RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - RNASampler(20)

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SPR_00277	[ FASTA input ]	GCCUGCUUAGCUCAGUUGGCCAGAGCAUCCGUUUCAUACGCGGAAAGUCACUAGUUCGAAUCUAGUAGCAGGCACCA
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SRP_00015	[ FASTA input ]	GUCGAGCUAUGUAACGAGAGCUUGUAACCCAAGUGGGGACUAUAAGAUGGUGGAACACUGGAUCGGCCCACGGGUCGGAUUUGUUGUUGGCAUAGGUCUGGACUGCCCAAUCCAAGCUGUGAGUGAACCGUAUGAACCAAGCGAAGGUUUGAUCCGUACGGUUGCUAAAGGUUGAGGGUAUUGCGUUAGGCUGGCUUCACAGAGCAGCGACUACCUCCCGCUCUCAGCAGUGGACGGACAACGGUUCGACGCCACACAAAUCCACUAUGGUCCGCUGGCUCGUAACCCGCUUGAACCACCAUUUU
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SRP_00020	[ FASTA input ]	GGCGGGUCUCCCCGCAUUGCAGCGCGGUGAACCUGGUCAGGGCCGGAAGGCAGCAGCCACAGCCGUUCCCUGCAAGUGCCGGGGGUCAGGCUCGCCACCCCGAACA
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SRP_00024	[ FASTA input ]	UCUACCGUGCUAGACGGGGAGGUAGCGGUGCCCUGUAACCUGCAAUCCGCAAUAGCCCAGGUGUGAAUUCCUAUCCUAGGUUUUCUUAUGUGAGGCUGCCGUUGAUGGCGGCGGUGUUGAGGAGCGGGUCCUGUGCAACGCGAACCCAUGAACCUGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCAUAAGUGGAUCAUCGCGUGUGCCGCAGGGUAGCCUGCUCUGAGCUGCUACCAUAAGUAACGCUCGGAUAAGGAUUAUCGAAGAUAGGUGCACGGUA
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SRP_00026	[ FASTA input ]	UUUGCCGUGCUAAGCGGGGGAGGUAGCGGUGCCCUGUACUCGCAAUCCGCUCUAGCGAGGCUGAAUUCCUUUCUGAGGCUGGUAUCCUGUAGGGUCUGCCUUAAGUAAGUGGUGUUGACGUCCGGGUCCUGCGCAAUGGGAAUCCAUGAACCAUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCAUUAAGUGGACACCCCCAUGUGCCGCAGGGUUACCUGGACUGAGCUAACUACUUAAGUAACGCUUAUGGGUGCCAGUCGACAGAAGGUGCACGGUA
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SRP_00030	[ FASTA input ]	UUUGCCGUGCUAAGCAGGCGAGGUAGCGGUGCCCCAUACCCGCAAUCCGCUCUAGGAGGGCCGAAUCCCUUCUCGAGGUUCGUUUACUGUAAGGUCUGCCUUAAGUAAGUGGCGUUGACGUCUGGGUCCUGCGCAAUGGGAAUUCAUGAACCAUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCAUUAAGUGAAACCUCUCAUGUGCCGCAGGGUUGCCUGGGCUGAGCUAACUGCUUAAGUAACGCUUAGGGUAGCGAAUCGACAGAAGGAGCACGGUA
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SRP_00031	[ FASTA input ]	UUUGCCGUGCUAAGCGGGGAGGUAGCGGUGCCCUGUACUCGCAAUCCGCUCUAGCAGGCCGAAUUCCUUCUUGAGGUUAGCUCAUCUUAGGGCCUGCCUUAAGUAAGUGGUGUUGACGUUUGGGUCCUACGCAAUGGGAAUCUGUGAACCCUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCAGUAAGCAGAACCUCUCAUGUGCCAUGGGGUCGCCUGAACCGAGCUAACUGCUUAAGUAACGCCUGGGGUGGCUAAUCGACAGAAGGUGCACGGUA
