|
ASE_00210
|
[ FASTA input ]
|
AGGGGGCUGGUGACUAUCCAAUUGGGAGGAAGCUCCGCCCACCCAUUAUGUGCAACAAUCCCGAGAGGGAUUGAAUGGGGCAUAGAAACGACACGGCCUUAAAACAGAUGACGAUGAUAUCCGAAAAUUGAGGAGUUUUAAGGAAUCGGUGAAACGGCCCCAUUCUGCACGGGUGCAAGCAUUAGCGUUUAGCUGAAUGUCGCCGAAAUUACAGAAGGCGGGCUAUAGCCCCCA |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((((...((.....))....[[[.[[[[[(((((...(((((....((((((....))))))(((((((((............((((((((((((.............((......))......)))))))))..)))........)))))))))))))))))))...((....))............))))))............]]]]]]]]..))))))))
|
| [ predicted structure ] |
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|
|
CRW_01535
|
[ FASTA input ]
|
GUCUACGGCCAUACCACCGGGAAAAUACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUCAAGCCCGGUAGGGCCAGGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUACCUGGUGCUGUAGACUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((....((((((((.......((((..((....))..))))........)))))).)).((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))).)))))))))..
|
|
PDB_00012
|
[ FASTA input ]
|
GGCAGAUCUGAGCCUGGGAGCUCUCUGCC |
|
[ reference structure ]
|
..(((....((((......)))).)))..
|
| [ predicted structure ] |
((((((...((((......))))))))))
|
|
RFA_00390
|
[ FASTA input ]
|
GAUAAGUCUGUGCUAAGCACACUGAUGAGUCUCUGAAAUGAGACGAAACUUAUC |
|
[ reference structure ]
|
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.(((((...))))).......(((((......)))))...)))))))
|
|
RFA_00416
|
[ FASTA input ]
|
CAAAAGUUUGGGCUAAAGCCCACUGAUGAGCCGCUGAAAUGCGGCGAAACUUUUG |
|
[ reference structure ]
|
.((((((.(((((....))))).......((((........))))...)))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.(((((....))))).......(((((......)))))...)))))))
|
|
RFA_00433
|
[ FASTA input ]
|
GAAGAGUCUGCGCUAAGCGCACUGAUGAGUCUUUGAAAUAAGACGAAACUCUUC |
|
[ reference structure ]
|
.((((((.(((((...))))).......((((........))))...)))))).
|
| [ predicted structure ] |
(((((((.(((((...))))).......(((((......)))))...)))))))
|
|
RFA_00587
|
[ FASTA input ]
|
GGCUGGUCCGAUUGCAGUGGUACUUAUAAUUAAUUGAUCACAGUCAGUUACAGGUUUCUUUGUUCUUUCUCCACUCCCACUGCUUCACUUGACUAGUCU |
|
[ reference structure ]
|
((((((((.....(((((((........................................................))))))).......)))))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((((((.....(((((((...........(((((((....)))))))((((......)))).............))))))).......)))))))).
