..
|
[ predicted structure ] |
..(((...{{{{{{.))).((cccccc.cccc(.ddd..))(((((((((((((bbbb.bbbb....bbbbb(......eee..eeee)))))))))))))((((((...EEEE...(((((((((...)DDDC))))))))))EEEBB..)))))).((.((((..))))<<}}}}}}))...CCC...((.(((((((BBBB[[[[[(aaa..)))))))((((.)AAA]](((.((((((((]]].))))))))(((.BBB..)))CCCCCC.>>.))).))))BBBB)).
|
ASE_00370
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACAGGACAGAGUGCCAGGUAACGCCUGGGGGGCGUGAGCCUACGGAAAGUGCAGCAGAAAAUAAACCGCCUCUUCGGAGGUAAGGGUGAAAUGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGUGUUCUGGCAACACGACGCGGCUAGGUAAACCCCACUCGGAGCAAGACCAAAUAGGGGAACAUUAUGUGCGGUCCGCACUGUUCCCGGGUAGGUUGCAAGAGGUGUGUGGCGACACACAUCCCAGAUGAAUGACUGUUCACGACAGAACCCGGCUUAU |
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((....)))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).))..)))..)))))))))))))...((((......((((((....(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....))))))))...........................))))))))..
|
[ predicted structure ] |
..(((lllll.((((((jjj({{{{{{..{{{{{{{{i((aaaaaaaa(.hhh))I))).((....((eeeee......e(...bbbbbbbb))..gg(..ggg(...gggggggg()}g(.ggggggggg(()A}}}}}}}..)).GGGG)G))..kk...kkk(..[[[..[[...)GG...)E)]]]..cccc.GGGGG.]])KKKKKG.)AAAAAAA)..EEEEEBBBBBBBB)}}}HHH..GG...)))((CCCC..)).}}}JJJ.GGG....)GGGLLLLLGG
|
ASE_00372
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCUUAGGGCAGGAUGCUGGGUAACUCCCAGCGGGACAGGGCAUAAGGCCUGUUCCAGCGCCAGUGCAACAGAAAAUAUACCGCCGGACUUUGUCCGGUAAGGGUGAAAUGGCGGGUUAAGAGCCCACCGGCAGGCUGGUGACAGCCUGGUCUGGUAAACCGCAUCCGGAGCAAAGCCAAAUAGGGAAGGUAUGGAGCUGCCCGCUCUUCUUCCGAGUUGGCCGCUUGAGAUAAGCAGUAAUGAUUAUCCUAGAUGGAUGACUGCCGCUGACUGUGCGAGAGUGCAGUUAGUACAGAAUCCGGCUUAC |
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((((((........)))))))).)((...(((((............(((((((((...)))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..)))))))))))))...((((......((((((...(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((((((((....)))))))))))......))))))))..
|
[ predicted structure ] |
....(((((((((llll(nn(.hhhhh..((((((m((.dd)M))))).ff(.iii(eee.eeeeeee(aaaa.aaaa(jj(...<<....<<<<<<<))))))))))FF>>>>>((((((b.(((((((c(.....)EEE.(()EEEEEEE(((..kkkk)AAAAAAAA>>.))C)JJ.{{{{{KK...{{{{{.)D.ggggggIII)LLLL.)))B)))>>GGGGGG...}}}}}.(((((...))))).[[[[KK.)))))))..)])).)HHHHHNN(((((((((((....)))))))))))..D)..}}}}}.]]])
|
ASE_00375
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCAACAAAGAGCGCCAUACUUCCUAACGGGAAGGAGGCUGACUGGAGACGGUCAGUUUACAGAAAGUGCCACAGAAAAUAUACCGUUCCGAUAGCUAUCGGGAUAAGGGUGAAAAGGUAGGGUAAGAGCCUACCGCUCCGCCAGUGAUGUCGGGGGCAUGGUAAACCUUAUGGGUUGAAAGAUCAAAUAGGUUCCGCAUUGGAUUAAGUUCCAAGAAGAGUUGCUCGCUCUUACGCGGAAUGGGUAGAUCGAUGGAUCCUGAUUGUGAAGUCAGGGCUAGAUAAAUGGCAAGAAUCCUUUUGGUUUAUAUCAGAUGGAAACAGAACCCGGCUUAC |
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((((((((....)))))))))).)((...(((((............((((((((((....))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......(((((((.(((((......))))).((((((.]]]]))))))..))))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((((((((....)))))))))))......))))))))..
|
[ predicted structure ] |
(((gg..ggg((((((((...(((((((b(.((((((...)))))).((((((((((....))))))))))........aaaaa........a(.ccccccc(.<<<<<<<<<<<<({{{{{{......{{{{{{(..ddddddd.)))))((eeee(()Ahhhhhhhhh)B))iii)}}}}}}...((((....)))).DDDDDDD))))EEEE.III..jjjjj......)))))))))))((((()CCCCCCCffffffff([[[)}}}}}}>))))).HHH..>>>>>GGG...AAAAA...>>>>>>)FFFFFFFF.]]]..JJJJJ......HHHHHHGG..
|
ASE_00376
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCGCAGGGCGGGAUGCCAGGUAAUGCCUGGGAGGUGAAAACCUAUGGAAAGUGCCACAGAAAAUAUACCGCCCCGCCGCGCACGCGCGCUGGGGUAAGGGUGAAAUGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCUGCUGGUAACAGCAGUGGCAGGGUAAACCCCAUCCGGAGCAAGACCAAAUAGGGAAGCAUGCGACUGGUUCGCAAUCUGUGGCCCGCAGAUGCUUCCGGGUAGGUUGCUUGAGGCAUUCGGUGACGAAUGACCCAGAUGAAUGACUAUCCGUUGUCUCCAGGCUAAUGGAGAUUCUGACAGAAUCCGGCUUAU |
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((((((....))).)).)))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((.(((((.....)))))((((((.]]]])))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................(((((((((((......)))))))))))......))))))))..
|
[ predicted structure ] |
......((((((.(((((d((((((((iiiii(((((..bbbbbbbbbbbbbbb.))))[[[[[..[(hhhhhhhh...hhh.))))))((((((((..))))).ccccc(..ffff...ffffffffff....))).FFFFFFFF<<<<<...<<)H.eee(aaa({{{{)FFFFFaa))))D)...(((..HHH....g((FC((((((..BBBBB..HHHHHHH])EEE...>>BBBBBBBBBB))))))jjj.)]]]]].)))..))..)>CCCC..((AA)))))).IIIII.(((((((.))G..))))))))}}}.JJJ...>>>>)}AAA
|
ASE_00377
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCAUGGAAGCGCGGUGCCGGAUAACGUCCGGCGGGGGCGACCUCAGGGAAAGUGCCACAGAAAGCAAACCGCCCUCGAGGCCGAAAGGCUUCGCGGAGGGUAAGGGUGAAAGGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGUCUUUGGCAACAAAGGCGGCAAGGCAAACCCCACCGGGAGCAAGACCAAAUAGGGGCUGCACGGACGAGAGAUCGUCCAGGUCUGUUUCCAGACCCGCGGCCCGGGUUGGUUGCAAGAGGCGUCUCGCAAGAGGCGUCCCAGAUGAAUGGCCAUCACCUCGCAGCAAUGCGAGGAACAGAACCCGGCUUA |
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((.[[[[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((((((((....))))))...))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......(((((((..((((((....)))))).((((.]]]]]]])))).))))))).....))))......((((((((....)))))))).................((((((((....))))))))......)))))))).
|
[ predicted structure ] |
((((....fffffffff(.bbb..bbbbbbbbb(((((...))))).bbbbbbbb.)))).)F.....((((h......((....BBBBBBBB.ccccc....(((ggg(...ddd(.....iii....iiiiiii...)))BBBBBBBBB{{{)))H)......)GGG.}}}<(..)DDD(([[[[[.)>..((((((.jjjj.IIIIIII((((((eeee)))))).((((((EEEE)))))).)CFFFFFFFF))))))((....((((((((....))))))))BBB..)]..CCCC).IIIaaaaaaa))..AAAAAAA.......]]]])JJJJ
|
ASE_00386
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCAUAGGGUGAGGUGCCAGGUAACGCCUGGGGGGCGCGAGCCCACGGAAAGUGCAACAGAGAGCAGACCGCCGAUGUCGGCUAUUCGCCGGCAGGUAAGGGUGAAACGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGUCGGUGGCAACAUGCGACGGCUAGGUAAACCCCGCCUGGAGCAAGACCAAAUAGGGAAGUACGCGAACCCAUGGUUUGCGCCUGCGGCCCGCAGGAACUUCCGGGUAUGUCGCUGGAGAUGAGCGGUGACGCGCAUCCUACAUGGAUGGUUGCCCACGACAGAACCCGGCUUA |
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((..(((((((.....))))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((.((((((((...))))))))(((((.]]]]))))).)))))).....))))......((((((((....))))))))...........................)))))))).
|
[ predicted structure ] |
..(((...<<<<<<<))).(((((((..[[[((((((...)))))).(((((((((((..(((....jj(.......{{{...{{{{{{{{{(aaaaaaaaaa))))AA(((..gggg.....((((((ff.....)))))))AAAAAAAA}.....ddd(.hh}}}.hhh...hh(.>>>>>>>ii...)))..((.)IIbbbb.)HHH.HHH.)))))))))))))FF.HDDDGG.[(.BBBBcccccc.((((((((....eeee))))))))GG)))))))..}}}}}}}}JJ)]]]]......CCCCCCEEEE
|
ASE_00393
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCAAAGGGCAAGGUGCCAGGUAACACCUGGGGGGCGCGAGCCUACGGAAAGUGCAGCAGAAAGUAUACCGCCCGGCGAUCCACCUUCGCGGUGGGUCACCAGGUAAGGGUGAAAUGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGUGACCGGCAACAGGCACGGCGAUGGUAAACCCCACCCGGAGCAAGACCAAAUAGGAAUCCGUCAGCUGCGGCCCGCAGCGGAUUCGGGUAGGUCGCUACAGGCAGGUGGUGACACCUGUCGCAGAUGAAUGAUCGUCCACGACAGAACCCGGCUUAU |
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((((((((((.....)))))))))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((....(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....))))))))...........................))))))))..
|
[ predicted structure ] |
.......(((((((((((...jjj(..kkk.kkkkkk.))KKKKKKgggg((.mmmmm((()KK..ffff.)K.....)))ggggJJJ))).((((((((.{{{{))))))))))).GGGG.cccc(...((((((([[[....)))))))cccc.))((h..((.FFFFiiiiiiii(..dddd))H)C...((...)DD..ee..((((((((bb)DDllllllCCC.G)))))))II)).LLLLLL]]].((((((((}}}}))))))))G)...G)..BBIIIIIICCCC......G))MMMMMEE
|
ASE_00412
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAGGAAAGUCCGGGCUCCCCAAUGGCCAGGCUUGCUGGGUAACGCCCAGUGCGGGUGACCGUGAGGAGAGUGCCACAGAAACACACCGCCGAUGGCUCCGCUUCCGCUGCGGUGGAGACGAGCACAGGCAAGGGUGCAAAGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGCAGCAUCGAGAGGUGCUGGCUCGGUAAACCCCGGCCGGGAGCAAGGCCCAGGGACCAACGGUUGGCCAUGACACCGGUCCCGCCCCAAGUGCGCCGCUCGAGGCCGCCGGAGACGGCGGUCCCAGACAGAUGAUCACCCCGGGCAGGGUCCGCCCCACCCGGAACAGAACCCGGCUUA |
[ reference structure ]
|
........(((.((((((((((.[[[[[[[.(((.(((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((..(((((.(((((((((....)))))))))))).)))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))))))).)).)))..))))))))))))))...(((...((((((...(((.]]]]]]]..)))))))))...........)))......((((((((....)))))))).................(((((.((((.....))))))))).......)))))))).
|
[ predicted structure ] |
((((((....{{{{{{{)))))).((((((((.cc((((((((...))))))).<<<<<<.((((..(((...((((..........[[[[(aa(gggggggggg)))dddddGGGGGGG.dddd(...)))).bbbbb....b(()]]]]....eeeee(...(((((((....)))))))DDDDDf(.......hhhhhhh.)DD.fffff.bbbbbb.D)))))))))))((((..BBBBBB))B....)EEEEE.)F)AA.(((((((()>>.))))))))GGG......)).))..}}}}}}}.FFFFDBBBBB>>>>CC..)H....HHHHHHF..
|
ASE_00413
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAGGAAAGUCCGGGCACCACAGGGCUGGUUGCUGGGUAAUUCCCAGUGCGCGCGAGCGUGAGGAUAGUGCCACAGAAAUGUAGACCGCCAGGCUCGUCCUGGUAAGGGUGCAACGGUGCGGUAAGAGCGUCACCAGCAGAGUCGAGAGGCUCUGGCUAGGUAAACCCCGCUGAAGGUGCAAGGCGAAGGUAUAUCUCGAGAAAACGGUGGCCCGCCGCCUCGAGUUGCCGAUGCUGCUAGAGGGUUUGAGUAAUCAGGCUCCCAGAGAGAUGGCGGUAAAAACAGAACCCGGCUUA |
[ reference structure ]
|
........(((.(((((((((...[[[[.((..((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((.............((((((((.....))))))..)).......((((((.......)).))))(((((((((....))))))).)).)))..))))).))...))))...((((.........((((((....((((.]]]])))).)))))).......))))......((((((((....))))))))..........................)))))))).
|
[ predicted structure ] |
((((.((((.((((gggggg(.[[[[[[f(c((jjjjjjj..)CF)...gggg<<<<<<(.eee)))).bbbb(.......((((.ddddddd.)>>>>>kkkkk(.....))))..KJJJJbbb...bbbbbb..bb((....iiiiii)JJJ))]KKKK>)bbb.)))))III...)GGGG.(((((.)BBBB.III)BB......(((((()]))))))EEE..)))))BBBBBBBBB...((((((((hh..))))))))]]...)]..DDDDDDD....HH...]GGGGGGBBB
|
ASE_00416
|
[ FASTA input ]
|
UGCCCCAGGAUAGGGGUGCGGUCGCGCCCGGGGGACUUCCCCCCUGGGUGAGGAAAGUCCGGGCACCAUAGGGCAGGGUGCCAGCUAACGGCUGGGCGGGGCAACCCGACGGAAAGUGCCACAGAGAAGAGACCGCCAGCGGCCGGGGCUUCCCCGGUGCGGGCAAGGGUGAAACGGUGGGGUAAGAGCCCACCGCCUGGCCUGGCAACAGGCUGGGGCACGGCAAACCCCACCCGGUGCAAGGCCCGAUAGGCAGGAAGGGCUUGCCCGGCCCGUUAGAACCUGCGGGAUGGGCCGCUUGAGGCCGGUGGCGACACCGGUCCCAGAGAGAUGACCGCGUAAAACAGAACCCGGCUUACGCCCUAUCCUGGGGACCCCGAGCGCAGGCUCGGGG |
[ reference structure ]
|
.....((((((((((((((((((.((((((((((......))))))))))....[[[.[[[[[((((...{{{{.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((.(((((((...)))))))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).))..)))..)))))))))))))...((((......(((((..(((((.}}}}))))).......)))))......))))......((((((((....))))))))..........)))))))..........]]]]]]]].).))))))))))....((((((((....))))))))
|
[ predicted structure ] |
((bbbbbbbbbbbbb.bbbbbbbb((((((((((..{{{{)))))))))).b(...(((((((((((....<<<..))))))..fffffffffffffff(.ii.iii...}}}}..iiii...((d......((>>>ccc.ccccccc)D)CCCCCCC.)))))..gggg.....((((((((..eeeeeeeeee(((((((((hh..)))))))))HH..IIII.))))))))EEEEE)).((((((.[[.(((((..)).)FFFFFFFFFF.FFFFF..)))))III.))))))CCCII.((((((((aa..)))))))))G.......GGGBBBBB]].......BBBBEEEEE...BBBBBBBBBBBBB.((((((((AA..))))))))
|
ASE_00417
|
[ FASTA input ]
|
UAGGCGAGGGGGCUGGGGGCUGUCGGGCUCGUACCCGAGGAAGUUCCGCCCACCGCACCGGGGCCGCGGUGCCGCAAGGCACCUCCCGAGAGGGAGGGCAACGGCACAGAAACGACACGUCCCUCGGGGGAUGUGGAUGAAAGCGGAGAAGGCUCCUGGCGACAGGAGCCGAGCUAACCCGCAGACAAUCCCGAGGGGAGCGGUGAAACGGCCGUCCCGCGGGGUGCAAGGCCGAGUUAGGGCCAAUGAGUUCCCGGUGUGAGGCCCGUGGUAGGCCGCUUAGUCGAAUGCCCCCGCAGGUACAGAAGGCGGGCUAUAGCCCCCUCGCCUA |
[ reference structure ]
|
.(((((((((((((((((((...(((((....)))))....[[[.[[[[[((((.{{{{{{{.((((((((((....)))))(((((....)))))((...((((............((((((((((((.............((((....((((((((....))))))))........))))......))))))))))..))........)))).)))))))))))...((((......(((((...(((..}}}}}}}))))))))......))))............))))))............]]]]]]]]..))))))))))))).
|
[ predicted structure ] |
((((((((((((((((((((((b..bbb((hhhhhh(.ccc..cccccc))..bbbbbbbbbb.b((.((((((aa.aa(.((((((....))))))[[[.)))))).....eeee.)Hgggggggggg..gggg(.dd...CCCCCC..dddddddd))).DDDDDDDD.bbb(.(()GGGG..DD.GGGGGGGGGGiiiii(...)))))).CCC.<<<<<<<<<...)]].BBBB.B)BBB..]A.B)BBBBBBBBB).(((((((.>>>.)IIIII..EEEE..AAA>>>>>>.HHHHH.....))))))).)))))))))))))))
|
ASE_00422
|
[ FASTA input ]
|
CAUAGGGCAGGGUGGUGGCCAACAGCCACCCGGGGUGACCCGCGGGACAGUGCCACAGAGAACAGACCGCCGGCUGCUUGCAGCCGGUAAGGGUGAAACGGUGGUGUAAGAGACCACCAGCGCUCCGGGCGACCGGAGCGGCUCGGUAAACCCCACCCGGAGCAAGUCCAGACAGCGCAUGCACGACGCCUCGGCGUCAGGGAGACCGGCCCGGUCGAGUGCGCGGGUAGGACGCUGGAGCCGGUCAGCAAUGGCCGGCCGAGAUGGAUGACCGUCACUGCACCAACGUCGGCAACGACGGUGCGGG |
[ reference structure ]
|
(...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((((....))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..))))))))))......((((.....((((((....(((((....)))))...((((((.]]]])))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................((((((((...((((....))))))))))))
|
[ predicted structure ] |
.....(((((((((((dddd....))))))){{{{(.<<<<<<<<<....)))).......((...>>(((((((((aa)))))))))...gggg....gggggg))..((.GGGGGG.(([[[[[[[(bbbbbbb.))DDDD((((..)>>>>.)]]]]]]]..(((((.....(((.ccc..AAGGGGccccccc(.......eeeeeBBBBBBB.)))>>>}}}}..)EEEEECC.((((((((CCC.))))))))ff...))))).)))))).(((((((...CCCCC...FF..))))))).
|
ASE_00427
|
[ FASTA input ]
|
CCACAAGCUGCAUGCCACAUGUCAUCCCACCCCCAUGUCCCUUGGGAAGGUCUGAGUCAAGGGCCAGAGCACCCUAACAGGACUUUCCCUGAGUUUUGGGGAGGUGAAUUCCCAGAGAACUCAGCUCCCUGCGAGGUCAGACUGGGCUGGACAUGCCACGGACCCACCCUUCUGGGAAGGGCCAGGUGGAUGCCUCCUCAGCCAGAACUUGGAACAGACUCAUGGCCAACCAAGUGAGUUCAAUGAGGUGAGGCACCCCACCCAAGGGGCCUCAUAACCCAAUUCA |
[ reference structure ]
|
(........(((((........))))).........)...............((((.....((((....(((((.....)))))(((((((.....)))))))(((((((...........(((..................................................................................))).......)))))))))))....................((((((((.((.......)))))))))).......))))
|
[ predicted structure ] |
......((((((cccc.cccc(..gggggg[...c({{{{{{{{{{..{{{{{{{.{(...ddddd..))..cc(....aaaaaaa((.hhhhhhhhhhhhhhhh)}.bbbbbbbbb...aaaaaaa..))))CC]}}}}}}}AAAAAAA)CGGG....))A.......BBBBBBBBB(((...)GGGC)CHHHHHHHHHH...CC((((((....HHHHHHDDDDD..))))))AAAAAA.eeee(.fffCCCC.))).}}}}}}}}}})EEEE........FFF
|
ASE_00428
|
[ FASTA input ]
|
UGGCCCGGGACGAGGGCGCGGUCGCGCCGAGGGCCGAACCCCUCGGGUGAGGAAAGUCCGGGCACCAUAGGGCAGGGUGCCAGGUAACGCCUGGGCGGGGUAACCCGACGGAAAGUGCCACAGAGAAGAGACCGCCAGCGGCCGGGGCUUCCCCCGGUGCGGGCAAGGGUGAAACGGCGGGGUAAGAGCCCACCGCCUGGCCUGGCAACAGGCCGGGGCACGGCAAACCCCACCCGGUGCAAGGCCCGGUAGGCAGGGAGGGCUUGCCCGGCCCGAGAGAACCUGCGGGAUGGGCCGCUUGAGGCCGGUGGCGACACCGGUCCCAGAGAGAUGACCGCGGAAAACAGAACCCGGCUUACGCCUCGUCCCGGAGGCGCCCGAGCGUUCGGGCG |
[ reference structure ]
|
.....((((((((((((((((((.(((((((((......))))).))))....[[[.[[[[[((((...{{{{.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((.(((((((....)))))))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).))..)))..)))))))))))))...((((......(((((..(((((.}}}}))))).......)))))......))))......((((((((....))))))))..........)))))))..........]]]]]]]].).))))))))))....(((((((....)))))))
|
[ predicted structure ] |
((((ccccccccccc.cccccccc.))))...((((.(((([[[[[[[[.[[...[(<<<<<((((.aaaa(..bbbb(gg.)))..ddddddddddddd(..)BB..(((....{{{{............{{{{((((iiiiiii)))jjjj))).eeeeee...)))).....)JJJJ(((..ffffff))).(((((((((hh..))))))))))E.))))..)EEE)BBAA(((.(((()EEDDDAA}}}}}}}}FFFFFF.IIIIIIIkk......DDDDDDGG.kkkkkkk)))).((((((((HH..))))))))DD.......CCCCCCCC.........)))KKKKKKKKKCCCCCCCCCCC...DD>>>>>]]]]]]]]]]]
|
ASE_00429
|
[ FASTA input ]
|
GAGGAAAGUCCGGGCUCCACAGAGCAGGAUGCCGGCUAACGGCCGGACGCCGCGAGGCGAGGAAUAGGGCCACAGAGACGAGCGUAUUCAGUUACGGUGAAACGCGGUAACCUCCAUCCGGAGCAACACCAAAUAGGCAGGCGAUGAAGCGGCUCGCUGAGUCUGCGGGUAGGUGGCUUGAGCCGGUCAGCAAUGGCCGGCCUAGAGGAAUGGUUGCCACCGACAGAACCCGGCUUAC |
[ reference structure ]
|
.....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((....))))).........)))..)))))))))))))...((((......((((((...(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....))))))))...........................))))))))..
|
[ predicted structure ] |
.......(((((([[[[[.....[(.aaa(bbbbbbbb.bb.))))))((((((.eeee(((((((.{{{{{......BB.)B.))))).fff..eeee...))))))..((((.)BBBBBBBA..EEEE...(((((((((..cc(.dd..))EEEE..))))))..<<.<<<<<(.gggggggg)DDCC..AA]]]]]])))))))..}}}}})GGGGGFFF...GGG>>>>>>>.
|
ASE_00430
|
[ FASTA input ]
|
CACAGGGCAGGGUGGUGGCCAACAGCCACCCGGGGUGACCCGCGGGACAGUGCCACAGAGAACAGACCGCCGGCUGCUCGGCAGCCGGUAAGGGUGAAACGGUGGUGUAAGAGACCACCAGCGCUCCAGGUGACUGGAGCGGCUCGGUAAACCCCACCCGGAGCAAGUCCAGACAGCGUGUGCACGGCGCCUUCGGGCGUCGAGGAGACCGGCCCGGUCGAGCGCGCGGGUAGGACGCUAGAGCCGGCCAGCAAUGGUCGGCCCAGAUGGAUGGCCGUCGCCGCGCCACCGGUAACGGGGGCGCGGA |
[ reference structure ]
|
(...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((((...)))))))))..)).......((((((.......))))))((((((((((....)))))))).)).)))..))))))))))......((((.....((((((...(((((((....)))))))..((((((.]]]])))))))))))).....))))......((((((((....)))))))).................((((((((((((....))))))))))))
|
[ predicted structure ] |
(((..eee(.bbbbbbbbbbb.bbbbbb(ccccc)))(((((((((((..)EEE..............(((((((((aaa)))))))))..(((((...[[[[[[[[[......[[[((..(((((((()CC.)))))))){{{{{{.....[[)))))]].CC..))))......((((CB))))ddddddddddddddd..))....AAABBBBB}}}}}}.)))))))..DDDDDD...((((((((<<..))))))))((...]]].BBBBBBBBBBB]]]]]]]]]>>..DDDDDDDDD)).
|
ASE_00434
|
[ FASTA input ]
|
GUGUAAAAAGCUAAUUGCUGCAUUUUUUAAAAAAUGUAGAGGAAAGUCCGUGCUCACACUAACUGUGAUGUUAGUAGUGUUUGUGUAUGUAUAAUUAAUAAGGCAUAGCAUAGGCAUAUGACGGCAAAUUUUUAAGCUAAGUGAUUUAAAUUAUAUGUUUAAAAAUUUAUAAAAGUGCCACAGAGACGAUUAAUCAAGAAAUUGAUGAGAUGAAACGUUGGUAAACCCCACAAGUGAGAAACCUAAAUUUCGGUAAGGGAAUCUAAUUUAGUAAAUUAAGAAAUUAAAUUAGGAUAGAAUUGUUUACAAUUCUAUAGAUAAAUAAUUAGCGCUACAUUUUUGUAGAACAGAACACGGCUUAUUUUUACAU |
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((.((((((((.....).)))))))....[[[.[[[[[(((((((((((......)))))).....(((((((((((..........))))))(((((....)))).)((.((((....((((..((((.....))))....))))....))))......(((((..........((((((((....))))))))..........)))..))))))))))))))...(((...........)))...(((((((..................)))))))(((((((((....)))))))))........))))))).(((((....))))).......]]]]]]]].)))))))))
