RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - ASE_00191

RNA: ASE_00191
Rfam family: RNaseP_arch

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CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...........(((((((...((((.((((((((((....))))..(((((....(((((......(((...........)))(((((((((.....((((...(((((.......)))))..)))).)))))))))..)))))....)))))...)))))).......((((((...((((((..........))))))..))))))..)))).......(((......)))..)))))))..
Carnac(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....................................................................................................................................................................................................................................................
CentroidAlifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(((.(((((((((........((((((((((....)))))(((((....))))).....((((............(((((((((((......................................))))))))..)))........))))...)))))))))...((((......(((((..........))))).....))))...........................)))))))).
CentroidFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	................(((((((...((((((((((....))))((((((....)))))).....(((............((((((((((((.......(...((((((.......))))))..)...))))))))))..))........)))...))))))......)))))))...((((((..........))))))....................(((((((.......)))))))...
CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..............(.................((((....))))((((((....))))))......................((((((((((....................................))))))))))....................................................................................................).....
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(((.(((.(((((........((((((((((....))))((((((....))))))....((((............((((((((((((...........((((((.......))))))......))))))))))..))........))))..))))))))))...(((((....((((((..........))))))...)))))...........................).)))))).
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	................(((((((...((((((((((....))))((((((....))))))....((((............((((((((((((......(((..((((((.......)))))).)))..))))))))))..))........))))..))))))......)))))))...((((((..........))))))....................(((((((.......)))))))...
DAFS(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..........((((............(((((.((((....)))).(((((....)))))...........................((((................(((.......)))...........)))).......................)))))...................(((..........)))......................................)))).....
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......((((.[[[[..............((((((....))))))((((....))))))))..]]]]............((((((((....((((.((((..((((((.......)))))).)))).))))....((((.(((......))).))))))))))))...((((((...((((((..........))))))..))))))..(((.......[[[[[[)))......]]]]]]...
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((...))).((.(((.(((.......(((((((....)))))))(((....)))((((...((((......((......((((((((((.....((((.((.((((.......)))))).)))).))))))))))....))......)))).))))))))))))..((((((...((((((..........))))))..))))))............(((((((.......)))))))...
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....................((....((((((((((....)))).(((((....)))))......(((..............((((((((((...(((.....((((((.......)))))).)))..))))))))))............)))...))))))...[[..))((((...((((((..........))))))..))))..]]..........(((((((.......)))))))...
MXScarna(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((....((.(((((............(((((.((((....))))..((((....))))......................(((((((((((.............(.((((....).))).)........))))))))..)))...............))))).......((((......(((((..........))))).....))))...........................)))))))))
Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....................................................................................................................................................................................................................................................
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((...))).....(((((((...((((((.(.(((.(((..((((((....))))))..))).))))............((((((((((......(((..((((((.......)))))).)))..))))))))))...(((......)))...))))))......)))))))...((((((..........))))))....................(((((((.......)))))))...
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NanoFolder	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((...)))(((((ffffff(.....((((((((<<<<))))))))((((..{{{{(..[[[[[(.aaa....((.cc))aaaaaaaaaa..)).((((..((((((.gggg..)))))).)))).AAAAAAAAAA.))))fff..)}}}}.ee)AAA]]..]]].)FFFFFF...((((((..GGGG.dd.))))))..>>>>..)))....CC.EE(((((((...DD..)))))))FFF
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ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..(((...))).....(((((((...((((((.......(((..((((((....))))))..))).................((((((((((.....((((..((((((.......)))))).)))).))))))))))...(((......)))...))))))......)))))))...((((((..........))))))....................(((((((.......)))))))...
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..............((((.((((.....((((((((....))))))))......(((((....((((...............((((((((((...........((((((.......))))))......)))))))))).)))).....))))).....))))))))...((((((...((((((..........))))))..))))))............(((((((.......)))))))...
RNAalifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(((.(((((((((........((((((((((....)))))(((((....))))).....................(((((.(((((......................................))))).))..)))...............)))))))))...((((......(((((..........))))).....))))...........................)))))))).
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((.....))...((((........((((((.(((....)))...(((((....(((((...))))).......(((....((((((((((...(((.....((((((.......)))))).)))..)))))))))).)))......)))))...)))))).......(((..(...((((((..........))))))..)..))).....))))...((..(((.......)))..))...
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((........((.(((.((((.....((((((((....))))))))..((..(((((....(((...)))......(((.((((((((((...(((.....((((((.......)))))).)))..))))))))))....)))...)))))..)).)))))))))..((((((...((((((..........))))))..)))))).))).((.....((..(((.......)))..)))).
RNAsubopt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((..((((......(((((((...((((((((((....))))))((((....))))(((...((((.......(((....((((((((((...(((.....((((((.......)))))).)))..)))))))))).)))........)))).)))))))......)))))))...((((((..........))))))))))..))............((..(((.......)))..))...
RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....(((.(((.((.(((((((.(((((((((((((..(.(((.((((((..))))))....(((...)))..((((.....(((((((((..(...(((.(((((((.......)))))))))).))))))))))..))))))).)))).))..))))))).)...)))))))).)((((((..........))))))......(((((......).((.(......))).)))))))))).
RSpredict(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	....................................................................................................................................................................................................................................................
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((.....))...............((((((.(((....)))..(((((....)))))......((...............((((((((((.......(...((((((.......))))))..)...)))))))))).............))...)))))).......(((..(...((((((..........))))))..)..)))............((..(((.......)))..))...
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..((.....))...((((........((((((.(((....))).((((((....))))))....((((.......(((....((((((((((...(((......(((((.......)))))..)))..)))))))))).)))........))))..))))))...((..(((..(...((((((..........))))))..)..)))))...))))...((..(((.......)))..))...
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..............((((........((((((.(((....))).((((((....))))))....((((............((((....))))...........((((((.......))))))......((((((.....)))))).....))))..)))))).......((((((...((((((..........))))))..)))))).....))))...(((((((.......)))))))...
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.....((((...((((..(((.........)))(((....))).((((((....)))))).[[[))))............((((....))))...........((((.(((((((.....))))))).((((((.....))))))....)))).(((..]]])))((((.(((....))).(((..........))).....))))..))))........(((((((.......)))))))...

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