|
|
RFA_00626
|
[ FASTA input ]
|
GUUUCCGUGUCCAUCCUUGUUAAAACAAGAAAUUUUACGGAAUAACCCAUUUUGCCCGACCGAUCAUCCACGCAGCAAUGGCGUAAGACGUAUUGAUCUUUCAGGCAGUUAGCGGGCUGCGGGUUGCAGUCCUUACCGGUAGAUGGAAAUAUUUCUGGAGAGUAAUACCCAGUCUGUUUCUCUGAUAAUUGCGCUGUUUUUCCGCAUGAAAAACGGGCAACCGACACUCUGCGCCUCUUUGAGCUGACGAUAACCGUGAGGUUGGCGACGCGACUAGACACGAGGCCAUCGGUUCACACCCGGAAAGGCGUUACUUUGCCCGCAGCUUAGUCGUCAA |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((.....(((((........))))).....)))))))........((((((((..((((....(((..((....))......)))...))))..)))))))).....(((((((((((........(((((((.....(((((....(((((..........)))))...)))))........(((.(((((((((.....))))))))))))(((((........(((((..........((((((((....))))))))..............)))))..)))))......)))))))...........))))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
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|
|
RFA_00627
|
[ FASTA input ]
|
AAUUCUACGUUGAUUCUCGUUAGACCAAGAGACUUGUGGAAUAAUAAACUUUGCCUGAUCACACAAAAACGCGGCAAUGGCGUAAGACGUAAUGUGAAAUCAAGCAAUUAGCGGGCUGCGGGUUGCAGCUUGGCCGGCAAGUGGGUAAAGCUCUGUUGUCUUAAAUUCAGAAGCUACCCUUUAUAUAAAAGCGCUGUUUUUCAGAACGAAACACAGGCUUACCGAAAUAAUGCGCCCCUAUGCAGGCGACAACCGUGAGGUUGACGGCUUAGCUAGAAGACUCGGGGCCAUCGGUUUACCCGGUCAUGAGGUUAUUUUGCCCGCAGUUCUAACGCCAA |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((.....(((((........)))))....)))))))........((((((((...((((...(((..((....))......)))..))))...)))))))).....(((((((((((.......(((((((.....(((((....(((((..........)))))...)))))..........(((.(((((((((.....)))))))))))).(((((........(((((........((((((((....)))))))).................)))))..)))))....)))))))............))))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
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|
|
RFA_00628
|
[ FASTA input ]
|
CUUUCCGCGUUGAUUCUCGUUAAACAGGGAAAACGGUGGAAUUAUAAAAUUUGUCUGAUCGCGCAAAAACGCAGCAAUGGCGUAAGACGUAAUGCGAAAUCAAACAAUUAGCGGGCUGCGGGUUGCAGCUUGGCCGGCAAAUGGAAUCAGAUCUGUCGACGUAAAUCAGAGGCUAUUCCCCUAGUAAAAGUGCUGUCUUUCACAAAGAAAAGCAGGCUUACCGAGAUAAUGCGCCCCUAUGCAGGCGACAACCGUGAGGUUGACGACUUUGCGAGAAGACACGGGGCUUUCGGUUUAACUCCGGCCAUGAGGUUAUUUUGCCCGCAGCUUUGUCGAUAA |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((.....(((((........)))))....)))))))........((((((((...((((...(((..((....))......)))..))))...)))))))).....(((((((((((.......(((((((.....(((((....((((...........))))....))))).........(((.(((((((((.....)))))))))))).(((((........(((((........((((((((....)))))))).................)))))..)))))......)))))))............))))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
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|
|
RFA_00630
|
[ FASTA input ]
|
GUUUCCGCACCGAAACUUGUUAAAACAAAAAGUUUAGCGGAAUAACCCAUUUUGUCUGACCGAUCAUCAACGCAGCAAUGGCGUAAGACGUAUUGAUUUUUCAGACAGUUAGCGGGCUGCGGGUUGCAGUCCUUACCGGUAGAUAGGAUCUUCUCUGGAGAGUAAUGCCCAGGCUGCUUCCCUGAUAAUUGCGCUGUGUUUCCGUAUGAAAUACAGGCAACCGACACUCUGCGCCUCUUUGAGCUGACGAUAACCGUGAGGUUGGCGACGCGAAAUAGUCACGAGGCCAUCGGUUCAUGCCCGGUAAGGCGUCACCAUGCCCGCAGCUUAGUCGUCAA |
|
[ reference structure ]
|
.(((((((.......(((((....))))).......)))))))........((((((((..((((....(((..((....))......)))...))))..)))))))).....(((((((((((........(((((((.....(((((....(((((..........)))))...)))))........(((.(((((((((.....))))))))))))(((((........(((((..........((((((((....))))))))...............)))))..)))))......)))))))...........))))))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
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|
|
RFA_00636
|
[ FASTA input ]
|
GUGGCCGGCAUGGUCCCAGCCUCCUCGCUGGCGCCGGCUGGGCAACAUUCCGAGGGGACCGUCCUCCUCGGUAAUGGCGAAUGGGACCCA |
|
[ reference structure ]
|
...((((((...[[[[[[(((........))))))))).......(((((((((((((...).)))))))).)))).....]]]]]]...
|
| [ predicted structure ] |
.((.(((((.((((.(((((......))))).))))))))).)).((((((((((((......)))))))).))))..............