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((((((((((((((((((((ggggggggga......((ddddddddd((((((({{{(hh)))))).(((((((((c((ffffffff..ff..f(.<<))C))))))))).ee.)>nnnnnnnnnnn(>F..kkkkk))FFFFFFFF)NNNNNNNNNNN..)A)))))))HH}iiiii([[[KKKKK))...(((.jjjjjj....)]]]mm(..lllll.))))EEDD..)LLFF.LLLMMJDD..JJJ..(((((((((((..}}bbbb..)))))))))))((((((((((II)))))))))).III...)))))))).)GGGGGGGGGJJ...))....DDDDDBBBB)))))))))
|
ASE_00437
|
[ FASTA input ]
|
AGUUGACUGGGUAGUCGCUGCCUUAUUGACGUCCCUUGGCCUAUCGCCAGGGAGACUGAUAAGGGGGAGGAAAGUCCGGGCUCCAUAGAGCAGGGUGCCAGGUAACGCCUGGGGGGCGCAAGCCUACGACAAGUGCAACAGAGAGCAAACCGCCGAUGGCCUCUCUUCGGGAUGGGAUCAGGUAAGGGUGAAAGGGUGCGGUAAGAGCGCACCGUGCGACUGGCAACAGUUCGUAGCAGGGUAAACUCCACCCGGAGCAAGACCAAAUAGGCCUCCACAUAGCGUUGCUCGCGUUAGGAGGCGGGUAGGUUGCUUGAGCCAGUGAGUGAUUGCUGGCCUAGAGGAAUGGCUACUACCGCGCAAGCGGAACAGAACCCGGCUUAUACGUCGACUCCACCU |
[ reference structure ]
|
.((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((.....)))))).)))).))))))))))....[[[.[[[[[((((...{{{{.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((..((((((((((...))))))).))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((...((((((.}}}})))))))))))).....))))......((((((((....))))))))..........)))))))(((((....)))))......]]]]]]]].).))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
((((((((((((((((((((((((.(((.((((((((((ddddfdd(d..d(((ggg(qqqqqqqqqqq(....mmmmmm)))).nnn.n(..ooooo))ddddddd())))))))))..hhhhhhhhh))).a((........ee...((iiii.iii)MMMMMMQ.))HOOOOO.ppppp(..jjjjj.....jjjjjjjj...)N)DFDD.pp((cccccc..)QQQHHppppp)))))....(((.QQQGGGD)A...III..(k([[[[[(.lll.))DDDDDDD)PPDLLDL]]]](()]K)))))JJJJJCCCCCC.)))))))))))DDNNN..PPPPPHHHHHHJJJJJJJJ..PP.........))IIIIQQQQ..))))))).PPPEE
|
ASE_00451
|
[ FASTA input ]
|
GGAGUUGACUAGACAGUCGCCGCUUCACUGCCGUCCCUUUCGGGGGAGACAGGUGGAGGGGAGGAAAGUCCGGGCUCCAUAGGGCAGGGUGCCAGGUAACGCCUGGGAGGCGCAAGCCUACGACAAGUGCAACAGAGAGCAAACCGCCGAUGGCCCACGCAAGUGGGAUCAGGUAAGGGUGAAAGGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCGCGGCUGGCAACAGUUCGUGGCAUGGUAAACUCCACCCGGAGCAAGGCCAAAUAGGGGUUCGCAUGGUACGGCCCGUACUGAACCCGGGUAGGCUGCUUGAGCCAGUGAGCGAUUGCUGGCCUAGAGGAAUGACUGUCCACGACAGAACCCGGCUUACCGGUCAACUCCAC |
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((.(((((((((((((.(((((....))))))))).)))))))))....{{{.{{{{{((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((..((((((((....))))).))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....))).))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((....(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....))))))))..........)))))))..........}}}}}}}}.).))))))))))..
|
[ predicted structure ] |
((((((((((.((((((((([((ggggg((bb.(((((((((..kkk......)))))))))......((((((jKKK.((iiii.)Jccccc(hhh...)))))))..((((...(((((.....<<<<....<<<.((..aa(dddd.ddddd...))..))))).{{{{(ee.eeeee.....eeeeeee....))))EEEEEEElllllllll..llll.))CCCCCDD...>>>EEEEE.LLLL..DDDDD..)).(((((((..DDAA.mmIIII>>>>))))))).ggggggggg)}}}}])))GGGGGMM.LLLLLLLLLEE..BB..)))))))).........HHHGGGGGGGGG))))))))))..
|
ASE_00454
|
[ FASTA input ]
|
UCCUACGCAAUUUUACCUGCCUUCAUAAGGAACUCAAAGGGUUCAGUUAGUACUUAACUUACUAUAUAAGCAGGUGGGAAAUUCGGUGGAACUCUAAGAGACAAUCAGCCGGAUCUUUAGCUUAAUUGUUAAAGAACUGUUUCCGUGAGGAAAGUCUGGGGAACUGGACUUGCAGCUGCUGUCACAAGAAAUCAACGCCCUUUGUUGGUGGAUGGGAAGGCAGUAGAGGUCUCUUUUGGCUUGGAUGCAAAUUUGGACGUCCAAGGCUUGCUGAGUGCAAUCGUGGGACAAAGAA |
[ reference structure ]
|
(((((((.......(((((..........(((((((((((...........)))))))).))).......))))).....................((((((.....................................(((((....)))))((((((....)))))).......(((((((...........(((((.......))))).......)))))))...))))))...((((((((((..........))))))).))).............)))))))(...)..
|
[ predicted structure ] |
(((((((...((((((((((bbbb(((.((..))eeeeeeee.eeee(.<<<<<<<..<<<<<<)))..)))))))))).((((((((((..)))ffffff(..ddd)))))))((((((c((.[[[)C))))))EEEE(((((((BBBB.((((((((.)].))))))))aaaaaaaaaaa(........{{{{.EEEEEEEE.>>>>>>))))))))AAAAAAA..)DDDFFF.FFF((((((((..]])}}}}.))))))))..AAAA>>>>>>>...))))))).......
|
CRW_00648
|
[ FASTA input ]
|
UAACAAGGUCUCGCCUGUACAGCAGCAUGAUCCCUCCGUCGAGUUUUCAUGUACCGAAGGCCUUAGCCGCCCGAAAGGGUGCCCCCGCCGCGACGCGGCCGCCACGGGAGCGGGCCGCACCAAGGAACGCGGGGCUGAAAGCGCUAGUCCGACCGGCCGAGUGCCGAUCGGGCAACACCGUCAAAUUGCGGGGACUCCCUAACAGCUCUCGACCACCAAGCGGGCGCCCGAAAGGGGCCCGUGGCCAGGGUCACGACCUCGGGUACGGUAACAGCGUCGAGAGAUGAGGCCGUUCCCCCCCCCCACCCAUGGGUGGCCGGGGGGCGCGGCGGAAAUGGGUGAUCCGCAGCCAAGUCCUACGGCCGGGCAGCCAGCCCGCGCUACGGAUGCCGUUCACAGACUAAAUGGUGGUGGGUCCGGUGGCGCCAGCAGCGCGCGCCGGGCUUAAGAUAUAGUCGGGCCCCUGCCGAAAGGUGGGGGGGGACGCAGAGUCACCGCUCCGUAGGUGAACCUGCAGAAGGAUCAA |
[ reference structure ]
|
....(((((((.....(((((......(((...(((....)))...))))))))...)))))))((((((((....)))))((((.............................................))))........))).(((((((((((.....)))))))))))..(((((((....((((((....(((......((((((((((((..((((((.(((....)))))))))..(((.(((....)))).))....)))....).)))))))).(((((((((((((((...(((((....)))))..)))))).)))))))))..)))...))))))(((..((((...((((((((.....))))).)))..))))..)))...[.[[[[[...)))))))(((((((((((((.....)))).))))))))).......]]]]]]((((((((((....))))))))..............))..............................
|
[ predicted structure ] |
((....((((((((tt(r(((ii.i(.nnnnnn.nnnn(aa.aaaaaa.)))))((..qqqqqq(ss.sssss(..[[[[[[[(jjjjjjj(.((oooooooo.))fffffffff.fff(...ccccc))))))R)AAAA(((((..(((((<<<<<<(.)CCC)C.)CFFFF..ggggggg(...mmmmm(bbbbbbb(...hhhhhhhh((..ll(.)I)FFFFFFF...hhhhhhhhhhhhh..hhhhhh(pp..))))).((((((...(()LL)HHHH.)FJJJJJJJ]]]uuuuuuuuuuu..)HOOOOOOOO)BBBB)]]]]SSS...)HG)HHHHHH{{.II..{{{(kkk)GGGGGG)).SS.SS)BBBMMHH)AAAA))))))PPNN.)}}}..>>>>>>.dddddddddddQQHHHH}}))))).DDDDDDDDDDD...))KKK.HHHHHHHHH((NN...UUUUUUUUUUU..))...MMM.QQQQ)TT((((((..))))))....NNNNNN.
|
CRW_00654
|
[ FASTA input ]
|
ACCAGGCGUUAAAAAGCAGACUCAGCGCCUAAGAGUCAGUGGGAAACCAUUGGCUAGUGCUUGGGUUUCAUUACUCAAGUGCAACACUGAUCAAAUUGCGGGAAAGCCCUAAAGCUUUGCUAACCAAGCUAAGUGUGAAAGCACUCAGUGGCCGGGUUAAAGACCUCGGGUAUGGUAAAAUCAGCAAAGAUGCAACAAUGGGCAAUCCGCAGCCAAGCUCCUGAAGCCUUAUAGGCAAUGGAGAAGGUUCAGAGACUAAAUGGCAGUGGGCCAACUUGUUGGCUUAAGAUAUAGUCCGUCCCAGCUGAAAGGCUGUCUGCUAGAGGAAGACCUUUCUAGGUCUGAGAGCUAGUAGAGGGUAGGAGAAGUCUCUCCUACCUGGAGGAAACGGGAGCC |
[ reference structure ]
|
...(((((((.............)))))))...(((((((((....))))))))).((((((((((......))))))))))..(((((.((....((((((....(((.....(((((((((((..(((((((((....)))))))))..(((.(((...)))..)))....)))....).))))))).((...))..)))...))))))(((...((((....((((...))))...))))..)))...[.[[[[[...)))))))((((((....)))))).......]]]]]]((..(((((....)))))((((((((....((((((....)))))).....))))))))((((((((((....)))))))))).......)).......
|
[ predicted structure ] |
.(((((((((....ddddddddd)))))))...(((((((((....))))))))).((((((((((aaaaaa))))))))))..((((((bb...bbbbbbb..bbbb(ff...fffffff.fff(eeee..((((....))))))))))((()BBBB...kkkk(.iii(()EEE...<<(EFFFFFF.jjj....jjjjjc..BBBBBBB((..ggggggg.gggggg.)C)))AAAAAABB)KKKK..DD((((...((((..(((((((((hh))))))))).)>>.FF)GGGGGIIIFFFF..G)JJJJDDDDDDD...)J.(((((([[[[))))))....))))JJJHH{{{{{{{{{{))))}}}}}}}}}})).]]]].GGGGGGG.
|
CRW_00658
|
[ FASTA input ]
|
AACAAGGUUUUGCCUUGAGCAGACGCUUGCGGAAGCCUUAGCAGCCCACAAGGGUUCCCCUCGCGACUAUAUUUAAAGGAAGGGGAUUGAAUGCUAGUGCCUGAGCUGCCAACUUGGGUGCGACAUCGCCAAAUUGCGGAGAACUCCACAUUUGCCUCGAUUACCAAGCGGACCGCCGAAAGGACCCCGUGGCCGGGCUAAUUGCUUUGGGUAUGGUCAAAACAUCGAGGAAAAGGAUGAUCCGCAGCGAAACCCUCUUGUUGUACAAAAGUGGGUGGCGUUCACAGACUAAACGGCGAUGGGUUCCAGAAAUUCGAAACCUGGGCUUAAGAUGUAGUCGGUUUGUCUUCGAAAGUGGCAGAUUGCAGAGUUUCACCGUUCCGUAGG |
[ reference structure ]
|
...((((((((....................))))))))((((((((....)))))(((((...................))))).......))).(((((((((.......)))))))))..(((((((....((((((....(((.......(((((((((((..((((....((....))...))))..((((((.....)))).))....)))....).)))))))....)))...))))))(((..((((((((.........))))))))..)))...[.[[[[[...)))))))(((((.((...........))))))).......]]]]]]((..(((((((....))).))))............))..........
|
[ predicted structure ] |
..((((((bbb))))))(((((.((hhhhhhhhh((({{{(.ffffff..fffffffffff)).jjjjjjjjjjjjj(..FFFFFF.jjjjjjjj((((((((((gggggg.)))))))))..jjjjjjj...jjjjjj(....jjjjj.jjjjjjjjjj(jjjjj(jjjjjjjjj(....jjj.jjj(.)))JJJ))FFFJJ))))JJJJJJJJJJJ.....JJJJJJJ....JJ.h(.)JJJJJJhh..FFFFF.)))))JJJJJJJ.JJJJJ)JJJJJJJJ.(((((....JJJJJJJ(((JJJ.BBB.aaaaaa)))FFF}}}.....((((((JJJJJJJJ.AAAAAA..GGGGGG)))))).))))))H.HHHHHHHHHHH
|
CRW_00663
|
[ FASTA input ]
|
CUACCAUGGUGGCAACGGGUGAGCACGUUGCCCUGUAGGACGCAAGACCGUCGGGCGCGUCGCGGCGGCACCGGCGACACGCUGGCUCAGAUGAGGUCUCCGGGGCCGACUCUCGGUACGCCACGGGAGCCGCCCGAACGCAUGCAAAGCGGUGGGCCUUCCCAGGGGGCUUUUGGCACAUGCUACCGCCGACUGCGGUGCCGGCAAAGUGAACGGGGAAUUAGGGUUC |
[ reference structure ]
|
................((((((.....)))))).((..((((......))))..))..((((((......((((((((.(((((...))).))..))))))))(((...((((((........))))))..)))...[.[[[[[...))))))((((((((...))))))))......]]]]]](((((((....)))))........))...................
|
[ predicted structure ] |
.(((..cccccccc..cc((((((.((((.<<<<<<..))))...dddd.dddddd(.(((([((eeeeeeee)]))).bbbb.))))){{{{{{{{{{{{{{{{{{..{{{{{{))).((((}}}}}}.)DDDDDD.(((.aaa..BBBB)))}}}}}})}}.}}}}}}}}}))))...}CCCCCCC)).(((.EEEEEEEEAAA.)))..>>>>>>.CCC..DDDD.
|
CRW_00664
|
[ FASTA input ]
|
AGGGCAAGUCUGGUGGACACACGCAUGUUGUCCGGCGCCGAGGCCCCCGGCGUUCGACUGCUGACGCCAGGGAAAACGUCGGCCCCUAAGAUCGGGCGCGACUUAGUGGCGUCGCCGCGAGUAUUCUUGUACGGGGAAGCGCACUUCGCUGUCUCAUCCCGUGUGGCCACAGCCUCCUUAACGCGCGCCAGGUGCCGGUGACUUCCGUGUACCGCUUGAGUACGUGCUAAUACCGCCGGACGGCAUUCCCUCGCCGGGUGCCCAGGGAUAUUGAUCGAGCAGCGCGUAAUCAGCUCAUAGCGUAUAUAAGUGGCCAGCAGCCGCGGUA |
[ reference structure ]
|
..........(((((((((((....)).))))...)))))........((((((....(((((((((((.....((.((((((((........)))).))))))..)))))))))))(((((....((((((((((.((((.....))))......)))))))))).....)).)))...[.[[[[[...))))))((((............))))......]]]]]].(((((..(((.(((.......)))))))))..................................................)).................
|
[ predicted structure ] |
.((((((((((.((((...eee(.ggggggggggggg..gggg(.ccccccc(a((.kkkkkkkkkkkkkkk..)AfffffffKKKff(lllllllllllllll))KKKKKKKK))))LLLL{{.(((.jjjjjjj)))...))).iiiiii((((JJJJJJJ[[[[[[(.)LLLL.)LL.)KLLLLLF((((FFFFFFF)))).)FCCbbbbbb.))))ddddddd(.hhh.CCCCCGGGGGGGGhhhhhGGGGGGG)))))HHHHH(((GGEEE(((()HHHDDDD}}..))))DDDIIIIII))).)]]]]]]KKK)..BBBBBB
|
CRW_00671
|
[ FASTA input ]
|
AACUAUGACUCAACCUUUUGAGGGUCAUUAAAGCGGCGUGAAAACGUUCGCUAGUGAUCUGAAGCCUUUUCAGGUUGCGACACUGUCAAAUUGCGGGGAAGCCCUAAAGAUUCAACUACUAAGCAGCUUGUGGAAACACAGCUGUGGCCGAGUUAAUAGCCCUGGGUAUAGUAACAAUGUUGAAUAUGAAUCUUGAUUGAAGAUGAAAUGGGUGAUCCGCAGCCAAGUCCUAAGGACGUAUAAUGUCUAUGGAUGCAGUUCAACGACUAGAUGGCAGUGGGUGUUGUUAAGACUUAGGUUUUUACAAUGCUUAAGGUAUAGUCUAUUCUCUAUCGAAAGAUAGCGUAUGGUGCUC |
[ reference structure ]
|
....(((((((..........)))))))...((((((((....))).))))).((((((((((.....))))))))))..(((((((....((((((....(((.....(((((((((((..((((((.(((....)))))))))..(((((((...))))).))....)))....).))))))).((((((((.....))))))))..)))...))))))(((..((((...(((((.....)))))..))))..)))...[.[[[[[...)))))))((((((((((((((....)))))))))))))).......]]]]]]((.(((((((....)))))))....))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((...eeeeeee))))))){{.{{{{{{(.bbb.((((((aaaa(((((((((((ii.)))))))))))..aaaaaaaaaaaa.(((((..kkk(fffffffffffff(.ddddddd(hhhhhhhhhh...hhhhhh(jj.))))..k(.)))))IIK))JJH.....<<<<<<<<.HHHHHHHHAAAA..<(((...(()HHH.)))HHHHDD...ggg(DD.))))))((((()>>>))>)))>D.>>>>))))..((((AAAAAAAADD)}}}}}}.(((((}}.FFFFFFFFFFFFFKKK.[[[[[))))).BBB))))EEEEEEE.AAAA.GGG.]]]]].
|
CRW_00672
|
[ FASTA input ]
|
AACUAUGACUCAACCUUUUGAGGGUCAUGAAAGCAGCGUGAAAACGUUUGCUAGUGGUCAAGUUGGGUAUUCUGAUUUGACUGCGACACUGUCAAAUUGCGGGGAAGCCCUAAAGCCUUAUUCACCAAGCAAUUGUGGAAACACUCUUGUGGCCAGGUUAAUAGCCUCGGGUAUGGUAACAGUAGUAAGGAUAAAUGUGAAAAAUGGGUUAUCCGCAGCCAAAUCCUAAGGGGAAAAAGAAUUACAAAUCCGUAUUUUCAUCCUAUGGAUGCAGUUCAACGACUAGACGGCAGUGGGUACUGCUCUUUUUUACUCUGAGUAGUGCUUAAGGUAUAGUCUGUCCUUUUCUGAAAAGAGAGGGAGGGGAGGUGCUCUUAAGGU |
[ reference structure ]
|
....(((((((..........)))))))...((((((((....))).))))).(((((((((((((.....)))))))))))))..(((((((....((((((....(((.....(((((((((((..(((((((((....)))))))))..(((((((...))))).))....)))....).)))))))...............)))...))))))(((..((((...((((.((((................))))..))))..))))..)))...[.[[[[[...)))))))((((((((((...........)))))))))).......]]]]]]((.(((((((....)))))))........))...........
|
[ predicted structure ] |
.(((.(((((((jj(gggggggggg..g((..bb...bbbbbb(kkk(((((.((((((((((((((iii))))))))))))))...aaaa(ff..fffffff...fffff(...eeeeeee.eee.)))))cccccc...(((dddd)))((((EEE)FIII{{{{{FFFF.))))...)))EEEEEEE((..))ggggggg()))))))FFFFFFF.....((((...))))..DDDD.CCCCCC((((((()KKKBBB..))))))GGAAAAGBB..hhhhh.BBB)G..hhhhhhhhhhhhGGGG))))(((HHHHHHHHHHHH.)JJ.HHHHHFF(((((((((....))))))))))))}}}}}GGGGGGGGGG.
|
CRW_00674
|
[ FASTA input ]
|
UAACAAGGUUUUGUUCUCGAGUAACGAGGAUGGAUAUUGAUCCUUCCGCGGUGACACUCACAGAAGCCUUUGCAGCCUCGCAAGAGUUUGGCGCGACAGUAAAGAAUGCCUGGAUGCAAGUCAGCGACGCUGGCAACACUUUCGAAUUGCGGGGACGUCCUUAGAGCUCAGUUCUACCAACCAGUGAGGGAAACCUCCGCUGGGGCCUAUGCUAAAAACAUGGGAGAUGGUAAGAAGGAACUGAGAUUGGAUAAUCCGCAGCCAAGCCCUAAGGUGUGGAAGCACUAUGGGACAGGUUCACAGACUAAGUGGAAGUGGGUGGCAUGCGUUAAGGCGUGUGCUGCUUAAGAUAUAGUCGGUCUUGCUGAGAAAUCAUCAAGAAGUCACUGCACAGAUUGAACGUUCCGUA |
[ reference structure ]
|
....((((((((......((((..(((((((((((....))))))))))).....))))...))))))))(((((((((....)))))(((..................)))..)))).((((((...))))))..(((((((....((((((....(((......((((((((((((..(((((((((....))).))))))..((((((.......))))))....)))....).))))))))...)))...))))))(((..((((...(((((....)))))..))))..)))...[.[[[[[...)))))))((((((((((((....)))))))))))).......]]]]]]((((((((((....))))))))...................))........
|
[ predicted structure ] |
((...((((((((((((((ddd..))))))))))(((((.bbbbbb(hhhhhhhh.hh(.......kkkkkkk(.llllllllll(jjjjjjjjjj)))))....ii)))))BB)KKKKK<<<<<<<((((((.....)JJJJJ..JJJJJLLL...eeee(.)KKeeeeeeee(.aaaa)))))))AAAA((((cccc((((((([[(LLLLLLL.....BBBBgggggg.....)EEEEEEEE.EEEEII..[[[[[({{...)))))).HH)}}]]].]]..ffffffff.)))).....DDD..)FFFF..(((((((((((((((..)))))))))))))))...)))GG((((((>>>>>>>...GGGG]].....HHHHHHHH...))))))..FFFFCCCC
|
CRW_00676
|
[ FASTA input ]
|
CUUGGUCAUUUAGAGGAAGUAAAAGUCGUAACAAGGUUUUGUUCUCGAGUAACGAGGAUGGAUUGGACUCCCUUCCGCGGUGACACUCACAGAAGCCUUUGCAGCCUCGCAAGAGGUCUGGCGCGACAGUAAAGAAUGCCUGAUGCAAGUCAGUUCGCUGGCAACACUUUCGAAUUGCGGGGACGUCCUGAGAGCUCGGUUCUACCAACCAGCAGAGAAAUCUAGCCGGGGCUGAUGUUAACAGCAUCGGAGGGUAAGAAUGAAUCGAGAUUGGAUGAUCCGCAGCCAACCCCUAAGGCUUGCUGCUAUGGGAGAGGUUCACAGACUAAGUGGAAGUGGGUGGUAUGCUCUAGCGUACUGCUUAAGAUAUAGUCGGUCUCUGCUGGAAACAGCGGAGAAGUCACUGCACAUGAAACGUUCCGUAGGUGAACCU |
[ reference structure ]
|
................................((((((((......((((..((.(((((((......).)))))).)).....))))...))))))))(((((((((....)))))..((((.............))))...)))).(((((....)))))..(((((((....((((((....(((......((((((((((((..((.(((((....))).)).))..((((((.......))))))..)))....).))))))))...)))...))))))(((...(((...(((.....)))..)))...)))...[.[[[[[...)))))))((((((((((....)))))))))).......]]]]]]((((((((((....)))))))).................)).................
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((.((((((((....(((((.....aaa((((((((((.ee..))))))))))(((((((..llll({{{{{{{{.{{{(...kkkkkkkkkkkkkkkkk.....))))))).))))).ii..ii..(((ggggggc.((dd..ddddddd)C)EE))))))...jjjjjjj..jjjjj)KKK..fffffff(.AAA..mmmmmmmmmm..))hhh(KKKKKKKK<<<<<<.KK)DDDDDD.hhhh..)))))FFFFFFF.[[JJJJJ.JJJJJJJ((.HHHHIIKKKK}}})HHHnnnnnnn(.bbbbbbbb.))))))).)}}}}((((((((((((()D))))))))))))).(((.>>)))))MMMMMMMMMM...DD)GGGG]].}}}}LLLL>>>>GG.II.)BBBBBBBBNNNNNNN
|
CRW_00685
|
[ FASTA input ]
|
CCAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGAACGUAUGCAUCAAAGCCCUCCGUAAUAAAAAAAAACAGCGCCAGAUGUCUCUCUCUGGAAGCACACCACGCACGGGGUUCGUUCCUCUCUGCAUGGCCGUGUGAAAAAGGCGAGUAGGCAAACGAUGGGAAACCCGGCUUGGAAUAGUAACCAGCCACAGAGGCCCCAUCAUACACUUCUAAAUUGCCGGGGAGUGCCCGCGAGGCCUUGACUACCGCGGUCCGCCGAGAGGUGAGAGCGAGCAAUCGCUCAGGACGCAGCAGUGUACGUAGUGGUACAUGGAUGGUAAAAACGUCAAGGAUAGGGUUGAUCCGCAGGGAAGCGCGAGGGCCAACCUGCCUUUGGGCAACAGUUGGCAAAGGCGAACCUUCAGAGACUCUAAUGGAGUGGGCGCAAGCUUAAGGGAGAGUCCAAUCCACUGGGAAACCAGGUCCACAGCAGUAACGGGGUGAUGCUCGCCCCAGAGGACUGUGGAAGGCAACCACCAAAGCGGUGUGUGUUGUCGGGUAGCAAUGGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAG |
[ reference structure ]
|
...............(((((((.......................................)))))))................................................................................................................................(((((((....((.((((....(((.......((((((((((((((.((((((....)))..((((((....)))))).))))))....((((((......))))))....)))....).)))))))....)))...))))))(((...(((....((((((.((((....))))...))))))....)))..)))...[.[[[[[...)))))))(((....))).......]]]]]].((...((((....)))).(((((((.......(((((((...)))))))......))))))).((((((................))))))........))........................
|
[ predicted structure ] |
((..((((((((..qqqqqqq(.jjjjjjjj.jjj..)))))))).(((.........((.)JJJJJJJ[[[[[[[[[[[(..ggggggg.gg(..kkkkkkkk((dddddddd(.<<<<<<<.JJJ....<<<<<<<<<((......hhhh...hhhhh(rrrrrrr.rr..)).bbbbb.bbbbb(mmmm(.eeeeeeeee..))))HHHHH..oooooo((..)EEEEE...ooooooooo[())>.EEEEMMM.(((((({{..))))))..[[((..}}.JQQQQQQQ.MBBBBRR.)B)BBBBB)....]]])..)].ffffff(.ii(()DDDDDD.tt)GG.))((((((ss(llllll(aa....))))))...))KKKKKKKK....))IIFFF.(((()FFF)OOO..pppp.]]]]]]]])))).HHHH((((....)))).((((((()AA..]]DDcccc.>>>>>>>>)LLLLLL.))))))).((((((CCCC.PPPPGGGGGGG)))))))OOO.TT.>>>>>>>SS.OOOOOOOOORRRRRRR
|
CRW_00688
|
[ FASTA input ]
|
GAAUGGCUCGGAUUUGAUGGGCCAUUCAACUUAUAACAGGCUCCGAAGUGACCUGUAACAGUGCCAAAAUGCGGGAAUUAGCCACCUUGGUGGUGAAACCCGCAGCUGAUCACCGCGUCAGUUCAACGACUAGAUGGUACUGGCUGGUUCGUUCCAGUUAAGAUAUAGUCUCUCACCGGGGGUAAAUCCCAGUGCUUCACGGCAUUAAAU |
[ reference structure ]
|
(((((((((.........)))))))))........(((((...........)))))...((((((....((((((.....(((((....)))))....))))))((((((......))))))...[.[[[[[...))))))((((((......))))))......]]]]]](.(((.((((.....)))).)))......).........
|
[ predicted structure ] |
((((((((((eeeeee.))))))))))(((([[[.((((a.((.dd(<<<<))A))....((((((..((((((bbbbbbbbb(fffffffff(((.......ccccc.)))))))))CCCCC....{{{{{)D)))))))BBBBBBBBB.)D).))))...]]]}}}}}..FFFFFFFFF.EEEEEE..((((((>>>>))))))....
|
CRW_00721
|
[ FASTA input ]
|
GUGGUGACCCUGUACUUUACCAACAUUUAUUCUGGUUCUUUGGUCAACGGAUGGCCCAAAAUAAAGAUUGCAAUGUGCUAUAAGCUGGAAAUCUAUGUAUUCAAUUUUAAAUACUUCCACGUAAAAAUUUUAAAUAUUGGUAGAUAAUCAGCUGGUAACCAAUUAUCCUUUUAAAUAAUAUUAUCCUUUUAAUAUGGAAUAUUUUAUUAUGGAUUUAGUAGGAACCUCAGAGACUAUAUGCACAUCACUUUAUUUUUAAAGUGAAGAGAUAGUCCAAAAAUAUUUACAUUUUUAAAUAUUUGCAUCCAGAGGUCAAUUUUAUAGGCCUCUUAACGUUGCUAUA |
[ reference structure ]
|
.........................................(((((.....)))))(((........)))..((((((....((((((..((((((.....(((((((((((((......)))......))))))))))))))))..))))))(((........((((..........................................)))).........)))...[.[[[[[...))))))(((((((....)))))))......]]]]]]..(((((((((......)))))))))..........................................
