RNA Secondary Structure Atlas - RNASTRAND - ASE_00264

RNA: ASE_00264
Rfam family: RNaseP_nuc

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Afold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((.....(((((((((((.......(((((((((......)))))).)))....)).)))))))))....((((((((((..(((((((.....((((((....))))))..((.(((((....))))).))(((..(((..((....))..((((((...))))))......)))..)))))))))).((((((((((((.........)))))))).)))).....))))..........((((((((((((((....)))))).)))))))).......))))))..)))))))))))))
CRWrnafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((.....(((((((((.........(((((((((......)))))).))).......)))))))))....((((((.......(((((((....((((((....))))))((((...((((((((((((((((((((((........((((((.((((((...((((.......))))...))))))..((((((((((((((....)).)))))))).)))).)))))))))))))........)))))))))))))))))))....))))))).......))))))..)))))))))))))
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CentroidHomfold‑LAST	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((((.........(((((((.........(((((((((......)))))).))).......)))))))...................((((((.........((((....))))..((.(((((....))))).))(((..(((..........((((((((...)))))).))...)))..)))))))))..((((.(((((((.........)))))).).)))).....................................................................)))))))))).
ContextFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((.....(((((((((........(((.((((((......)))))).))).......))))))))).(((.(((((......(((((((........(((((....)))))..(.(((((....)))))..)(((..(((............((((((...))))))......)))..))))))))))..(((((((((((.........)))))))).)))....................((((((((((((((....)))))).)))))))).......)))))))))))))))))))))
Contrafold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((.....((((((((((..(.(..(((.((((((......)))))).))).)..)).)))))))))....((((((.(...(((((((((.......((((((()))))))(((...((((((((((((((((((((((........(((((..((((((.(.((((.......))))..)))))))..((((((((((((.........)))))))).))))..))))))))))))........)))))))))))))))))).....)))))))..)).).))))))..)))))))))))))
DAFS(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((...................................(((((........)))))......................................................................................................................................................................................(..............(.......(((........)))......))..........................))))
DotKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((.........(((((((.......(((((((((......)))))).))).........)))))))....((((((((((..(((((((.....((((((....)))))).....(((((....)))))...(((..(((.........(((((((((...)))))).)))..)))..)))))))))).((((((((((((.........)))))))).)))).....))))..........((((((((((((((....)))))).)))))))).......))))))..)))))))))))))
Fold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((((.(((((((.(((((((((.......(((((((((......)))))).)))....)).)))))))((....))....((((..(((((((.....((((((....))))))..((.(((((....))))).))(((..(((........((((((((((...)))))).)))).)))..)))))))))).((((((((((((.........)))))))).)))).....))))...)))))))((((((((((((((....)))))).))))))))....((....)).....)))))))))).
IPknot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((......((((((((........(((.((((((......)))))).))).......)))))))).....((((((.......(((((((.....................(((...(((((((((((((((((({{(((..........(((((((([[.)))))).))...)))..)))]].(((..((((((((((((.........)))))))).)))).........}}........))))))))))))))))))))).....))))))).......))))))..)))))))))))))
MXScarna(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((....(((......(.(...(((((...........((..(........)..))..........))))).)).....(((((((.........(..........).....(.)...................................(..........................)...............................................................................................(((....))).........))))))).....)..))))).
Mastr(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................
MaxExpect	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((((((......((((((((((.......(((((((((......)))))).)))....)).)))))))).....((((((.......(((((((....((((((....)))))).(((...((((((((((((((.(((..(((.........(((((((((...)))))).)))..)))..)))..(((((.((((((((((((.........)))))))).))))..................)))))))))))))))))))))).....))))))).......))))))..)))))))))))).
McQFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((.....(((((((((.........(((((((((......)))))).))).......)))))))))....((((((.......(((((((......((((((..))))))((((...((((((((((((((((((((((.............((((((...))))))...(((((((((..((((.....))))(((((((.........))))))))))))))))....)))))))........)))))))))))))))))))....))))))).......))))))..)))))))))))))