|
|
RFA_00654
|
[ FASTA input ]
|
UUCAUGUCUUAAAGGAAGAAACAGCUUUCAAGUGCCUUUCUCCAGUUUUUCCAUGAGCGCAAGAUUAUUA |
|
[ reference structure ]
|
....(((((((((............)))...((((.(((.((.........)))))))))))))))....
|
| [ predicted structure ] |
.............(((((......)))))..((((.((................))))))..........
|
|
RFA_00658
|
[ FASTA input ]
|
AUCCAGCUGACGAGUCCCAAACAGGACGAAACGCGCGUCAAACUGCAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((())))....))))))
|
| [ predicted structure ] |
...(((.(((((.((((......))))........)))))..)))...
|
|
RFA_00664
|
[ FASTA input ]
|
CCCUGGCUGACGAGUCCCAAACAGGACGAAACGCGCGUCCUGGAU |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
....((((....)))).....(((((((.......)))))))...
|
|
RFA_00703
|
[ FASTA input ]
|
CUUUCCCUGAAGAGACGAAGUGAUCAAGAGAUUGAAGACGAGUGAACUAACGACUCCUCCUUCUCUCACAAGUCGAAACUCAGAGUCGGAAAG |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((.....................................................))))...((((.)))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((...(((...((((....((((..((.((...((......))...)).))..))))))))..))).....))))....))))))
|
|
RFA_00708
|
[ FASTA input ]
|
GCACUUCUGAAGAGUCCCAUGCUAGGACGAAACAGCCUUCCAGUAC |
|
[ reference structure ]
|
((((((.......((((.......))))...(((()))).))))))
|
| [ predicted structure ] |
......(((....((((.......))))....)))...........
|
|
RFA_00749
|
[ FASTA input ]
|
GGGAGCCGCGGCCACGCCGAGUAGGAUCGAGGGUACAGCUCCC |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((((....(((.((((.....))..))..)))...))))))
|
|
RFA_00764
|
[ FASTA input ]
|
CAAUCCCGAGGCCACGCCGAGUAGGAUCGAGGGUACAGGAUUG |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((((....(((.((((.....))..))..)))...))))))
|
|
RFA_00765
|
[ FASTA input ]
|
GAAAGCCGAGGCCACGCCGAGUAGGAACGAGGGUACAGCUUUC |
|
[ reference structure ]
|
.(((((....(((.((((.....))..))..)))...))))).
|
| [ predicted structure ] |
((((((....(((.((((.....))..))..)))...))))))
|
|
RFA_00767
|
[ FASTA input ]
|
GCACUCUCUAUCAGAUUGGAUGUCUUGCUGCUAUAAUAGAUAGAGAAGGUUAUAGCAGACUA |
|
[ reference structure ]
|
....((((((((...............[[[[[[[[[[.))))))))..]]]]]]]]]]....
|
| [ predicted structure ] |
...........................((((((((((...........))))))))))....
|
|
RFA_00768
|
[ FASTA input ]
|
ACACUCUCUAUCAGAAUGGAUGUCUUGCUGUCAUAACAGAUAGAGAAGGUUGUGGCAGACCC |
|
[ reference structure ]
|
....((((((((...............[[[[[[[[[[.))))))))..]]]]]]]]]]....
|
| [ predicted structure ] |
...........................((((((((((...........))))))))))....
|
|
RFA_00769
|
[ FASTA input ]
|
UUGGUCUUGCACACAACGGUAAGCCAGUGGUAAUGUCAGUGCAAGAAGGAUAUUACCAUAGCA |
|
[ reference structure ]
|
....((((((((..............[[[.[[[[[[[.))))))))..]]]]]]].]]]....
|
| [ predicted structure ] |
..((.(((((........))))))).(((((((((((...........)))))))))))....
|
|
RFA_00770
|
[ FASTA input ]
|
CUACUCUUGUACAGAAUGGUAAGCCAAGUGUCAAUAGGAGGUACAAGCAACCUAUUGCAUAUUA |
|
[ reference structure ]
|
....((((((((...............[[[.[[[[[[[..))))))))..]]]]]]]]]]....
|
| [ predicted structure ] |
................(((....))).(((.(((((((..((....))..))))))))))....
