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GAGGAAAGUCCGGGCAACACAGAGCAGGAUACUUCUUAACGAGAAGCAGUUCGCGAGGGCUGAGUAGUGUAACAGAAAAUAACCGCCACACUUCGGUUUGGUAAGGGUGAAAAGGUGGGGUAAGAGCCUACCGUAGCGGCCGUAAUUCCGCUAGCCGUACGCCUUAUGGGUUGUAAGAUCAUGUACACCGACGCAUGUAGAGUGACUCGCUCGAUGUCGGGGGGUAGAUCGCUAGAGUUGCGUAGUGAUACGUAAUCGAGAUAAAUGGCAGACGUUGUGCUUGCACAAUACAGAAUCCGGCUUA |
| Reference structure (ext) |
|
[ sec struct ] |
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Afold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CRWrnafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CentroidAlifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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CentroidFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
CentroidHomfold‑LAST
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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ContextFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Contrafold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
DAFS(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
DotKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Fold
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[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
IPknot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
MXScarna(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Mastr(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ |
|
MaxExpect
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
McQFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PETfold_2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PETfold_pre2.0(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
PknotsRG
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
ProbKnot
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNASLOpt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.........(((((..((((.....((((....)))).........((((((....))))))....))))..............((((.....(((((((...((((((....((((((.......))))))...(((((.............))))).))))))......................((((((......(((((...)))))..))))))....))))))).....((((((((....)))))))).........))))....((((((....))))))......))))).... |
|
RNAalifold(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
(.(((...)))...(((..............(((((.....)))))..((((....))))............................................(((......((...............)).((....((....))....)).........))).....)))...............................................................(((...((....))...)))................)............................... |
|
RNAfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAshapes
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAsubopt
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RNAwolf
(ext)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
RSpredict(seed)
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................((....))......((.......)).. |
|
Sfold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
UNAFold
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Vsfold4
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
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|
Vsfold5
|
[ FASTA input ] |
[ sec struct ] |
.......((((..((........)).))))...(((.....)))((((((((....)))))....(((((..........<<<<<..))))).>>>>>.(((...........((((((.......))))))..(((((........))))).))).((((((.....)).))))....(((((........)))))..(((([[[..))))...]]]...((((....(((.......{{{{{))).}}}}}....(((...((((.....))))aaa))).AAA........)))).))).. |
