RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - ASE_00251

RNA: ASE_00251
Rfam family: RNaseP_nuc

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Reference structure (ext)		[ sec struct ]	.......((((((.............................((((((....)))))).(((((((....))))))).(((((((...........((((((....))))))......))))))).))))))...(((((((......)))))))....................((((....))))..
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...(((.((((((.(((((((((....)))))))))......((((((....)))))).(((((((....)))))))((((((((.((.....(((((((((....)))))).))))))))))))))))))).(((((((((......)))))))))..))).(((...)))...((((....))))..
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CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	............................................((((....))))..((.(((((....)))))))((((((((.(.........((((((....))))))....).))))))))........((((((((......)))))))).................................
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......((((((.(((((((((....)))))))))......((((((....)))))).(((((((....)))))))((((((((...........((((((....))))))......))))))))))))))..((((((((......))))))))...................((((....))))..
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((.(((.((((((.(((((((((....)))))))))......((((((....))))))((((((((....))))))))(((((((.((.....(((((((((....)))))).)))))))))))).)))))).(((((((((......)))))))))..))).))..........((((....))))..
DAFS(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((................(((......)))................(......).............................................................................................(..(((..........))).....).............)))
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((((.[[[[[[.(((((((((....)))))))))..............))))))...(((((((....)))))))((((((((........(((((((((....)))))).)))..))))))))]]]]]].(((((((((......))))))))).....((((...))))..((((....))))..
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((.(((.((((((.(((((((((....)))))))))......((((((....))))))((((((((....))))))))(((((((.((.....(((((((((....)))))).)))))))))))).)))))).(((((((((......)))))))))..))).))..........((((....))))..
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...((..((((((.(((((((((....)))))))))......((((((....)))))).(((((((....)))))))((((((((.((........((((((....))))))....))))))))))))))))..((((((((......)))))))).[[[))..]]]........((((....))))..
MXScarna(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((.................(......)(............((..........)).............................(.....(((.............)))..)..............................................................(...))....))).
Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.............................................................................................................................................................................................
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...(((.((((((.(((((((((....)))))))))......((((((....))))))((((((((....))))))))(((((((.((.....(((((((((....)))))).)))))))))))).)))))).(((((((((......)))))))))..))).(((...)))...((((....))))..
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PETfold_pre2.0(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...............(((((((......)))))))((......(((((....)))))...((((((....))))))..(((((((.(((.......(((..........))).)))..))))))).)..)................................(............((((....)))).)
PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((.(((.((((((.(((((((((....)))))))))......((((((....)))))).(((((((....)))))))((((((((.((.....(((((((((....)))))).))))))))))))))))))).(((((((((......)))))))))..))).))..........((((....))))..
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	...(((.((((((.(((((((((....)))))))))......((((((....))))))((((((((....))))))))(((((((.((.....(((((((((....)))))).)))))))))))).)))))).(((((((((......)))))))))..)))((((...))))..((((....))))..
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((...((((.(((((((((....)))))))))......((((((....))))))((((((((....))))))))..))))............((((((....))))))..)))))....((((......(((((((((......))))))))).....)))).........((((....))))..
RNAalifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	................((((..........)))).((......(((((....)))))....(((((....)))))...................................................)..)...........................................................
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((.(((.((((((.(((((((((....)))))))))......((((((....)))))).(((((((....)))))))((((((((.((.....(((((((((....)))))).))))))))))))))))))).(((((((((......)))))))))..))).))..........((((....))))..
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RSpredict(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.............................................................................................................................................................................................
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(..(((.((((((.(((((((((....)))))))))......((((((....))))))((((((((....))))))))(((((((...........((((((....))))))......))))))).)))))).(((((((((......)))))))))..)))..)..........((((....))))..
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(..(((.((((((.(((((((((....)))))))))......((((((....)))))).(((((((....)))))))((((((((.((.....(((((((((....)))))).))))))))))))))))))).(((((((((......)))))))))..)))..)..........((((....))))..
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Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.......((((((.(((((((((....))))))))).......(((((....))))).((((((((....)))))))).((((((.((........((((((....))))))....))))))))..)))))).(((((((((......))))))))).....(((.....)))..((((....))))..

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