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| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
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|
Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CRWrnafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CentroidAlifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CentroidHomfold‑LAST
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
DAFS(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Fold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((.((((..((((((.(((((((((.....)))))))))..........................................................(((((((((....)))).)))))............................................................((((........))))..(((((.((....)).)))))........................((((.....(((((((.((((((....))))))..((((.....))))...)))))))....)))).............))))))....((((((.....))))))....................)))))))))).... |
|
MXScarna(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Mastr(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((..((.((((.((.((((....((((((.(((((.((.((.....))...)).)))))(((.....))).))))))..((((((.....))))))(((((((((....)))).))))))))).)).))))))...........(((((..(((((....)))))..))))).....)))))....((((((...(((((((.((....)).))))).))..............(((((...........((((((((((((((....))))))).((((.....))))...))))))).(((((((((((((......))).))).(..((((((.....))))))..).........))))))).)))))))))))... |
|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................(....(...)......).......... |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((....(((((.((.((((....((((.(.(((((.((.(((...)))...)).))))).)))))...((((((..((((...))))..)))))).(((((((((....)))).))))))))).)).)))).)...........(((((..(((((....)))))..))))).....)))))....((((((....((((((.((....)).))))).)...............(((((...........(((((((.((((((....))))))..((((.....))))...))))))).(((((((((((((......))).)))....((((((.....))))))............))))))).)))))))))))... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..(((((..((.((((.((.((((....((((((.(((((.((.((.....))...)).)))))(((.....))).))))))..((((((.....))))))(((((((((....)))).))))))))).)).))))))...........(((((..(((((....)))))..))))).....)))))....((((((...(((((((.((....)).))))).))..............(((((............(((((((((((((....))))))).((((.....))))...))))))..((((((((..(((......)))(((.....((((((.....))))))....)))....)))))))).)))))))))))... |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
....((((.((((..(((((.....)))))..)))))))).........((((..........))))..(((...........))).(((.....))).(((((...(((....))).(((((.............))))).........))))).(((((....)))))..((((........((((........))))..(((((.((....)).))))).........))))..(((((((..((((.....(((((((.((((((....))))))..((((.....))))...)))))))....))))...................(((((((((....))))).((((.....)))).))))....)))))))....... |
|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
..((((......((((((((..(((((((.....))))))).((((...((((....[[[[[.)))).....(((((((..(((.....)))..)))).(((((...(((....))).(((((.............))))).........))))).(((((....)))))....]]]]]..)))((((........))))..(((((.((....)).)))))..........))))..........((((............(((((((....))))))).((((.{{{{)))).........}}}}.))))............))))))))...(((((....))))).((((.....)))).(((.....))).))))...... |