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PknotsRG	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((((((.....(((((((((((.......(((((((((......)))))).)))....)).)))))))))....((((((((((..(((((((.....((((((....))))))..((.(((((....))))).))(((..(((..((....))..((((((...))))))......)))..)))))))))).((((((((((((.........)))))))).)))).....))))..........((((((((((((((....)))))).)))))))).......))))))..)))))))))))).
ProbKnot	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((((((((((((((.......(((((((((......)))))).)))....)).))))))))).{{.{{{{{{.(((...[[[[[[.....((((((....)))))).[[[...[[[[[[[[[[[[...(((..(((........((((((((((...)))))).)))).)))..)))........(((((((((((((......).)))))))).)))).[[[.)))]]]..))))).......]]]]]]]]]]]]]]]......]]]]]].......}}}}}}}})))))))))))))
RNASLOpt	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((.....(((((((((............((((((......))))))...........)))))))))....((((((.......(((((((.......(((((....)))))......((((((((((((((((((((((........((((((.((((((...((((.......))))...))))))..((((((((((((.........)))))))).)))).)))))))))))))........)))))))))))))))........))))))).......))))))..)))))))))))))
RNAalifold(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((((..(((.............((((...........................................)))).......................((((........(((((....)))))....(((((....)))))....................................................)))).............................................................................................................)))..))))
RNAfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((((((.....(((((((((((.......(((((((((......)))))).)))....)).)))))))))....((((((((((..(((((((.....((((((....))))))..((.(((((....))))).))(((..(((..((....))..((((((...))))))......)))..)))))))))).((((((((((((.........)))))))).)))).....))))..........((((((((((((((....)))))).)))))))).......))))))..)))))))))))).
RNAshapes	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((.........(((((((.(((((((((.......(((((((((......)))))).)))....)).)))))))............((((..(((((((.....((((((....))))))..((.(((((....))))).))(((..(((..((....))..((((((...))))))......)))..)))))))))).((((((((((((.........)))))))).)))).....))))...)))))))((((((((((((((....)))))).)))))))).....)).(((((.....))))).....
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RNAwolf (ext)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((((((((((((((((((((.(..((((((((((......))))))))))))))))..)))))..((((((((((((..(..)))))).)..))))))(((((..)))))((((......)))..)(((((((((....(......)...))((((((((...))))..))))((((........))))...)))))))(((((((((.(........)))))))))).....))))))))))((((((((((..((..))..))).)))))))((((...))))..(...))))))))))))
RSpredict(seed)	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	((............................................................................................................................................................................................................................................(.(..).)................................(...).............................))
Sfold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.((((((((((((.....(((((((((.........(((((((((......)))))).))).......)))))))))....((((((.......(((((((......((((....))))...(((...((((((((((((...(((..(((............((((((...))))))......)))..))).(((((((.(((((((((((.........)))))))).)))..................))))))).))))))))))))))).....))))))).......))))))..)))))))))))).
UNAFold	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	(((((((((((((.....(..((((((((.......(((((((((......)))))).)))....)).))))))..)....((((((((((..(((((((........(((((....))))).((..((((....))))..))(((..(((..((....))..((((((...))))))......)))..)))))))))).((((((((((((.........)))))))).)))).....))))..........((((((((((((((....)))))).)))))))).......))))))..)))))))))))))
Vsfold4	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.(((((((.((((....)))).(((((........(((....)))((((.....))))....)))))....))))))).....((((.....)))).((((.....(((((....))))).((((.(((((....))))).(((((..((...((....))..)).)))))...)))).)))).((((((..((((.....)))).((((((.........)))))).)))))).(((...........))).((((((((((((((....)))))).)))))))).......((((((.....))))))....
Vsfold5	[ FASTA input ]	[ sec struct ]	.........((((....)))).(((((((.......)))).....((((.....)))){{{.{{))).....}}}}}......((((.....)))).((((....((((((....)))))).....(((((....))))).(((...................[[[[[)))..]]]]].))))..(((.....)))....((((((((((((.........)))))))).)))).(((...........))).((((((((((((((....)))))).)))))))).......((((((.....))))))....

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