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SRP_00037	[ FASTA input ]	UUUGCCGUGCUAAGCGGGGAGGUAGCGGUGCCCUAUACUCGCAAUCCGCUCUAGCAGGCCGAAUCCCCUCUCGAGGUUAUGUUGCUGUAAGGUCUGCCUUAAGUAAGUGGUGUUGACGUUUGGGUCCUGCGCAACGGGACCCCGUGAACCUUGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCAAUAAGCGGGUCUUCUCGUGUGCCGCAGGAGUGCCUGAACCGAGCUAACUGCUUGCGUAACGCUUAUGGCUACGCAAUCGACAGAAGGUGCACGGUA
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SRP_00038	[ FASTA input ]	GGGAGGUUGGUGGUGGACGCACUGCUCGCCAACCGGGUCAGGUCUGGAAAGAAGCAGCCCUAACGAGUUCUGGUACGGGUCAUCGUACCAGCCUCCUAUUU
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SRP_00042	[ FASTA input ]	AGCCUCCACGCGGCGCUAUGUCACCCAACUCCCCCAGGGCAGGAAUGCAGCAAGGGUAAGUGGCCUCUGACGGGUGUGUGGAGGUUUUCU
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SRP_00044	[ FASTA input ]	GCUGGCGGGCCCCUUCGCAUGGUUCGGCGGUGAAUCUGGUCAGGUCGGGAACGAAGCAGCCAUAGUCGUUCAGAACCAGUGCCGGAGUAAGGCUCGCCUACCGGUAUCCCU
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SRP_00046	[ FASTA input ]	CCUAGGACCCGUACUAUCAAGUGUUGCUAAACCCCGUCAGGACUGGAAGGUAGCAGCGGUAAGCGAUUUUUUUGGUGAGUACGCAAGUCUUAGGUUGA
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SRP_00051	[ FASTA input ]	GGGAGAUUGGCGGUGGACGAGCCACUCGCCAACCGGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCCUAACGAGGUCCGGAUCGGGUCGCUCGUCAGUCUCCUACCUGUUUU
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SRP_00054	[ FASTA input ]	GGGAGGUUGGUGGUGGACGAGCCACUCGCCAACCGGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCCUAACGAGCCACGGCACGGGUCAUCGUGCCAGCCUCCCACCCUUUCU
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SRP_00057	[ FASTA input ]	GAGUUAUCUGUUAGCUCCAAACACUGCAAUAUUGAAUAGUUGGUCAGAUUCGGAAGGAAGCAGCCAAAUCAAUUGAUACAGGUGUUCUGAUAAAGCUAACAGAAACUCCUAAA
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SRP_00066	[ FASTA input ]	GCCAGACGCGGUGGCACGUGCCUGUAGUCCCAGCUACUCGGGAGGCUGAGGCGGGAGGAUCGCUUGAGCCCAGGAGUUCUGGGCUGUAGUGCGCUAUGCCGAUCGGGUGUCCACACUAAGUUCGGCAUCAAUAUGGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACCGGAUUGCCUAAGGAGGGGUGAACCGGCCCAGGUCAGAAAAAGAGCAGGUCAAAACUCCCAUGCUGAUCAGUAGUGGGAUUGCGCCUGUGAAUAGCCACAGCACUCCAGCCUGGGCAACAUAGCAGGCUCUCUCUUUAAAA
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SRP_00075	[ FASTA input ]	GUAAGUCGGGGACCUCUUAAGAUGAGAGACUUCUGAACCGGGUCAGGAUCGGAAGAUAGCAGCCCUAAGGAAAGGCCUUUUGUGCUAAGAGUCUUCUCUGACUUAC
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SRP_00077	[ FASTA input ]	GGGUAAGUUGGGGGCCUUUUAAGAGAAGGAACCUGCGAAUCGGGUCAGGACUGGAAGGUAGCAGCCCUAAGGAGAGUUUUCUUUUGCUAAAAGAAUGUUCUCCAACUUACUCUUUU
