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| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
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CRWrnafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidAlifold(seed)
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CentroidHomfold‑LAST
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
ContextFold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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Contrafold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
DAFS(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Fold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
MXScarna(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Mastr(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((((((..........(((..((((.(((((...))))).)).))..)))....(((.(((((((((......))))...((((((...)))))).((((....)))).((((..(((..........)))))))(((((((((....)))))))))((([[[.......((((((((...)))))))).((((((((....))))))))...))).((((.((((((..(((.((((.(((....))).)))))))......((((((....))))))..(((((............))))).((((((((....)))))))).))))))...))))]]]((((((((.((((....)))).)))))).))......))))))))....)))))))))).... |
|
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
((((((......(((((((....................................(((...)))...(((..............(((((.....))))).((((....))))....................................................(((.......((...............)).((....((....))....))..........))).....))).........................................................................(((...((....))...)))..........)))))))........................................((.........)))))))).... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................((..)...(............(....)..................)......(..........)..(...................)............).... |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((..((....((.(((..((((.(((((...))))).)).))..))).)).(((.(((((..(((((((.......(((((((...((((.(.((((....)))).)))))................))))((((((((((....))))))))).).))).......((((((((...)))))))).((((((((....)))))))).)))))))......((((..((((..(((((((((..((((....))))....((((((....))))))....)))))))))....(((.....((((((((....)))))))).....)))....)))).((((((((.((((....)))).)))))).)).)))).)))))))).))..))))))))).... |
|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(((((((((..((....((.(((..((((.(((((...))))).)).))..))).)).(((.(((((.((((((((.......(((((((...((((...((((....))))..)))).((..........)).)))).(((((((((....)))))))))...))).......((((((((...)))))))).((((((((....)))))))).))))))))...((((((((((....((((((((..(((((....)))))...((((((....)))))).....))))))))......))))..((((((((....)))))))).))))))....((((...(((((((.((((....)))).)))))))))))....)))))))).))..))))))))).... |
|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
...................((((....)))).((((....)))).................((((..((((......))))...((((.......)))).((((....)))).)))).((((..........))))...(((((((((....)))))))))...((((......(((((((.....))))))).((((((((....)))))))).(((((..............)))))......)))).(((((....)))))...(((((......)))))..(((((............))))).((((((((....)))))))).............(((......))).((((....))))......((((........))))......((((....)))).. |
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Vsfold5
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.((((.......(((((((((((....)))).((((....)))).((((.((............)))))).........((((((((((.....))))).((((....))))..((...(((..........))).)).(((((((((....)))))))))....{{{......(((((((.....))))))).((((((((....)))))))).{{{{{......)))))...}}}}}.(((((}}}..(((((....)))))...((((((....))))))..[[[[[.)))))......]]]]].((((((((....))))))))..........))))))).((((((..((((....))))..))))))........))))........((((....)))).. |
