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RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - ASE_00213



RNA: ASE_00213
Rfam family: RNaseP_arch

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CRWrnafold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((((((........(((((((....))).)))).(((..(((((((..(((((....)))))..((((((((.......(((.....(((((((((....((...(((....)))...)).....)))))))))..)))........)))))))))))))))((((((.......))))))....)))..))))))........((........))..))))))).
Carnac(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........................................................................................................................................................................................................................................
CentroidAlifold(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ((((((((..........(.....).....(((.(((((((((....(((((....(((((....)))))......((((............(((((((((((...............................))))))))..)))........))))......)))))))))...((((.))))..............................))))))))..))))))))
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ContextFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((.....((.(((....))).))..((.((((((((((....(((((...(((((....)))))..((((((((............((((((((((((.............(((....)))......)))))))))..)))........)))))))).))))))))))...(((...)))..............................)))))))...))))))).
Contrafold [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((....((.(((....)).))).(((.(((((..((.((((.((..((((((((....))))).(((((((((.......(((.....(((((((((.((.........))...............)))))))))..)))........))))))))).((...((((((.......))))))..)).....)))..)).))))..))..)))))))).)))))))).
DAFS(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] (((.(((((........(((()))).......(..((((..........(((((...((((....)))).............................((((...........((.(........))).......))))........................)))))..........(.((.)).).............................)))).)...))))).)))
DotKnot [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((.......(((....)))....(((.(((((.......(((((((((.(((((....)))))...(((((((.......(((.....((((((((((((....)))....(((((....))))).)))))))))..)))........))))))))))))))))(((...(((((.............)))))))).............)))))))).)))))))).
Fold [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((....((.(((....)))))..(((.((((((((((....(((((...(((((....))))).(((((((((.......(((.....(((((((((.............................)))))))))..)))........)))))))))))))))))))...(((((..((.....))..)))))................)))))))).)))))))).
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MaxExpect [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((....((.(((....))).)).(((.((((((((((....(((((...(((((....)))))..((((((((.......(((.....(((((((((((((.......))))..............)))))))))..)))........)))))))).))))))))))...(((((..((.....))..)))))................)))))))).)))))))).
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RNAfold [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((....((.(((....))).)).(((.((((((((((....(((((((.(((((....)))))...(((((((.......(((.....(((((((((.........(((....)))..........)))))))))..)))........)))))))))))))))))))...(((((..((.....))..)))))................)))))))).)))))))).
RNAshapes [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((.((......))...........((.(((((..(((((((.(((....(((((....)))))........((......))...))).......(((((((.......)))))))..)))))))...((((((....(((......)))....((((.((...((((((.......))))))..)).))))....))))))........)))))))..)))))))).
RNAsubopt [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((....((.(((....))).)).(((.((((((((((....(((((...(((((....))))).(((((((((.......(((.....(((((((((.........(((....)))..........)))))))))..)))........)))))))))))))))))))...(((((..((.....))..)))))................)))))))).)))))))).
RNAwolf (ext) [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((((..(((.(((........)))))).((((((((((((...(....).((((((..))))))(((((((((...((((((.((.((((((((((((....(....................)...))))))))))..)))))))))).)))))))))..)))))))..((((...))))....(((((.(........).)..)))).)))))...))))))))).
RSpredict(seed) [ FASTA input ] [ sec struct ] ..........................................................................................................................................................................................................................................
Sfold [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((....(...((....))...).(((.(((((........(((((((..(((((....)))))..((((((((.......(((.....((((((((...............................))))))))..)))........)))))))))))))))........((....((.....))....)).................)))))))).)))))))).
UNAFold [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((....((.(((....)))))..(((.((((((((((....(((((...(((((....))))).(((((((((.......(((.....(((((((((.............................)))))))))..)))........)))))))))))))))))))...(((((..((.....))..)))))................)))))))).)))))))).
Vsfold4 [ FASTA input ] [ sec struct ] .(((((((.....((((.......((((....)))).........(((.....))).((((....))))...........))))......((((.(((((((((.(((.......))).((((....))))..))))))))).......((((((....)))))).)))).(((((.......)))))..(((....((((...............)))).)))..))))))).
Vsfold5 [ FASTA input ] [ sec struct ] .((((((((((.........)))..(((....))).(((......(((.....))).((((....))))..........(((((........<<<<.((((....[[[..)))))]]].((((....)))){{{{{)))).}}}}}.....((((....)))).((((....)))).(((((..((.....))..))))).>>>>...........))).......))))))).