|
[ predicted structure ] |
.((((((((.jjjj.jjjjjjj(.bbbb(eeeeeeeeeee.)))))..fffff(((.cccccc((((((llllllllllllllllll(aaaaaaaaaaaaa.)))))).AAAA.<<<<(.hhhhhhh([[[[[({{)JJJJJJJ)EE)AAAAA)))kk))))}AAA...)}]]]]((.(((((dd....))))))]HHHHHHH>>EEALLLLLLLLLLLEEEEEEE...DD((((((.JJJJ..((((((((ii..))))))))BBBB)))))).((ggggggggg..KK))GGGGGGGGG.FFFFF(((((((II>>CCCC.)))))))CCLLLLLLL..))
|
CRW_00756
|
[ FASTA input ]
|
GCUAGGGAUAACAGGGUGCGACCUGCCAAGCUGCACAAUUCAAUGUGGUUAGAAAACCAACUUGGAAUCCAAUCUCCAUGAGCCUACCAUCACAUGCGUUCUAGGGUUAACCUGAAGGUGUGAAGCUGAUGGGAAAAAGUAACCCAAACUGUAUGUGACAGUGAGGGGGCAGGCUAGAUUCCUAUGGGCAAUGUAAAUGAACACUCAUCUGAGGCAUCGUGACCCUAUCACAUCUAGUUAAUUGUGAGAGAAUCUUAUGUCUCUGUUUCAUAAGAUUGAUUGGACAAUUUCUCACCGGUGUAAAGAGUGGUCCUAAGGGAAUCAUCGAAAGUGAAUUGUGCGGAACAGGGCAAGCCCCAUAGGCUCCUUCGGGAGUGAGCGAAGCAAUUCUCUCUAUCGCCUAGUGGGUAAAAGACAGGGCAAAAAGCGAAUGCCAGUUAGUAAUAGACUGGAUAGGGUGAAUAACCUAACCUGAAAGGGUGCAGACUUGCUCAUGGGCGUGGGAAAUCAGAUUUCGUGAAUACACCAGCAUUCAAGAGUUUCCAUGCUUGAGCCGUGUGCGGUGAAAGUCGCAUGCACGGUUCUACUGGGGGGAAAGCCUGAGAGGGCCUACCUAUCCAACUUU |
[ reference structure ]
|
.....................((((.....((((((((((((...((((......))))...((((........))))..(((((.(((((((((((.(((..(((....)))))).)))))....))))))......((..(((..(((((.....)))))..))).))))))).(((((((..((((.((....))...(((((.......((((((........................((((((((((((((((.........))))))))...........))))))))))))))...)))))))))...)))))))........))))))))))))..))))....((((..((((((((....)))..(((((((....)))))))....)))))..))))........(((((((..((.....((((((.......))))))...((((.....)))).((((....))))))...)))))))....(((((((((.................................)))))))))..((((((((((((((....)))))..)))))))))...(((((((...((((....))))...))).)))).....
|
[ predicted structure ] |
(((((u..((((g(([[[[[[[[[[[....[[[[[[[[[[[[.)G)sss(((.........ppppp.(((((((()]f((.cccc.c(.(((((((((mmmm.((((((((((..))))jjj(.hh(.aaaaaaa....))))))....)))))))))...kkkkkkkk(yyyyy)))))qqqqqqffff((e(..vv(..xxxx(.ddd(.)Ydddddd.dddddddd)))(((((((((({((((((...))))))((iiiiiiii)YY..}))))))))))((tttttttt(.bbbbb(.MMMM.oooooo...))).EAAA(((...]]]]]]]]]]]].)).((((..)))))VV..)YYKKKKKK.)XXXX.rrrrr(...wwwwwwwww)))))))))<<<<<..IIIIIIII....<<<<<<<(((((((()AA..)P)))))DDDDDDDD...nn..)PPPP)>O...KKCC]]]]..OOOOOBBBBBT.>TTTTTTT)>DDD>WWWWW...>)FFFF.>>>>>>.ssssAAHHJJJ>))U(((((((((DDDDDD...]]]]]]))))))))))NN.WWWWRRRRRCCC)F...QQQQQQ))))).)SSS)SSSS
|
CRW_01535
|
[ FASTA input ]
|
GUCUACGGCCAUACCACCGGGAAAAUACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUCAAGCCCGGUAGGGCCAGGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUACCUGGUGCUGUAGACUU |
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
[ predicted structure ] |
(((((((((..(((.((((((.bb.b(.[[[[[[[[[[[[[(aa.aa((..))...)))))){{(<<<<<<<)A))).)AAA]]]]].]]]]])>>]]]B..>>>>>}})))))))))BB
|
CRW_01539
|
[ FASTA input ]
|
ACCAACGGCCAUACCACGUUGAAAGUACCCAGUCUCGUCAGAUCCUGGAAGUCACACAACGUCGGGCCCGGUCAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAACACCGGGUGCUGUUGGCAU |
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
[ predicted structure ] |
....(((aaaa.....aaaa(....<<<<<<<<<<))).>>>>.((((...[[...)AAAA{{{{{{)))).((((((((((.>>>>>>...}}}}}}]]...)))))))))).AAAA..
|
CRW_01563
|
[ FASTA input ]
|
AUCCACGGCCAUAGCCUUCAUAGAGCACCCUGCCCCGUCCGAUCCAGGAAGUUAAGCUGAACAGCGCUCGGUUAGUACCACGGUGGGGGACCACGUGGGAAUCCCGGGUGCCGUGGUU |
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))
|
[ predicted structure ] |
.((((((((..(((((((..[[))).((ccc(bbbb))..{{{.)BBB..)))).((((..))))aaaaaa.]]))<<<<<<<<.BCCC....)))))).}}}AAAAAA>>>>>>>>.
|
CRW_01583
|
[ FASTA input ]
|
AUCCACGGCCAUAGGACUCUGAAAGAACCGCAUCCCGUCUGAUCUGCGCAGUUAACCAGAGUGCCGCCUAGUUAGUACCACGGUGGGGGACCACGCGGGAAUCCUAGGUGCUGUAGUUUU |
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
[ predicted structure ] |
.(((((.((.aaaa.((((((..{{{{{((((<<<<<<<<<<..))))..{{{...))))))))[[[[[[[>>>>.......))))).}}}...>>>>>>...]]]]]]]AAAA.}}}}}
|
CRW_01590
|
[ FASTA input ]
|
GGGUGCGAUCAUACCAGCGUUAGUGCACCGGAUCCCAUCAGAACUCCGCAGUUAAGCGCGCUUGGGCCGGAGUAGUACUGGGAUGGGUGACCUCCCGGGAAGUCCCGGUAUUGCACCCUU |
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......((((((.((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
[ predicted structure ] |
.((((([.((......<<<<(cc))]))).(((...))).)C..((((..{{(.)C>>>.{{{{{{.))))(((((((((((((bb(()}}>)}}}}}}bb)))))))))))))))BBBB
|
CRW_01593
|
[ FASTA input ]
|
GUCUACGACCAUACCACAAUGAACACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGCAUUGUCGGGCCAGGAUAGUACCUGGAUGGGGGACCGCCUGGGAACGCCUGGUGUCGUAGACUU |
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
[ predicted structure ] |
(((((((((..(((.(((((((((...{{{{{{{{{{{{{(.aa.aa([[)))...)))))))]]<<<<<<...)))..)AAAA}}}}}..((.}}}}}}.))>>>>>>)))))))))}}
|
CRW_01595
|
[ FASTA input ]
|
GUCGACGACCAUACCACGUUGAAAGCACGACAUCUCGUCCGAUCUGUCAAGUUAAGCAACGUUGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUCGGAGACGGCCUGGGAAUCCCAGGUGUUGUAGACAUAUUUUGGUUUU |
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))).............
|
[ predicted structure ] |
((cc(.aaaaa.)).(((((([[.[(<<<<<.<<)CC[[[[[[[({{{{{{{....)))))).(((((AAAAA.)}}}}])]]]]]]>>>..(((((((bbb)))))))>>>>].}}}..BBB]]))))).
|
CRW_01603
|
[ FASTA input ]
|
AGAUGCGAUCAUACCAGCACUAACGCACCGGAUCCCAUCAGAACUCCGAAGCUAAGCGUGCUUGGGCGAGAGUAGUACUGGAAUGGGUGACCCUCCGGGAAGUCCUCGUGUUGCAUCCCG |
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......((((((.((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
[ predicted structure ] |
.((((((((..((..<<<<<))..((.[[[[[.[[[[[......[[[[..[[[[.))>>>>>{{{(((((..]]]]..]]]]]]]]].(((..]]]]]...))))))))))))))))}}}
|
CRW_01617
|
[ FASTA input ]
|
GCCUACGGCCAUACCACGUAGAAUGCACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGCUGCGUCGGGCGUGGUUAGUACUUGCAUGGGAGACCGGCUGGGAAUACCACGUGCUGUAGGCUU |
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
[ predicted structure ] |
(((((((((.((.(((.((((.bbbb(<<<<<<(([[[[[[[(..{{..{{{{{)))))))]]]]]]]aaaa}}a(}}})>>>>}}aa>>BBBB.)))..)AAAAA.)))))))))))AA
|
CRW_01625
|
[ FASTA input ]
|
GUUGUCGGCCAUACUAAGGUGAAAACACCGGAUCCCAUUCGAACUCCGAAGUUAAGCGCCUUAAGGCUGGGUUAGUACUAAGGUGGGGGACCGCUUGGGAAGUCCCAGUGUCGAUAGCCU |
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
[ predicted structure ] |
(((((((((...(((((((((.......((((<<<<<<<.....))))[[[[[({{)))))))..aaaaaa(((()}))))>>>>>>>..((}]]]))...))AAAAAA)))))))))]]
|
PDB_00011
|
[ FASTA input ]
|
CGCAAAUUUGCGCGCAAAUUUGCG |
[ reference structure ]
|
(((((((((((())))))))))))
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((..)))))))))))
|
PDB_00017
|
[ FASTA input ]
|
GGUGCAGAAACAGCGCUUCGGCGCGUAUAUUACGCACC |
[ reference structure ]
|
(((((((..((((((((..))))))))....)))))))
|
[ predicted structure ] |
(((((.((....[[[[[))]]]]](((...))))))))
|
PDB_00036
|
[ FASTA input ]
|
GGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACUAGGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACUGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACU |
[ reference structure ]
|
((((((((((((((.(((((((((((((.))))))))))))).))))))))))))))...........................
|
[ predicted structure ] |
((((..{{{{{{{{{{((......[[(..<<<<..<<<<<<....))......)))))]]..}}}}}}}}}}>>>>>>..>>>>
|
PDB_00070
|
[ FASTA input ]
|
GCCCGGAUAGCUCAGUCGGUAGAGCAUCAGACUUUUAAUCUGAGGGUCCAGGGUUCAAGUCCCUGUUCGGGCGCCA |
[ reference structure ]
|
(((((((..(((((......)))))(((((((.....)))))))....(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
((((((((((((..((.{{{.{{{{))..((((((((...))))))))..[[}}}}.)).]]))))))))))}}}.
|
PDB_00078
|
[ FASTA input ]
|
GAAUUGCGGGAAAGGGGUCAACAGCCGUUCAGUACCAAGUCUCAGGGGAAACUUUGAGAUGGCCUUGCAAAGGGUAUGGUAAUAAGCUGACGGACAUGGUCCUAACCACGCAGCCAAGUCCUAAGUCAACAGAUCUUCUGUUGAUAUGGAUGCAGUUCGAAUUGCGGGAAAGGGGUCAACAGCCGUUCAGUACCAAGUCUCAGGGGAAACUUUGAGAUGGCCUUGCAAAGGGUAUGGUAAUAAGCUGACGGACAUGGUCCUAACCACGCAGCCAAGUCCUAAGUCAACAGAUCUUCUGUUGAUAUGGAUGCAGUUC |
[ reference structure ]
|
(((.((((((((.((((((....((((.((((.((((((((((((((....)))))))))))(((.{{..)))....)))......))))))))...)))))))))).)))))))..((((...(((((((((...)))))))))..))))((.....[[[.[[[[[[[[.[[[[[[.[[.[[[[.[[[[.[[[(((((((((((....)))))))))))[[..))...]]....]]]......]]]]]]]]]].]]]]]]]]]].]]]]]]]..((((...(((((((((...)))))))))..))))}}.....
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((..(f(((((....(((((...(((((.eeeeeeeee....eeeeeeee(bbb({{{{{{{{{{{{))))).}}cccc)))))...))))))).........((....}}}}..aaaaaaaaa)F)<<<<<<<<<.<<<.))))))))(((((((((((..(((((((....(((((...(((((.)EEEEEEEE....EEEEEEEEE)}}}}}}BBBdddddd))))).DDCCCC)))))...)))))))..[[[.)A..>>>..DDDD..>>>>>>>>>)))AAAAAAAA).]]].))))))))
|
PDB_00113
|
[ FASTA input ]
|
GGCCUGAGGAGACUCAGAAGCC |
[ reference structure ]
|
(((((((((..))))))..)))
|
[ predicted structure ] |
((((((((....)))))..)))
|
PDB_00119
|
[ FASTA input ]
|
GGACCCGGGCUCAACCUGGGUCC |
[ reference structure ]
|
((((((((((...))))))))))
|
[ predicted structure ] |
(((((((((.....)))))))))
|
PDB_00136
|
[ FASTA input ]
|
GUCUACCUAUCGGGCUAAGGAGCCGUAUGCGAUGAAAGUCGCACGUACGGUUCUAUGCCCGGGGGAAAAC |
[ reference structure ]
|
...(((((..(((((...((((((((((((((((..))))))..))))))))))..))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
.(((({{{.{{{{{{)).[[[[[[[[[[[[[[[))..]]]]..]]]]]]]]]]]..}}}}}}}}}.....
|
PDB_00137
|
[ FASTA input ]
|
GGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((((((((..))))))))))))).
|
[ predicted structure ] |
((((..((((((....))))))..)))).
|
PDB_00160
|
[ FASTA input ]
|
GGCGUAACGUUGAAAAGUUACGCC |
[ reference structure ]
|
(((((((((......)))))))))
|
[ predicted structure ] |
((((((((.((...))))))))))
|
PDB_00178
|
[ FASTA input ]
|
GGCGAUACCAGCCGAAAGGCCCUUGGCAGCGUC |
[ reference structure ]
|
(((((..((.((((..))))....))..)))))
|
[ predicted structure ] |
((([[[....[[[[[...))).]]]]]...]]]
|
PDB_00221
|
[ FASTA input ]
|
GGCCUAAGACUUCGGUUAUGGCC |
[ reference structure ]
|
(((((..((((..)))).)))))
|
[ predicted structure ] |
((((...((((..))))..))))
|
PDB_00278
|
[ FASTA input ]
|
UCCGUGAUAGUUUAAUGGUCAGAAUGCCAGACUGAAGAUCUGGAGAUCGGGGUUCAAUUCCCCGUCGCGGAGCCUUUGCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCCGCUUGUCGCGUGGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCGUCUCCGUGAUAGUUUAAUGGUCAGAAUGGGCGCUUGUCGCGUGCCAGAUCGGGGUUCAAUUCCCCGUCGCGGAG |
[ reference structure ]
|
(((((((..(((((......)))))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))......(((((((..((((........))))((((((..[[[..))))))....(((((.......))))))))))))]]](((((((..(((((......)))))(((((((.....)))))))...(((((.......)))))))))))).
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((dddd((((..cccc))))ddddd(.<<<<<<<.<<<<<<<CCCC.))){{{{))))))))(((((bbbbbbbb(.(()DDDDDeeeeeeeeeeeee.ee(.aaaaaaa)))))..((((>>>>>>>))))))BBBBBBB.(((((((((.)BDDDD(((.)AA..AAAAAEEEE.EEEEEEE>>>>>>>}}}}.)))..EEEE.)))))))))
|
PDB_00312
|
[ FASTA input ]
|
GGCAGAGUCCUUCGGGACAUUGCACCUGCC |
[ reference structure ]
|
(((((.((((....)))).......)))))
|
[ predicted structure ] |
(((((.(((((..))))).......)))))
|
PDB_00326
|
[ FASTA input ]
|
GCCAGGAUGUAGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAAAGCGUAAUAGCUCACUGGUGGGUGCUCAGUACGAGAGGAACCGCACCC |
[ reference structure ]
|
(((((((((..((((.......))))..)))........((((....)))).))))))(((((((...((((..))))..)))))))
|
[ predicted structure ] |
((((((((((([[[[)){{{{{]]]]..))))((.......<<<<.))}}}..)))))((((((}}..>>>>...((..))))))))
|
PDB_00341
|
[ FASTA input ]
|
CCCAUGCGAGAGUAGGGACUGCCGAUGGUAGUGUGGGG |
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((.....)))))))))))))))).
|
[ predicted structure ] |
(((((((....((....))((((...))))))))))).
|
PDB_00349
|
[ FASTA input ]
|
GAGACAUUGCACCCGGAGUCUCGAGACAUUGCACCCGGAGUCUC |
[ reference structure ]
|
(((((.......((((.((((())))).......)))).)))))
|
[ predicted structure ] |
(((({(([[[(.<<<<.))}))((((()>)>>>.]]]).)))))
|
PDB_00417
|
[ FASTA input ]
|
AAGGCGGCCGAAAGGCUAGACGGUGGGAGAGGGUGGUGGAACGCCGAUGGCGAAGGCAGCCACCUGGUCCACCCGUGACGCUUUAAGGCGGCCGAAAGGCUAGACGGUGGGAGAGGGUGGUGGAAACGCCGAUGGCGAAGGCAGCCACCUGGUCCACCCGUGACGCUUU |
[ reference structure ]
|
..(((.((((..))))...((((((((((.(((((((............(((..))).)))))))))))))).)))...)))..(((((.((((..))))...((((((((((.(((((((.............(((..))).)))))))))))))).)))...)))))
|
[ predicted structure ] |
....((((((...<<<(....{{{{{{...{{{{{{{....{{{{{.{{{{([[[[[.[[[[[[[..[[[[[(aa....aaaaa....))))))...)AAA....)AAAA]...]]]]]]].....)]]]].}}}}}}}}}}.}}}}}}}..}}}}}>>>....]]]]]
|
PDB_00430
|
[ FASTA input ]
|
GGGCAGGUUCCCGAGGGCCAAAGGGGACGGUCUGUAAAACCGUUGGCGUAGCCUUCGCUGGUUCGAAUCCAGCCCUGCCCA |
[ reference structure ]
|
(((((((..(((..........)))(((((((.....)))))))(((...)))...(((((.......)))))))))))).
|
[ predicted structure ] |
(((((((.((([[[[[[[....)))((((((.{{(<<.)))))).)>>..]]]]]]]((((}}.....)))).))))))).
|
PDB_00527
|
[ FASTA input ]
|
AGAAGGAGUGUACGGUUAGGUCGCU |
[ reference structure ]
|
..((....((()))........)).
|
[ predicted structure ] |
.((...[[[[.[[..))..]]]]]]
|
PDB_00565
|
[ FASTA input ]
|
GACACUAAGUUCGGCAUCAAUAUGGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGUUGCCUAAGGAGGGGUGAACCGGCCCAGGUCGGAAACGGAGCAGGUCAAAACUCCCGUGCUGAUCAGUAGUGUC |
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((((((((.((((((((((((....)))))))))))).)))))........((((((....(((((.(((((....))))).)))))..)))))).)))))))))).)))))))
|
[ predicted structure ] |
(((((((.(([[[[[[[(..((.((((((((.{{(...<<<<<<<..<<<<))))))))))..aa..>>>>..((((((..))))))...)}}.)).)]].....>>>>>>>]]]]]AA..)))))))
|
PDB_00570
|
[ FASTA input ]
|
GGCACCUGACCCCAUGCCGAACUCAGAAGUGCCCGGCACCUGACCCCAUGCCGAACUCAGAAGUGCCC |
[ reference structure ]
|
(((((((((....((....)).))))..))))).(((((((((....((....)).))))..))))).
|
[ predicted structure ] |
(((((((((.....(((((...[[[(..{{{..))))).)]]]...}}}.......))))..))))).
|
PDB_00571
|
[ FASTA input ]
|
GCGGAUUUAGCUCAGUUGGGAGAGCGCCAGACUGAAGAUCUGGAGGUCCUGUGUUCGAUCCACAGAAUUCGCACCAUUUUUU |
[ reference structure ]
|
.((((((..((((........))))(((((((.[[[.)))))))....(((((.......))))))))))).....]]]...
|
[ predicted structure ] |
((((((((...((((((bbb([[[[[[..))))))<<<<.(((((()BBB]]]]]]aa))))..)))))))).))>>>>.AA
|
PDB_00573
|
[ FASTA input ]
|
GCUGGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAGUGCGUAACAGCUCACCAGCGCUGGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAGUGCGUAACAGCUCACCAGC |
[ reference structure ]
|
(((((((((..((((.......))))..)))........((((....)))).))))))(((((((((..((((.......))))..)))........((((....)))).))))))
|
[ predicted structure ] |
(((((.((((bbbbbb(...aaaaaa([[.[[[[[(...<<<<<(..{{{{..)))))(((((.)}}})}>>>)>((.>]]]]]])).)]AAAAAA.)BBBBB..B)))..)))))
|
PDB_00584
|
[ FASTA input ]
|
GGGAUGCGUAGGAUAGGUGGGAGCCGCAAGGCGCCGGUGAAAUACCACCCUUCCC |
[ reference structure ]
|
((((((.........(((((((((((..)))))..........))))))))))))
|
[ predicted structure ] |
((((.((((.[[.[({{{{{..{{{{....))))}}}}....)]}}}}}]]))))
|
PDB_00698
|
[ FASTA input ]
|
CGUACGCGUCACGCGUACGUUCGUACGCGUCACGCGUACGUU |
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((((((..)))))))))))))))))))..
|
[ predicted structure ] |
(((((((((.(((((((((..))))))))).)))))))))..
|
PDB_00701
|
[ FASTA input ]
|
GGCCGGGCGCGGUGGCGCGCGCCUGUAGUCCCAGCUACUCGGGAGGCUCGACACUAAGUUCGGCAUCAAUAUGGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGUUGCCUAAGGAGGGGUGAACCGGCCCAGGUCGGAAACGGAGCAGGUCAAAACUCCCGUGCUGAUCAGUAGUGUCAGGCUGGAGGAUCGCUUGAGUCCAGGACCUGUGCAACAUAGCGAGACCCCGUCUCUUUGUUCUGGGCUGUAGUGCGCUAUGCAAUAGCCACUGCACUCCAGCGAUCGGGUGUCAUCGCGCCUGUG |
[ reference structure ]
|
((((((((((((..[[))))))))....((((.]].....)))))))).((((((((((((((((((((((.((((((((((((....)))))))))))).)))))........((((((....(((((.(((((....))))).)))))..)))))).)))))))))).)))))))((((.((....(((((...((.((((.)))).)).....)))))...)).)))).......(((((.(((((((.(((((...)))))))))))).)))))..((.(((((......))))))).
|
[ predicted structure ] |
(((aaaaaaaaaaaaaaa(((((((.(({{(..bbbbbbbbbbbbb)).ggggggg.ggggggg(ccc....cccccBBBBBBBBB.ccccccc.....))))))CCChhhhhhhhhh(CCCCiiiiiiiii(()}}...<<(dddddd(....CCCCCCC.eeeeee..CGGGGGG..eeeeeee))GGGGGGGG.)EE..)EEEEEE))..[[[[[[[..)HHHH)))HHHHHH.IIIIIIIII(((((]]]]]]]ff.BBBB)))))..EEEEEDDDDDD>>AAAAAAAAAAAAAAAFF
|
PDB_00725
|
[ FASTA input ]
|
GGUGGUGAAGUCGCUCGGCGAGCGUCACACCACCC |
[ reference structure ]
|
(((((((..((((((((.)))))))).))))))).
|
[ predicted structure ] |
(((((((..(([[[[[.))]]]]]...))))))).
|
PDB_00734
|
[ FASTA input ]
|
GGUGACGCCGUAAGGCGCAGCC |
[ reference structure ]
|
((((((((((..))))))))))
|
[ predicted structure ] |
(((..((((....))))..)))
|
PDB_00823
|
[ FASTA input ]
|
GGUGGAGGCUGCCGAAGCCA |
[ reference structure ]
|
(((((((((.))))))))).
|
[ predicted structure ] |
(((...[[[[)))..]]]].
|
PDB_00828
|
[ FASTA input ]
|
CGCUUCAUAUAAUCCUAAUGAUAUGGUUUGGGAGUUUCUACCAAGAGCCUUAAACUCUUGAUUAUGAAGUG |
[ reference structure ]
|
(((((((((...(((((((.[[[.[[)))))))........((((((]]..]]]))))))..)))))))))
|
[ predicted structure ] |
(((((((((..(({((<<.)}).(((([[[[[[[[[[[[)))))>]]..>)]]]]]]]]]].)))))))))
|
PDB_00851
|
[ FASTA input ]
|
GGAGCUCGCCCGGGCGAGGCCGUGCCAGCUCUUCGGAGCAAUACUCGGCGGAGCUCGCCCGGGCGAGGCCGUGCCAGCUCUUCGGAGCAAUACUCGGC |
[ reference structure ]
|
((a(((((((()))))))aaaa..))((((((..))))))...)AAAAA(([(((((((..))))))<<<<..))((((((..))))))...)]>>>>
|
[ predicted structure ] |
..(((((((((((((((((({<.((.bbb(ddddddd(...cc)))}))..aa))))))))))))))[[[[.AC.ACDD>DDDDDBB...B)))]]]]
|
PDB_00890
|
[ FASTA input ]
|
ACAUGAGGAUCACCCAUGUACAUGAGGAUCACCCAUGU |
[ reference structure ]
|
(((((.((....)))))))(((((.((....)))))))
|
[ predicted structure ] |
(((((..((((...((((..))))..))))...)))))
|
PDB_00917
|
[ FASTA input ]
|
GGAGAGGAGCAGGCGGUCCGGGGGCGCGCGCUCCCGAAGCCGGACUCUGAGCGGGUGCCGGGUAACGCCCGGGAGGGGUGACCCUCGGACAGGGCCAUAGAGAAGACCGCCGGCAAGGGUGGAACGGUGGGGUAAGAGCCCACCAGCGUCGGGGCAACCCGGCGGCUUGGCAACCCCCACCGGAGGGCCAAGGGGGUGGGCGCUCCUACCCCCUUGGCCGGUGUGCGGUAACGCACACCGACCGCCUCCGGCUUAUGCUCCUCUCC |
[ reference structure ]
|
((((((((((.(((((((((((((((()))))))))[[[[.[[[((((.{{{{.((.(((((.....)))))((((((..))))))((...(((((..........((.(())...)).......((((...........)))).((..((((....))))..))...)))..)))).)).))))(((((.(((((.(((}}}}))).))))).))))).(((((.((..)).))))).)))))))]]].]]]]..))))))))))
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((((((((eeeeeeeee.ee.((((((..{{{...{{{{(<<<<..<<<<<<<<.<<<<.)))))).[[[.[[[[c((......aaaa)>>>>...C)))))>>>.)]]]]....((((((((dddd.((((]]].>>>>)))))).>>>>>}}}EE.AAAA...))))))))...(((((((((((((((}}}})))))))))))))))((((((((bb..)))))))).BBEEEEEEEEEDDDD)))))))))))
|
PDB_00923
|
[ FASTA input ]
|
CCACGGUUCGAAUCCGUGGC |
[ reference structure ]
|
((((((.......)))))).
|
[ predicted structure ] |
((((((((..)).)))))).
|
PDB_00994
|
[ FASTA input ]
|
AGUCCCGUGGGGUAGUGGUAAUCCUGCUGGGCUUUGGACCCGGCGACAGCGGUUCGACUCCGCUCGGGACUAAGUCCCGUGGGGUAGUGGUAAUCCUGCUGGGCUUUGGACCCGGCGACAGCGGUUCGACUCCGCUCGGGACUACC |
[ reference structure ]
|
(((((((..((............)).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))).(((((((..((((........))))(((((((.....)))))))...(((((.......))))))))))))...