|
|
RFA_00773
|
[ FASTA input ]
|
CUAGUCUUAUACACAAUGGUAAGCCAGUGGUAGUAAAGGUAUAAGAAAUUUGCUACUAUGUUA |
|
[ reference structure ]
|
....((((((((..............[[[.[[[[[[[.))))))))..]]]]]]].]]]....
|
| [ predicted structure ] |
..................(....)..(((((((((((...........)))))))))))....
|
|
RFA_00779
|
[ FASTA input ]
|
CUACUCUUGUACAGAAUGGUAAGCACGUGUGAUGGGAGGUACAAGCAACCCCAUUACAUAUUA |
|
[ reference structure ]
|
....((((((((..............[[[[[[[[[[..))))))))...]]]]]]]]]]....
|
| [ predicted structure ] |
..........................((((((((((..(......)...))))))))))....
|
|
RFA_00805
|
[ FASTA input ]
|
UAACUAGAUUACAGAGAUGUGAUGGAAAAUAGUUGAUGAGUUGUUUAAUUUUAAGAAUUUUUUAUCUUAAUUAAGGAAGGAGUGAUUUCAAUGGCACAAGAUAUCAUUUCAACAAUCAGUGACUUAGUAAAAUGGAUUAUCGACACAGUGAACAAAUUCACUAAAAAAUAAGAUGAAUAAUUAAUUACUUUCAUUGUAAAUUUGUUAUCUUCGUAUAGUACUAAAAGUAUGAGUUAUUAAGCCAUCCCAACUUAAUAACCAUGUAAAAUUAGCAAGUGAGUAACAUUUGCUAGUAGAGUUAGUUUCCUUGGACUCAGUGCUAUGUAUUUUUCUUAAUUAUCAUUACAGAUAAUUAUUUCUAGCAUGUAAGCUAUCGUAAACAACAUCGAUUUAUCAUUAUUUGAUAAAUAAAAUUUUUUUCAUAAUUAAUAACAUCCCCAAAAAUAGAUUGAAAAAAUAACUGUAAAACAUUCCCUUAAUAAUAAGUAUGGUCGUGAGCCCCUCCCAAGCUCGCGGC |
|
[ reference structure ]
|
.......((((((....)))))).....(((((((.(((((((((((...((((((........))))))........((((((((.((..........)).)))))))).....((((((((...........).)))))))...((((((....))))))........((((.(((((....((((.......))))..)))))))))..((((((((((....(((((.(((((((((.........))))))))))))))...(((((((((((.....))))))))))).(((((..........)))))))))))))))........((((((((......))))))))....((((......))))...)))))))).)))((((((((.....)))))))).....((((((((..((((((.............)))))))))))))))))))))..........................(((((((((.........)))))))))
|
| [ predicted structure ] |
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|
|
RFA_00808
|
[ FASTA input ]
|
CUUCCGAUGUAGGCCCGUAUUCUUCGCCUGUACCACGGGUCGGUUUUAGUACAGGCGUUUUCUU |
|
[ reference structure ]
|
...........(((((((......[[[[[[[[[.))))))).......]]]]]]]]].......
|
| [ predicted structure ] |
........................(((((((((...............))))))))).......
|
|
RFA_00809
|
[ FASTA input ]
|
CUUCCGAUGUAGACCCGUCCUCCUUCGCCUGCGUCACGGGUCCUGGUUAGACGCAGGCGUUUUCUG |
|
[ reference structure ]
|
...........(((((((.......[[[[[[[[[.))))))).......]]].]]]]]].......
|
| [ predicted structure ] |
.....((((......))))......((((((((((.(........)...)))))))))).......
