RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - ASE_00066

RNA: ASE_00066
Rfam family: RNaseP_bact_a

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Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.((((......((.((((((((.....)))))))).)).(((.(((((.(((...(((.(((...((((((..((((....))))..))))))...((..(((((..(((.((((((((.....)))..))))).)))..((((((((((......)))))))...)))......(((((((....((((........))))....)))))))))))).))....))).))).......((((..((..(((((((((((((....)))))...((((.....)))).))))))))..)).))))((((((......))).)))..((((((((.....))))))))....)))))))))))...))))))))))
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Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.((((((..((((((((((((((...)))))))))......((((..........))))......((((((..((((....))))..)))))).((((((.......))))))((((((.....)))..))).........(((((((((......)))))))..)).......(((((((........)))).((((((.((....)).))))).)..........)))..((.((..((((..((..(((((((((((((....)))))...((((.....)))).))))))))..)).)))))).))..........(((...((((((((.....))))))))..)))....))))).)).))))))))))
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Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.(((((((.((((((((((((((...))))))))).(((...)))....((((.((.(((((((.((((((..((((....))))..)))))).(((((((((....)))).)))))........(((........))).((((((((((......)))))))...)))......(((((.......))).))..((......))...))))))).)).))))............((..((((......(((((((((((((....)))))...((((.....)))).)))))))).....)))))).(((......)))(((...((((((((.....))))))))..)))....)))))))).))))))))))
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.((((.........(((((((((...)))))))))..............................((((((..((((....))))..)))))).(((((((((....)))).)))))........................(((((((((......)))))))..))...........(((........)))...(((((.((....)).)))))........................((((......(((((((((((((....)))))...((((.....)))).)))))))).....)))).....................((((((((.....))))))))..................))))))))))
MXScarna(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((.((((.(((((((((((((((((...)))))))))............(((((........(((.(((((((................)))))))((.....(......)......)).........(((...........((((((((((......)))))))..)).).....((((((.......)))))).(.((.((((....)))).)))....))).......))))))))...(((..((..((((((...........(.......((.((...)).))).)).))))..)).))).............))))))))........................................))))))))..
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McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	........((((........(((((((((...))))))))).(((...)))........(((((((.....((((((..(((((..)))))..))))))(((((((.......))))))).((((......(((........)))....(((((((......)))))))....))))......((((........))))..[[[[[.......)))))))))))............(((((((............(((((((((.]]]]]..(((.....(((...))).))))))))))))..((((((((..............(((...((((((((.....))))))))..)))....)))))))).)))))))...
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PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.((((.(((((((.((((((((.....))))))))......(((.((.((((...(((.(((...((((((..((((....))))..)))))).(((((((((....)))).))))).((...(((((............((((((((((......)))))))...)))......(((((((....((((........))))....)))))))))))).))....)))))).))))...((((..((..(((((((((((((....)))))...((((.....)))).))))))))..)).))))...)).)))....))))))).((((((((.....))))))))..................))))))))))
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.(((((((.((((((((((((((...))))))))).(((...)))....((((....((((((((((((((..((((....))))..)))))).(((((((((....)))).)))))........(((........))).((((((((((......)))))))...)))........(((.......))).................))))))))....))))..(((.(((((((((...................(((((....)))))...((((.....))))..)))))).))).)))..((((((......))).)))..((((((((.....)))))))).........)))))))).))))))))))
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.((((.(((((((((((((((((...))))))))).(((((.......((((.....(((((...((((((..((((....))))..)))))).(((((((((....))))).)))).....((((((...............(((((((......)))))))..((((........((((........))))..(((((..........))))).........)))).........................)))))))))))....))))..((((.....))))....))))).....................)))))))).((((((((.....))))))))..................))))))))))
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RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.((((.(((((((.((((((((.....))))))))......(((.((.((((...(((.(((...((((((..((((....))))..)))))).(((((((((....)))).))))).((...(((((............((((((((((......)))))))...)))......(((((((....((((........))))....)))))))))))).))....)))))).))))...((((..((..(((((((((((((....)))))...((((.....)))).))))))))..)).))))...)).)))....))))))).((((((((.....))))))))..................))))))))))
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((.........(((((((((((((((((...)))))))))......(((.((.((((...(((.(((...((((((..((((....))))..)))))).(((((((((....)))).))))).((...(((((............((((((((((......)))))))...)))......(((((((....((((........))))....)))))))))))).))....)))))).))))...((((..((..(((((((((((((....)))))...((((.....)))).))))))))..)).))))...)).)))...)))))))).((((((((.....)))))))).......)).(((.....))).......
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RSpredict(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................(...).........))))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.((((..((((((.(((((((((...)))))))))...............(((.((.(((((((.((((((..((((....))))..)))))).(((((((((....)))).)))))..........................(((((((......))))))).............................................))))))).)).))).............((..((((......(((((((.(((((....)))))...((((.....))))..))))))).....))))))...........))))))..((((((((.....))))))))..................))))))))))
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.((((.(((((((.((((((((.....))))))))......(((.((.((((...(((.(((...((((((..((((....))))..)))))).(((((((((....)))).)))))......(((((............((((((((((......)))))))...)))......((((..(....((((........))))....)..))))))))).......)))))).))))...((((..((..(((((((((((((....)))))...((((.....)))).))))))))..)).))))...)).)))....))))))).((((((((.....))))))))..................))))))))))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........(((......))).((((((.....)))))).((((...((((..........))))......((((((..((((....))))..)))))).(((((((((....)))).)))))......((((((..............(((((((......)))))))..............((((........)))).((((.........)))).)))))).......)))).(((((((..((((......((((((((.((((....))))....((((.....)))).))))))))..((((.(((...........)))))))..((((((((.....))))))))..........))))....)))))))...
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((((...(((......))).((((((.....))))))........((((....{{{{{.))))...(((((((((..((((....))))..)))))).(((((((((....)))).)))))........)))........(((....(((((((......)))))))....)))}}..(((((.......((((..[[[[[[)))).....]].]]]].............))))).......((((......((((((((.((((....))))....((((}}}..)))).))))))))..((((.(((...........)))))))..((((((((.....))))))))..........))))........))))..

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