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((<(([[.((..aaa((((((({{{.{{{)))))))))(((((.bbbb..)))))..AAA[[[[[)>))))))))))ccccc..}}}(((((((.]]]]].)))))))]]ccccc.BBBB))CCCCC.}}}CCCCC.
|
PDB_01009
|
[ FASTA input ]
|
GCCAGGGUGGCAGAGGGGCUUUGCGGCGGACUGCAGAUCCGCUUUACCCCGGUUCGAAUCCGGGCCCUGGC |
[ reference structure ]
|
((((((((([[[)).......]]]..((((.......))))......(((((.......))))))))))))
|
[ predicted structure ] |
((((((((.((((.<<<<<(.[[.[[[[[[)))))].]]]]]].]>>>>>((({{{.)))}}}))))))))
|
PDB_01051
|
[ FASTA input ]
|
GAGACUAUCGACAUUUGAUACACUAUUUAUCAAUGGAUGUCUC |
[ reference structure ]
|
(((((......(((..(((((.....))))).)))...)))))
|
[ predicted structure ] |
(([[.(((({{{{{{{))))....[[[..))]]]}}}}}}}]]
|
PDB_01074
|
[ FASTA input ]
|
GCGACCGACCAUAGCUGCUGCAGCGGUCAAAGGUCGCGCGACCGACCAUAGCUGCAUGCAGCGGUCAAAGGUCGC |
[ reference structure ]
|
.(((((((((...((((...))))))))...))))).((((((((((...((........))))))...))))))
|
[ predicted structure ] |
((((([.....(({{{{{{{{{{{{{{....)]))))((((((.....))}}}}}.}}}}}}}}}....))))))
|
PDB_01076
|
[ FASTA input ]
|
GACACUAAGUUCGGCAUCAAUAUGGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGUUGCCUAAGGAGGGGUGAACCGGCCCAGGUCGGAAACGGAGCAGGUCAAAACUCCCGUGCUGAUCAGUAGUGUCGAGGUCCCGCGUACAAGACGCGGUCGAUAGACUCGGGGUGUGCGCGUCGAGGUAACGAGACGUUAAGCCCACGAGCACUAACAGACCAA |
[ reference structure ]
|
.((((((((((((....(((((.((((((((((((....)))))))))))).)))))........((((((....(((((.(((((....))))).)))))..)))))).....)))))).)))))).(((((((((((.......)))))....(((((((((((((..((((((((((..)))))))))).))))).))))).)))...))))))
|
[ predicted structure ] |
....(((..((((((((...((.((((((((bbbbbb.bbbbbb(.aa.aa)))))))))).AA..[[[[...((((((..))))))....[[{((.<<<<....)BBBBBB((((..)))).}))))))).)]]ccccccc(....)>cccccc))).BBBBBB.)CCCCCCCCCCCAA(((((...))))).]]]].......CC....>>>)..
|
PDB_01130
|
[ FASTA input ]
|
GUUCUUGCUUCAACAGUGUUUGAACGGAACGUUCUUGCUUCAACAGUGUUUGAACGGAAC |
[ reference structure ]
|
(((((...(((((......))))).)))))(((((...(((((......))))).)))))
|
[ predicted structure ] |
((((((<<<<({{.))(((((((((()>>.((([[.>>}}.)))]]))))))))))))))
|
PDB_01193
|
[ FASTA input ]
|
CUCCUACGGGAGUUCCGCGGAGGCCCGUCACGCCAUGGGAGCGGGCUCUACCCGAAGUCGCCGGGAGCCUACGGGCAGGCGCCGAGGGUAGGGCCCGUGACUGGGGCGAAGUCGUAACGACAUGCGCAGUUCUCUUCCUAGUACGAGAGGACCGGAAGGGGUGCCGGAAGGUCAAGGGGAGGGGUGCAAGCCCCGAACCGAAGCCCCGGUGAACGCUGAUCUCCCCCGAGCGUCCACAGCGGCGGGGAGGUUUGGCGCCAGGAGGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCCUUUAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUGGUGCUCUUGGUCGCGCCUGCGUAGGAUAGGUGGGAGCCUGGCGCCGGUGAAAUCCACCCUGGCGCGGCUGGGGGCUCCGUGAUAACAAAGCGGUUAUGUACCGGAUUUUUAUUCCGGCUAUCGGGGUUCAAUUCCCCGUCGCGGAGCCA |
[ reference structure ]
|
(((((..)))))..((()))..((.((((.(((((((((((((((((((((((((.(((((.....((((..))))..))))))))))))))))))))))))))))))..))))..))(((.......)))((((((((..(((....))).))))))))(((((((..((((..(((((((((((..)))))))))))..)))))))))..))(((.(((((((((.((((.....)))).)))))))..)))))((.((.(((...................)))......................)).))((((((((.((((((((.........(((((....................))))))))))))).))))))))(((((((..(((.........)))((((((((...))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
.(((((((.(((((.dddddd.(k((((.hhhh(.ee(..gggggggggggg(ppppppppppp..pppp))))))..(((((..)PPPPPPPPPPPP...bbbbb(...((((<<.)))).((nnn.n((((((((m>>((.llllllll..)M)))))).fffffff)PP)).[[[[[[[)))))..)BBBBB...((.{{{{{{{{{{.{{{{{..]]]]]]]))}}}}})EEq(iiiiiiiiiiiPGiiiiiiiiii(GGGGjjjjjj....)L.)F..LLLLLL..((.aaaaaaaaa)K))).GGGGGooooooooooooooo)Q)))))))((((((((..)AAAAAAAAA)cc...)))))))JOOOOOOOOOOOOOOODDDDDD....CC..FFFJJJJJIIIIL)GGHHHH))FFFNNNN}}}}}}}}}}...IIIIIIIIIII.IIIIII
|
PDB_01199
|
[ FASTA input ]
|
AUCGUAGCCAAUGAGGUUUAUCCGAGGCGCGAUAUCGUAGCCAAUGAGGUUUAUCCGAGGCGCGAU |
[ reference structure ]
|
(((((.(((...((((.....))))))))))))(((((.(((...((((.....))))))))))))
|
[ predicted structure ] |
.((((aaaa.))))AAAA((({((..<<<<)}))(((([[[[.))))]]]].((())..>>>>)))
|
PDB_01236
|
[ FASTA input ]
|
GGGCUUCGUUAGGUGAGGCUCCUGUAUGGAGAUACGCUGCUGCCCAAAAAUGUCCAAAGACGCCAAUGGGUCAACAGAAAUCAUCGACAUAAGGUGAUUUUUAAUGCAGCUGGCCUAUGCCAUACAGUGCUAAAGCUCUACGAUUGAAGCCCA |
[ reference structure ]
|
(((((((((.((((((((((.((((((((((....(((((.((((((..(((((....)))))..)))))).....(((((((((.......)))))))))....))))).......))))))))))))))).))))).))....))))))).
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((((((.<<<<.<<<<<<<(..{{..{{{{(.[[......[[[[(...aa.)))).((((((((..(((((((((()]]]]..))))))))))...)}}}})))))))).)>>>>>>>.]])))>>>>AA...}})))))))).
|
PDB_01275
|
[ FASTA input ]
|
GGCGGUGGGGGAGCAUCUCCUGUAGGGGAGAUGUAACCCCCUUUACCUGCCGAACCCCGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACGGUAGGCAGGACGUCGGGCGGUGGGGGAGCAUCUCCUGUAGGGGAGAUGUAACCCCCUUUACCUGCCGAACCCCGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACGGUAGGCAGGACGUCG |
[ reference structure ]
|
(((((((((((.(((.(((((....))))).)))..))))))....(((((.....(((((.((((((..)))))).)))))..))))).))))).(((((((((...((((((((((..))))))))))....))))...(((((((....(((((.(((((....))))).))))).)))))))))))).
|
[ predicted structure ] |
((([[[[[[(..(((<<<<<<<<<<<<<<..)))..ccccccc..cccccc(..ddddddd..)))((aaaaaa.....)DDDDDD..bb.))((((({DCCCCCC..((.>>>>>>>>>>>>>>eeeee..BBAAAAAA.eeeeeee..)]]]]]]..})))))CCCCC.))..EEEEEEE..CCEEEEE.
|
RFA_00416
|
[ FASTA input ]
|
CAAAAGUUUGGGCUAAAGCCCACUGAUGAGCCGCUGAAAUGCGGCGAAACUUUUG |
[ reference structure ]
|
.((((((.(((((....))))).......((((........))))...)))))).
|
[ predicted structure ] |
((((((((((((((..))))))...((..[[[[[....))]]]]]..))))))))
|
RFA_00434
|
[ FASTA input ]
|
CAUAAGUCUGGGCUAAGCCCACUGAUGAGCCUUUGCGAUAAGGCGAAACUUAUG |
[ reference structure ]
|
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
|
[ predicted structure ] |
(((((((.((((([[.))))).({((..<<<<<]])}))>>>>>...)))))))
|
RFA_00436
|
[ FASTA input ]
|
CAUAAGUCUGGGCUUAGCCCACUGAUGAGUCGCUGCGAUGCGACGAAACUUAUG |
[ reference structure ]
|
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
|
[ predicted structure ] |
(((((((.((((([[[))))).]]]((.{{{{{..))..}}}}}...)))))))
|
RFA_00442
|
[ FASTA input ]
|
CAAAAGUCUGGGCUAAGCCCACUGAUGAGUUGCUGAAACGCAACGAAACUUUUG |
[ reference structure ]
|
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
|
[ predicted structure ] |
(((((((.((((([[.))))).......(((((]]....)))))...)))))))
|
RFA_00446
|
[ FASTA input ]
|
CCGGUGUCUCAAGGUGCGUACCUUGACUGAUGAGUCCGAAAGGACGAAACACCAG |
[ reference structure ]
|
.((((((.(((((........))))).......((((....))))...)))))).
|
[ predicted structure ] |
..(((((.(((((((([[)))))))){{..]].((((....))))...)))))}}
|
RFA_00604
|
[ FASTA input ]
|
AGAUACCUCCUGUGGAUCCAUUCAGGAUUAAUGAAAUCCUGUCAUUCAACCCCAAAAAUCUUGUCAAAUUAUUGCCUCGUCUUUUGGGCACAAACAAAAGUCACGCAGGAGGUUCAGACAUUCGACAUAAGAUACACUAUUUAUCUUAUGGAAGGUCUAGUUUUU |
[ reference structure ]
|
.....(((((............(((.(((.....))).))).....................................((((((((........)))))))).....)))))..(((((.(((..(((.(((((.......))))).)))))).)))))......
|
[ predicted structure ] |
(((([[[[[[[[[[[[[..[[{(((((((ccccc)))))))CCCCC.((.ddddddd)}))((((.)]]..))bbbb.]]]DDDDDDD....b(.aaaa.a(.]]]]]]]]]]<<.)))))B.)A(((((((((.eeee..)))))))))>>BBBB.EEEEAAAA
|
RFA_00620
|
[ FASTA input ]
|
UGACAAUUGCUGUAUUCAUUCUCCUUUCUCGAUAGGAAUUGGAGUCAUACAACCCCAGAAACCAUCCUUAUACCUUGAGUAUGCUGAAUUCCGUUAGCGUAGCUCUUGGCUAUUCUCAUAGUGAUUGCAUAUUUGGAGUUACUUAUUCGUCAAUUCAAUUAAAAUUCAUGACGAACCUAAAAGUACUCUGAAUGGUUAUUUUUUAUAAUU |
[ reference structure ]
|
.....(((((..........(((...(((.....)))....)))...................................((((((((......)))))))).......))))).....((((((((....(((.(((((.........((((................))))............))))).))))))))))).........
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((((((..(((....aaaaa.)))bbbb))((((((.(((.[[....AAAAA...BBBB)))...]]<<<<<<<<<<<))))))>>>>>{{{{{{{(eeeeeeeee..)))))))))).((cc(()}}}}}}}...fffffff))..ddddd))CC)))FFFFFFF..(((((>>>>>>.EEEEEEEEE..)))))DDDDD
|
RFA_00664
|
[ FASTA input ]
|
CCCUGGCUGACGAGUCCCAAACAGGACGAAACGCGCGUCCUGGAU |
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
|
[ predicted structure ] |
....((((..[[)))).....(((((((.....]])))))))...
|
RFA_00674
|
[ FASTA input ]
|
AUUCAGCUGACGAGUCCCAAAUAGGACGAAGUGACGCGCGUCCUGGAU |
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))......(((()))).))))))
|
[ predicted structure ] |
((((((((..[[)))......{{{{{{{...)))]]..}}}}}}}.))
|
RFA_00675
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAACUGACCAGUCGGAAAUAGGACGAAACGCGCGUCCAGGAU |
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
|
[ predicted structure ] |
((((..(((((..))))).....(((((.......))))).))))
|
RFA_00677
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAGCUGACGAGUCCUAAAUAGGGUGAAACGCGCGUCCUGGAU |
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
|
[ predicted structure ] |
(((((((([[[[))(((((..)))))((.....))]]]]))))))
|
RFA_00684
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAGCCGAUGAGUUCCAAACAGGACUAAACGCGCUUCUUGGAU |
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
|
[ predicted structure ] |
((((((..(((([[[[[....))]]]]].........))))))))
|
RFA_00703
|
[ FASTA input ]
|
CUUUCCCUGAAGAGACGAAGUGAUCAAGAGAUUGAAGACGAGUGAACUAACGACUCCUCCUUCUCUCACAAGUCGAAACUCAGAGUCGGAAAG |
[ reference structure ]
|
((((((.......((((.....................................................))))...((((.)))).))))))
|
[ predicted structure ] |
(((((.((..<<<<([[[[[[..(((({{{.))))))..((((..]]]..aaaaaa}}}(()>>>>....))]]]..)))).AAAAAA)))))
|
RFA_00716
|
[ FASTA input ]
|
ACUCCGUGACAAGUCUCGAAUAGGACGAAAUGUGCGUCCUAGAU |
[ reference structure ]
|
((((((......((((......))))...(((()))).))))))
|
[ predicted structure ] |
..(((({(((..))).((..[[[[[[[..)}))]]]]]]]))).
|
RFA_00717
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAGCUGACGAGUCCCAAAUAAGACGAACGCGCGUCUGGAU |
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))..(((())))))))))
|
[ predicted structure ] |
((((((.(([[[.[[[.)).....]]].......]]]))))))
|
RFA_00730
|
[ FASTA input ]
|
CUUUCCCGAGGCCACGGCGAGUAGCAUCGAGGGUACAGGAAAG |
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
[ predicted structure ] |
(((((((((.(((..)))..[[[...)))....]]].))))))
|
RFA_00763
|
[ FASTA input ]
|
UGAUGCCGAGGCCACGCCGGGUAGGAUCGAGGGUACAGCAUCG |
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
[ predicted structure ] |
((((((((((((...)))..[[[...)))....]]].))))))
|
RFA_00765
|
[ FASTA input ]
|
GAAAGCCGAGGCCACGCCGAGUAGGAACGAGGGUACAGCUUUC |
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
[ predicted structure ] |
((((((((.(((...)))..[[[....))....]]].))))))
|
RFA_00770
|
[ FASTA input ]
|
CUACUCUUGUACAGAAUGGUAAGCCAAGUGUCAAUAGGAGGUACAAGCAACCUAUUGCAUAUUA |
[ reference structure ]
|
....((((((((...............[[[.[[[[[[[..))))))))..]]]]]]]]]]....
|
[ predicted structure ] |
.(((([[[[[[(.{{.((((..)))))))).(((((((..)}}]]]]...)))))))....]].
|
RFA_00773
|
[ FASTA input ]
|
CUAGUCUUAUACACAAUGGUAAGCCAGUGGUAGUAAAGGUAUAAGAAAUUUGCUACUAUGUUA |
[ reference structure ]
|
....((((((((..............[[[.[[[[[[[.))))))))..]]]]]]].]]]....
|
[ predicted structure ] |
.((.(((((((([[..((((..))))[[[[[[[[[[[.))))))))..]]]]]]]]]]]]]))
|
RFA_00808
|
[ FASTA input ]
|
CUUCCGAUGUAGGCCCGUAUUCUUCGCCUGUACCACGGGUCGGUUUUAGUACAGGCGUUUUCUU |
[ reference structure ]
|
...........(((((((......[[[[[[[[[.))))))).......]]]]]]]]].......
|
[ predicted structure ] |
...(((((.[[[[[[[[[)))...{{{{{{{{{.]]]]]]]))...]]}}}}}}}}}.......
|
RFA_00816
|
[ FASTA input ]
|
GCUUGAUCUCUGUAUUUGUUUCUAUUUUGAACAUUUGCCUGCUACCUUGGCAUAACAUCAAUAAGGUACAAACAUCGCAAAAAGUCAUCAUAAGGUGGGUUUUAGUACGUAGGCGCUGUAGAACUUAAUUGUUCUGAUAGAGCAGCGAGUCGUGCAUGCUAGUCUAACAUUUCUUGCUACCUAGUAUCUUUAGAAGAUUUCCCUCCCUUAGCGGUC |
[ reference structure ]
|
..........................................((((((..............)))))).....(((((............(((((.(((.....(((((....(((((((((((......)))))......))))))...))))).((((((..................))))))..............)))..)))))))))).
|
[ predicted structure ] |
(((((aaaa.aaaa(((((cccccc.(((<..((.ggggggggggggg(...ddd..))>))DDDGGG.{{{{)G.)))).eee..e(..((ffffff}}}}))[[[[GGGGGGG..CCCCCC.GG).(((((((bbb)))))))))))).)AAAA(((((((((((.)]..]]].FFFFFF.EEEE..)))))AAAA.........))))))BBB
|
SPR_00030
|
[ FASTA input ]
|
AAAAAAUUAGUUUAAUCAAAAACCUUAGUAUGUCAAACUAAAAAAAUUAGAUCAUCUAAUAUUUUUUACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((..((((......)))).(((((.......)))))....(((((.....))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((((.((.((..{{.)).[[))}}.)))))))....((((((...)))))).))))))]]..
|
SPR_00066
|
[ FASTA input ]
|
GCCGAGGUAGCUCAGUUGGUAGAGCAUGCGACUGAAAAUCGCAGUGUCGGCGGUUCGAUUCCGCUCCUCGGCACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((<<<<<<<)).((((((.>>>>>>>.{{{{{..)))).[[[[[))}}}}}]]]]])))))))....
|
SPR_00228
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUAUGGCGAAAUUGGUAGACGCUACGGACUUAAAAUCCGUCGACUUAAGAAAUCAUGAGGGUUCAAGUCCCUCUAUCCCCACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((..(((...........))).(((((.......)))))................(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((.((([({((<<<<.<<)}])(((((.))....)))))..((((..(((.>>)>aaaaa)))))))AAAAA)))))))>>>)
|
SPR_00314
|
[ FASTA input ]
|
CGGGAAGUGGCUCAGUUUGGUAGAGCAUUCGGUUUGGGACCGAAGGGUCGCAGGUUCAAAUCCUGUCUUCCCGACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((.{{(<<<<.)))).((((((([[[))))))).....(((((.]]])}}))))))))))))>>>>
|
SPR_00331
|
[ FASTA input ]
|
UGGGGUAUCGCCAAGCGGUAAGGCACCGGAUUCUGAUUCCGGCAUUCCGAGGUUCGAAUCCUCGUACCCCAGCCA |
[ reference structure ]
|
(((((((..(((.........))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((...)))..(({{{.{{{{{))..((.}}}}}.[[[(.<<<<.)))>>>>]]]))))))))}}}.
|
SPR_00333
|
[ FASTA input ]
|
UGGGGCGUGGCCAAGUGGUAAGGCAGCGGGUUUUGAUCCCGUUAUUCGGAGGUUCGAAUCCUUCCGUCCCAGCCA |
[ reference structure ]
|
(((((((..(((.........)))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((<<<<((({..(([[[[.[[[[[[.)})))]]]]]]](((((((..)))))))]]]).)))))))>>>>
|
SPR_00353
|
[ FASTA input ]
|
GCGCCCGUAGCUCAAUGGAUAGAGCGUUUGACUACGGAUCAAAAGGUUAGGGGUUCGACUCCCCUCGGGCGCGCCA |
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
((((((((([[[(..{{{.)))}}}.(((((]]]<<<<))))).aaa.(((((>>>>...))))))))))))AAA.
|
SPR_00398
|
[ FASTA input ]
|
GAAAUAUGUUGAUCAAGAAAAGCUGCUAACUUUUUCUUUAAUGGUUUAAUUCCAUUAUAUUUCUCCA |
[ reference structure ]
|
(.((...(........)(((((.......)))))......((((.........))))...)).)...
|
[ predicted structure ] |
((((((((((((..((((((((.[[.[[..))))))))]]{{{{.))))..}}}}))))))))..]]
|
SPR_00452
|
[ FASTA input ]
|
GGAGGAUUAGCUCAGCUGGGAGAGCAUCUGCCUUACAAGCAGAGGGUCGGCGGUUCGAGCCCGUCAUCCUCCACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((.{{(<<<<))))..((((([(...)}}.[[[[[[.))))).>>)]]]]].]]))))))).>>.
|
SPR_00456
|
[ FASTA input ]
|
GAUUCCGUAGCUCAGCUGGGAGAGCGCCACCUUGACAGGGUGGAGGUCGCUGGUUCGAGCCCAGUCGGAAUCACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((.((((..{{{{{{..(((((((((((...))))))).[[[))))))))....}}}}}})))))))]]].
|
SPR_00462
|
[ FASTA input ]
|
CAAGAUAUAGCUUAAACAAAGCAUCCAGUUUACACCUAGAAGACUUCAUUCAUUAUGAAUAUCUUGACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.....)))).((.((.......)).))....((((.......)))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
((((((((.((((.....))))((..(((((.......{{)))))[[[[}})).]]]]))))))))....
|
SPR_00476
|
[ FASTA input ]
|
GACCUCGUGGCGCAACGGUAGCGCGUCUGACUCCAGAUCAGAAGGCUGCGUGUUCGAAUCACGUCGGGGUCACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((.(({((...[[[[[[[[[[((((.((..))))))...)})]]]]]]]........)))))))))]]].
|
SPR_00496
|
[ FASTA input ]
|
GACCUCGUGGCGCAAUGGUAGCGCGUCUGACUCCAGAUCAGAAGGUUGCGUGUUCGAAUCACGUCGGGGUCACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((((((([[[.[[[[[(((((.((..)))))))..)))))))(((]])))))]]])))))))]]].
|
SPR_00497
|
[ FASTA input ]
|
GACCUCGUGGCGCAACGGUAGCGCGUCUGACUCCAGAUCAGAAGGCUGCGUGUUCGAAUCACGUCGGGGUCACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((.(({((...[[[[[[[[[[(((<.((..aa)>))...))}]]]]]]].)A.A)..)])))))))]]).
|
SPR_00502
|
[ FASTA input ]
|
AGCGGGGUGGGGUAGUCAGGAAAUCCGAUGGGCUCAUAACCCGUAGAUCGAUGGUUCAAAUCCAUCCCCCGCUACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((a(.{{(.(((..)))<<<<<<..))(()A)).)))>>.(([[[[))...>>>>}})))))))]]]]
|
SPR_00509
|
[ FASTA input ]
|
CGCGGGGUGGAGCAGCCUGGUAGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAGAUCGUCGGUUCAAAUCCGGCCCCCGCAACCA |
[ reference structure ]
|
.((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
|
[ predicted structure ] |
.(((((([[((((aaaaaa({{)))).)AAAAAA..}}....((<.((.bbbbb)>)..)BBBBB)))))))...]]
|
SPR_00512
|
[ FASTA input ]
|
CGCGGGGUAGAGCAGCCUGGUAGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAGGUCAGAGGUUCAAAUCCUCUCCCCGCCACCA |
[ reference structure ]
|
.((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).....
|
[ predicted structure ] |
.(((((((((((([[[[[[[..)))).]]]]]]]..))(((.{{{))).(((((}}}....))))))))))).....
|
SPR_00542
|
[ FASTA input ]
|
GGAGGGGUAGCGAAGUGGCUAAACGCGGCGGACUGUAAAUCCGCUCCCUCAGGGUUCGGCAGUUCGAAUCUGCCCCCCUCCACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((..(((...........)))((((((.......))))))............(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((((([[[[[[[[)))...((((((((((((..{{]]]]](((...))).]]])))))))).}})))).)))))))....
|
SPR_00557
|
[ FASTA input ]
|
CCGACCUUAGCUCAGUUGGUAGAGCGGAGGACUGUAGAUCCUUAGGUCACUGGUUCGAAUCCGGUAGGUCGGACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((({.(([[[[.)})).<<<<(aa.))(()>>>>.AA))(((((.....))))))))))))))]]]]
|
SPR_00832
|
[ FASTA input ]
|
GUUGUUAUAGCAUAAGAAGUGCAUUUGUUUUAAGCGUAAAAGAUAUGGGACAACUCCA |
[ reference structure ]
|
((((((...((((.....)))).(((((.......)))))........))))))....
|
[ predicted structure ] |
((((((((.((((..<<.)))).>>{{{{{{....))..}}}}}}[[[)))))).]]]
|
SPR_00868
|
[ FASTA input ]
|
GGGCCCGUAGCUCAGCCAGGUAGAGCGCCCGGCUCAUAACCGGGUGGUCGGGGGUUCAAAUCCCCCCGGGCCCACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((...))..[[[.((({{{{{{{)))((..}}}}}}})).(((((((..))))))).)))))))]]].
|
SPR_00932
|
[ FASTA input ]
|
AGCCCCGUGGUGUAGCGGCCUAGCAUGCGGGGUUUUGGUCCCCGUGACCCCGGUUCGAAUCCGGGCGGGGCUACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.........)))).(((((.......)))))....(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
((((((((.((((.<<<<....)))).(((((((.[[[[..>>>>)))))))(({{{.)).}}}))))))))]]]]
|
SPR_00957
|
[ FASTA input ]
|
GGGCCCGUAGCUCAGCCAGGACAGAGCGCCGGCCUUCUAAGCCGGUGCUGCCGGGUUCAAAUCCCGGCGGGCCCGCCA |
[ reference structure ]
|
(((((((..((((..........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
((((((((.((...)).((((...{{{{{{{{{.))))((}}}}}}}}}[[[[[[)).....]]]]))))))))]]..
|
SPR_01040
|
[ FASTA input ]
|
GCCGCCGUAGCUCAGCGGUAGAGCGCCGGCCUCGUAAGCCGGUGGUCGCGGGUUCGAAUCCCGCCGGCGGCUCCA |
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((.{{.{{{{.))))).}}}}((.<<<<((((..[[[[[[[[[[))))))..]]}}.]]]]]]]]>>>>...
|
SPR_01143
|
[ FASTA input ]
|
AGCACCGUAGCUCAGUGGGAGAGUGGGGGGCUCAUAACCCCCAGGUCCAUGGAUCGAAACCAUGCGGUGCUA |
[ reference structure ]
|
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))).
|
[ predicted structure ] |
(((((((((.(((.[[[[[.)))((((((.]]]]]..))))))(((((..))))).......))))))))).
|
SRP_00005
|
[ FASTA input ]
|
GGGCGGUGCGAGCAGAUUGCGCGUGAAGUCGGUCAGGUUAGAAAUAAAGCAGCCGUAGCGUCGUCUUUCUGGGUUGCGCUUCCCACUGUU |
[ reference structure ]
|
.((.(((((((.((((....((((.....((((....(((....)))....))))..))))......))))..)))))))..))......
|
[ predicted structure ] |
(((((((((.<<<<<((aaaaa))<<<<(..AA..{{.{{{{(.....[[[[[[AAA))))))))))}}}}]]]]]])>>>>}}.>>>>>
|
SRP_00038
|
[ FASTA input ]
|
GGGAGGUUGGUGGUGGACGCACUGCUCGCCAACCGGGUCAGGUCUGGAAAGAAGCAGCCCUAACGAGUUCUGGUACGGGUCAUCGUACCAGCCUCCUAUUU |
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((.((.((((((((......((((....(((....)))....))))...)))))...))).))..)))))))..)))))))))....
|
[ predicted structure ] |
((((((((((((aa((((((.<<<<<.))..bbbbbbbb..)))).(({{BB>>>>>(((...[[[((BBBBBB))))))).]]]))))))))))))AA}}
|
SRP_00046
|
[ FASTA input ]
|
CCUAGGACCCGUACUAUCAAGUGUUGCUAAACCCCGUCAGGACUGGAAGGUAGCAGCGGUAAGCGAUUUUUUUGGUGAGUACGCAAGUCUUAGGUUGA |
[ reference structure ]
|
((((((((.((((.(((((((.((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))...)))))))..))))...))))))))....
|
[ predicted structure ] |
((((((((.((((((.[[[[.((((((((..((.{{{..))<<<<<<<<<))))))))((..}}}))>>>>>>>>>.))))))...))))))))]]]]
|
SRP_00103
|
[ FASTA input ]
|
GCCGGGCGCGGUGGCGCGCGCCUGUAGUCCCAGCUACUCGGGAGGCUGAGGCAGAGGGAUCGCUUGAGCCCAGGAGUUCUGGGCUGCAGUGCGCUAUGCCGAUCGGGUGUCCGCACUAAGUUCGGCAUCAAUAUGGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGUUGCCUAAGGAGGGGUGAACCGGCCCAGGUCGGAAACGGAGCAGGUCAAAACUCUCGUGCUGAUCAGUAGUGGGAUCGCGCCUGUGAAUAGCCACUGUACUCCAGCCUGGGCAACAUAGCGAGACCCCGUCUCUUUU |
[ reference structure ]
|
((((((((((......)))))))....((((........))))))).(((((.(.(...(((((...(((((((....(((((.(((((((.(((((.(....(((((((((.(((((.(.(((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).))))((...)).(((((.....((((....(((....)))....))))...))))).))))))).)..)))))))...))))))).).)))))))))))).)))))))))))).....)))))..).).)))))....
|
[ predicted structure ] |
((ffffffffffffffff(hhhhhh.(((((ggg..gggggggg(aaaaaaaaa.))))).jjjj.((((((((.dd)))))))))).)FFFFFF(((((((iii((((({{)))))JJJJ)))))))...(((((((.)GGGGGGGG.bbbbbb.DD)))))}}AAAAAAccccc((((((..(((eeeeeeee)))...III.HHHHHH......[[[[[[GGG..(((.<<<<<<.FFFFFFFFFF))).AAA>>>>>>)))))).EEEEEEEE....))]]]]]]BBBBBB.CCCCC.
|
SRP_00117
|
[ FASTA input ]
|
GACUGGAAGGUUGGCAGCUUCUGUAAUCACGCUUCUGUGAGGUCCGAUUGUGGGAUGGCCUGAGGCUGGGAUUUACUGCGUAGCGGACCAGCUCAUGUUGACGGAACGUCCGCACUAAGCUUGCCAUCAAUAUGGGUGCCAUGGAGGAGUCCGUGGCAUUCAGGUUGGCUAAGGAGGGAUGAACCGGGCCAGGGGUGAAAACCAGCAGCCAAGAGUUCCCGUGGUAGGCAGUAGUGGGAUAGCGUACCGGAGUGGACUGCCGUUAUCAGCCCAACCAAUAUGGUUGGACCACAAUCUUUUUU |
[ reference structure ]
|
(((((((((.(....).)))))....(((........))))))).((((((((..(((((...((.((((.....(((.((((((...(((.((((.((..(((.((((((.(((((.(((((((((((((.(((((((((((((....))))))))))))).)))).(...)..(((((......(((....(((....)))....)))....))))).)))))))))..)))))))...)))).))))))))).))).))))))))))))).)).....)))))..))))))))......
|
[ predicted structure ] |
..((((..[[[[[[[[[.((((((..((bbbb(eee(aa(ffffffffffff...ffffff(.iiiiii))aaaaaaa(cc.ccccc(..{{{{.{{{{{)))))).)CCCCC.ggg.ggggggggg}}}}}(((((((((((((....)))))))))))))..gggg((.ddddddddd....)IIIIIIhhh(<<....)))).))GGGG}}}})HHHGGGGGGGGG.)AAAAAAA..)FFFFCC)FFF.GGG.]]]]]])FFFFFFFF>>]]]..FFFAAEEEBBBB...DDDDDDDDD
|
SRP_00138
|
[ FASTA input ]
|
GCCUUGAUCUUAGACAAGUAUAUUUUCACGGUAUCAGAAUCGGAAGAUAGCAGUACAGAAAGUAGCUUGUCAUAGUGAUCAAGGUCUAUU |
[ reference structure ]
|
(((((((.....(((((((.((((((....((((....(((....)))....))))..))))))))))))).......))))))).....