|
|
RFA_00814
|
[ FASTA input ]
|
ACGUAGCUUAAAACGUUUGGUUCACAUACAUCUGCCUGCUGCCUUGGCACAAUAUCAAAAAGGCAUAAACAUCGCACAUAAUGGUUAUUUACGGCUAUGAGGAUGGUUUUAGUACGUAGGCGUUGCGGAACUUCGGUUCGGAUAGAGCAAUGAAUCGUGCAUGCUAGGAACUGACCAAAUAACGCAGCCCUAGUAUCUUUCGAAGAUUUCCAUACCUUUGCGAUC |
|
[ reference structure ]
|
.......................................((((((..............)))))).....(((((......................(((((.(((.....(((((....(((((((((((....)))))......))))))...))))).((((((......................))))))..............)))..)))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
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|
|
RFA_00816
|
[ FASTA input ]
|
GCUUGAUCUCUGUAUUUGUUUCUAUUUUGAACAUUUGCCUGCUACCUUGGCAUAACAUCAAUAAGGUACAAACAUCGCAAAAAGUCAUCAUAAGGUGGGUUUUAGUACGUAGGCGCUGUAGAACUUAAUUGUUCUGAUAGAGCAGCGAGUCGUGCAUGCUAGUCUAACAUUUCUUGCUACCUAGUAUCUUUAGAAGAUUUCCCUCCCUUAGCGGUC |
|
[ reference structure ]
|
..........................................((((((..............)))))).....(((((............(((((.(((.....(((((....(((((((((((......)))))......))))))...))))).((((((..................))))))..............)))..)))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
...........(((..((((.(......)))))..))).((.(((((((............)))))))))...(((((............(((((.(((.....(((((....(((((((((((......)))))......))))))...))))).((((((..................))))))(((.....)))...)))..)))))))))).
|
|
RFA_00817
|
[ FASTA input ]
|
AUGUACUAACCUCUAGCUUUUCUUAUACCUUUUGCCUGCUACCUUGGCAUUACAUCUAAAAAGGUACAAACAUCGCAUUGUCAUAAAGAGGUGGUUUUAGUACGUAGGCGCUGUGGGACUUCAUUGUCCCGGUGAUGCAGUGAAUCGUGACUACGAGAUUGUCCAGUAGUUGGUGCUCGUAUCUUUAGAAGAUUUCCUUCCUCGGCGAUC |
|
[ reference structure ]
|
.......................................((((((...............)))))).....(((((..........((((((((.....(((((....(((((((((((......)))))......))))))...))))).((((((..................))))))..............))).)))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
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|
|
RFA_00818
|
[ FASTA input ]
|
ACCUAGCCGAAACACUAUGUUGGAAAGAAGACGCUUGCUACCUAGGCAUAAUGUAAAAUUAGGUAUAAACAUCGCAGUUGUAAACUUGAGGUGGUUUAGUACGUAGGCGUGAUGAUGACUUGUUGAAGUGAAACCACGAAUCGUGCUCGCUAUUACGUUGGCCCUUAAUAGUAUCUAUGAAGAUUUCCCAUCCUCAGCGGUC |
|
[ reference structure ]
|
......................................((((((...............)))))).....(((((...........((((((((....(((((....(((((((((((....))))).....))))))...))))).((((((..............))))))..............))).)))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
......................................(((((((.............))))))).....(((((...........((((((((...((((((....((((......((((....)))).....))))...)))))).(((((((..........))))))).(((....)))....))).)))))))))).
|
|
RFA_00819
|
[ FASTA input ]
|
ACUUAGCUAAAUCGUUUGGUUCAAAACAUUUGCUUGCUGUCUUGGCAUAACAUCAAUAAAGGCAUAAACAUCGCAAAAUAAUGGUUAUAAUUAAAUGGCUAUGAGGAUGGUUUUAGUACGUAGGCGUUGCGGAACUUCGGUUCAUAUAGAGCAAUGAAUCGUGCAUGCUAGGAAAACUGACCACACACAGUGUUGGCAGACCUAGUAUCUUUCGAAGAUUUCCAUACCUCCGCGAUC |
|
[ reference structure ]
|
.....................................((((((...............)))))).....(((((...........................(((((.(((.....(((((....(((((((((((....)))))......))))))...))))).((((((..............................))))))..............)))..)))))))))).
|
| [ predicted structure ] |
.....((......((((......))))....))....((((((...............)))))).....(((((.......(((((((......))))))).((((((((.....(((((....((((((.((((....)))).......))))))...))))).(((((((....(((.((((((...))).)))))).)))))))(((.....)))...)))).)))).))))).
|
|
SRP_00084
|
[ FASTA input ]
|
GGCGGGCCUCCCCGCAUUGCACGGUAGCGAACCUGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCACAGUUAUUCAGUGCAAGUGCCGGGGGUCGGGCUCGCCACCCCUCCC |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..)))))))...))))))...)))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...)))))).))).))))...))))))))).........
|
|
SRP_00134
|
[ FASTA input ]
|
CUGAUAGCUGGGUCCCGCGCAACGGUAGGUUAUGAACCCCGCCAGAUCCGGAAGGAAGCAACGGUAGUAGCUGAUUCCGUGUGCCGCGGGGGAGCCCAGCUAUCAGUUGU |
|
[ reference structure ]
|
...(...(((((((((.((((.(((.(.(((((.....(((.....(((....))).....)))..)))))...).))))).....)).)))).)))))........)..
