RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - ASE_00046

RNA: ASE_00046
Rfam family: RNaseP_bact_a

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Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((.(((((((.((((((.....))))))...(((...(((((..............(((((.....)))))..(((....)))..(((....((((...............((((....))))....((((....(((.........)))))))(((((..(((....)))..)).))).))))..))).....)))))..((((((.(((..((((....))))))).))))))......((((((((....))))))))...)))....))))))).(((.(.(....).))))...)))))))...))
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((.((((((((.(((((((....))))))).((((((((.(((....(((......((((((...))))))...((((.((((......((((..............))))((((....))))...)))).....(((.((((....)))).....(((..(((....)))..))))))......))))..)))..)))..((((((((((.........)))).....))))))))))).((((((((....))))))))...)))...)))))))).(((...........)))...)))))))))...
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CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((.........((((......))))......(.(((((((((..............(((((.....))))).((((....))))...........................((((....))))............((.(((.......))).))..(((..(((....)))..)))..................))))...((((((......................))))))......((((((((....))))))))...........................)))))).....)))))))))...
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((.........((((......))))....(((.(((((((((..............(((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((.((((....))))...)).......((.(((.......))).))(((((..(((....)))..))).)).)))..)))).....))))...((((((......................))))))......((((((((....))))))))...........................))))))))...))))))))....
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Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((((.....((((((((((((...)))))))......))))).................((((((...)))))).((((....))))..((.((((..............))))))...((((((((...((((((((((.(((.......))).))..(((..(((....)))..)))(((..(((.........)))))).....((((((.....)))))).))))).))).)))))))).((((((((....))))))))...(((((.((((..(((......)))))))..))))).))))))))...
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McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((.(((((((((((((((...))))))).....[[[[[((((.........(((((((((((...)))))).((((....)))).((((((((................((((((((..........((((....(((.........))))))).)))....))))).........))))).....))))))))))))...((((((......................))))))......((((((((....)))))))).........))))))))..........]]]]]......)))))))))...
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RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((....(((((...((((((......))))))..))))).................((((((...))))))...((((.....(((((....((((...............((((....))))................((((...((((.(((((.....))))).........))))......))))....))))......(((((((.....))))))).......)))))..(((((((((((((....))))))))................))))).....))))........)))))))))...
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RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((.((((((((((((((.....))))))...(((...(((((..............(((((.....))))).((((....)))).(((....((((...............((((....))))....((((....(((.........)))))))..(((..(((....)))..)))....))))..))).....)))))..((((((.(((..((((....))))))).))))))......((((((((....))))))))...)))...)))))))).(((...........)))...)))))))...))
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((.(((((((.((((((.....))))))...((((((((((((...(....((((((((((.....)))))...((((..((....))(((((((................((((....))))....((((....(((.........))))))).))((..(((....)))..)).)))))....))))))))).))))).((((((.(((..((((....))))))).))))))))))).((((((((....))))))))...)))....))))))).(((...(....)..)))...)))))))))...
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((.(((((..........)))))..((....(((.((((((....((((((((((...((((((((((...((((.((((.(.((((...)))).)..((((...((((.(((((((((..))).(((...((..((((((((...)))).))))))....))))))))..).))))....))))..)))).).)).)....)))).))))))..(..).))))))))))...((((.((((.((((((((...).))))))).................))))))))).))))))))...)))))))))...
RSpredict(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((......................................................................................................................................................................................................................................(....................(.....)..............................((.......)).........))))...
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((..((((((.((((((.....)))))).........(((((..............((((((...))))))..(((....))).........((((...............((((....))))............((..(((......))).))..(((..(((....)))..)))....))))..........)))))..((((((......((((....))))....))))))......((((((((....))))))))..........))))))......................)))))))))...
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Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((.....)))))..((((((.....))))))................((((...((((.(((((.....))))).((((....))))......(((aaa...........))).((((....))))......(((((.....((((....)))).((((.....))))......)))))...))))..(((.....AAA......{{{{{..))).[[[[}}}}........}))))]]]]...((((((((....))))))))...(((((..<<<<<<.................)))))...>>>>>>...

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