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((.<<<<<<<.<<<<<<<.<<<(.{{.)))}}>>>>>>>>....(((.>>..)))>>>>>>>[[[[.)))))))))]]]].
|
SRP_00144
|
[ FASTA input ]
|
GGACUAGGUCGGGCAGUUAGGCCCUGCUCUUCACCCGCGAAAUAGGUCUUUAGCGGGGACCGAACACGGGCGCGUCCGGUCAGACCGGCGCGGGCCCCGGAAGCCAACGUAGAAACCUCGUCCUUCGGGGACAGCGGUUCCGCGUACCCCUUCCGCAGGGAAGGGUUCGCGCGGUUUAUCGGUGGUACCCCGCCAGGCGCGGAAGCGAGCAGCGGACCAUCGGACGUGCGUCGCUCGAGGGAUCGCGGGGUGGAGGAGGCAACCGGGAUUCCCCACGUCGGAACGCCGGGCAACCUCGCUGUCCAC |
[ reference structure ]
|
((((..((((((((((.......))))))....(((((..............))))))))).....((((...(((((((....((((((..((.(((((..(((..(.(....(((((((((((((.(.((.((((..((((..(.(((((((....))))))).)...))))..).(((((((....((((....(((....)))....)))).))))))).)))..)))...))))))...))))))).).)..)))..))))).....)).))))))...)))))))...))))..))))..
|
[ predicted structure ] |
.((((.ggg.ggg.)))).(((((((((.(((.iiii.)))...ffff(ee))))))).hhhh..(((.ccccccccccc.)EEFF.bbbbbbbbb(aa.aaaaa..))).FF..hhhhhhhhhhhh(<<<<<<<<<((((((((..GGG.{{{{(.[[[[()BBBBBBBBBAAAAA.[[[[[[.[[[[[[[[...))))))))jjj(dd.)}}}}))CCCCCCCCCCC.)JJJ)HHHHHHHH.]]]]]]]]HHHH.......IIII.)]]]]..AAHHHH..]]]]]]DD.GGG>>>>>>>>>..
|
SRP_00170
|
[ FASTA input ]
|
GCUCCCCACGUGGCGCCAUCCAGGCCAACUCCCCCAGGGUGGAAACGCAGCAAGGGUAACCGGGCUCUGGCGGGUGCGUGGGGGGUCUUUU |
[ reference structure ]
|
((.((((((((..(((((.((.((......(((.....(((....))).....)))...)).))...))))).)..))))))).)).....
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((.(((((aaaa.))).....[[[[[[[[[[[({{{....))..AAAA..)}<<}}]]]]].]]].)))))))))))>>]]]
|
SRP_00173
|
[ FASTA input ]
|
UUUGUCGUGCUAGACGGGGAGGUAGCGGCGCCCUGUAACCCGCAAUCCGCUCUAGCGGGGUUGAAUUCCUCAUUUGAGGCAUCGUAAUUGUUUGGUCUGCCCUUGACAAGUGGUGUUGAAGGUUGGGUCUUGCGCAAUGGGAACCUGUGAACCAUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCAUUAAUCAGUGCUUCUCAUGUGCCGCGAGGUUGCCUGGCCCGAGCUAACUAUCAAGGUAACGCAGGUGAUUGCAUGUCGAGGUGAGGUGCGCGACACUAA |
[ reference structure ]
|
..((((((((..(((((((.(.(...).).))))....(((((...........)))))))).....(((((((...(((((..((((((((((...(((.(((((..((((((......((((((((((((((((.((((((.(((......((((....(((....)))....))))....)))...))))))))...))))))...))))))))...))).))).))))))).)..)))))))))).)))))..))))))).))))))))....
|
[ predicted structure ] |
((jjjjjjj(aaa(((((mmmm(.eeeeeee))))).(((((...((((((gg)))))).ii(()MM(((((ll)))))..iiiii(MM{{{{{{{{{(.cccccccc.cccc(.ddd(GG<<)))))ff(((kkkkk..LLkkkkkkk.)CCCCbbbbbbb.)}}}.hhhhhhh))))II.)>>DHHHHHHH.DDEEEEEEE))((((BBBBBBB}}}}}}.)))).))IIFF...KKKKKKK.KKKKK.CCCCCCCCIII...)AAAJJJJJJJ.
|
SRP_00193
|
[ FASTA input ]
|
GGAGGCCCUCUUGGUUCCUCGCAAUGAUGUUCGGUUUAUUAGGUCAGGUUCGGAAGAAAGCAGCCGGAGUCGAGAUUUUCGUGUGCCGAGAUCAAGCUGGGAGGGUCUCCACCCAACU |
[ reference structure ]
|
((.(.((.(((((((..(((((.((((.((((((((...(.(((....(((....)))....))).))))))))..).)))))...)))).....))))))))).).)).........
|
[ predicted structure ] |
((((((((((((((((.((((...((((.[[[[[[({{{...))))<<<<<<<..<<<<(.)]]]]]]<<)))).)>>>>}}}((>>>>>..))))))))))))))))))..>>.>>.
|
SRP_00194
|
[ FASTA input ]
|
GCCGUGAUAAAGAUUACGCCCGAAUGAGUCAGGACCGGAAGGUAGCAGCUAUAAGGGAAUGUGUCUUGUAUCACGGUUUUU |
[ reference structure ]
|
(((((((((.((((....((......(((....(((....)))....)))....))......))))))..)))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((((...((([[[[[[...[[)))((((((..{{{{((((]].))))..]]]..]]])))))))))))))))}}}}
|
SRP_00197
|
[ FASTA input ]
|
UGAUGAGCUAGUCCGGGUAGCCCGGCGUUACCUGUAACCCGAAAUCGCCGAUAUGCGGGGGACGAAGCCAAUGGAAGAUGCGUCAAAGGGAUUCCAGCCUGUGAUCUCAACUGAGAAACCCCGUCCUGCUUGGAUGAUGCAGGUAUGUGGACUUGCUGGAAAACAGGUCCUCAUACCCUAACUGCGGAAACCGGUCGAGGCCCGGAAGGGAGCAGACUCACUGUGGGCAACCGUCGCUUGCGGGGUCGCGGGGUGGAGAAGAGAUUCCAGUCUACUGAAAUCUCCCAGAUACAACGACCUGCGGUGUGCUCAUCA |
[ reference structure ]
|
((((((((..(((((((((((.....)))))))....((((.(..........).))))))))...(((...((..(.((.(((...((((((.(((.(((.((((((..((.....((((((((((((.((.(((.((..((((((.(((((((.(....).))))))).))))))....((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))).))..)))))...)))))...)))))))..))..)))))).)))....))).))))))...))).)).)..))...)))..))))))))
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((iiiiii(<<<.(((((.ccccccc(...ee....))))).(((ggggggggg(aaa(ll.lllll.))))LLL..kkk(.LLAAA.[[[[[[[[[[[..))).....GGGGGG.f()GGG(((((()EECCCCCddd((((((jjjjjjj...)))))))))).)]]]..((bbbb...)F((((.)B)]]]]]].hhhhhhh)))){{{{{{{{{...BBB).]]KLL.KK>>>IIIIII((((........JJJJJJJ))))HH..{{HHHHH))}}DDD.CC.}}}}}}}}}.))))))))
|
SRP_00198
|
[ FASTA input ]
|
GCUGAUGAGCUAGUCCGGGUAGCCCGGCGUUACCUGUAACCCGAGAUCGCCGAUACGCGGGGGACGAAGCCAAGGGAAGAUGCGUCGAAGGGACUCCAGCCUGGAAUCUCAACGGAGAAGCCCCGUCCUGCUUGGAUGGUGCAGGUAUGCGGGUUUGCUGGAGAGCAGGUCUUCAUACCAUAACUGCGGAAACCGGUCGAGGCCCGGAAGGGAGCAGACUUACUGUGGGCAACUAUCGCUUGCGGGGCUGCGGGGUGGAGAAGAGGUCCCAGUCUCCUGGUAUCUCCAAGAUUCAACGACCCGAGGCGUGCUCAUCGCUU |
[ reference structure ]
|
(.((((((((..(((((((((((.....)))))))....((((.(..........).))))))))...(((..(((..(.((.(((...((((..((((.((((.(((((..(......((((((((((((.((.((((((..((((((.(((((((((....))))))))).))))))....((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))).)).))))))...)))))...)))))))...)..))))).))))....))))..))))...))).)).)..)))..)))..)))))))).).
|
[ predicted structure ] |
((aaaaaaaa...(((((((.((((((((.{{{{{{{(.jjjj....))))).(c((<<<<<<<<.<<<<((hh.hhh((.eeeee...eeeeeeeeee((((iiiiiiii.)))...dddddddddddddd))hhhh()JJJJ}}}IIhhhhhh.)EEEEEEDDDDDD))HHH.)C[[[[[.[[[[.....[[))))H..)))))))..]].]]]].HHbbb]]]]]))..)HHHHHHHHDDDDDDDD.}}}}.((((((.fff.EEEE.H>>>>>>>BBB))))))IIIIII...>>>>>).EEEEEAAAAAAAAFFF
|
SRP_00200
|
[ FASTA input ]
|
GCAAGCCGCAUCGGUCCCCUCGCAAUGAUACGCUGUGAACCCCGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACGGUAACAGCGGACUCGUGUGCCGGGGUGUGGCUGGUGCGGUGAGCCGCCCAUU |
[ reference structure ]
|
((..((((((((((((.((((((.((((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))))...))))).)..)))))))))))..))........
|
[ predicted structure ] |
((..((((((((((((a(((<<<(..bbb.bbbbb(..{{{{{(...[[..[[[.)))).))..a(((.)BBBBB.((]]])>>>.)]]}}}))))))))))))))..AA)).}}BBB
|
SRP_00216
|
[ FASTA input ]
|
AGAACCAUCACAUCAUUAGAGUCGAAUCAUGUCAGGCCAGAAAUGGAGCAGCAUUAAGACUUGUCAGUGAGUGUGAUGGUUUU |
[ reference structure ]
|
(((((((((((..((((.(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))...)))).)..))))))))))
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((((..((([[[[(...{{{{((....(((....))).)).{{..))))}}}}}}..]]]])))))))))))))
|
SRP_00229
|
[ FASTA input ]
|
GCCCAUAGAGGAGGAUCUUCAACGUUUUGAAGAUGUGUCAGGACUGAAAAGAAGCAGCACGCAAAACGCUUCGAAGUCGCCCCCAUUCUAUGGGUGCCGUACC |
[ reference structure ]
|
((((((((((..((...((.((.((.((.....(((((.....((....)).....)))))...)).)))).)).......))..))))))))))........
|
[ predicted structure ] |
((((((((((..((((((((((.[[[))))))))((((...{{{{.....{{{{{.))))<<..]]]}}}}}..}}}}<<))...))))))))))>>.>>...
|
SRP_00233
|
[ FASTA input ]
|
GACCUGGAUCUAUGCGACUGCAACGCCUAAACCUUGUCAGGACCGGAAGGUAGCAGCAACACAGGAUGCUUGUGGUAGGCGUAGUCUCCGGGUCGCCCUAUU |
[ reference structure ]
|
((((((((.((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...))).)).)))))))..))))))..))))))))........
|
[ predicted structure ] |
((((((((.((<<<<<<((((.aaaaaaa.(((((((.{{{))...))))).))))((.[[[[[[.))]]]]]].AAAAAAA))>>))))))))>>}}}>>.
|
SRP_00234
|
[ FASTA input ]
|
AUACGUGCUAAGCGGGGAGGUAGCGGUGCCCUGUACUCGCAAUCCGCUAUAGCGGGGCCGAAUUCCCACUCGAGGUGGGACGACUUUAUGGUCUGACUUAAGGGAUUGGUGUUGACGCCCGGGUCCUGCGCAACAGGAACCCACGAAUCCUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCAGUAAGUGGUUAUUCUUGUGUGCCGCAGGGAAGCCUAGGCCGAGCCAUGAACUUAUGUAGCGCAUAGGGUCGUUUCAUCGACAGUGGGUGCACGUAU |
[ reference structure ]
|
((((((((...((((((.(.(...).).))))...(((((...........)))))))......((((((...((((((.((((((((((..(((...((((...(.(((......(((.((((((((((((.((((((.((((.....((((....(((....)))....))))...)))).)..)))))))...))))))...)))).)))...)))..)..))))..)))..)))))))))).))))))...)))))).))))))))
|
[ predicted structure ] |
((((((((((..((((((((((((((.ee(.[[[[[[[[[[[[))))))).<<<<<<<<...)))))..(((.ddddddddddddddddd.ddd(aaa...(((]]](((((ff))))){{>>>>>>>>{{.{{{{{{.))).))).}}}}}}.((((.)DDDbbb..(((}}AAA..cccccc.cccccccc)))CCCCCCCC.)))).)EE}}CCCCCC...BBB.)))))))DDDDDDDDDDDDDDDDD..FF]]]]]]]]])))))
|
SRP_00243
|
[ FASTA input ]
|
AACCGGGGACCUCAUGGAAUAAAUUAGUUCGAACCAGGUCAGGACAGGAAUGUAGCAGCCUUAAGAAUCAUACUUAUGCCUUGAGAUAAUCUCCGGUUUUUU |
[ reference structure ]
|
(((((((((.((((..(.((((.((.((((.....((((....(((....)))....))))...)))).).).)))).)..))))....)))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((((.((((((((((..))).(((([[[[({{{{..)))).)]..<<<.<<<}}}}<<<<..)))..>>>>>>>..))))>>>.))))))))).]]]
|
SRP_00244
|
[ FASTA input ]
|
GGAAACCUUCUCGGUUCCUCGCAAUGGUGUCUGGUUUACCCGGUCAGGUUCGGAAGAAAGCAGCCAAAGUCAGAAUUUCUGUGUGCCGAGAUCAAGCUGGGAAGGUUUCCACCCAACG |
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((.(((((.((((.((((((((.....(((....(((....)))....)))..)))))))..).)))))...))))....))))))))))))))))........
|
[ predicted structure ] |
((((((((((((((((((([[[[[(((((..<<<<<)))).{{{.)))(((((..aa..((>>>>>..))(((()].))))]]]]))))).AA.))))))))))))))))}}}.....
|
SRP_00266
|
[ FASTA input ]
|
GCCCGAAAGUAUAUAAUUGUAGAAACUAAAUCUUGUCAGAACCGGAAGGUAGCAGCAAUAAUGUUUACAUAUAGAAGAUAUGAUUUUCGGGUGUUUU |
[ reference structure ]
|
((((((((((.((((..(((..(((((.....((((....(((....)))....))))..).))))))))))).........)))))))))).....
|
[ predicted structure ] |
((((((((((.((((((<<<<<(..((..aaaaaaa.)).(((.[[.))){{{.AA.{{.)).)}}}}})))).AAAAA>>.))))))))))>>>]]
|
SRP_00267
|
[ FASTA input ]
|
ACGGAGUGUCGUGGCGGGCACUUGUGAGCCAGCUUCUAGGCCGUAGAUUAUGGUGGAGAGAGUGAGGGAGGGAUCCCUGGUCGGAAUUCGGUCUACGACGACCGGGCGUCCGUGCCAAGCGAUGCGUCACUAGGGGGUAAGACUCGGAAGGGUCUCUCUCCCGGGUGGAAAAGGACAACCGUAUGGCUCAGGCCCGAAAGGGAGCAGGCAAAAGGUUGCGCGCGUUGACAGUGGCCGGAUAGCGUCUGCGAGUAGAUCGACCUGAACAGCCCUUCUAAUACCUCUCGACCCAUAAUCGU |
[ reference structure ]
|
((((((((((......)))))))....(((........)))))).((((((((....(((((...(((((((....(((.((((..((.(.(((((..(...(((((((((..((((.(.(((((((((((.(((((..((((((....))))))..))))).))))........(((((.....(((....(((....)))....)))....))))).)))))))..)..)))).))...))))))).).)))))).)).)))).)))))))))).....)))))...))))))))..
|
[ predicted structure ] |
((((b((gggggg({{{{{{([[[[[[[[[[(((((((dddd(..aaaaaaaa)))))..<<<(.eeeeeeeeeee(((((((..hhhhhhhhhhh..))))))))).))))).BGG..(((((((()>>>.ccccccc..((((((..EEEEEEEEEEE)))))).....ccc.((((()].]]]]]]].]]}}}.fffff.ffffff....))))).)))))))).}}})AAAA...(((.FFFFFF..HHHHHHHHHCCC..)G..FFFFF))).CCCCCCCGGG)AAAADDDDHH
|
SRP_00269
|
[ FASTA input ]
|
GACUCGGGCCCAUGCGGCUUCGACGCCUAAAUCUGGUCAGGACCGGAAGGUAGCAGCCACAAGGGAUGCUUGAAUCUGGCGUGGAUUCCGGGUCACCUAAA |
[ reference structure ]
|
((((((((.((((((((.((((((((((.....((((....(((....)))....))))...))).)).))))).)).))))))..)))))))).......
|
[ predicted structure ] |
((((((((.(((((((((([[[..((((...((((((({{)))))))))))[[[)))).....((((]]]]]])))).))))))..))))))))..}}...
|
SRP_00273
|
[ FASTA input ]
|
GGUGGCCCCAUCGGUCCCCCCGCAUUGAUUACCCGUUAACCUGGUCAGGCCCGGAAGGGAGCAGCCAUAGCGGGAACAUCGAGUGCCGGGGUGUGGCUGGUGGGGCCGCCUCCAUUU |
[ reference structure ]
|
((((((((((((((((.((((((.(((((..((((((....((((....(((....)))....)))).))))))...))))))...)))))...)))))))))))))))).......
|
[ predicted structure ] |
((((((((((((((((((((((..<<<<<..<<<<<<(.[[[[[[..[[[.))){{))).(((]]].)]]]]]].((>>>>>))>>>>>>.))))))))))))))))))).....}}
|
SRP_00276
|
[ FASTA input ]
|
GGCGGCGGGCUAGGCCGGGGGGUUCGGCGUCCCCUGUAACCGGAAACCGCCGAUAUGCCGGGGCCGAAGCCCGGGGGGCGGUUCCCAAAGCCGCUCCCAGAAGCCGAGGUCGAACGAUGAGUCCUCGUCCCGCGGGGUGCCCGGUGGGGGAGGCACGGCUGAAGGGCCGUGCUAACCCCCUUUGGGCCCCGAACCCCGCAAGGCCCGGAAGGGAGCAGCGGUAGGGGCCACGGAGCACGCUCGCGGGGGUGCGGGGAUGAGAUAGGCCUCGGUGGAUGGGAGCGGUGGAGGGUUCCCACCCUCGGGCGUGCCCGCCGCC |
[ reference structure ]
|
((((((((((..(((((((((((.....)))))))....((((.(..........).))))))))...(((((((((..((..(((...((((((((((...(((((((((.(.(.....((((((((((((((.(.(((((((.(((((.(((((((((....)))))))))..))))).)..((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))).))).))))...))))))...))))))))..).).)))))))))...))))))))))...)))..))..)))))))))..))))))))))
|
[ predicted structure ] |
((((((((((...(((((ffffffff(dddddddddd.ddd(..(((((e((.gg(bbbbbbbb(...aaaaaaaaa)))E))[[(...<<<<<<<<<<...(({{{{{(((..))))).))}}}}}[[[[[[[[[[[[[)))))(((((.(((((((((....)))))))))..)))))(((((((()]]]]]]]]ccc.)))))))).((((((..)]]]..)]]((>>>..>>>>.>>>]]DDDD.CCCDDDDDDD..)AA)AAAAAAAB...DDFFFFFFFF))...)))))).BBBBBBBGG..))))))))))
|
SRP_00278
|
[ FASTA input ]
|
CGGGUAGGGCCGGGGGCUCGCCCUCCCCCGAGCCCCGAAAUGGGCGUAAUGCGGGGGCCAGUAACCCGCACGUCGGCCGUAGUGGUCCAGGGCAGACCCGGCCGACCCAUGACCCCCGUCCCGCGGGGCCGGCGGCGCGGAGCCCCCUCCGGAGGGAGGGAGGCUACCGCCCUUACCGGGGGAACCAGGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACCUAACCCCGGACGCCCGGCGUUCGCGGGGCCACGGGGUGAGGCAACGGCCGGGCCCCCUGCCCUGGGCCCCUACGGCUGGCGUGCGGGGGCCGC |
[ reference structure ]
|
(((.(..(((((((((.......))))).....((((.(..........).)))))))).....((((((((((((((((((.((((((((((((.((((((((..((.(...((((((((((((.(.(((((((.((((((((((((((....)))))).)))).))))..)..((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).)).)))))...))))))...)))))).).))...))))))))....)))))))))))).))))))))))))))))))).))).
|
[ predicted structure ] |
.((((.bbbbbbbbbbbbb))))(((((((.[[[[[[...[[[[[[[..[[(((((<...((..aaaaaaaaaaaaaaaaaa.aaaaaaaaaaaa.aaaaaaaa.aaa.aa.)>)))eeeeeeeee({{(.ddddddd.BBBBBBBB.ddddddd(((((.cccc....)))))..)))))))))AACCCC.BBBBB((..AAA.)DD.DDD....DDDDEEEEEEEEE.)]]]]]]]]]..]]]]]]..)DD..AAAAAAAA))..AAAAAAAAAAAA.AAAAAAAAAAAAAAAAAA.DDD}}
|
SRP_00285
|
[ FASTA input ]
|
GCUAGUAGUGGGCAUUGCUCUUGCUUAGUUGGUCAGGUCUGAAAAGAAGCAGCCAGGGUAAGAUUCUGUGGGUCAUUACUAGUAUCA |
[ reference structure ]
|
(((((((((((.(((.(.(((((((...(((((....(((....)))....))))))))))))..).)))..)))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((((..<<(aaaaaaaa.))(((({{{{(([[[...)).)AA))))AAAAAA>>.}}}}....))))))))))).]]]
|
SRP_00303
|
[ FASTA input ]
|
GGUGACCCUAGGGUCCCCCCGCAAUGAUAACUUGUGAACUCGGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACCGCAGCAAGCGACUCGUGUGCCGGGGUGUCGGCUCUAGGGGAACCUCCAAAU |
[ reference structure ]
|
(((..(((((((.(..((((((.((((...(((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))....)))))...)))))....).)).)))))..))).......
|
[ predicted structure ] |
(((..<<<<<<<<<<...<<(..{{{{...{{{{(...[[[[[[...))))>>...((((.....((()}}}}....}}}}aa]]]]]].))).>>>>>>>>>>..AA))))....
|
SRP_00308
|
[ FASTA input ]
|
CCGUGCUAGGUGGGGAGGUAGCGGUUCCCUGUACUCGAAAUCCGCUUUAUGCGAGGCUUAAUUCCUUUGUUGAGGCCGUAUUUUUGCGAAGUCUGCCCAAAGCACGUAGUGUUUGAAGAUUUCGGUCCUAUGCAAUAUGAACCCAUGAACCAUGUCAGGUCCUGACGGAAGCAGCAUUAAGUGGAUCAUCAUAUGUGCCGUAGGGUAGCCGAGAUUUAGCUAACGACUUUGGUUACGUUCGUGAAUUACGUUCGAUGCUUAGGUGCACGG |
[ reference structure ]
|
((((((.((((((((((.(...).))))))...((((.(..........).))))))))....(((..((...((.(((...((((((((....((.(((((..((((((......((((((((((((((((((.((((((.((((.....((((....(((....)))....))))...)))).)..)))))))...))))))...)))))))))).))).))).)))))))....))))))))..))).))...))..))).))))))
|
[ predicted structure ] |
((((((..(((((((((.cccccc))))))((((ffff({{{{{{{{{{{{{{.((((((((..dddd))).)))))))))((g(([[[[[[[[[[[[)G)aaaaa((eee)FFFFbbbbbbbbb(hhhh}}}}.}}hhh)))((((((()]((((((.CC))))))DDDD.<<<<<<}}}}}}}}..HHH))AAAAAiiii]]]]])HHHHBBBBB.CCCC((]]]]]])))BBB)))))))((.IIII)).>>>>>>BEEE.))))))
|
SRP_00317
|
[ FASTA input ]
|
ACUGGGCGUUGUGGCGUGCGCCUGUAAUCCAGUUACUUGGAAGUCGGGGUUGGUGGAUCGUUUGAGAGCGGGAGUUCUGUAUGUCGUCGCUCUAUGGCGAUCGGGCGUCCAUGCUAAGCUCGGCAUCGAUAUGGUUGAUUGGUCGGAGGACUGGCCAACCAGGUCGUCUAAGGAGGGACGUACUGGCCCAGGGCGGAAACGCAGCAGGCAAAAGUCCCCGUGUGGAGCAGUAGUGGGAUAGCGCCUGUGAAUAGGCGGCGGCUUGCAGCCCGUUCAACAUAGUGAGACCCAAUCCUUUUUU |
[ reference structure ]
|
(((((((((........))))))....(((........)))))).((((((((....(((((...(((((((....(((((.(((((((((..........(((((((((.(((((.((((.((((((((.((((((.((((((....)))))).)))))).))))((...)).(((((....(.(((....(((....)))....))).)..))))).)))).))))..)))))))...)))))))......))))))))).)))))))))))).....)))))...)))))))).....