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SRP_00084	[ FASTA input ]	GGCGGGCCUCCCCGCAUUGCACGGUAGCGAACCUGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCACAGUUAUUCAGUGCAAGUGCCGGGGGUCGGGCUCGCCACCCCUCCC
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SRP_00086	[ FASTA input ]	GCCGGGCGUUGUGGCGUGCGCCUGUAAUCCAGUUACUUGGAGGCUUGGGUUGGAGGACGGCGUGAGAUUGGGAGCCCUGUGGCGCUCUGCCCUAUGUCGAUCGGGCGUCCGCGCUAAGCUCGGCGUCAAUAUGGACAUCCCGGGGGAGCUUGGGGUGGCCAGGUUGUCUAAGGAGGAACGAACCGGGCGAGGCCCGAAAGGGAGCAGUCAAAAGUUCCCACGUUGAUCAGUAGCGGGAUAGCGCCUGUGAAUAGGCGGAGUGUCACAGCCCAGUCAAUAUCGCAGGACCCGAUCCUUU
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SRP_00088	[ FASTA input ]	GUGCUAGACGGGGAGUUAGCGGUGCCUUGUACCUGCAAUCCGCUGUAGCAGGGUUGAAUUCCUUGUUUGAGGCUAUAAUUUGUGGGGUUUGCCUCAUCUUGGUCAAUGUUGAGAAUUGGGUCCCACGCAACGGAAAUUCAUGAACUCCGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCGGUAAGUGAAAUCUUCCGUGUGCCGUGGAUAAAUCUGAUUUGAGUUGACCAGGUGAGUAACACUCAUAGAUUAUUGUCGAUUCAAGGUGCAC
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SRP_00089	[ FASTA input ]	GCCGUGCUAGAUGGGGAGUUAGCGGUGCCCUGUAACCUGCAAUCCGCUACAGCAGGAUCGAAGUCCUCAUAGAGGCUCUAACUUGUGGAGUCUGCCCUAUGUAAGUGGUGUUGAGAGUUGGGCCCCACGCAAUGGAAACCUGUGAACCUCGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCGAUAAGCAGUCAUUUUCAUGUGCCGUGGAUACGUCUGGCUUGAGCUAACUGCAUAGGUAACGUUCAUAAGUUAUUGUCGAAGUGAGGUGCACGGUU
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SRP_00090	[ FASTA input ]	CCGUGCUAGACGGGGAGUUAGCGGUGCCCUGUACCUGCAAUCCGCUAUAGCAGGGUUGAAUUCCUCGAUUUGAGGCUAUACUAUGUGGGGUCUGACCUAUAUAAGUGGCGUUGAGAAUUGGGUCCCACGCAACGGAAACUCAUGAAACCCGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCGGUAAGUGAUAAUUUUCGUGUGCCGUGGAUAAACCUGGUUUGAGUUAACUGUAUAGGUAACGUUCAUAUGCUAUAAGUCGAAACGGGGUGCACGG
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SRP_00094	[ FASTA input ]	GGACUUCGCAUGGCGCGUAUCCCAUGAACUCCCCCAGGGCAGGAAUGCAGCAAGGGUCAGUGGGCUCUAGCGGGUGUGCGGAGUCCCCUUU
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SRP_00095	[ FASTA input ]	GGAUCCCGUGCGGCGUUUAUCUUGUGAACUCCCCCAGGGCAGGAAUGCAGCAAGGGUCAGCGAGCUCUGACGGGUGCGCGGGAUCCCCUU
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SRP_00103	[ FASTA input ]	GCCGGGCGCGGUGGCGCGCGCCUGUAGUCCCAGCUACUCGGGAGGCUGAGGCAGAGGGAUCGCUUGAGCCCAGGAGUUCUGGGCUGCAGUGCGCUAUGCCGAUCGGGUGUCCGCACUAAGUUCGGCAUCAAUAUGGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGUUGCCUAAGGAGGGGUGAACCGGCCCAGGUCGGAAACGGAGCAGGUCAAAACUCUCGUGCUGAUCAGUAGUGGGAUCGCGCCUGUGAAUAGCCACUGUACUCCAGCCUGGGCAACAUAGCGAGACCCCGUCUCUUUU
