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| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
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|
Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CMfinder(20)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CRWrnafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Carnac(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidAlifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidAlifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidHomfold‑LAST
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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ContextFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
DAFS(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
DotKnot
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Fold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
MXScarna(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
MXScarna(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Mastr(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Mastr(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Multilign(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PETfold_2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PETfold_pre2.0(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PETfold_pre2.0(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PPfold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAalifold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....(..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................((.(...(..............((......................................).)...............))..........)).)..... |
|
RSpredict(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((((.((.....((.....((((.((((((...)))))).))))................................(((((((...))))))).....................................((((((((((((...((((.....(((((((((((.(((((........))))).))))))))))).....))))...))))).)))))))...........((((((.......))))))..(((((((....))))))).............................................................)).......((((((.....((((((((....)))))))).................((((((((((....))))))).))).........))))))....)).)))))))))).... |
|
TurboFold(20)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((((.((....(((((((.((((.((((((...)))))).)))).(((...)))...(((((((............(((((((...)))))))((((....))))..((......)).........((((((((((((((((...((((.....(((((((((((.(((((........))))).))))))))))).....))))...))))).)))))))...))))....((((((.......))))))..(((((((....)))))))...(((......))).)))))))..........(((((..(((.........)))))))).((.........)).......((((((((....))))))))..........)))))))((((((((((....))))))).)))...................)).)))))))))).... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((((((((.((((.((((((((.((((.((((((...)))))).))))..((.(((..(((((...(((((((((..((((((((((...)))))..)))))...((....)).....((((.((.....((((((((((((((((...((((.....(((((((((((.(((((........))))).))))))))))).....))))...))))).)))))))...))))....((((((.......))))))..(((((((....)))))))..(((((....(((....)))......)))))....)).)))))))))))))...))))).))).))....))))))))..((((((((....)))))))).............))))((((((((((....))))))).)))..........((....))....)))))))))).... |