|
[ predicted structure ] |
(((aaaaaaaaa.aaaaaaaaaah((ggggggg.gggggg.)H).((((((((...((((((...{{{{{{{..{{{{{(fffffffffffffff))))))))AAAAA((((d()A.(((((((.ii(.eeee)))))((((((((....))))))))GGGGGG.bbb([[[[[(((((((GGGGGcccc..)}}}}}AAAA.))..<<<<..))))).))D))).)].FFFFCCCCAAAAAAAAA.)EEGG.FFFFFFFFF>>>>..}}}}}}}..EEIIFF.)]]]))))))))]BBB)
|
SRP_00321
|
[ FASTA input ]
|
AUGGUCAGGUAGGGUGGAGGGUCUCGCCAGCCCUUAUACCCACAUGGCGCAACGUGGGCACCAGUAACUCCUAUGCUAUAAUACCUGCUCUUCGAGAUCCCAGUCUAACUAUGAUCAUCGCCCGACGGGGCGAGAUAGUCGUGGGUUCCCUUUCUGGAGGGAGAGGGAAUUCCACGUUGACCGGGGGAACCGGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACCGUGCCCGGCUAUCCGCGUUCGUCGGUCUCCGAUAGGAGGAAGACUGGGGGUAAAUCUCGGGGAGUAAGGGUUAUGGCAUAGGGGAGCUGACCAU |
[ reference structure ]
|
((((((((.(..((((((((((.......))))))...(((((..........))))))))).....(((((((((((((((.(.(((((((((((.(((((((((..((....(.((((.((((((.(.((.(((((.((((((((((((((((....))))))))))).))))).)..(((.((....(((.....(((....))).....)))..))))).)))))))...))))))....)))))...)).)))))))))......))))))))))).).)))))))))))))))).))))))))
|
[ predicted structure ] |
(((((((((<(((((cc...cccccccc.)))))(({{{{.)>.((((.(((((ddddddd.(((..aaaaaaaaaaaaaaa.aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa.)))(((((...ff([[[[[[[CCCCCCCC.)))))(((((((((((((....)))))))))))))..))))).bbbb(eee.ee.))))..)EEEE...EB(((..CCDDDDDDD))).BBB)]].]]]]]FF(((((..))))))).AAAAAAAA}}}}.AAAAAAAAAAAAA.AAAAAAAAAAAAAAAAA..))))))))
|
SRP_00322
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUCAGGGAGGGUGGGGGAUCUCGCCAAUCCCUAUUACCCGCAAGGCGUAAUGCGGGCACCAGUAACUCCUACCCUAUGGUGUCUCCUAUCUGUAGGUCCCAGUGGAGCGAUGAAGCCUGCCCAGCGGGGCUUGGCGGUCAUGGGCUUUCUCUCCGGAGGGAGAGAAAGUACCAUGAUAGCUGGGGGAAUCGGCGAGGCCCGGAAGGGAGCAGCCGUGCCUGGACGCCAGCGUUCGCUGGUCAACAGCCAGAGUGAAACUGGGGUAAACCUAUAGAUAGGUAGGCCAUGGGGUAGGGGGUCUGGCCCCAU |
[ reference structure ]
|
(((((((((...((((((((((.......))))))....((((((........)))))))))).....(((((((((((((((.(..(((((((((((((((((((...((......(.(((.((((((.(.((.((((((((((((((((((((((....))))))))))).)))))))..(((.((....((((....(((....)))....))))..))))).)))))))...))))))....))).)...))...))))))))....))))))))))).).))))))))))))))).)))))))))..
|
[ predicted structure ] |
(((((((((..(((((((...jjjjjj(..cccc((((([[[[(..hhh.)))).eeeeee{..((..iiiiiiiiiiiiiiiii(.aaaaaaaaaaaaaaaaaa(...fffff....)))}))).)]]]]((bbbbb.((((((((((((((((((....))))))))))).))))))).)FFFFF.((AAA)AACCCCggggg.)JJJJ)).HHH)AAAAAA)AA((((((()))))))))..)A.BBBBB.JJ....GGGGG<<..AAAAIIIIIIIII...IIIIIIII)EEEEEE.)))))))))>>
|
SRP_00332
|
[ FASTA input ]
|
GGCGGCGGGCUAGGCCGGGGGGUUCGGCGUCCCCUGUAACCGGAAACCGUCGAUACGCCGGGGCCGAAGCCCGGGGGGCGGUUCCCGAAGCCGUUCCCGGAAGCCGGGGCACAACGGUGAUCCCUCGUCCCACGGGGCCGGCGGUGGGCGGGGUCCGGCUGGAGGGCCGGGCUAACGCCCUUUGCCCGCCGAACCCCGUCAGGCCCGGAAGGGAGCAGCGGUAGGCGGGACGUUCGGCGCUCGUGGGGUAGCGGGGGUGAGCGAGCCCCGGUGGAAGGGGACGGUGGAGGGUCCCCACCCCCGGGCGCGCCCGCCGCC |
[ reference structure ]
|
((((((((((..(((((((((((.....)))))))....((((..............))))))))...(((((((((..((..(((...(((((((((....((((((((.(..(......(((((((((((((.(.(((((((.(((((.(((((((((....)))))))))..))))).)..((((((.....((((....(((....)))....))))..)))))).))).))))...))))))...)))))))...).).))))))))....)))))))))...)))..))..)))))))))..))))))))))
|
[ predicted structure ] |
(((..((((([...((((ffffffffff(.{{{{{{{..))))....<<<<<h[(cccccccccc(..aaaaaaaaaaaaaaaaa(...eeeeeeeee....)))[[[[.[[...(((..bbb(jjjjjjjjjjj(jj(ggggggggggg.(((((((((....)))))))))...ggggggg))))FFFFFFFFFF.ddd))))))...]EEEEE..]E]].]GG]GGGEEEHAAAAA)JJJJJJJJ)A}}}}}}}DDD.JJJAAAAAAAAA...AACCCCCCCGGGGGGG]))).CCC]>>>>>.GGGGGGJJBBB
|
SRP_00333
|
[ FASTA input ]
|
GGCUCGGAAUCAUGCGAUCGCAACGCCUCAACCUUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCAAUACGGGAUGCUUGCGAUAGGCGUGAUCUCCGGGUCACCCUCUG |
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...))).)).)))))))..))))))).))))))))........
|
[ predicted structure ] |
((((((((.((.(((.ccccc(bbbbb(..((((.[[[)))).<<<<..))aaa()))....{{{.AAA))>>>>B)BBBBC]]].)))))))).}}}CCCC
|
SRP_00337
|
[ FASTA input ]
|
CCGUACUAGAUGGGGAGGUAGCGGUGCCCUGUAGCCUGCAACCCGCUAUAGCAGGGUCGAAUUCCCAGGCUGAGGCCUGAUUUCUGUAAGGCCUGGCGCAAGUAAGUGGCGUUGAUACUUGAGUCCUGCGCAACGGAGAUUUGCGAACCCCGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCGGUAAGCAAACACCUCCGUGUGCCGCAGGGGUGCUUGAGUGGAGCUAACUGCUUGCGUAACGCUUAUGGGGACAGGUCGAAGCUGGGUGUACGG |
[ reference structure ]
|
((((((..(((((((.(.(...).).))))....(((((...........)))))))).....(((((..(..((((((.((((((((((...((((((((((.((((((.....(((((((((((((((((.((((..(((((.....((((....(((....)))....))))...)))))....))))))...))))))...)))))))))..))).)))))))))))..)))))))))))))))))).)..))))).))))))
|
[ predicted structure ] |
((((((....((.....(((((((.cccccc(aaaaaa....))))))).)AAAAAA....bbb(CCCCCC..[[[[[[.[[[[[[[[.[[[[[[[[[)).(((((({{{{{{{.{{{{{{{{{{{{{{{..{{{{{{))))))..((((]]]]]]]]]((...)BBB<<<.))(((((((..(((}}}}}}.>>>}}}}}}})))}}}}}}}}.dddd...))))))).}}}}}}}]]]]]]]]]]]]]]..DDDD))))))))))
|
SRP_00338
|
[ FASTA input ]
|
AGCCCCCGGUCCAGCGCGGCGGGCCAGGCGUGAACCGGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCCUAAGCGCCUCGGUCCGGGCGCCGCUGGGAAGCCGGGGGCGCUU |
[ reference structure ]
|
.(((((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))...)))))).))))))..)).)))))))...))))))))....
|
[ predicted structure ] |
.(((((((((((((((.(((<<<(.{{{{{(...aaa.)))..(((((((...[[[[.)AAA...)}}}}}>>>)))))))..))))))...)))))))))]]]]
|
SRP_00342
|
[ FASTA input ]
|
CCGGGGCCGCCCACGAAAUAUCCCCCAAACCCCGCUAGGUCCGGAAGGAAGCAACGGUAGGGGGACGCUUCGGUGCGCGAUCCGCCCCGG |
[ reference structure ]
|
(.((((.((.(..((((.(.((((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))).).))))..)..)).))...)).).
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((...[[..(({{{{{{..(((.<<<..)))(((....aaaaa..)))))}}}}}}.AAAAA)))).>>>.]].)))))))
|
SRP_00354
|
[ FASTA input ]
|
GCCGGAGCGACUGCUCUGUUACCCUUUCGGGGGCCGGGUCCGCUUAGCGGGGACUUCUUGGACAAGCGAGGGUUCUGACGCGUUGACUUGGUGUUCUGCUUGGUUGCGUGUCGGCUGCGGCGACGUCCCUGCAGAGGGACGUGGCCGGGCCGUUGAUGCGGAGGGAACGGGUCAGGCCGGCGACGGAGCAUCCCACCUUGCGCACGUUCCCGUUGCAGAAGCACACCGAGGAGCAUCUCAGGGCUUGAGCCCCAAGUGUCGUCGCGAGGCGGUCCUUUU |
[ reference structure ]
|
((((((((....)))))....(((....)))))).(((.((((((.((((.(..(..((.(....((..(((((((((.((.((..(((((((((((((..((..(((((((((((..(((.((((((((....)))))))).))).))))).....(((.(((....(((.....(((....))).....))).))))))))))))..))...)))))...))))))))))))...)))))))))..))..).)).).).)))).)))))).)))...
|
[ predicted structure ] |
(((((((c(..((((((((gg((((e((ffffffff..ffff(.[[[[[[[[[j((dddd(..kkkk))J))E.{{{{.{{{(.hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh.)))))ggggggggggggg(aaa.aaaa.HHHHHHHHHHHH))))GK.GKKKDGGGG..ii(iiiiii(<<<))))))C)).)II.AAAAGHHH..GDDD)]]]]].HHH.]]HHHHHHH}G]AAA}}}}}}GIIIIII>>>G]FFFGGGG))))))...FFFFFFFFF)
|
SRP_00355
|
[ FASTA input ]
|
GCCGGAGCUCUCUGCUCUGUCACCUUCGGGGGCCGGCGCCUGUGAGCGGGGAAAGCCUGGACCAGCGGGGGUACUGCUGCGUUGACUUGGUGUUCUGCUUGGCGGUGCGUCCGUUCCGGCGGCGUCACUGUAGAGCGACGCUGGCGAGCGGUUAAUGCGUGGGAAACGGGUCAGGCCGGCAACGGAGCAGCCCACCUCGCGCGCGCCGCCGUUGCAGAAGCACACCGAGGAGCAUCCCAGUGCUCUGCGCCCCAGGCGUCGUCGCGAGCCGGCGCUCAAACUCGAUUUUU |
[ reference structure ]
|
((((((((.....)))))....(((..)))))).((((((.((..((((.(...((((((.......(((((((((.(((.((..(((((((((((((..((((((((((((((((.(.(((((((.((....)).))))))).))))))).....(((.(((....((((....(((....)))....)))).))))))))))))))))...)))))...)))))))))))))...))))))))).....))))))..).))))..)).))))))..............
|
[ predicted structure ] |
((((((((cc.cccccccc(.((((((([[[[(dddddddd(kkkkkkkk(fffffffff.....))))))).aaaaaaaaaaaa((.iiiiiiii)]]aaaaaaaaaaa]])))))))).(((bb..((((((h((.eeeeee(ggg.))AAAAAAAA((((....<<<FFFFFF<<<..)CCCCCCCC)))))FFFKKAAAAAAAAAAA((AAAAjj.....>>>.IIIIIIII....)H)))))))>>>)KKKDDDDD.)))BB)JJ)GGG.KKK)EEEECCDDDEE
|
SRP_00358
|
[ FASTA input ]
|
UGGGGCUCUGGUCCUCUCGCAACAAUAGCUCGUGAACUCGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCGCAGCGUGUGACUUGUGUGCCGGGAUGUGGCUGGGGUCCCACCCUUUAAA |
[ reference structure ]
|
(((((((((((((.((((((.((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))...)))))...)))))...))))))))))))).........
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((((...((((.......aaa.)))).((((((((((((..<<<<<.AAA.((.{{([[[[)))))))))}}))))))]]]]))))))))))))).>>>>>...
|
SRP_00383
|
[ FASTA input ]
|
GUCGGGCGGACGGUGCUGUCGCCAACCCGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCGUAACGAAUUUUUAUCGGGUCGUUCCGGC |
[ reference structure ]
|
(((((((((.(((((...(((......((((....(((....)))....))))...))).....)))))..)))))).)))
|
[ predicted structure ] |
.(((((((({{{{{{{{.))))).[[[[[[[.[[[(<<<<<<.<<}}}.}}}}}..))))]]]>>]]]]]]]..>>>>>>.
|
TMR_00036
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGUUUUGGAUUUGCCAAGGUCAACGAAAUUUAUAUAGCAUAUCUUGGUUAUGCAAGUAAAAACAUCGAGGUUAUAAUAACCGGAAAUAAAAAACAAACUGCAACAAAUACAAAAGAUUUUACUGGACAAACUCCAGUUUAUCAAAUGAAUUUUGUAAACAGUUUUUCUUCACAAUUAGCUUUUGCUUAAAUAAAUAAGCAGAACCCGCACUUAAAUUAACUUACGAUUUAAGGAAGGAAAUAAGGUAAGUUUUGCUAUUUGAGUUUGUCUUUGCUCUUUUAAGCAAAUAUCAAAAAGACUAGUAAUUUAUGGAUUUUGUUUGUUUUUUCAUAAAUUGCAAAACCACAAAAUAAACUAAAUAUGUAGAAUAUAUAAAUUAAAGUGAUUUUGCACAUGGGUUCGACUCCCAUCAUCUCCACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((....((((((((((.(((((((((.{.{{{))))......}}}.}................................................................................................................(((((((((......))))))))).((...((((((((.aaaaaa))))))))...)).......AAAAAA((((((....(.(.<.<<<<<<..).)....))))))......>>>>>>.>(((((.(..(((....[[[[[[[[[)))...))))))........]]]]]]]]]...))))).....))))))))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((((lll(((((((((..kkkkkkkkkk(nnnnnn.))))))))((((((jjjjjj(...eee((((((cc.)))))ddd..d(.<<<<<<<<<))))....aaa...aaaa)>>>>>>((((((((((.mmmmmmm...)KKKKKKKKKK....hhh((((((((..[[[(.ggggggggggggg)).ii.iii(bbbbbbb..(((((((({{{{{{{))))))))))))))))I>..}}}}}}}.NNNNNNI>I))))))))).))))ffGGGGGGGGGGCC))))))FFHHH.((((((((((((AAAA>DDDDEEEJ))))))))))))...........MMMMMMM)IIL.((((((((.AAA.)]]]..GGG.))))))))..BBBBBBBJJ.JJJ.LL)))))))....
|
TMR_00123
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAUUCUGGAUUCGACGGGAUUCGCGAAACCCAAGGUGCAUGCCGAGGUGCGGUAGGCCUCGUUAAUAAACCGCAAAAAAAUAGUCGCAAACGACGAAAACUACGCUUUAGCAGCUUAAUAACCUGCUCAGAGCCCUCUCUCCCUAGCUUCCGCUCUUAAGACGGGGAUCAAAGAGAGGUCAAACCCAAAAGAGAUCGCGUGGAUGCCCUGCCUGGGGUUGAAGCGUUAAAACUAAUCAGGCUAGUCUGGUAGUGGCGUGUCCGUCCGCAGGUGCCAGGCGAAUGUAAAGACUGACUAAGCAUGUAGUACCGAGGAUGUAGGAAUUUCGGACGCGGGUUCAACUCCCGCCAGCUCCACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((.............((((((((.....(.((..(((((((((((((({{{{{{...))))).......}}}}}}.............................(((((.((((.........))))..)))))(((((((((((..(((...<<<<<)))..)))).....)))))))..........>>>>>....(((....((((.aaaaa))))....)))...........AAAAA..((((((((.(.(((.[[[.[[[))).).)))))))).........]]].]]]...)))))...))))..)).)....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((bbbbbb.((ccccc((ii(f(..((...))<<<<<<<.<h((((((lg.((nnnnnnn)G((.)L))))......[[[[[[......[[[....((dddddddddd))[[(mmm.mmmmm(ee(((((aaaaa(()Naaaaaaa..)))))ee.NNNNNN).))..))AAAAAH)....(((...)EE.))>F)))).cccII(((((((.DDDDDDDDDDMM....)M...AAAAAAA..jjjj(.kkkkkkkkkkkkkk)MMMMM.)))))))..]]]...EE.]]]]]].>>>>>>>.)JJJJ.))))CCCKKK]]).KKKKKKKKBBBBBB..CCCCC.))))))).KKK
|
TMR_00180
|
[ FASTA input ]
|
GGGGACGUUACGGAUUCGACAGGCACAGUCGAGCUUGAAUUGCGUUUCGUAGGUUACGUCUACGUAAAAACGUUACAGUUAAAUAUAACUGCUAAAAACGAAAACAACUCUUACGCUUUAGCUGCCUAAAAACAGUUAGCGUAGAUCCUCUCGGCAUCGCCCAUGUGCUCGAGUAAGGGUCCUAACUUUAGUGGGAUACGUUUCAACUUUCCGUCUGUAAGUUGAAAAAGAGAACAUCAGACUAGCGAUACAGAAUGCCUGUCACUCGGCAAGCUGUAAAGUGAAUCCUUAAAUGAGUUGACUAUGAACGUAGAUUUUUAAGUGGCGAUGUGUUUGGACGCGGGUUCGACUCCCGCCGUCUCCAUUG |
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.....(((((((...(((((((((({{.{{{{))))).....}}}}.}}.......................................(.(((((((........))))))).)..((((((((((((((..aaaaa)))).))))..)))))).........AAAAA.....(((((((((...[[[[[.)))))))))..........]]]]]..((..(...(..((((.<<<<<<<))))...)..)..))............>>>.>>>>...)))))......))))))).....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((((((((aaaaaaa(.ccccccccccc))gggggggggg(((((ee.eeeeeee(.....mmmmmmmmm(.<<<.<<<<((.iiii...)AA.pp({{{{{{{(hhhhh(bbb)))))....))>>>>)EEEEEEE..dd((.kkkkkkk(jj)}}kkkk(.)}}}}}PP..)BB.IIIIfffff.EE))(((((((((AAAAAnnnn)))))))))..))DD.g(qqqqqq.BHHgg(NNNN..))))))))..((HHH.)>>>MMMMlll)GG)Gooooo(GKKKKGGLLLooGGGGGGG)MMM)OOOOO.)KKKKKKKQQQQQQ.MMCCCCCCCCCCCFFFFF)))))))OOJJ
|
TMR_00240
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGUGUACAGGUUUCGACGGGGAUAGGAAACUAAAGGUUGCAUGCCGAGGUCCGGGCUGGCCUCGUUAAAAAGCCCGGGGCGAAUUACACGCCGAUAAUUACGACUACGCCGUAGCAGCUUAAUACCCUGCUACCGAUCCGCCGAGCCUCUCCCACGGGUGAAGAUGGAUCGUUAUUUCAGUGGGAUAGUCAAGGGGAGUGCCCGCGGCCCCAAGGCGAAACUUUAGCAGGAUCGCUUCCCGGAAAUCCCUGCCAGGGGAGAGUCGGGCGGCUAAAUCAAAUCCUGGCAUAAGCAUGUAGACGCCUUCUGUGUAUGAUCUUCGGACGCGGGUUCGACUCCCGCCACCUCCACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((.(...((...((((..(((((((((({{{{{{{...))))).......}}}}}}}..............................(.(((((((.........))))))).)..(((.(.............<<<<<<.).)))....>>>>>>........(..(...((...a..aa.aa..))....)..)........AA.AA..A..((.((.((..(((.[[[[.[[)))...)).)).))..........]]..]]]]...))))).....))))...))...).)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((((.((((((.(((((((.gggg...g(...cccccccccc.ccc.ccccccc([[)))))))....)CCCCCCCeee.((bbbbbb..bb(..hhh.hhhh(.{{{{{.{{)GGGGG))..ddddddd.ddddddd..)))))).((((((ii(kkkkk(DDDDDDDjjjjjjj.)))))))}}}}..(((((((aaaaaaa}}]].aaaaaa...CCCDDDDDDD)}H))))))).JJJJJ)JJfffffff(..<<<<<<<HHHHH))..(((..)FFFFFFFHBBCCCCCCCC.AAAAAA.BBBBBB))))KKKKKIIAAAAAAA>>>>>>>.EEE))))))).CC.
|
TMR_00352
|
[ FASTA input ]
|
GGGCCUGACAAGGUUUCGACUGGUCGAUGGACAACUGAACAGCGGGCGAGUGUUGGCCGCACUUCUACUCUGAGUGAACGCGGCAACUGAUAAACGCAACCGACACGGAUGCAACGGUGACCGACGCCGAGAUCGAGGCCUUCUUUGCUGAAGAGGCUGCCGCUCUCGUCUGAAGGAACCAGCCUGGCUCAGCGUGCUGCUGUGCAGCGGCCAGGCUUCAUCUCUAACAGCAGCGAACGGACAUGAGGGAGCGCAAACCCUCGUCCCAAACAUCAUGAAUGCGUCGCACGGGCUCCAGCGUCAGGGGCCAGAGGUGGGAAACGGUGUGAAACUCCUGUCCUGGGGAUCACCGACCGAUACGCCAAACCAGGACUACGCCCGUAGAACGCAGUGAGAAAGACACCAGGACAGGGGUUCGAGUCCCCUCAGGUCCACGU |
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((...(.......((..(..((((((((((...[[[[[.....))))).........]]]]]....................................................(...(..(.((((((..((((((...((.(((..))).))...))))))...)))))).)..)...)....................................................................................................................(.((((((((...(((.{{{{{{{)))))))..)))).)........}}}}}}}...)))))..)..)).........)...)))))...(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
((((((((.((((((((((.(((((((d((...aaaa....aaaaaaa.aa)D))))))(((((kk.kkkk)))))...eeeee(..cccc...cc(..ii..i(llllll(..{{{{{{.{{{{{{{{{{{))))))))))((((((((.KKKK(()EEEEE}}}}}bbb(..gg....ggggggggg)))))(((((((((AA.))GGGGGGGGGffffffff.)))))))))..)BBB.(((((((.)II....))))))))A.....ICCC)C...}}}}}}.mmm((((((.)LLLL.))))))FFFFFFFF.....((((((.hhhhhhhhhhhhh(CC.}}}}}}..jj.))))))...GG.[[[[[.AAAAAAA....LLAAA))))..KK...)JJHHHHHHHHHHHHH]]]]]..)))))))).MMM
|
TMR_00353
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGUCAUGGAUUUGACAGGAUAUCUUUAGUACAUAUAAGCAGUAGUGUUGUAGACUAUAAAUACUACUAGGUUUAAAAAAACGCAAAUAAAAACGAAGAAACUUUUGAAAUGCCAGCAUUUAUGAUGAAUAAUGCAUCAGCUGGAGCAAACUUUAUGUUUGCUUAAUAACUACUAGUUUAGUUAUAGUAUUUCACGAAUUAUAGAUAUUUUAAGCUUUAUUUAUAACCGUAUUACCCAAGCUUAAUAGAAUAUAUGAUUGCAAUAAAUAUAUUUGAAAUCUAAUUGCAAAUGAUAUUUAACCUUUAGUUAAUUUUAGUUAAAUAUUUUAAUUAGAAAAUUAACUAAACUGUAGAAAGUAUGUAUUAAUAUAUCUUGGACGCGAGUUCGAUUCUCGCCAUCUCCACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.(.((((((((((..((((((((((..{{{{{{....)))))....}}}}}}........................................................................(((((....(((........)))....))))).(((((((.............((((.....[[[[[[[)))))))))))...........]]]]]]](.((((((((..aaaaaaa..)))))))).)......AAAAAAA(.(....(((((.....<<<<<<<<<.))).))..).).......>>>>>>>>>...))))).....))))))))))).))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((((((.[[.[[[[[[[[..[[[[[[[[[[[..(((((((((((.aaaaa(.gg))))))))).)GGAAA.......))..[[[[(...((((...))))dddddddddddd))))))))(((.eeeeee.)))DDDD(((((((()DDDD))))))))(((...((.ffffffffff(AADDDD]]]]hhhh(((((((((iiiiiiiiii)))))))))..EEEEEE...IIIIIIII))((((((((..<<<<<<<..))))))))((((bbbb>>>>>>>bbbbbbbbbbb(.{{{{{{{{{)))).)BBBBBBBBB}}}}}}}}}..BB)FFFFFFFFFFBBBB..]]]]]]]]]]].]]]]]]]]II.cccccHHHH)))CCCCC)))))))..]]
|
TMR_00357
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGUCAAGGCUUCGACAUGAUUGAUAAACUUAUUAGUUCAGUAGGGUCUGCCCUUUAUAGCUCAAGGUAAUAAUAACCGACAAAACUUCUAAAGAACUAGCUGACGAAAACUUUGUUUUAAAUCAGUUAGCAUCAAACAACUACGCUUUAAACUUCUAAAUAAAUAAUAAAUAGCGUACUAGGUUUUUUAAAAACCUAGAUUUAUAGGAUAAAACUAGAUUUUGUAACUCGUUUUUAGUUUUACUAUUAAUACUGAUUAAUUAGUUUUUUGACCCAACGAUUACUACGAACCAAGAUGUUGAUACUUAUCACUUGGUUUGAGCUUCAUAAGUAUCUAAACUGUAAAUAAAACUAAUUUGCUGAGUCGAUUGUGGAAACGGGUUCGAUUCCCGUCAUCUCCACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((((..(.(..((((((.(((((((([..[.)))).....]..]..................................................................................(.(....((..............))....).)(((((((((...)))))))))(.(((.(((.aaaaaa....)))..))).)........AAAAAA.((..((.....{.{{{{{...))..)).......}}}}}.}.(((((..((.((..<<<<<<<<.)).)).))))).......>>>>>>>>...))))........))))))..).)...)))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((((.jjjj(ii((((({{{{{(.....((((((.hhhhhhhhhhhh.((..fffff.)).hhhhhh..))))))...((((((.((((..))))((((((((.eee.HHHHHH.eeeee.)))))))).kkkb...d(.((((((EEEEE..mmm(.FFFFFggggg...))))))(((((((((lll)))))))))cccccccc))dddd(()GGG))))))<<<<<<<<<<<<DDDDB).GGMMM.((.)CCCLLLnnnnnn(()CHHH...nnn.nnn.))aaaaaaaa()))))iiiiiiiii..AAAAAAAA))JJJJ.IIIIIIIIINNN.CCCCDKKK))NNNNNNHHHHHHHHH)}}}}}.>>>>>>>>>>>>.IIEEE.NNN)))))))....
