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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - ASE_00144



RNA: ASE_00144
Rfam family: -

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ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .....(((.((((((((((((((((......)))))).....(((((((((((......))))))((((((.(((....))).))))).)((.(((....((((......(((.....)))....)))).....)))....................((((((((....))))))))...............))))))))))))...(((........)))...((((((...((........))...))))))..................................((...(((((..((((....)))).....)))))..)).......)))))))).
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] .......(..(((((.(((((((((......))))))...)..)).)))))..).....((.((((((((((..((((..(((...((..((((((((.....)))).).)))..((((((((.(((((...(((.((....((((...........((((((((....))))))))................))))(((.......))))).))).....)))))))))))))(........))).)))....(((((((.....))))))).))))..)))))))))).))(((((.(((((....)))))....)))))..((........))......
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McQFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .........((((((((((((((((......))))))..[[[[[..(((..........)))[[[[[[[[[[(((((((................)))))))...[[[[[((((...))))...(((((..)))))[[[[.................((((((((....))))))))((((............))))..))))))...]]]]..]]]]].....((((((..................))))))(((((((.....))))))).......]]]]]]]]]]...(((((.(((((....)))))....)))))...]]]]]....))))....
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RNASLOpt [ FASTA input ] [ sec struct ] .........(((((.....((((((......))))))..(((((....(((((...))))).((((((((((..(((((.....(((((....((((.....((((....((((...))))...((((....))))........)))).........((((((((....))))))))..............))))............((((((((((....))))...)))))).........)))))......(((((((.....))))))).))))).))))))))))...(((((.(((((....)))))....)))))...)))))...)))))....
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Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] .....(((.((((..((..((((((......))))))...((((..................((((((((((........(((.......(((.................)))..((..((((.(((((...((((((((..((((.......(.(.((((((((....)))))))).).)............))))..(....)...)))).).)))...)))))))))..)).............)))....(((((((.....))))))).......))))))))))...(((((.(((((....)))))....)))))...)))).))..))))))).
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .....(((.((((..((..((((((......))))))..(((((....(((((...))))).((((((((((..(((((.(((((((...(((((((......))))...)))..((..((((.(((((...(((.((((...((............((((((((....))))))))((((............)))).......))..)))).))).....)))))))))..)).......))))..)))....(((((((.....))))))).))))).))))))))))...(((((.(((((....)))))....)))))...)))))))..))))))).
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] .......((((.((((...((((((......))))))......(((.(((((........)))))...(((((((.......)).))))).))).(((.....)))...)))).(((((((....)).)))))...........))))......(((((((((((....))))))).((((............)))).........))))...((((....))))(((((...((........))...))))).((((((.......)))))).(((.............))).((((.(((((....)))))....))))..((((......)))).....
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((..<<<<....<<<....)))).>>>.>>>>.....(((((.[[[....)).)))]]]..(((..((((((((((.((.........))..))))))).(((....(((.....)))...((((....))))........))).......(((((((((((....))))))).((((............)))).........))))....(((....)))aaaaaa)))........(((((..AAAAAA((((((.......)))))).{{{...))))).....}}}.((((.(((((....)))))....))))...(((......))).)))..