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SRP_00161	[ FASTA input ]	GGGCAAUGUCCGACCUCCAAAUUGUGUCAGGACCGGAAGGUAGCAGCACUAAGGUUGCUUGGGCAUGUGCCUUUUU
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SRP_00164	[ FASTA input ]	GGUGACUCUAUUGGUCCCCUCGCGACGAUAGAUUGUGAACCCCGUCAGGCCCGGAAGGGAGCAGCGGUAGCAGUUGAUGCGGGCGCCGGGGUGUGGCUCUUAGAGUCGCCGCCCAACU
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SRP_00170	[ FASTA input ]	GCUCCCCACGUGGCGCCAUCCAGGCCAACUCCCCCAGGGUGGAAACGCAGCAAGGGUAACCGGGCUCUGGCGGGUGCGUGGGGGGUCUUUU
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SRP_00171	[ FASTA input ]	GCUGGAGGCGGUGGCACGUGCCUGUAGUCCCAGCUACUUAGGAGGCUGAGGCGGGAGGAUUGCUUGAGCCCAGGAGUUCUGGUCUGUAGUGCACCAUGCCCGUUGGGUGCCUGCACAAAGUUCAGCAUCAAUAUGGUGACCUUCCGGGAGCAGGGGACCAGCAGGUUUCCUAAGAAGGGGUGAACCGGCGCAGGUUGGAAAAGGAGCAGGUCAAAACUUCCAUGCUGAUCAGUGGUGGGAUCACAUCUGUGAAUAGCCACUGCACUCCAGCCUGGGCAACUUAUUGAGACCCCGUCUCUAAA
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SRP_00178	[ FASTA input ]	GUCGAGCUUAGUAAUGUGGGCUUGUAACCCAAAUGGGGGCAUUAAUGUGGUGGAAUGUUGGGCUGUACCAGAUGGUUGGGCUUGGUGGGCUAAUUUCUGACUUGCCCUAUCCAAGCUUAGAGUUGGAUCAUGUGGCCCAAUUGAAGAAAUGGACUACUUGAUUCGUAAAGUGGGGCGGAAUGCGUGAGGCUGGUUUCACAGAGCAACGAUAAGUUUCCGCUCUAAGCGGUGGAAGGAUAACGAGUCGGUGUUCUCUGAGUCCAGUAAUGCCUGAUGGGCUGCUCUAAUUAAACCACCACUUUU
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SRP_00179	[ FASTA input ]	GCCGAGCUCAGUAGCGUGGGCUUGUAACUCAAGUGAGGGCAUCAGUGUGGUGGAAUGUUGAACAUGCCCAGAAGGUAGGGCUUGUGUGACAAUUCUCUGGCCUGCCCUGUCCAAGCAAAGAGUUGGGUCUUGUGGGCCAAGCGAAGGCUUGGGCUGCUGGGCUCCUAAAGUGGGGUGGACUGCGUGAGGCUGGUUUCACAGAGCAACGAAUAGCUCCCGCUCUGUGCAGUGGAAGGAUAACGAGCCAGUGUCAUAUAAGUUCAACGAAUGUCUGAUGGGCUGUUCUAGUUAAACUACCACAUUU
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SRP_00181	[ FASTA input ]	GUCGAGCUUAGUAACGUGGGCUUGUAACCCAAGUGGGGAUGUUAAGGUGGUGGAAUAUUGGGCUGUCCCAGAUGGCUGGGCUUGGUGGGCUAAUUUCUGGCCUGCCCUAUCCAAGUACAGAGUUGGAUCAUGUGGUCCAAUUGAAAGAAUGGGCUACUAGAUUCCUAAAGUGGGGUGGACCCGUGAGGCUGGUUUCACAGAGCAACGAAAAACUUCCGCUUUGUGCAGUGGAAGGAUAACGGACCGGUGCCUUCCAAGUUCCAUUAAUGCCUGAUGGGCUGUUCUAGUUAAACUACCACAUUUU
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SRP_00182	[ FASTA input ]	GCCGAGCUUUGUAACGUGGGCUUGUAACCCGAGUGGGGGCAACAAUGUGGUGGAAUGUUGGGUCCAUCUUGAUGGAUGGGCUUGAAGGGCUAAUGUUCUGGCCUGCCCUGUCCAAGCACAGAGUUGGGUCAAGUGGUCUAUACGAAAGUAUAGCCACUUGGCCUUUAGAGUGGGAUGGACUGCGUGAGGCUGGUUUCACAGAGCAACGACUAGUCCCCGCUCUGUGCAGUGGAAGGAUCACGGGCUAGUGCUCUUUGAGUCCUAACAAAAACCUGAUAGGUUGCCUAAUUAAACCAUCACUUUU