|
TMR_00361
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGUGUUUUGGUUUUGACAAUUAAAAAAAAUUUCUAAGAUGCAGUGGUUUGGUAGACCAUAAUACCGAAAUAAUCAAAACGCAAAAAAUUCAAAAAAAUCUCCAAACGAAGCAAAAAUUGAUUACCCAUUUUUAUCAUAUAACCAAUUAAAUUUUGCAUACGUUUAAUCAAUUUAUUAUAAUAUAUCCUUAAAAAUUUAAAUUUUAUCAUGUAUACGGGCCUCCCAUUUCUGUAACUUGAAAAAUAUUUAAAUUUAGAUAAUCAAACUUAUCAAACUUAUAAGAUUAUCCUCCUUUCAAUUUAUUAUAAUAUAUCCUUAAAAAUUUAAAUUUUAUCAUGUAUACGGGCCUCCCAUUUCUGUAACUUGAAAACUGUCGACUCUAUUAAUUUUUUUUAUUUGGAUCGGGGUUCGAUUCCCCGCACCUCCACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((............(((.((((((.((((..((.(.((((((.(.(({{{.)).)..............}}}............................................................................................(.(((((.(..............).))))).).(((((................((...(<<...<<)...))))))).............>>...>>(.......(...[...[[....).......).......]]...]........(....((......a...a.aaa.))....)...........AAA.A...A...)))))..).).))..)))).)))))).)))...(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
((((((((.((((((((((.gg(hhhhhhhhhhh..hhhhhhhhh(.kkkkkkkkk(...eee.eee.eeeee..)))))))(((.{{{.{{{{{b(((((.....ppp(..ooo.oooooooooo...))))))((..mmmm..)B).aaa((()HHHHH.)OOOOOOOOOOOOOiiiiiiiina(..HHHHlllllllllllld()).l(jjjjj([[[[[[...)HH..)))...((((<(.ffffff.))N)AA(((((((.FF.)KKKKKKKKKMMMM.))))))A.((.)>))))(()IIIIIIIIFFFF...)A)DLLLLLLLLLLLL...)J)JJJJL]]]]]]...EEEEE.EEE..}}}}})).PPP.))...EEE.HHHHHHHHHGG}}}(((((((ccc)))))))...))))))))CCC.
|
TMR_00374
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGUCACGGUUUCGACAUGAAUGGUUGAUCUUCAAAUGCAGCAGGGUAAGCCCUUUACAGCUGUCGAGGCUAAUAAAUGCUAAGAACAAUAAAAACGAAGCUGUUGAAGUAGAAUUAAACGACUUUGAAAUCAACGCUUUAAGCCAAAACGCUAAUUUAGCUUUAUACGCUUAAUUACAUUUGGUAAUAAGUUCAUAUCUUUUUCUAGGUAGGUAUGAAUGUUUAAUAACUAGAUAGCUAAUUUAAUUCCUAUAACAAUUAGUGAAGUUCGUUAGGAUUACUUUUAUUUAUGGGUUGUUCUUUGCCUCUAUUUAAAAGGACAUAUUAAAGUUAGAACUAAGCUGUAGAUUUUGUCGCAUUGCUAUUUGUGGAAACGGGUUCGACUCCCGUCAUCUCCACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((((..(..(..((((.(((((.((.(.....[[[...).))....]]]....................................................................................((((.(((.......))).))))(((((((..........(.(((.....{{{{{))).)..))))))).......}}}}}..(((((((....<<<<<....))))))).........>>>>>...((((((..((.((((.aaaaaaa)))).))..))))))..........AA..AAAAA...)))))....))))..)..)..)))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
((((((((((.nnnnnnnnnn)))((iiiiii((((((af((.((((((((..))))jjjjjjjjNNNNNNNNNNjjjjjj))))lllllllll.l(.oooooooooo(.pppppppppppppp)).)A))))F)(((.(((<((.((((((.eeeee(kkkkkkkkkkkk.kkkk(gggg..))))))[[[[.(((((((((m((ccc)GGGGM)))))))))PPPPPPP[[.[[)PPPPPP..)PKKKKbbbb({{{)O.)EEEEE>)))OOOO)}}}BBBB..JJJJJJKKhhhOOOOOLLLL.hh.LLLLLL)))..CCC..]].KKKKKKKKKK..)).JJJJJJJJ]])))(((((ddHH]]]])))))DD(((((.IIIIII)))))))))))).HHH
|
TMR_00384
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGACCUUGGUUUCGACGGGGGUUGCGAAGCAGAUGCGGGCAUACCGGGGUCUCAGAUUCCCGUAAAACACUGAAUUCAAAUAGUCGCAAACGACGAAACUUACGCUUUAGCCGCUUAAGGCUAGCCGUUGCAGCAGUCGGUCAAUGGGCUGUGUGGUGAAAGCCACCGCAACGUCAUCUUACAUUGACUGGUUUCCAGCCGGGUUACUUGGCAGGAAAUAAGACUUAAGGUAACUGGUUUCCAAAAGGCCUGUUGGUCGGCAUGAUGGAAAUAAGAUUUUCAAAUAGACACAACUAAGUAUGUAGAACGCUUUGUAGAGGACUUUCGGACGGGGGUUCGAUUCCCCCCGCCUCCACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((.............((((((((.....(((((.(((..((((((((((..<<<<..))))).......>>>>.................................((((((......)))))).((((((.((((((.[[[[[[[))))))(((((....))))).))))))........]]]]]]]..((((((.(((.{{{{{{{{))).))))))........}}}}}}}}.(((((..(...(((.aaaaaaa)))....).)))))...(((....))).AAA.AAAA...))))).....))))))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((.(((((((((.bb(.aaaaaaaaaaaaaa(.iiiiii{((gg)})))))))...(((((((((.(l.((ccccc)L.(((([[)GG)I..(((((...kkk..kkk((((((ddddd.)))))).)))))..)I.(((((((((((((((.(((((((..KKK)))))))..(((j((ffffff)J)))Cnnnnnnn(((.mmmmmmmm))).((((((KKK.hhh.MMMMMMMM.))))))....))))))))))))))).<<<NNNNNNNHHH))))>>>.II.)F......DDDDDFFFFF)...)AAAAAAAA.ee.]]CCCC)))))))))))AA.IIAAAABB))))).EE.
|
TMR_00395
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGAUCCGGUUUCGACGUGGGUUGCAAAGCAGCGCAGGGCAUACCGAGGUUCAGUACCCUCGUAAAACAGCUGAAAAAAAAUAGUCGCAAACGACGAAAACUACGCUUUAGCCGCUUAAUCCGGCUAAACUCCACACCGGUGGGCCUCAACGCCGGGUCUGGCAACAGACAGUGGAGUCAUUAACGAGGAUCGCGUUUUGCAGGGUUACUUUGCAGAGCGCUAAAAAAUAGGUAACUCGCCUGUCAUCAGCCUGCCGGUUGGCGGAUGCCAGGUCAAAUUAAAUAACAUGGCUAAGUAUGUAGAACUGUCUGUAGAGGACUUGCGGACGCGGGUUCAAUUCCCGCCGCCUCCACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.....((((..(((..(((((((((([[[[[[..))))).......]]]]]]...............................((((((((.......))))))))((((((.((((((..<<<<..))))))(((((....))))).))))))........>>>>...((((((((((aaaaaaaaa))))))))))........AAAAAAAAA(((((......(((.{{{{{{{)))......)))))...(((.)))}}}.}}}}...))))).....))).))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((.((((((((((((..kkkkkkkk(...{{{{.{d.(([[[[[[)D)).((((((..ffffff......))))))......a(((((....))))iii..iii.))((((((((.lllll.))))))))a()}..aaaaaaaaa(.bb...))))))))(((((ggggggggg)A<<<<(()AFFFFFF.cc(((((((((((((eee)))))))))))))EEE....AAA)}}}}KKKKKKKK..j(.)AAAAAIIIIjjjjjj.)))))hhh...LLLLL.....))>>>>..]]]]]].)JGGGGGGGGG.BB(((((((((JJ)))))))))..IIAJJJJCC)))))HHH.
|
TMR_00398
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGACUUGGCUUCGACGUGGGUUGCAAAACAGAGCAGGGCAUACCGAGGACCAGUUACCUCGUAAAUACAUCUGGAAACCAAUAGUCGCAAACGACGAAAACUACGCUCUAGCCGCUUAAAUCCGGCUGGACUCCGCACCGGUGGGCCUCAACGCCGGGUCUGGCAACAGACAGCGGAGCCAUUAACGAGGAUCGCGCCCGGUAGGGUUACUUUACAGGGCGUUAAACAAUAGGUGACUCGCCUGCCAUCAGUCCGCCGGUUGACGGAUGCCAGGUUAAAUUAAAAAACAUGGCUAAGUAUGUAGAACUGCCUGUAGAGGGCUUGCGGACGCGGGUUCAAUUCCCGCCGCCUCCACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.....((((..(((..((((((((((.[[[[.[.))))).......].]]]]................................((((((((........))))))))((((((.((((((..{{{{..))))))(((((....))))).))))))........}}}}...((((((.(((aaaaaaaaa))).))))))........AAAAAAAAA(((((......(((.<<<<<<<)))......)))))....((.)).>>>.>>>>...))))).....))).))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((.((((((((((..[[[[[((((....hhh.hhhh(jjjjjj.jj.jjj(dddddddd.)))).....((((........eeeeee....ee(bb....b(kkk(((((((((ff(...{{)))))))).gggg.ggggggggg(.iii..iiiiii(cccccc.))))...))))))))((((()}}..)CC.)CCCCII)I)DDD.[[[[[[[[[)III<<(..aaaDDDDDJJJII)JJJJ..JJ.)IGGGGGGGGGGGGGKKKBBBEE))))).)>>.......EEEEEE.JJHHHH))..HHH]]]]]]]]]((((((((FF))))))))..AAA]]]]])))))))....
|
TMR_00399
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGACCUGGCUUCGACGCGGGUAGCAAAACCUAAGGGGCAUGCCGAGGUGCAGUGACCUCGUUAAUCACGCUGCAACAUUAUAGUUGCCAACGACGACAACUACGCACUCGCUGCUUAAAACCCAGUAGGGUGCCGUCUGACUGAAGCCGUGCUUGUGCGUUCAGAUUUCAGGCGUCGAUUCUCACAAGAUCGCGGUGAAGUUCUCCCAGGGCAGACCCGCUAAAACUUUACUGGGAUCGCCGUAUGUUUUCCUUGCCCGUCGGGUAGCAUGCGGUUAAAUUAAUGACUGGGCUAUGCAUGUAGAACCGAAGGCGGAGUACUUGUGGACGCGGGUUCGAUUCCCGCCGCCUCCACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((......(((..((..(((((((((([[[[[[[.))))).......]]]]]]]................................((.((((.........)))).))....(((((((.....(.((..aaaaaa)).)......)))))))........AAAAAA.(.((((....(((({{{{{))))....)))).).........}}}}}..(((((....(.(((..<<<<<<<)))..)...))))).........>>>.>>>>...))))).....))..))).....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((...((((((((..{{{{{{{(....<<<<..<<(aaaaaa(((((.ccccccc)))))((dddd.ddddd(..[[[[[.[[(hhhh))dd(.ff..)]]ddddd(CCCCCCCiii...iiiiiiiiiii..iiiiiii.))))))))((((.)DDDDD...(((.IIIIIII)DD.jj(bbbbbbb))))DDDDD..((((((((((HHHHggggggggg..IIIIIIIIIII.FF((((((((((.)>>)}}}}}}}.>>>>))))))))))III..]]]]].))))).GG.AAAAAA))))).)JJ.eeee))))BBBBBBB..GGGGGGG.DDDD.EEEE)))))))....
|
TMR_00430
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGACCGGCUUUGACAGCGUGAUGAAGCGGUAUGUAAGCAUGUAGUGCGUGGGUGGCUUGCACUAUAAUCUCAGACAUCAAAAGUUUAAUUGGCGAAAAUAACUACGCUCUCGCUGCGUAAUCGAAGAAUAGUAGAUUAGACGCUUCAUCGCCGCCAAAGUGGCAGCGACGAGACAUCGCCCGAGCAGCUUUUUCCCGAAGUAGCUCGAUGGUGCGGUGCUGACAAAUCGGGAACCGCUACAGGAUGCUUCCUGCCUGUGGUCAGAUCGAACGGAAGAUAAGGAUCGUGCAUUGGGUCGUUUCAGCCUCCGCUCGCUCACGAAAAUUCCAACUGAAACUAAACAUGUAGAAAGCAUAUUGAUUCCAUGUUUGGACGAGGGUUCAAUUCCCUCCAGCUCCACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((...........(((......(((.((((((((...((((((((((...aaaa.aa.)))))........AA.AAAA.............................(.(((((((.....(((.(((..((.......))..))).)))...........))))))).)...((((((.(((((.(((..<<<<<<<))).))))).....))))))........>>>>>>>..((((((((...{{{{{..))))))))..........}}}}}.(...((.((.((...(((..[[[[[[[)))..)).)).))...).........]]]]]]]...)))))......)))))))).))).....)))...(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
((((((((.(((((((((.(((llllllllll(nnnnnnnnnnnn(((((.[[[[[[[[[.[[[[[[[[[..[[[(.dddddd...ddddd(.aaaaa(....cc)))))))).nnnnnn({{{.))))))<<<..)DDDDD.(()LLLLLLLLLL)AAAAA.mmm)NNNNNN.)]]]..))jjjjjj.((((fffffffffg.((kkkk..]]]]]]]]].)G)).....)KKKK)F..((((((((NNNNNN.hhh))))))))HHH.)))...eee(DDD..iiiiii}}}.JJJJJJ.DDD)))))))).)F]]]]]]]]]....)EEE...((((.(((((((((CCFFF.NNNNNNIIIIII)))))))))..bbbbb))))>>>BBBBB.FFFF.MMM..
|
TMR_00431
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGCAAGGUUUCUACAUUGUGAAAAAACAAAUAUAUGAAAGUAAAACGAGCUCAUUAUUAGAGCUUUUAGUUAAAUAAAUGCAGAAAAUAAUAUUAUUGCUUUUUCUCGAAAAUUAGCUGUUGCAUAAAUAGUCUCAAUUUUUGUAAUUCGAAGUGAUAGACUCUUAUACACUACGAAUAUUCUGUUAGAGUUGCUCUUAAUAAAAGAAAAGUAAAAAAAUACAAAUUCUUAUGUUUUUUACCUGAAUUGAUUCAAUUUAAGGUUAGUAUUUUUUGAUUUUUACAAUGGACGUGGGUUCAAGUCCCACCAGCUCCAUCA |
[ reference structure ]
|
(((((((.........(.(((((((((((...((((((........((((((((((..[.[[[[.))))).]]]].]................................................................................................................................................................)))))..((((((((((...)))))).))))..)))))).....))))))))))).).(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((..((((((((.<<<<<<<<<<<.((...fff(ddd(.hh.(((.kkkkkkkkkkkkkkkkk)))(((((((.cccccccccc(..{{{{.{{{{{{{{{e(([[.[[[[[)E)))))aaaaaaaa.aa)).jjjjjjj(((((bbb.)]]]]]]])}ggggg)AAA...))))).AA)}}}}}.GGGGG.KKKKK.BBB.)})))).KKKKllllllll(..iiiiAAAAAH}}}}}))))JJJJJJJ)HDD}CCCCCCCCCC)LLLLLLLLII>>>>>>>>>>>(((KKKKKKKKDF)))..FF)))))))II..
|
TMR_00443
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAUUCUGGAUUCGACGGGAUUUGCGAAACCCAAGGUGCAUGCCGAGGGGCGGUUGGCCUCGUAAAAAGCCGCAAAAAGAUAGUCGCAAACGACAAUCAAUAUAAAGCACUAGCAGCUUAAUAACCUGCCUAGAGCCUUCUCUCCCUAGCUUCCGCUCUUAAGACGGGGAUAAAGAGGAGUCAAACCCAAAAGAGAUCGCGUGGAUGCCUAGCUUGGGGUUGAAGCGUUAAAUUUAAUCAAGCUAGCUUAUUUGUGGCGUGUCUGUCCGCAGCAAGUAAGUGAAUUUAAAGACUAGACUAAGCAUGUAGUGCCGCGGAUGUAGAAAUUUCGGACGCGGGUUCAACUCCCGCCAGCUCCACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((.............((((((((.....(.((..((((((((((((((.aaaaaa..))))).....AAAAAA.................................((.(((((((.........)))).))).))(((((((((((..(((...[[[[[)))..))))....)))))))..........]]]]]....(((....((((<<<<<<))))....)))...........>>>>>>.((((((((((.(((.{{{{{{{))).)))))))))).........}}}.}}}}...)))))...))))..)).)....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((((ffffff.(((.ggggg(((((((...(((h(({{{{{{{..{{{{{{{{)H))ddddd(.....ee.e(....bbbbb.))))))))))...(((((.((..ii.((((.kkk(....aaaaaaa)))).)Eiiiiii(..<<)AAA.}}}}}}}}...)EEDDD.)).)IIIIII((....)}...>>.)).cc(jjjjjjIIjjjjjjjjj.))))).)CC(((((((((.JJJJJJJJJ(([[[[[[[[[[[BBBBBJJJJJJ.DD.[[[.)))))))))))..]]]...(((.}}}}}}).]]]]]]]]]]])))..))FFFFFF.AAAAKKK....GGGGG.)))))))....
|
TMR_00457
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCCGUUUAGGAUUCGACGCCGGUCGCGAAACUUUAGGUGCAUGCCGAGUUGGUAACAGAACUCGUAAAUCCACUGUUGCAACUUCUUAUAGUUGCCAAUGACGAAAACUACGGCCAGGAAUUCGCUCUCGCUGCGUAAGCAGCCUUAGCCCUGAGCUUCUGGUACCUUCGGGUCCAGCAAUCACCAGGGGAUGUCUGUAAACCCAAAGUGAUUGUCAUAUAGAACAGAAUCGCCGUGCAGUACGUUGUGGACGAAGCGGCUAAAACUUACACAACUCGCCCAAAGCACCCUGCCCUUCGGGUCGCUGAGGGUUAACUUAAUAGAAACGGCUACGCAUGUAGUACCGACAGCGGAGUACUGGCGGACGGGGGUUCAAAUCCCCCCGGCUCCACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((........((..((((((((((((((..[[[[[[[.)))))........]]]]]]]....................................((......(((...(((((....)))))...)))......)).((((.(((....)))))))(((((((..(((..(.<<<<<)..)))...))))))).........>>>>>...(((((...((..aaaaaa.))...))))).........AAAAAA..((((...(...((({{{.{{{)))....)..))))..........}}}..}}}...)))))...))))...))......)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
((((((((((..aaaaaa(iiiiiii.(((((.hhh([[(fffffffffffffffffff.))).<<((...{{.{{{(.kk(...jjjjjjjjFFFFFFFFF.))))....<<<<<(mmm(..)))))((dddddd.ddd((.lllllllll(.gggggggggg((nnnnnnnnnnnnnnnnnnnn(..cccccc.ccccc..)).....)NNNNNNN..JJJJ))CCCCC.oo)))>>>>JJJ..((((NNNNN)HHH.)LLLLL..)LLLL.)>>>FFF......)JK.)MMM.)FF)AAAAAA.NNNNNNNN((eee))..K}}}..)DDD..FFFFF]]bb...OODDDDDDEEEIIIIIII}}GGGGGGGGGG.CCCCCC.)))))))BB..
|
TMR_00469
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCCGACCUGGUUUCGACGUGGGUUGCGAAGCAGUGGAGGGCAUACCGAGGACCCGUCACCUCGUUAAUCAAUGGGAAUGCAAUAACUGCUAACGACGAACGUUACGCACUGGCAGCCUAAGGGCCGCCGUCCUCGCACUGGCUCGCUGACGGGCUAGGGUUCGCAAGAACCAGCGAGGUCAUUUACGUCAGAUAAGCCCCGUCGGUGUCACGACUGCGGGGACGAAAACCAAGUGACUCGCCGUCGUAGAGCGUGUUCGUCCGCGAUGCGGCGGUUAAAUCAAAUGACAGAACUAAGUAUGUAGAACUCUCUGUGGAGGGCUUGCGGACGCGGGUUCGAUUCCCGCCGGCUCCACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((.....((((.((((..((((((((((.[[[[[..))))).......]]]]]..................................((((.(((....))).)))).((((((.((((((..<<<<<<))))))(((((....))))).)))))).......>>>>>>.....((((((.(..aaaaa..).))))))...........AAAAA...((((....(.(((.{{{{{{{)))..)...))))...........}}}.}}}}...))))).....))))))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((...((((((.((((((((((((..((((((.nn(.eeeeeoe(.dddddddddddddddd(..hh(.ffffffff(..gg))))))..)G(((..)))cccc(.bbb))))))))(((((((.aaaaaaaaaa.))))){{{{{{{{{{))mmmmmmm)G..((...)FDDDDDD<<<<<.)))).ll(..kk}}}}}}}}}}kkkkk..AAAAAAAAAA.))))))(()FF)DD(((((((((DD)CCCC))jjjjjjjjj)))))))))DD.)KK>>>>>.BBB..))..OEEEEE.MMMMMMM.KKKKK.iiLLJJJJJJJJJDDDDENN.FFFFFHH.))))))).II.
|
TMR_00502
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGAUUAGGAUUCGACGCCGGUAACAAAACCCGAAGUGCAUGUCGUGAGGGUAGCCAAUCACGUAAAUCCAAAGCUGCAAAUUAUCAGUUGCCAAUGAUGACAACUACGGUGCUCAACUAGCUGCGUAAGUAGCUUUUUGUUACACCAUCUAGCGGUACGCCGCUAGCGGUUUUUAACAAGGUGCCAGUACCGCGUUAACGACUGUCACUUAGAACUGGAUCGCAGUGAAGCCUGCCUGGGGUGGAUCAGCUAAACUUUUACAGGAUCGCGCUUUUCGUCCCGCCCGCUGGGCUGUAAAGCGUUAAAUCAAUAAGCGGUUCUAAGCAUGUAGAGCUGACGGCGGAGUACUGACGGACGGGGGUUCAAAUCCCCCCGCCUCCACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((............((.(((((......((...(((.((((((((((..<<<<<...)))))..........>>>>>..............................(.....(((..((((((....))))))..))).....)....((((((....))))))(((((.......aaa.aa.....)))))............AAAAA.........(.((.(....((((.{{{{))))....).)).)........}}}}...(((((.((..(((.[.[[[[[)))....)))))))..........]]]]].]....)))))....)))...)).....))))).))...(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((.(((((((m.((aaaaaaaaaaa(.d((.cccccc(.hhhhhj((kkkkk(...ll(gggg.)))J)iiiiiii(...eeeeeeeeee...ee()GGGGL..e(bbbbbbbb..bb.bbbbbb))))BBBBBBBMLKKKKK..)BB((((((((..))))))))(((())nnn((..))C.nnnnn)))).))NNNBBBBBB)H.(((((((((((((BEEEEE...CC)HHHHA.((((((.<<<<<<..CCC)D.<<(()AA.<<<<<<({{{{.))))))NNNNN.))>>)>>>>>>)E.))).EEEE.)))))))))).AAAAEE>>>>>>AAAA)EIIIIIII}}}}..(((((((..))))))).)))))))....
|
TMR_00503
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGACACGGCUUCGACGUGUAGUAAGCGUGCAGCAGACUGACCUGCCGAGCAGCCUGAUUCGCUUCGUAAAACCUGUCAGGAACUGUAACUGCGGACGAUUAUUCGUACGCGAUGGCGGCGUAACAGCCCCCAUCUGUCUCGCGUCGCUCCUGGCCCUUGGGGAGCGUGAGACAUCGACAAAAAGGGUGUAGCCGCCGCGUUCUCCGACUGCGGAUGCGCCGGUGAAAUCUAAUCAGUCUCAGCGCCGCCCUGGCCUUGUGAAUGGGCAGACGGGCGACGUGAACCGCCAAUGCAUUCACUAUGCAGGUAGAGGUUUGCCUGUGCGGCUACACGGACCCGGGUUCGACUCCCGGCAUCUCCACAA |
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((...(((((((((((((..(((((((((...[[[[[[....))))........]]]]]]..............................(((((.(((......))).)))))((((((((((..((((..{{{{{{)))).))))))))))........}}}}}}...((((.(((((((...aaaaa.))))))).))))..........AAAAA...(((.((((((.(((..<<<<<<<)))..).))))).)))............>>>>>>>...)))))....)))))).)))))))))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((...(((({{{{...{{{{{(..<<<<<(.iiiiiiiiiiii)))).((((((((aa(.[[[[[[c((.bbbbbb)C))..)))).)}}}}}.))]].((.(()IIIII)]Agggggg((...]]]ee.eeeeee(.dddddddddddddddd..dddddddddddd.))..hhhh.....IIIhhhhhhhhhhDDDDDDDDDDDD..)DDDDDD.DDDDD}}}}.fff..IIII>>>..)DDDDDEE.((((.)Akkk(jjjjjjjjjjEEEE)GGGGGG...))))((>>)))KKK)).BBBBBBFFF.JJJJJJJJJJHHHHHHHHHHEE..(((((.HHHH..))))))))))))....
|
TMR_00519
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGAUUCUGGAUUCGACGGGAUUCGCGAAACUCCGGGAGCAUGCCGAGGGGCGGUUGGCCUCGUAAAAAGCCGCAAAGUUAUAGUUGCAAACGACGAUAACUACGCUCUGGCUGCUUAAUUAGCGCCAGCCAUCUACCACAGGUCUCGCACAUGGGCAGUGGAUUUGAUGGUCACCUUACAUCGUGCUAGCGAGGGAACCUUGUCUGGGGGUGAACCGCGAAACAGUUCCAGGCUCACCGUUAGAAAUCCUGUCUUUCGGAGUUCGAGCGGUUAAAUAAAAGAGAGACUAAGCAUGUAGCGCCUUGAGCGUAGGUUUUUCGGACGCGGGUUCAAGUCCCGCCGCCUCCACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((.............(((((..(......(((.(((.(((((((((((.<<<<<<..))))).....>>>>>>.................................((((((.........).)))))(((((..((((..(.((({{{{{{)))).))))....))))).........}}.}}}}..(((.....((((([[[[[)))))....)))..........]]]]]..(((((....(.(((.aaaaaaa)))..)...))))).........AAAAAAA...)))))...).))).))).....)..)))))...(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
.((((((.(((((((llll(..[[[[[[[[[....)))))))((((((((((((((((.aaa((((((....<<((((((..kkkk..))))..i((((((...ccccccccccccccccc.cc(((((e..((..dd(......jjjjjjj(...{{{{...{{{(gggggggg(...fff.....)))))E))))))hhh(.)))))iiiiiiii....)Jmmmmm.)D)}}}))>>.)FFFGGGGG.CC.))))))))))).)HHHCCCCCCCCC.KKKK.)D)JJJJJJGGG)))))..))))))CCCCCCCCMMMMM)]]]]]]]]]LLLL..)I}}}}.IIIIIIIIAAA
|
TMR_00528
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGAUUCUGGAUUCGACAAGAUUCACGAAACCCUAGGAGCAUGCCGAGGGGCGGUUGGCCUCGUAAAAAGCCGCACAGUUAUAGUUGCAAACGACGAUAACUACGCUCUAGCAGCUUAGGCUAGCUAGCCAUCUUGCUCACGUUUCUCAAAUGGGCAGAGUAUUAAGAUGGUCACCUUUACAUUUGAUAGCGAGGGAACCAUGUUCAGGGGUGAACCGCGAAACAGUACUGAACUCGCCAAUAACAAUCCUGUCUUUCGGAGUGUUGUUGGUUAACCAAUAGAAAGACUAAGCAUGUAGCGCCGAGGAUGUAGGCUUUUUGGACGCGGGUUCAAGUCCCGCCGCCUCCACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((.............(((((..(.....(.(((.((.(((((((((((.{{{{{{..))))).....}}}}}}.................................((((((((....))).)))))((((((.((((..(.(((aaaaaa)))).))))....))))))..........AAAAAA..(((.....(((.([[[[[).)))....)))..........]]]]]..(((((..(...(((.<<<<<<<)))....).))))).........>>>>>>>...)))))...).)).))).)....)..)))))...(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((.(((((((((dd....)))))).)))(((((..(((((((jjjjjjjjjj((((((((..aaaaaaaaaaaa.((((((ggggg(....[[DD))))))..{{{{{.)]]GGG.)))))))ee.(((((((((.GGiiiiii.iiiiii(<<<}}}}}..)))))))))cc(hhhh.)IIIIIIcccc(.ffff..))))))).)))))....)CC.....(((..bbbbbbbbb...CC....bb)JJJJJJJJJJ.)CC((((((((..))))))))HHHH))).EE..AAA.((>>>BBIIIIII.AAAAAAAAA...BBBBBBBBB..FFFF)))))))))....