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((((((((((((((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))....)))).)).))))))...)))))))))))))....
|
|
SRP_00137
|
[ FASTA input ]
|
ACUCGGGAAAUACGUUAUUAAUAGCUUAAACUUGUCAGGACUGGAAAGUAGCAGCAAUUCAGCUUAAUUACAUAAGGUGUUUUCCGGGUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((....((.(...((((.....((((....(((....)))....))))...))))..).))....)....))))))))))...
|
| [ predicted structure ] |
(((((((((((((.(((((((.((((.....((((....(((....)))....))))...))))...))).)))).)))))))))))))...
|
|
SRP_00146
|
[ FASTA input ]
|
CUCUUAUUUAGACCUAUGCAAUAGGAUUUUAGGGUAACGCUUCAGGGUAGGAAUACAGCAGAGUCCCCUAAUUUCUUGUGUGCCUUAGCCAUCUGAAUAGGAG |
|
[ reference structure ]
|
((((((((((((.(((.((.((((((..((((((....((((....(((....)))....)))).))))))..)))))))...).)))...))))))))))))
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((.(((.(((((((((..((((((....((((....(((....)))....)))).))))))..)))))).)))..)))...))))))))))))
|
|
SRP_00200
|
[ FASTA input ]
|
GCAAGCCGCAUCGGUCCCCUCGCAAUGAUACGCUGUGAACCCCGCCAGGCCCGGAAGGGAGCAACGGUAACAGCGGACUCGUGUGCCGGGGUGUGGCUGGUGCGGUGAGCCGCCCAUU |
|
[ reference structure ]
|
((..((((((((((((.((((((.((((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))))...))))).)..)))))))))))..))........
|
| [ predicted structure ] |
((..((((((((((((.(((((((((((..((((((.....(((.....(((....))).....)))..))))))...)))).))).))))...))))))))))))..))........
|
|
SRP_00231
|
[ FASTA input ]
|
GGCGGGCCUCCCCGCAUUGUGAGGUAGUGAAUCUGGUCAGAUCCGGAAGGAAGCAGCCACAGCUAUUUUUCGCAAGUGCCGGGGGUUCGGCUCGCCACCCGUAUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((.((((((((((((.....((((....(((....)))....))))..))))))..)))))))...))))))...)))))))).........
|
| [ predicted structure ] |
((((((((((((((((((((((.(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...)))))).))).)))))...)))))))).........
|
|
SRP_00241
|
[ FASTA input ]
|
GCUCAGGAGGAUUUAUUCUCUGUAACAUCGUGGGUUCGGUUCUGCGUGUGCUUGUAGGACUAAGAGUGAACCUGUUAUGACGCUGUGCUUUGGCUUGUCCAUUUCAAAUUAGGUGUCAACAAUGUGGGCUUAGAGUAGUCUUCGCUUUCAUGGUUGUCAAAGAAGUCGGGAAUGCCUCAGGCUGGCAACAGAGCAGGGAAAACGACUCGCACUUAAUAGUGAAAGGAUAGCAAGCCUUUAUAGCGUCGAAGGUUAUCGCUUGGCUCCUAACUGGUAUUCGCAUGGCUGUGGCAUCAAUACCUUU |
|
[ reference structure ]
|
..((.(((((((..))))))).....(((...)))..)).......(((((((..((.(((..(..((..........(...(.(((((..(((((((((.(((...(((((((((((((.(((.((((..(((....)))..)))).))).))))(...)..(((((....(.(((....(((....)))....))).)..))))).)))))))))...))).))...))))))).....))))).)....)..............))..)))).)).........).)))).))........