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SRP_00194	[ FASTA input ]	GCCGUGAUAAAGAUUACGCCCGAAUGAGUCAGGACCGGAAGGUAGCAGCUAUAAGGGAAUGUGUCUUGUAUCACGGUUUUU
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SRP_00200	[ FASTA input ]	GCAAGCCGCAUCGGUCCCCUCGCAAUGAUACGCUGUGAACCCCGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACGGUAACAGCGGACUCGUGUGCCGGGGUGUGGCUGGUGCGGUGAGCCGCCCAUU
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SRP_00209	[ FASTA input ]	GGCCCCUACGUGGUGUCAUCUCGCUGAACUUCCCCCAGGACCGGAAGGUAGCAAGGGUAGGUGGGCUCUGGCAGGUGCGUGAGGGGUCUUCACGUUU
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SRP_00213	[ FASTA input ]	GGACCCCGCGCGGCGUCUAUCCUGUGAACUCCCCCAGGGCUGGAAGGCAGCAAGGGUCAACGGGCUCUGUCGGGUGCGCGGGGUCCCCUUCA
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SRP_00215	[ FASTA input ]	GCCAUUACAACAAUUAACACGAACCAUGUCAGGUCAGAAAUGAAGCAGCAUUAAGUAUCUUAAUUGUGUGUAAUGGCUUUU
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SRP_00227	[ FASTA input ]	GGCGGGUCUCCCCGCAUGGCAAAUCGGAACACCGGGUCAGGGGCGGAAGCCAGCAGCCCACUCCAAUGCGCCAGUGCCGGGGGUUUGGCCCGCCGCCCUAUU
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SRP_00228	[ FASTA input ]	GCCGGGCAUUGUGGCGCAUGCCUGUAAUCCAGCUGCUUGGAGGCUAGAGAUGUUGAAUGGCUUGAGGUGUGGAUUCCUGAUGGCGGUCGUGCUAUGUCGAUCGGGUGUCCGCGCUAAGUCGGGCGUCAAUAUGGUGCCUUAAGAGGAGUCUCGAGUCACCAGGUUGGUUAAAGAGGAGCGUACCGGCCCAGGGUGGAAACACAGCAGGCAAAAGCUCCCGCGUUCGACAGUAGUGGGAUAGCACCUGUGAAUAGACGGCCGUCAACAGCCAUGCCAAGAUAGUCGAACUCAUCUCUCUUUUU
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SRP_00335	[ FASTA input ]	CCACGCUAGGCGGGGGGCUGGCGGUCCCCUGUACCCGAAAUCCGCCGUACGCGGGGCCGAAUUCCCACCCGAGGCUCUUCGGGUCGGGAAACGGCGUGACUCGGGGGCGAUGAAGACCGGGUCCCACGCAACGGAACCCUGUGAACCUGGUCAGGCCCGGGAGGGAGCAGCCAUAAGCAGGUGUUUCCGUGUGCCGUGGGGGAGCCCGGUUGGAGCCUUCCGAUCAUGCACGCCCCGGUCCGGAGAAGUCGACGGUGGGUGCGUGG
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SRP_00369	[ FASTA input ]	GGUGGCCCUGCCGGUCCCUCGCAACGCUAGAUCGAAAACCCCGCCAGGGCCGGAAGGCAGCAACGGUAUUGAUUGAUGCGGGUGCCGAGAUCAACCGGUGGGGCCAUC
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SRP_00383	[ FASTA input ]	GUCGGGCGGACGGUGCUGUCGCCAACCCGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCGUAACGAAUUUUUAUCGGGUCGUUCCGGC