|
TMR_00541
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGUAACGGAUUCGACGGGAUUGAAUCGUGGUGGGGAGGCGUGCCGGGUUCCGAGCUCCCGUAAAACGAUCGGAAAACAUAACUGCCAACACGCAGUUUGCAUACGCUGCUUAAUUAAUUAAGUAGCCGUUCCAGCCACUGAGCCUGCGCGGUGGUGAGUGAACGUCAUUUUGCAGGAUAGGCCAAGAGCUUCGGUCCGGAGCUGGCGGCUGAGACUCAAUCGGGCUAAGCUGCCACCGCCCUUGCCGGUUCAGGGGUGGCCGCCGACAACCAUGAGCCGGAUACGCACGUAGUUCUCUCCAGUACGGGCUUUUUCGGACGGGGGUUCAACUCCCCCCGCCUCCACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((..(..(((((.(((((((((((((((((...<<<.<.))))......>.>>>.................................(((((((((....)))))))))(((((..(((((((..[[[[[[)))))))....)))))......]]]]]].(.((((...(((((.{{{{{{)))))...)))).)........}}}}}}..((.((((((..(((..aaaaaaa))))))))).))..........AAAAAAA....)))))....)))))))).))))).)..)))))...(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
.(((((((i.((((((((d(({{{)D)))))((hhhhhhh..hhhhhh.hhhh(..gggggggggg....)).hhhhhh...hhhhhhhh..))..HHHHHHccc(ff.ffffffffff))FFFFFFFFFF)I)))).((([[(<<<<<<<.<<<<<<<(((((((.)C)))))))CC)[[[FF)))..((((((((kkkkkk(ee(aaaaaaaa)))HHHH..)KKKKKK..)EE)>>>>>>>..(((bbbbbbb(jjjjjAAAAAAAA.)))...)JJJJJBBHH..HHGGGG)))))).]]])]].>>>>>>>GGGGGGHHHHHHHHHH.BBBBBHHHHHHH}}}....
|
TMR_00547
|
[ FASTA input ]
|
GGGGACGUUCAUGGAUUCGACAGGGGUCCCCCGAGCUCAUUAAGCGUGUCGGAGGGUUGGCUUCGUCAUCAACACACACAGUUUAUAAUAACUGGCAAAUCAAACAAUAAUUUCGCAGUAGCUGCCUAAUCGCACUCUGCAUCGCCUAACAGCAUUUCCUAUGUGCUGUUAACGCGAUUCAACCUUAAUAGGAUAUGCUAAACACUGCCGUUUGAAGUCUGUUUAGAAGAAACUUAAUCAAGCUAGCAUCAUGUUGGUUGUUUAUCACUUUUCAUGAUGCGAAACCUUUCGAUAAACUACACACGUAGAAAGAUGUGUAUCAGGACCUCUGGACGCGGGUUCAAAUCCCGCCGUCUCCAUUA |
[ reference structure ]
|
(((((((.............(((((((((...(.((.((((...((((((((((aaaaa.))))).............AAAAA..................................(.((.(((......))))).)..(((((.(((((((((.<<<<<<)))))))))..))))).........>>>>>>....(((((((.....[[[[[[....)))))))...........]]]]]]..((((((((..(((.{{{{{{{)))...))))))))..........}}}}}}}...)))))......)))).)).)..)))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
((((((((((.nnnn(((((jjjjjjjj[...[((((.ddddd(..hhhhhhhhhhhhhhhhhhh.hh(.aa.......))))).iiii((.eee(g((kk.)G..eeee[())).((ooooooo))((((((..fffff.ffOO.(((((((((.mmmmmm)))))))))..)))))){{{{{]).MMMMMM.)HH(((((((.))EEEccHHHHHHH)))))))]]))).)DDDDD..OOOOO((((((((AA}}}}}.EEEE..lll))))))))))FFHHHHHHHHHHHHCC.((((((.FFFFFLLL.))))))...)JJJJJJJJKK.(((((NNNN...))))))))))))IIII
|
TMR_00562
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGAUCGGUUUCGACAGGGGAUGUUGAAACAGGGGAAGCGAGCCGAGGAACGCGGCAAUGAUCUCGUUAACCACGUGUCGCAAAAAAAUAAUCGCCAACUCUAAGCGCGAUUCCCAGCAGUUCGCUCUCGCUGCCUAAUAAGCACCGAUAGCGCUUGGGUGUCAGACCGGGGAGUUCCCGACCCGGACCCUGGCAUAAUCUAGGGAACUCAACCGUCCGCCCGGGCUGCGGGGGCGGAUGGGAAAUCAAACAGCAGCUGGGCCUGUUGGCGGCUUGUCCGCGUGACCGCCAGGGCCGAGAAAAGCACAGCGGACUGCGCUCGGAGAAGCCCUGAAUUAACUCCACUGGACCCGGGUUCGAUUCCCGCCAUCUCCACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((...........(((.(((..(.((..(((((....((((((((((...[[[[[.....)))))..........]]]]]....................................(.(..((((.(((.(((.......))).))).))))..).).((((((.(((((..<<<<<<..)))))...)))))).......>>>>>>....((((((((((.{{{{{{..))))))))))...........}}}}}}.(((((..((((((...aaaaaa....)))))))))))............AAAAAA...)))))......)))))..)))..))).)))....((((.......)))).)))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((((.eeeeeeeeeee(.lll(..hhhhh((.[[[[[[[(.fffffffff.fffff))FFFFF......kkk(.(((.......jjjjj.....jjjjjjjj(aaaaaa(.cccccccccc.cccc)))dd..dd.CC)))))).)JJJJJJJJ(({{{(..bbbb((((((((<<<<<<<.<<<<<<<.DD)EEE.))))))))..((((((((((.ggggg(ii))))))))))....)LLL.)))IIGGG)CCEEEEEEEE)FFFFFFFFF]]]]CC..>>>>>>>(((((....)DDKCCCCCCCCAA.)))))...KKHHHHHAAAA...]]].)}}}..>>>>>>>JJJJJBBBB.))))))).GG.
|
TMR_00566
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUUGUUACGGAUUCGACAGGCAUUAUGAGGCCUAUUUUGCAACUCAUCGGCAGAUGUAAAAAUGCCAGUUAAAUAUAACUGCAAAAAAUAACACAACUUACGCUUUAGCUGCCUAAAAACCAGCCGGCGUGACUUCUAUAGGAUUGCUUGUGUCUUAUUAGAGGUCUCAAAACAGCAAGCUACGUUUAGGUGAUUGUCUAGUCACCUAAAAAGAGAACCCUAGACUCGCAGGCUGAUGGCUUGAGUUAUGUGUCCUUGGUCUGUUAAAGUAAGACAUAACCUAUGGUUGUAGACAAAUAGGUUAGCAGGUGUUUGGACGUGGGUUCGACUCCCACCAGCUCCAUCA |
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((....(((((((((..((((((((([[[[))))......]]]]...................................((.((.((((.........)))).)).))((((((.(((((((.aaaaaa)))))))..))))))........AAAAAA....(((((((((..{{{{{{))))))))).........}}}}}}..(((((.(...((.(...<<<<<<<).))...)))))).........>>>>>>>....))))).....)))))))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
((((((((((((iii..iiiiiii.ii(gggggggg.gggggg(..cccccccc.cc)))))...(((((((((((..)CC.)CCCCCC...{{{{{{{{{{{.{{)))))))).(((.......}}..ffffffff(bbbbbb(.((((eeeeeeeeeee(aaCCGGGGGG.....)))).[[[[[((((((((((((<<))))))))))))[[(.dddddd)))..GG))).GGGGGGII)]])BBBBBBFF(((((((IIIIIII..)AAEEEEEEEEE)FFFFFF.]]]]].))).}}}}}}.hh..}}}}}.))))HHDDDDDD>>EE.....)))))))III.
|
TMR_00571
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUCGUUACGGAUUCGACAGGCAUUAUGAGACCUAUUUUGCGACUCAUCUAGCGGAUGUAAAACGCCAGUUAAAUAUAACUGCAAAAAAUACAAAUUCUUACGCAGUAGCUGCCUAAAAACCAGCCUGUGUGAUCAAUAACAAAUUGCUUGUGUUUGUUGAUUGGUCUUAUUGUUAACAAGCUACGUUAGAACUGAGUCAGGCUGUUCUAAAAGAGUUCUACUGACUCGCAUCGUUAGAGUUUGAGUUAUGUAUUGUAACGGUGUUAAAUAAACACAUAACCUAUAGUUGUAGACAAAUGGGUUAGCAGAUGUUUGGACGUGGGUUCGACUCCCACCGGCUCCAUUA |
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((....(((((((((..(((((((((..{{{)))).....}}}....................................(((...((((.........))))...)))((((((.(((((((.<<<<<<)))))))..)))))).........>>>>>>....(((((((..[[[[[[...)))))))..........]]]]]].(((((((((.(((....aaaaaaa))).))))))))).........AAAAAAA....))))).....)))))))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
((((((((((((jj(kkkkkkkkkk(.dddddddddd(ccccccccc..cccccc(nn)))))...aa((((...<<<<<<<(((((...)DD..eeeeee(.ggggggg(..bbbbb.....bbbbbb([[[[)DDb(hhhhh..)))){{)DDDDDDKKKK)BKKKKKKJJHHHHH.ffffff.)CCCCCC)))(((()]]]]BB.NNmmm)BBBBEE)BBBBB))))(((((((((.FFFFFF)}}>>>>>.lll)))))))))((..))..EEEE((((((((CCCCCCCCCLLL))))))))(((>>))).iiiiGGGGGGG.)))))))....)AAIIIIMMM
|
TMR_00584
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUCGUUACGGAUUCGACAGGCAUUAUGAGGCAUAUUCUGCGACUCGUGUGGCGACGUUAACGCUCAGUUAAAUAUAACUGCAAAAAAUACUAAUUCUUACGCUGUAGCAGCCUAAACACCUGCUCGCGUGACUUCUAGCAGAUUGCUUAUGUUUGUUUAGAGGUUUUAUUGAUUUAUAAGCUACGUUCGAUCAUUGCCUAGCUGGUCGAAAAGAGAUUUAUAGGCUCGCAUAUAGAAGGCUUGAGUUAUGUGUCGCCUAUCUGUUAAAUGAAAGACAUAACCUAUGGUCGUAGACGAAUAUGUUGGCAGAUGCUUGGACGUGGGUUCGACUCCCACCGGCUCCAUAA |
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((....(((((((((..((((((((..<<<<)))....>>>>....................................((...(((((.........)))))...))((((((.(((((((.aaaaaa)))))))..))))))..........AAAAAA....((((((((..{{{{{..))))))))..........}}}}}..(((.((((..(((....[[[[[[[)))..)))).)))..........]]]]]]]....))))).....)))))))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((((b.((kkkk(((((((((jjjjjjjj(...eeeeeeee(.((((ffffffff(ddddddddd.ddddddddddddd(....ggg.))){{{{{{{(()DDDD.ccccc(.)))).iiiee)}}}eeeeeeee(aa..aaaaaa))))))))EEEEEEEE}DDDD.EEkkkkk(..lllllllllllll())EEElllllll.)D.}}}))DDDDD)IIICC.CCCBLLLLLAAAADDDDDD[[[[DDFFFFF(((((((((()LLL..AAEEEE.))GGGEJJJJJJJJKKKK).AA)))))))))).LLLLLLLLLLFFF))))))).LLKKKKK.]]]].
|
TMR_00594
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCCGCAAUGGUUUCGACAGGUUGGCGAAAGCUUGCCCGUGAUACAGGUCGAGAGUGAGUCUCCUCUCGCAAAUCAAAGGCUCAAAAAAAAGUAACUGCGAAUAACAUCGUCAGCUUCAAACGGGUAGCCAUAGCAGCCUAGUCUGUAAAAGCUACAUUUUCUUGUCAAAGACCGUUUACUUCUUUUCUGACUCCGUUAAGGAUUAGAGGUUAACCCCAACGGAUGCUUUGUUUGGCUCUUCUCUAGUUAGCUAAACAAUCAAGACUCAGACUAGAGCAUCCCACCAUCAGGGAUAAUCGAUGGUCCCCGUCCUAGGGCUAGAAGGACUAAACCUGUGAAUGAGCGGAAAGUUAAUACCCAGUUUGGACAGCAGUUCAAUUCUGCUCGGCUCCAUUU |
[ reference structure ]
|
(((((((............((((((((..(..((((.((..(.((.((((((((((.{{{{{{...))))).........}}}}}}.........................(..((..(.......((((.(...........).)))).......)..))..)................((((((..(((...[[[[[[..)))..)))))).......]]]]]]....((((((((((...bbbbbbb.))))))))))...........BBBBBBB.(((((..aaaa.)))))....AAAA(.((..<<<<<..)).)...>>>>>...)))))...)).)..)).))))...)..))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((.((((((((jjj.((((((((((..iiiiiiiiic((ggggggg((((((eeeeeee.))))))........gggg(.nnn...nnn(aaaaaaaa([[[[.))))C)))))...)AAAAAAA...mmAN)NNNN.bbb((d.(({{{{)D))})NG<<<<...)))))))).)GGG..(((((((....(((((.fffffffff)))))...hhh((((((((((lllllllllFFFFFFFFF}}})..>>>>)G.EEEEEEEBBB)))))))))).....)))))))MM.JJJ.))))))).(((((LLLLLLLLL)))))((.GGGGGG)..kkkkkkkkk.]]]].))....HHH((((..IIIIII...KKKKKKKKK..))))III
|
TMR_00605
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAAACGGCUUCGACGUCCUAGUGAAAGUUGGGCUGUGAUGCAGGUCGAGAGUGGACUAUCUCUCGUUAAUCCAGAGUCCAAGCCAAAAGUAACUGCGAACAACAUCGUUCCUUUCGCUCGUAAAGCUGCUGCGGUAGCCUAAGACCUCUAAACAGGUUCGAGCACUCGUUGUCCGACUCCGUUAAGGGCAGCGGGUUAACCCCAACGGAUGCGCUAGACAGUUCUCUCUGGUGGGCUGUUUAGCAAAGACUCGACCAGAGCAUCCUACUGUUCGGGAUAAGGAACAGUCCCCGCCUGAGGGUCAAAAAGGCUAAGCCUGUGAAAGAGCAGUCGAUGAAUAGCUAGGGCGGACACGGGUUCGACUCCCGUCAGCUCCAUUA |
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((((.(..(((((....(..(.((((((((((.[[[[[[...))))).........]]]]]]...........................((..((..(....(.(.((((......)))).).)....)..))..))........((((((.((((...bbbbbb..)))).)))))).......BBBBBB...((((((((((((.<<<<<<<)))))))))))).........>>>>>>>.(((((..{{{{{)))))...}}}}}(.((..aaaa...)).)....AAAA...)))))...)..)....)))))...).)))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
((((((((((((((([[[.[[[[[[[[[[((d(((((((((ll.ll(.<<<<<<<))((((((.aaa.aaa(jjjjjjjj))))))hhhh...ee(..e()JJJ....eeee(.ff)LLLLeeeeme(..cccccc))).M)))))D)gggggg(...iiiii.)EEEE[[[[[[[[[[[.)EE)))))..]]]]]]]]]]])E....)]..((((((((((((((((((kkkJJJJ.))))))))))))..JAA>>>>>>>KKK)))))).((((((({{{{{{)I)))))))....IIIIG.GGGGG.....HHHH.((((((((..)FCCCCCC)FEEE..}}]]]]]]]]]EE))))))))]]].}}}}.))))))))AAAA
|
TMR_00609
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGAACGGGUUCGACGGGGAUGGAGUCCCCUGGGAAGCGAGCCGAGGUCCCCACCUCCUCGUAAAAAAGGUGGGAACACGAAUAAGUGCCAACGAACCUGUUGCUGUUGCCGCCUAAUAGAUAGGCGGCCGUCCUCUCCGGAGUUGGCUGGGCUCCGGAAGAGGGCGUGAGGGAUCCAGCCUACCGAUCUGGGCUCCGCCUUCCGGCCCGGAUCGGGAAGGUUCAGGAAGGCUGUGGGAAGCGACACCCUGCCCGUGGGGGGUCCUUCCCGAGACACGAAACACGGGCUGCGCUCGGAGAAGCCCAGGGGCCUCCAUCUUCGGACGGGGGUUCGAAUCCCCCCGCCUCCACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((...........(((((((((((.((((((((...((((((((((..aaaaaaa)))))......AAAAAAA..................................((((((((.....))))))))((((((.(((((((..<<<<<<<))))))).).))))).......>>>>>>>..((((((((((((..[[[[[[[)))))))))))).........]]]]]]](.(((((((.(.(.(...{{{{{{{.).).).))))))).)........}}}}}}}...)))))......)))))))).)))))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
((ddddd((((((((((.iiiiiiiiiii.iiiiiiii...iiiiiii..iii(((((((gggggg.....)))))))..i(bbbbb..b(<<<..)))))))))))Baaaa(((((((([[.[[))))))))((((((((((((((((>>>ee))))))))).)))))))aa(jj(.]]{{{{{{.{{{{{{{{{{{{))((((((h}}}}}}}}}}}}((.ccc)}}H)))))))I(((((((.}}}})JJAAAAAffffffff)C))))))).III.II...EE.ADDDDD.IIIII(((...IIIIIIII.IIIIIIIIIII.GGGGGGBBBBB.]]FFFFFFFF))).CC).
|
TMR_00624
|
[ FASTA input ]
|
GGGGAUGACUAGGUUUCGACUAGGGAUGUGGGGUGUUGCGCUGCAGGUGGAGUGUCGAUCUCCUGAUUCGGCGCCUUUAUAACUGCCAAUUCUGACAGUUUCGACUACGCGCUCGCCGCGUAAUCGCGGGCCUGUGUUUGCGCUGCUCUGAGCGAACAUAUCGGCCCGACGCCAAACGGAGCUUGCUCUUACGUUGUGCACGGCGGACGUAGGGGGACUUUUGUCUGUGCUAAGACUCUGGCGCGUGCGGUGCAGGCCUAGCAGAGUCCGACAAACGCAGUACGCACCGCUAAACCUGUAGGCGCGCAGCACUCGCUCUUUAGGACGGGGGUUCGAUUCCCCCCAUCUCCACAA |
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((....((((((((((((.(((((((((.{{{{{.))))....}}}}}.............................(((.((((((.....)))))).)))(((((((((((((((...aaaaaa.)))))))))..))))))........AAAAAA...((((((((((..<<<<<<..)))))))))).........>>>>>>(..(((((((..(.(.[[[[[[[...).)..)))))))..)............]]]]]]]...)))))...).)))))))))))..)))))))...(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((..(((((((((....iiii((((aaaaaaaaaaaaaaaaaa(((llllll(bb)))(((()LLLLLL.{{(((.hhhh(..mmm..((.cccc))CCCCmmmmmmmmmmmm.)))))))kkkkk(dddddddddddddj..((gggg..)J))..)KKKKK..[[(eee))))))))).(((((((((ffff.MMMMM)))))))))((((((((((((((((((.<<<<<<MMMMMMM)DDDDDDDDDD.))))>>>>>>.BB)G}}.)MMMH..FFFFGGG)..AAAAAAA)EEAAAAAAAAAAA))..E]].))))))))))))HHHIIII..)))))))DDD.
|
TMR_00683
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGUGAUUCGGAUUCGACGACGGUAUCGAACCCUUAGGUGCAUGCCGAGGGCGUAGUGGUUCUCGUUAAUCAAAACACUACAAACCUAUUAGUUGCCACAUUGACAACUACUGGAAGUGCAAACGACGAGUUCUUUGACGCUCGUCUUCGUGCUUAAUCGUAGCUAAACCCUACGAGCUUCCCAGUCCGUCCGGCUCGUCUGCUGGCUGGUUUUUCGGACUGUCAUCGUAAGCGGACUCGCCACGUUCAGCAGGUCUCUGGCUGACGGGUUAAAACUUGUGGGAAUCGCGCUGCAGAACCCCGACCACUGGGUCGCUGUGGUGUUAAAUUUAAACGUGGAUCUAAGCAUGUAAAGCCGAAGGCUGAGAGCUGGCGGACGCGGGUUCGACUCCCGCCGCCUCCACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((............((.((((.(.....(((..(((.((((((((((..{{{{{{..)))))..........}}}}}}...........................................(.(..((....(...((((((....))).........)))...)....))..).)...(((((((.((((((...aaaaa)))))).....)))))))........AAAAA(((((......(((((...<<.<<<)))))))))).........>>>>>...(((((...(.((((.[[.[[[.))))...)..)))))...........]].].]]...)))))....)))..)))....).)))).))...(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((((..((((.((((((.cccccccc.(((((mm.m(jjj(bbbbbb(eeeeeeeee(ddd.ddd(ffffffff..)))))mmmmmmmm..)F))))a(..)F..a(((g(FFppp.(((((((...)FFF.)))))))(([[[[[[[(.llMMMMMMMM....lllll))G))).aaaaaa(.nnnn(iiiiiiiiiiiiiiiiii)FDD)))))).LLLLL.AAAAAAA..kkkkkkkkk((.{{{{(.<<<<<(..hhhhhIIIIII)))DEEEEEEEEA>>>)>>HHHHH.oo...))))))))))EBJJJMMM)L.L]].}}}})KK.OO)]]]]])PDDD)NNNN.)KKKKPP.IIIIIIIIIIII.CCCCCCCC..)))..BBBBB...KKK
|
TMR_00698
|
[ FASTA input ]
|
GGGGGCGUUCUGGUUUCGACGGAUUGCUAGAAGUGGAGGCUGCAUGCCGCGGAUGAUUCGUUGGCCGCGUUACCAAUUCGGAUCAAACAAACUAAAUGCGAACUCUAACGAGCUUGCCCUCGCCGCUUAAUUGACGGUGACGUUCCUCCAGUGAAGUCUGUGAAUUGGAGGGGCGACUACUUACAGGCUGGCCAAAAGAGCGGGCGACCGGCUCCGAGGCGAGAUCUACAGGCCGCUGGGUGGACGGUAUCCUGGCAGUAGGAGACUGGACAUCGAGAUCAAAUUAUUGCCUGAGCAUGGAGACGCUUUCAUGGAAGGUGGUUCGGACAGGGGUUCAACUCCCCUCGCCUCCACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((............(((((((((....(((.(((.((((((((((((..{{{{{{....))))).........}}}}}}.............................(((((.(((.........))).)))))((((((((((((..aaaaaaaa.))))))))))))......AAAAAAAA.(((....((((.[[[[.[[.))))...)))..........]].]]]].((((..((((.((..<<<<<<<<)).))))..)))).........>>>>>>>>...)))))....)).))))))....)))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((bbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbb(..iiiiiiiiiiiiiiiii.iii(..((((jjjjjjj(.<<<<(..{{{{{{{{{.......{{(ggg))))ccccc....)>.))))))).(((((((.eeee.)>>>J((((((((((((..[[[[[[[[[)))))))))))).((..]]]]]]]]]JJJJJJ.))..aaaaaaa.((((h((ffffff..)III...H)))).))))))).IIIIII.)BBBBBBB.)F((.BBB....BBBBBBBBB..)GGAAAAAAA.IIICCCCC.FFFFF)G}}.BBB..}}}}}}}}}.ddddd.EEEE))DDDDD.IIIIIIII..
|
TMR_00703
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAUUUAGGAUUCGACGGGAAUUCAGAAGUCUGAGGUGCAUGCCGAGGUGCGGUAGGCCUCGUUAACAAACCGCAAAAAAAUAGUCGCAAACGACGAAAACUACGCACUAGCAGCUUAAUACCCUGCUCAGAGCUCUCUCGCCCUAGCUUCCGCACGUAAGACGGGGAAUAACGAGAGAUCAAACCCAAACGCGCUAGCCCGGAUUCUCCCGCCUGAGAGAUGAACGGCGAAUUAUAAUUCAGGAUAGUCAUUCAUUAGCGUGUCGGUUCGCAGGUGGAUGGUGAAUUUAAAGAUCGACUAAGCAUGUAGUACCAAUGAUGAAAGGUUUUCGGACGCGGGUUCAACUCCCGCCAGCUCCACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((.............((((((((.....(((...((((((((((((((<<<<<<...))))).......>>>>>>.............................((.((.((((.........))))..)).))(((((((((((..(((..aa.aaa)))..)))).....)))))))..........AAA.AA..(((.....((((...[[[[[)))).....)))..........]]]]]...(((((.(..(.(((.{{{{{{{)))..)..)))))).........}}}}}}}...)))))...))))...)))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((((((((((((((..((hhhhhhh..(({{{{{(.nnnnnnnn(bbbbbbb(.(d((((((o(....(((((........aaaaaa....a(.llllllll.lll.)).f(jjj[((.ggggggg)AAAAA])fffff((.)AA)JJJ.))))O)iii()))))D)eec..FFFFFF)e(....mmm.mmmmmmmmm)))))))))).(((((((.)M..<<<<))LLL..)CEE.IIIGGGG.)Gkkkkkk..MMMMMMMMM)BBBB)B))))))).MMEHHHHHHH..))))BBNNNN.NNNN}}}GG)..KKKKKK....LLLLLLLL...(((((>>>>.}}))))))))))))....
|
TMR_00706
|
[ FASTA input ]
|
GGGGCUGAUUAUGGAUUCGACGAAAUAAACAAAACUAAAGAUGCAUGUCGAGCAGAGGUGGACUCGUAAAACCUCAAAUUGAUAAUUGCAAAACAUAAGUACAACGAGCCUGCUCUAUUAGCAGCUUAAUUAGAAUAAAAUCUUAGGCUCCUUCUUAGAUAUAUUAUCUCUAGAUGUAUCAAUAGAAGUCAAAAUUAGAGAUCGCGAUAUGAACGGGCUUGUACGUUCCUACGCUAAAAUAAUACAAGAUAAUUUUUAGUUCACACUUCUUUCUGUAGAACUAAAAAUAUUUAAGAAAGAAUAAACAUGUAGUAUCAAUAGAAUUGAAGUUUCGGACGCGGGUUCAAAUCCCGCCAGCUCCAUAU |
[ reference structure ]
|
(((((((.............((((((........(((..(((((((((((((..{{{{{...))))....}}}}}..............................(((((((((.(....).)))......(((.(..).))).))))))(((((..((((((((.aaaaaa))))))))...))))).......AAAAAA..(((....(((((<.<<<<<<)))))...)))........>>>>>>.>.(((((..(.(.(((.[[[[[[.)))...).).)))))......]].]]]]...)))))...))))..))).......))))))...(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
(((((((.((((j((((((((d...((....aaaaa...aaaaaa)D)))))..((((ggggggggg....))))..cccccccccccc....))J))iii..((((((((b.((((((.hh(((((((ee(ffff....)C)))))))..hhhhhhhhh.hhhhhhhhhhhh.AAAAAA))))))(({{{{..HHHHHHHH.CCCCC.)EE.B))))))))..FFFF((((()}.......(((..HHHH<<<<<<<<<<(....[[[[[[[[))))]]]]]]]]>>HHHHH>>>>>>>>)A....)))))CCCCCC)HHHH}}})AAAA).(((.GGGGGGGGG..))).HH))))))).III
|
TMR_00711
|
[ FASTA input ]
|
GGGGUCGACUUGGAUUUCGACGGGAGCUAAAUAGCCUCGGUUGCAUGUCGGCAUGGGCACGCCGUAAAACUACCCGCAAUCAAUAAACGCAAACAACGCAAACUACGCUCCCGCUUACGCCAAAGCUGCGUAAGUCUAACUCUUCGGAGCCGUCAAGCCUCACAAUGCUAACUAGUGGGGAUUUGGCGUAACUUUGUUAGCCGCUCUCUCGUCUCAUCCGAAGCGAGGGAAAAGAUUAGGAUUGCCCAUCACUUCCGCCUUGGGGGCUUGAGCAAAGCGAUGGAAAGAGCUUUCAACCCCAUCUAAGCAUGUAGAGACUGGGGUGGGUUUGGCUUUCGGACUGGGGUUCGAUUCCCCACGACUCCACCA |
[ reference structure ]
|
(((((((.............((((((((((...(((((((((.(((((((((.[[[[...))))........]]]].........................................(.((.(((................))).)).).(((((((((((((...{{{{{{..)))))).))))))).......}}}}}}...((((((((...<<<<.<<)))))))).....>>.>>>>...(((((..((....(((.aaaa.a.)))...)).)))))...........A.AAAA......)))))....)))))))))....))))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
[ predicted structure ] |
((((((((.((((((([((.bbbbbbbbbbb(ffffffffffffffff((((eeeeeee.)))).fff..((...((.iii..i(...dd.....ddddd...)).kkkk.kkkkkkkkkkkkkkkDDDDD))))]))).))((((((KK)){{{{{{{{{.{{{.(((((()I<<<<<<<KKKKKKKKKK<<<<)))))).))hhhhhhh(jjj.)))))))HHHHHHH>>>>.(((((..EEEEEEE...(((((aa}}}}}}}}}}}}DD...KKK.))))).KKKKFFF..gggggg)))))FFFFFF.JJJ..GGGGGGAA)FFFFFFFFFFBBBBBBBBBBB.III>>>>>>>))))))....
|