|
| [ predicted structure ] |
.....(((((......)))))...............((((..((((.(((((.(((((((((((....(((((.....(((((((((....(((((((((.(((((.(((((((((((((.(((.((((..(((....)))..)))).))).)))).......(((((......(((....(((....)))....)))....))))).)))))))))..)))))))...)))))))..)))))))))..)))))....))))).))))).).))))).))))..))))................
|
|
SRP_00257
|
[ FASTA input ]
|
AUCCGGCUGUAUGCUCCUCGGGGUAUGCAGCUGUAACCGUAAGGGGAAAGCAAAGUAAUUUGCGCAGCCUUUAAGGGAUGUUACUCAUGCCACGAGAAAUUCAAUAUAUAAGAGCUCUCGUCUAUUGCAAGAUAUAAGUUACUGAGCAUGUUAUGUUGGAAAGAUAACAUGCUGUAGUAAUAAUGAAUUGCGGAACGCCUUAGGCUGGAAACAGAGCAGGGUUAGCAAUCGCUUGUAUACGGUGCAAAGUUUGCGAUGAGCGAUUAGUAUAUCUCGAAUCUCGUCAAGCAUGGUAAGCACACCAAUUGGUUGUUUUUUUU |
|
[ reference structure ]
|
(((((((((((((((((..))))))))))))).....(.((((((....(((((....)))))....)))))).)))))(((((.(((((.((((((..(((.((((((.((.((((((((((.(((((..((((((((((((.((((((((((.((....))))))))))))..))))(...)..(((((.....((((....(((....)))....))))..))))).))))))))....)))))))...)))).))))..)).))))))...)))))))))...)))))))).))......................
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| [ predicted structure ] |
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SRP_00285
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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| [ predicted structure ] |
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SRP_00308
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[ FASTA input ]
|
CCGUGCUAGGUGGGGAGGUAGCGGUUCCCUGUACUCGAAAUCCGCUUUAUGCGAGGCUUAAUUCCUUUGUUGAGGCCGUAUUUUUGCGAAGUCUGCCCAAAGCACGUAGUGUUUGAAGAUUUCGGUCCUAUGCAAUAUGAACCCAUGAACCAUGUCAGGUCCUGACGGAAGCAGCAUUAAGUGGAUCAUCAUAUGUGCCGUAGGGUAGCCGAGAUUUAGCUAACGACUUUGGUUACGUUCGUGAAUUACGUUCGAUGCUUAGGUGCACGG |
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[ reference structure ]
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| [ predicted structure ] |
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SRP_00328
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[ FASTA input ]
|
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[ reference structure ]
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SRP_00329
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SRP_00331
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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SRP_00338
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[ FASTA input ]
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[ reference structure ]
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| [ predicted structure ] |
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SRP_00340
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[ FASTA input ]
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GGUGAGCGUAACGUCUCGCUGUCACCUGAGUGGGGGUCGUCCGUUGGUGGCAGGAGAAUCGCGCUUCCCUGCCUGGCACCGGGUACAAGUGACAAUCUGCCCCUUGCAAGGCCGCAGUCUCCGGUGGGAUGGGGACGGAGGUCCCCAUCUCUCGGGUGAUGAUGAGACGCGCAACGCCUCAGGCUGGAAACAGAGCAGGGAAAAGUGUCCGCUGUGGCGCAGAGCAGGGAUCACAGAGUGUCACCCCGGCUGAACAGGGCAGGUGGAGGAGCUCCUCACACCGCGUUU |
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[ reference structure ]
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SRP_00357
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[ FASTA input ]
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GGGGGCCCUGGUCCUCCCGCAACACUAGUUCGUGAACCUGGUCAGAUCCGGAAGGAAGCAGCCACAGCGGAUGAUGUGUGUGCCGGGAUGUGGCUGGGGUCUCC |
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[ reference structure ]
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| [ predicted structure ] |
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SRP_00367
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[ FASTA input ]
|
GGUGGCCCCGUCGGUCCCUCGCGACGCUAGAUCGAAAAUCCCGCCAGGGCCGGAAGGCAGCAACGGUAUCGAUUGAUGCGGGCGCCGAGGUCAACCGGCGGGGACACCACCCCACUC |
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[ reference structure ]
|
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| [ predicted structure ] |
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