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TMR_00017	[ FASTA input ]	GGGGCUGAUUCUGGAUUCGACGGGAUUGGCGAAGCCCAAGGUGCACGUCGAGGUGCGGUAGGCCUCGUAAAUAAACCGCAAAAAAAUAGUCGCAAACGACGAACAAUACGCUUUAGCAGCUUAAUAACCUGCAUUUAGCCUUCGCUCCCCAGCUUCCGCUCGUAAGACGGGGAUCAAGCGGAGUCAAACCUAAACGAGAUCGUGUGGACGCUUCGGCUUGGAGAUCGAAACACUAAAUUGAAUCAAGCUAGUUUAUUCUUCGCGUGUCUGUCCGCAGGGGAUAAAUGAAGUUAAAGACCAGACUAAACGUGUAGUGCUGAAGGUAGAGUAAUUUCGGACGCGGGUUCAACUCCCGCCAGCUCCACCA
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TMR_00042	[ FASTA input ]	GGGGACGUUACGGAUUCGACAGGGAUAGUUCGAGCUUAGGUUGCGAGUCGAGGGGAUCGGCCUCGUUAAAACGUCAAAGCCUAUAAUUGGCAAACAAAACAAUCUUUCUUUAGCUGCUUAAUUGCACUAAAGGUUCCUCCCUCCAUCGUCCAUGUGGUAGGGUAAGGGACUCAAACUAAGUGGACUACGCCGGAGUUCGCCGUCUGAGGACAAAGGAAGAGAACAACCAGACUAGCAACUUGGAAGCCUGUCGAUAGGCCGAAGAGUUCGCGAAAUGCUAAUAUAUCGACUACACUCGUAGAAGCUUAAGUGCCGAUAUUUUUGGACGUGGGUUCGACUCCCACCGUCUCCACCA
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TMR_00082	[ FASTA input ]	GGGGCUGUUUUUGGAUUUGACAAAAUUAUCAACAAAGUAAAGUGCAUGCCGAGGAACGGUUUGCCUCGAUAAAAGCCGUAAAAAAAUAAUUGCAAAUAAUAAACAAAACUACGCUUUAGCAGCUUAAAAAACUGAAUAAAGCCCUUCCUUCUUAUCCUCCUUCUCUUAGGAUGAGAAAACAGGAAGGUCAGAAAAAGAGAAAAACGUGGAUAUCAAGCUUGACGAUAACACGAAGUAGUUUUUUCAAGCUAUAUACCUAAUAUGUGUUUUUCCAAAUUAGGUAAUGAAUUCAAUAAAGAAAAAACUAAGCAUGUAGGGCUUUAUUAGUAGAAAUUUUGGACGCGGGUUCGAAUCCCGCCAGCUCCAAAA
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TMR_00123	[ FASTA input ]	GGGGCUGAUUCUGGAUUCGACGGGAUUCGCGAAACCCAAGGUGCAUGCCGAGGUGCGGUAGGCCUCGUUAAUAAACCGCAAAAAAAUAGUCGCAAACGACGAAAACUACGCUUUAGCAGCUUAAUAACCUGCUCAGAGCCCUCUCUCCCUAGCUUCCGCUCUUAAGACGGGGAUCAAAGAGAGGUCAAACCCAAAAGAGAUCGCGUGGAUGCCCUGCCUGGGGUUGAAGCGUUAAAACUAAUCAGGCUAGUCUGGUAGUGGCGUGUCCGUCCGCAGGUGCCAGGCGAAUGUAAAGACUGACUAAGCAUGUAGUACCGAGGAUGUAGGAAUUUCGGACGCGGGUUCAACUCCCGCCAGCUCCACCA
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TMR_00137	[ FASTA input ]	GGGGCGGAUCUAGGAUUCGACAAGAUUCAUGAAACUCAAGGUGCAUGCCCAGGGGCGGUUUGCCUGGUAAAAAGCCGCAAAACUAUAAUUGCUAACGACGAUACGUUCGCACUAGCCGCUUAGGCUAGCCAUCGCCUUGAAAUCUCUCCUAUUGGUUAGAGGAUCGAUGGUCACCCCAAAUAGGAUAGCGAGGGAAGCACGCUUGAGGCUGAACCGCGAAAUAGUAUCAAGCUCACCAUGACGAAGCCUGUCGCUUGGCGUCUAAUUGGUUAAAUAAAUGAGCGACUAAGCAUGUAGUACCGAGAACGUAGGCUUUUUGGACGGGGGUUCGAUUCCCCCCCGCUCCACCA
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• N/A - RNA 2D structure in Vienna format could not have been generated (most likely due to difficult to represent pseudoknot structure). Check secondary structure file for details.